第12章 DNA的生物合成课件.ppt
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1、第第1212章章D N AD N A 的 生 物 合 成的 生 物 合 成DNA Biosynthesis2022年年6月月23日日20时时23分分12022年年6月月23日日20时时23分分2第第1212章章 1865 1865年年,奥地利生物学家奥地利生物学家孟德尔孟德尔(Mendel)总结总结8 8年的年的豌豆杂交豌豆杂交实验提出:实验提出:“hereditary factor(遗传因子遗传因子) )”决定决定生物性生物性状、状、分离定律分离定律和和自由组合定律自由组合定律。 1910 1910年,美国生物学家年,美国生物学家摩尔根摩尔根(Morgan)对对果蝇果蝇进行系统研究,提出进行
2、系统研究,提出基因在染色体上直线排列、基因在染色体上直线排列、连锁连锁遗传遗传和和连锁交换定律连锁交换定律。19331933年获诺贝尔奖。年获诺贝尔奖。 1909 1909年年,丹麦生物学家,丹麦生物学家约翰逊约翰逊(Johannsen)进行了进行了年的年的菜菜豆豆自自交交与与纯系纯系实验实验;据希腊文据希腊文“给予生命给予生命”之义,之义,最先最先用用“基因基因” 替代替代了了“遗传因子遗传因子”。2022年年6月月23日日20时时23分分31.1.基因概念的提出和发展基因概念的提出和发展肺炎肺炎双双球菌遗传球菌遗传转化实验转化实验2022年年6月月23日日20时时23分分42.2. 噬菌体
3、侵染细菌实验进噬菌体侵染细菌实验进一步一步携带遗传信息的是携带遗传信息的是DNA鲁利亚鲁利亚(Luria)2022年年6月月23日日20时时23分分63.3.DNARNAProtein中心法则中心法则The Central Dogma1958 F. Crick翻译翻译转录转录反转录反转录复制复制复制复制中心法则的补充:中心法则的补充:1965年发现年发现RNA复制复制1970年发现逆转录酶年发现逆转录酶2022年年6月月23日日20时时23分分74.4.中心法则的中心法则的复制的基本规律复制的基本规律第一节第一节Basic Rules of DNA Replication2022年年6月月23
4、日日20时时23分分8学习要求:学习要求: 掌握复制及其基本规律、半保留复制、双向复掌握复制及其基本规律、半保留复制、双向复制、半不连续性复制、复制叉、复制子、领头链、制、半不连续性复制、复制叉、复制子、领头链、随从链、冈崎片段的概念。随从链、冈崎片段的概念。 熟悉半保留复制的实验依据。熟悉半保留复制的实验依据。2022年年6月月23日日20时时23分分9 DNA DNA复制是一个由多种酶催化,多种蛋白因子复制是一个由多种酶催化,多种蛋白因子参与,并且受到精密调控的复杂过程。参与,并且受到精密调控的复杂过程。 E. coli E. coli 染色质的复制涉及约染色质的复制涉及约3030种蛋白质
5、种蛋白质。 指遗传物质的传代,是以母链指遗传物质的传代,是以母链DNADNA为模板,按为模板,按碱基配对的原则碱基配对的原则, ,合成两个完全相同的子链合成两个完全相同的子链DNADNA分子分子的过程的过程。 (semi-conservative replication) (bidirectional replication) (semi-discontinuous replication) 2022年年6月月23日日20时时23分分10Watson and Crick, 1953.亲代亲代DNADNA荣获荣获1962年诺贝尔医学与生理学奖。年诺贝尔医学与生理学奖。2022年年6月月23日日2
6、0时时23分分121958, M. Mmlson & F. W. Stahl设计的实验设计的实验2022年年6月月23日日20时时23分分131958, M. Messelson & F. W. Stahl设计的实验设计的实验2022年年6月月23日日20时时23分分14按半保留复制方式,子代按半保留复制方式,子代DNA与亲代与亲代DNA A的碱基序列一致,即子代保留了亲代的全部遗的碱基序列一致,即子代保留了亲代的全部遗传信息,体现了遗传的保守性。传信息,体现了遗传的保守性。遗传的保守性,遗传的保守性,是物种稳定性的分是物种稳定性的分子基础,但不是绝子基础,但不是绝对的。对的。2022年年6月
7、月23日日20时时23分分1553553353352022年年6月月23日日20时时23分分16 E. Coli E. Coli的称的称ori C,由,由245 bp245 bp的保守序列和控的保守序列和控制元件组成;制元件组成; 酵母的酵母的称称autonomously replicating sequence, 含含含含11 bp富含富含AT的核心序列的核心序列。2022年年6月月23日日20时时23分分1753oriorioriori5355332022年年6月月23日日20时时23分分18复制子复制子(replicon):独立完成复制的功能单位。:独立完成复制的功能单位。 3 5 3
8、5 3 5 解链方向解链方向领头链领头链(leading strand)随从链随从链(lagging strand)3 5 3 5 2022年年6月月23日日20时时23分分19 原核原核:10002000 个核苷酸(个核苷酸(nt) (相当于相当于1个顺反子,即基因的大小个顺反子,即基因的大小) 真核真核:100200个核苷酸(个核苷酸(nt) (相当于相当于1个核小体个核小体DNA的大小的大小) 2022年年6月月23日日20时时23分分202022年年6月月23日日20时时23分分21学习要求:学习要求: 掌握参与掌握参与DNA复制的主要物质种类,原核和真核生物复制的主要物质种类,原核和
9、真核生物DNA聚合酶作用、种类及特点,拓补异构酶、引物酶、单链聚合酶作用、种类及特点,拓补异构酶、引物酶、单链DNA结结合蛋白和合蛋白和DNA连接酶的作用和特点。连接酶的作用和特点。 熟悉熟悉DNA复制的化学反应、保真性的酶学依据。复制的化学反应、保真性的酶学依据。 了解了解DNA聚合酶的分子结构特点,复制中聚合酶的分子结构特点,复制中DNA分子的拓补分子的拓补学变化。学变化。 dATP, dGTP, dCTP, dTTP;(dNTP) 依赖依赖DNA的的DNA聚合酶,简写为聚合酶,简写为 DNA-pol; 解开成单链的解开成单链的DNA母链;母链; 提供提供3 -OH末端使末端使dNTP可以
10、依次聚合;可以依次聚合;。2022年年6月月23日日20时时23分分22(dNMP)n+ dNTP(dNMP)n+1+ PPiDNA pol2022年年6月月23日日20时时23分分243 5 5 3 3 5 DNA-pol5 3 OHP2022年年6月月23日日20时时23分分255 3 3 5 外外2022年年6月月23日日20时时23分分265 3 DNA-polDNA-pol DNA-pol 2022年年6月月23日日20时时23分分272022年年6月月23日日20时时23分分28u DNA-pol (109kD)2022年年6月月23日日20时时23分分291959年诺贝尔生年诺贝
11、尔生理学医学奖得主理学医学奖得主5 3 2022年年6月月23日日20时时23分分305 3 GC将错配的核苷酸从引物链的将错配的核苷酸从引物链的3端除去端除去 2022年年6月月23日日20时时23分分31323个氨基酸个氨基酸小片段小片段5 核酸外切酶活性核酸外切酶活性大片段大片段/604个氨基酸个氨基酸 5 核酸外切酶活性;核酸外切酶活性;DNA聚合酶活性聚合酶活性N 端端C 端端枯草杆菌蛋白酶枯草杆菌蛋白酶 Klenow片段是实验室合成片段是实验室合成DNA,进行分子,进行分子生物学研究中常用的工具酶。生物学研究中常用的工具酶。 2022年年6月月23日日20时时23分分322022年
12、年6月月23日日20时时23分分33*是由是由A. Kornberg的的二二儿子儿子Tom B. Kornberg发现的。发现的。u (含含10多个亚基的异二聚体多个亚基的异二聚体)2022年年6月月23日日20时时23分分342022年年6月月23日日20时时23分分35定位定位核核核核线粒体线粒体核核核核5353聚合活性聚合活性有有有有有有有有有有3535外切活性外切活性无无无无有有有有有有持续合成持续合成能力能力中等中等低低高高有有PCNA(PCNA(亚亚基基) )时高时高高高功能功能起始引发,起始引发,引物酶引物酶活性活性低保真度低保真度的复制的复制线粒体线粒体DNADNA复制复制延长
13、子链的延长子链的主要酶,主要酶,解旋酶活性解旋酶活性填补空缺,填补空缺,切除修复,切除修复,重组重组2022年年6月月23日日20时时23分分36突变率突变率约为约为1/101/103 3;DNADNA聚合酶聚合酶和和,是子链与母链能准确配对是子链与母链能准确配对( (突变率突变率1/101/104 45 5) ),使遗传,使遗传信息延续和传代的保证;信息延续和传代的保证;和复制和复制等机等机制制,使突变率由,使突变率由1/1068降低降低到到1/10910 。DNADNA聚合酶聚合酶 和和实现的即时校读实现的即时校读,可使突变率由,可使突变率由1/1045降低到降低到1/1068;2022年
14、年6月月23日日20时时23分分37DNADNA分子的碱基埋在双螺旋内部,只有分子的碱基埋在双螺旋内部,只有把把DNADNA解开成单链,它才能起模板作用;解开成单链,它才能起模板作用;因此,因此,DNA复制涉及复制涉及DNA双螺旋构象变双螺旋构象变化及解链过程。化及解链过程。 2022年年6月月23日日20时时23分分38 沿着随从链的模板,从沿着随从链的模板,从5533方向,促使复制叉向前延伸;方向,促使复制叉向前延伸;:沿着领头链的模板,从沿着领头链的模板,从33 5 5方向向前移动,促使双链不断解开;方向向前移动,促使双链不断解开;2022年年6月月23日日20时时23分分39 2022
15、年年6月月23日日20时时23分分402022年年6月月23日日20时时23分分412022-6-23422022年年6月月23日日20时时23分分42 (DNA topoisomerase, Topo) 2022年年6月月23日日20时时23分分432022年年6月月23日日20时时23分分44TopoTopo将前方将前方的的正超螺旋转变为负超螺旋正超螺旋转变为负超螺旋; TopoTopo使使DNADNA变为松弛状态变为松弛状态,与转录有关。,与转录有关。TopoTopo和和TopoTopo都能清除前方的正超螺旋。都能清除前方的正超螺旋。通过切断、旋转和再连接,理顺通过切断、旋转和再连接,理
16、顺DNADNA链。链。 2022年年6月月23日日20时时23分分45DNA正超螺旋与负超螺旋正超螺旋与负超螺旋负超螺旋负超螺旋DNA双螺旋双螺旋正超螺旋正超螺旋、2022年年6月月23日日20时时23分分46切割切割DNA双链,此时不需双链,此时不需ATP;尔后;尔后由由ATP供能供能,使,使DNA分子成负超螺旋分子成负超螺旋再连接再连接切口切口。不需不需ATP,切割双链,切割双链DNA中的一条链,中的一条链,使使DNA松弛后松弛后, 连接切口。连接切口。 Topo: Topo:u 临床上使用的某些抗肿瘤药临床上使用的某些抗肿瘤药(如喜树碱、鬼如喜树碱、鬼臼乙叉甙等臼乙叉甙等) 可通过抑制可
17、通过抑制Topo酶活性而杀死肿酶活性而杀死肿瘤细胞。瘤细胞。2022年年6月月23日日20时时23分分47 由由RNase HRNase H与与DNA-polDNA-pol外切酶活性除去冈崎片段外切酶活性除去冈崎片段中的中的RNARNA引物,间隙由引物,间隙由DNA-polDNA-pol填补成填补成DNADNA,缺口由,缺口由DNADNA连接酶催化相邻冈崎片段间的连接酶催化相邻冈崎片段间的3-OH3-OH和和5-P5-P形成形成磷酸二酯键而连成完整的磷酸二酯键而连成完整的DNADNA链。链。只能连只能连接碱基互补基接碱基互补基础上双链中的础上双链中的单链缺口;而单链缺口;而对单独存在的对单独存
18、在的D N A 单 链 或单 链 或RNA单链没有单链没有连接的作用。连接的作用。2022年年6月月23日日20时时23分分482022年年6月月23日日20时时23分分49 在复制中起最后接合缺口在复制中起最后接合缺口( (双链中的单链双链中的单链 缺口缺口) )的作用;的作用; 在在DNADNA修复、重组及剪接过程中起缝合缺修复、重组及剪接过程中起缝合缺 口的作用;口的作用; 基因工程的重要工具酶之一。基因工程的重要工具酶之一。u DNA DNA连接酶功能连接酶功能2022年年6月月23日日20时时23分分50DNADNA复制因子和酶复制因子和酶原核生物原核生物真核生物真核生物功能功能起始
19、识别因子起始识别因子Origin Rec. FactorDna AHU(类组蛋白类组蛋白) )ORC(6(6聚体聚体) )Cdc6、MCM识别、结合复制起始点识别、结合复制起始点解螺旋酶解螺旋酶HelicaseDan B(6(6聚体聚体) )Dna C(6(6聚体聚体) )DNA-pol 解开解开DNADNA双螺旋链双螺旋链单链结合蛋白单链结合蛋白Single Strand BPSSBSSB结合、稳定结合、稳定DNADNA单链单链拓扑酶拓扑酶Topoisomerase拓扑酶拓扑酶 拓扑酶拓扑酶 拓扑酶拓扑酶 清除复制叉前方的超螺旋清除复制叉前方的超螺旋引物酶引物酶PrimaseDna GDNA
20、-pol 合成一小段合成一小段RNARNA引物引物DNADNA聚合酶聚合酶DNA PolymeraseDNA-Pol DNA-Pol 亚基亚基DNA-pol DNA-pol PCNA以亲代以亲代DNA单链单链为为模板模板,按按53方向延长方向延长子链子链DNARNARNA酶酶 H HRNase HRNA酶酶 HDNA-Pol RNA酶酶 HRNase H分解、清除引物分解、清除引物连接酶连接酶Ligase连接酶连接酶连接酶连接酶连接连接DNADNA片段片段参与参与DNADNA复制的主要因子和酶复制的主要因子和酶2022年年6月月23日日20时时23分分51DNADNA生物合成过程生物合成过程第
21、三节第三节The Process of DNA Replication2022年年6月月23日日20时时23分分52学习要求:学习要求: 掌握原核生物掌握原核生物DNA复制过程和各阶段的特点;复制过程和各阶段的特点;掌握端粒和端粒酶概念,掌握端粒和端粒酶概念, 熟悉真核生物熟悉真核生物DNA复制过程和各阶段的特点;复制过程和各阶段的特点;熟悉复制起始、引发体、负超螺旋等概念。熟悉复制起始、引发体、负超螺旋等概念。 了解端粒延长机制。了解端粒延长机制。 原核生物原核生物DNA的复制有一个特定的复制起始的复制有一个特定的复制起始点;点;E. coli的复制起始点称为的复制起始点称为oriC,由,由
22、245 bp的的保守序列和控制元件组成。保守序列和控制元件组成。2022年年6月月23日日20时时23分分53上游有上游有能被能被DnaB(DnaB(解螺旋解螺旋酶酶) )和和DnaCDnaC蛋白识别结合蛋白识别结合 下游有下游有被被DnaADnaA蛋白蛋白( (起始因子起始因子) )识别结合识别结合 DnaA( DnaA(起始因子起始因子) )、DnaB(DnaB(解螺旋酶解螺旋酶) )、DnaCDnaC、HU(HU(类组蛋白类组蛋白) )、拓扑酶、拓扑酶( (即促旋酶即促旋酶) )和和SSBSSB2022年年6月月23日日20时时23分分54Arrangement of sequences
23、 in the E. coli replication origin, oriC. *DUE: DNA unwinding element.Model for initiation of replication at the E. coli origin, oriC. Eight DnaA protein molecules, each with a bound ATP, bind at the R and I sites in the origin. 引物引物3 HO53 5 3 5 HO3 5Dan C解螺旋酶解螺旋酶引物引物HO3 (Dna B)(DnaG)(DnaG)引发体:引发体:含
24、有解螺旋酶含有解螺旋酶(DnaB)、DnaC蛋白、引物酶蛋白、引物酶 (DnaG)和和DNA复制起始区域的复合结构。复制起始区域的复合结构。引引 物:物:是由引物酶催化合成的短链是由引物酶催化合成的短链 RNA分子分子,能提能提 供供3-OH。 2022年年6月月23日日20时时23分分563 AAGACCTATTGCAAT-5 5 TTCTGGATAA-OH3 2022年年6月月23日日20时时23分分57领头链:领头链:合成一段合成一段RNA引物(比冈崎片段的引物引物(比冈崎片段的引物 略长),开始合成后通常一直继续下去。略长),开始合成后通常一直继续下去。2022年年6月月23日日20时
25、时23分分58随从链:随从链:分段进行,需要不断合成分段进行,需要不断合成RNA引物和冈崎引物和冈崎 片段。片段。 2022年年6月月23日日20时时23分分59领头链:领头链:合成一段合成一段RNA引物(比冈崎片段的引物略引物(比冈崎片段的引物略 长),开始合成后通常一直继续下去。长),开始合成后通常一直继续下去。随从链:随从链:分段进行,需要不断合成分段进行,需要不断合成RNA引物和冈崎引物和冈崎 片段。片段。 2022年年6月月23日日20时时23分分60 在营养丰富培养基,在营养丰富培养基,E. Coli 每每20分钟分钟即可分裂一次;其基因组碱基数为即可分裂一次;其基因组碱基数为4.
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