第十三章 DNA 生物合成.ppt课件.ppt
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- 第十三章 DNA 生物合成.ppt课件 第十三 生物 合成 ppt 课件
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1、内容提要内容提要 DNA 的半保留复制的半保留复制 依赖依赖 RNA 的的 DNA 合成合成 DNA 损伤与修复损伤与修复 1.光复活光复活NNOCH3ONNOOCH3PNNOCH3ONNOOCH3PT(胸腺嘧啶)二聚体胸腺嘧啶)二聚体只有高等哺乳动物该功能退化掉了。只有高等哺乳动物该功能退化掉了。例例 对细菌紫外诱变或杀灭时尽量保持暗环境。对细菌紫外诱变或杀灭时尽量保持暗环境。2.切除修复切除修复3.重组修复重组修复 复制同时的修复复制同时的修复*在后代中只有一个个体含有该条在后代中只有一个个体含有该条DNA,后代越多,影响比例,后代越多,影响比例越小,等于消除影响。越小,等于消除影响。*4
2、.SOS修复修复 SOS求救信号求救信号DNA损伤严重,复制受到抑制,前几种方法难以奏效时:n诱导校对能力差的诱导校对能力差的DNA聚合酶形成,聚合酶形成,局部局部“乱配乱配”*进化、变种、癌症、诱变育种等等都是基于这一机理。进化、变种、癌症、诱变育种等等都是基于这一机理。n为了生存为了生存变变。第一节第一节 DNA 的半保留复制的半保留复制 DNA 半保留复制的理论半保留复制的理论 参与参与 DNA 复制的酶复制的酶 复制的起点和方式复制的起点和方式 复制过程复制过程一、一、DNA 半保留复制的理论半保留复制的理论 半保留复制的实验依据和意义半保留复制的实验依据和意义 双向复制双向复制 复制
3、的半不连续性复制的半不连续性(一)半保留复制的实验依据和意义(一)半保留复制的实验依据和意义 半保留复制的实验依据半保留复制的实验依据 半保留复制的概念半保留复制的概念 半保留复制的意义半保留复制的意义 复制的半不连续性复制的半不连续性1. 半保留复制的实验依据半保留复制的实验依据 1958年,年,Meselson 证明:用,证明:用,15NH4Cl 唯唯一氮源培养大肠杆菌,之后,用一氮源培养大肠杆菌,之后,用 14NH4Cl 培培养,然后进行养,然后进行 CsCl2 进行密度梯度离心。由进行密度梯度离心。由于于 15NH4Cl 密度大于密度大于 14NH4Cl,因此,形成因此,形成不同区带,
4、经过若干代培养后,两个不同区带,经过若干代培养后,两个 NH4Cl 区带增多。区带增多。2.半保留复制的概念半保留复制的概念 DNA 生物合成时,母链生物合成时,母链 DNA 解开为两股解开为两股单链,各自作为模板单链,各自作为模板(template)按碱基配对按碱基配对规律,合成与模板互补的子链。子代细胞规律,合成与模板互补的子链。子代细胞的的 DNA,一股单链从亲代完整地接受过来,一股单链从亲代完整地接受过来,另一股单链则完全重新合成。两个子细胞另一股单链则完全重新合成。两个子细胞的的 DNA 都和亲代都和亲代 DNA 碱基序列一致。这碱基序列一致。这种复制方式称为半保留复制。种复制方式称
5、为半保留复制。3. 半保留复制的意义半保留复制的意义 按半保留复制方式,子代按半保留复制方式,子代 DNA 与亲代与亲代 DNA 的碱基序列一致,即子代保留了亲代的全部的碱基序列一致,即子代保留了亲代的全部遗传信息,体现了遗传的保守性。遗传信息,体现了遗传的保守性。 遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础,遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础,但不是绝对的。但不是绝对的。(二)双向复制(二)双向复制 原核生物的原核生物的 DNA 双向复制双向复制 真核生物的真核生物的 DNA 双向复制双向复制1. 原核生物的原核生物的 DNA 双向复制双向复制 原核生物复制时,原核生物复制时,DNA 从从起始点
6、起始点(origin)向两个方向向两个方向解链,形成两个延伸方向解链,形成两个延伸方向相反的复制叉,称为双向相反的复制叉,称为双向复制。复制。 复制起始点(复制起始点(oriori):DNADNA复制要从复制要从DNADNA分子的特定分子的特定部位开始,此部位称复制部位开始,此部位称复制起始点起始点复制中的放射自显影图象复制中的放射自显影图象A. 环状双链环状双链 DNA 及复制起始点及复制起始点B. 复制中的两个复制叉复制中的两个复制叉C. 复制接近终止点复制接近终止点(termination, ter)oriterA B C2. 真核生物的真核生物的 DNA 双向复制双向复制 真核生物每个
7、染色体有多个起始点,是多复制真核生物每个染色体有多个起始点,是多复制子的复制。子的复制。 习惯上把两个相邻起始点之间的距离定为一个习惯上把两个相邻起始点之间的距离定为一个复制子复制子(replicon) 。复制子是独立完成复制的。复制子是独立完成复制的功能单位。功能单位。53oriorioriori535533553复制子33. 复制的半不连续性复制的半不连续性顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,这股链称为这股链称为领头链(先导链)领头链(先导链)。另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能顺着解链方向连
8、续延长,这股不连续复制的链称顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称为为随从链(滞后链)随从链(滞后链)。复制中的不连续片段称为。复制中的不连续片段称为岡崎片段岡崎片段(okazaki fragment)。 领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的的半不连续性半不连续性。3 3 5 5 3 3 5 5 解链方向解链方向3 3 5 5 3 3 3 3 5 5 领头链(先导链)领头链(先导链)(leading strand)(leading strand)随从链(滞后链)随从链(滞后链)(lagging strand)(lagging strand)
9、二、参与二、参与 DNA 复制的酶复制的酶 DNA 聚合反应聚合反应 DNA 聚合酶聚合酶 DNA 连接酶连接酶 DNA 解旋相关酶类解旋相关酶类 引物酶引物酶( (PrimasePrimase) )和引发体和引发体参与参与 DNA 复制的物质复制的物质 底物底物(substrate): dATP, dGTP, dCTP, dTTP聚合酶聚合酶(polymerase): 依赖依赖 DNA 的的 DNA 聚合酶,简写聚合酶,简写 为为 DNA-pol模板模板(template) : 解开成单链的解开成单链的 DNA 母链母链引物引物(primer): 提供提供 3 -OH 末端使末端使 dNTP
10、 可以依次聚合可以依次聚合 其他的酶和蛋白质因子其他的酶和蛋白质因子(一)(一)DNA 聚合反应聚合反应 聚合反应方程式聚合反应方程式 聚合反应的特点聚合反应的特点1. 聚合反应方程式聚合反应方程式n1d ATPn2d CTPn3d GTPn4d TTPDNA聚合酶聚合酶DNA模板模板DNA +(n1+n2+n3+n4)PPiPPi 随即被焦磷酸酶水解,从而推动随即被焦磷酸酶水解,从而推动聚合反应的进行。聚合反应的进行。(dNMP)n + dNTP (dNMP)n+1 + PPi 2. 聚合反应的特点聚合反应的特点 以四种脱氧核苷三磷酸为底物;以四种脱氧核苷三磷酸为底物; DNA 新链生成需引
11、物和模板;新链生成需引物和模板; 新链的延长只可沿新链的延长只可沿 5 3 方向进行;方向进行; 产物产物 DNA 的性质与模板相同。的性质与模板相同。 反应需反应需 Mg+ 激活。激活。(二)(二) DNA 聚合酶聚合酶 原核生物的原核生物的 DNA 聚合酶聚合酶 真核生物的真核生物的 DNA 聚合酶聚合酶1. 原核生物的原核生物的 DNA 聚合酶聚合酶 DNA-pol DNA-pol DNA-pol DNA-pol IV DNA-pol V1)1)大肠杆菌三种大肠杆菌三种DNADNA聚合酶比较聚合酶比较DNADNA聚合酶聚合酶分子量分子量每个细胞的分子统计数每个细胞的分子统计数5 5 -3
12、 -3 聚合酶作用聚合酶作用3 3 -5 -5 核酸外切酶作用核酸外切酶作用5 5 -3 -3 核酸外切酶作用核酸外切酶作用转化率转化率主要功能主要功能活性(活性(nt/minnt/minDNADNA聚合酶聚合酶DNADNA聚合酶聚合酶(复合物)(复合物)109109,000000400400+ + + +1 1校读校读, ,修复修复10001000120120,0000004040+ + +- -0 .050 .05400400,00000010-2010-20+ + + +5050复制复制100000100000特特 性性不清不清填补缺口填补缺口50505 u ucgagccgagcu u
13、ag-ag-OH OH 3 5 u ucgagccgagcu uagagDNA poldNTP2)52)5 3 3 聚合作用聚合作用3 agctcgatcgtagcctagcgtagcagtgcacgatc agctcgatcgtagcctagcgtagcagtgcacgatc 5 3 agctcgatcgtagcctagcgtagcagtgcacgatc agctcgatcgtagcctagcgtagcagtgcacgatc 5 catcggatcgcatcgtcacgtgctag catcggatcgcatcgtcacgtgctag 3 53内切酶内切酶外切酶外切酶3)3)外切酶与内切酶作
14、用图解外切酶与内切酶作用图解5 5 3 3 外切酶活性的功能外切酶活性的功能 切除引物,切除突变片段切除引物,切除突变片段534)34)35 5 外切酶活性外切酶活性 校校 读读 错配碱基错配碱基小片段小片段 大片段大片段(Klenow fragmentKlenow fragment)5 5 3 3 聚合功能聚合功能 3 5 3 5 外切酶活性外切酶活性5353外切酶活性外切酶活性5)DNA pol I5)DNA pol I功能:功能:是原核生物复制延长中真正起催化作用的酶。是原核生物复制延长中真正起催化作用的酶。 DNA-pol :由十种亚基组成,其中:由十种亚基组成,其中亚基具有亚基具有
15、53 聚合聚合 DNA 的酶活性,因而具有复制的酶活性,因而具有复制 DNA 的功能;而的功能;而 亚基具有亚基具有 3 5 外切外切酶的活性,因而与酶的活性,因而与 DNA 复制的校正功能有关。复制的校正功能有关。 (250 kD)6) DNA-pol 2. 真核生物的真核生物的DNA聚合酶聚合酶 DNA-pol : 起始引发,有引物酶活性。起始引发,有引物酶活性。 DNA-pol : 参与低保真度的复制参与低保真度的复制 。 DNA-pol : 线粒体线粒体 DNA 复制中起催化作用。复制中起催化作用。 DNA-pol : 延长子链的主要酶,有解螺旋酶活性。延长子链的主要酶,有解螺旋酶活性
16、。 DNA-pol : 复制过程中起校读、修复和填补缺口的作用复制过程中起校读、修复和填补缺口的作用。l在真核生物中,目前发现的在真核生物中,目前发现的 DNA 聚合酶有五种,聚合酶有五种,分别命名为分别命名为 DNA 聚合酶聚合酶 (pol ),),DNA 聚合酶聚合酶 (pol ),),DNA 聚合酶聚合酶 (pol ),),DNA 聚合酶聚合酶 (pol ),),DNA 聚合酶聚合酶 (pol )。)。l其中,参与染色体其中,参与染色体 DNA 复制的是复制的是 pol (延长随从(延长随从链)和链)和 pol (延长领头链),参与线粒体(延长领头链),参与线粒体 DNA 复复制的是制的
17、是 pol ,pol 与与 DNA 损伤修复、校读和填补损伤修复、校读和填补缺口有关,缺口有关,pol 只在其他聚合酶无活性时才发挥作只在其他聚合酶无活性时才发挥作用。用。 真核生物的真核生物的DNA聚合酶聚合酶填填补补引引物物空空隙隙,切切除除修修复复,重重组组延延长长子子链链的的主主要要酶酶,解解螺螺旋旋酶酶活活性性线线粒粒体体DNA复复制制低低保保真真度度的的复复制制起起始始引引发发,引引物物酶酶活活性性功功能能+-3 5 核核酸酸外外切切酶酶活活性性高高高高高高?中中5 3 聚聚合合活活性性25.512.514.04.016.5分分子子量量(kD)DNA-pol填填补补引引物物空空隙隙
18、,切切除除修修复复,重重组组延延长长子子链链的的主主要要酶酶,解解螺螺旋旋酶酶活活性性线线粒粒体体DNA复复制制低低保保真真度度的的复复制制起起始始引引发发,引引物物酶酶活活性性功功能能+-3 5 核核酸酸外外切切酶酶活活性性高高高高高高?中中5 3 聚聚合合活活性性25.512.514.04.016.5分分子子量量(kD)DNA-pol3. DNA 连接酶连接酶 DNA 连接酶连接酶(DNA ligase)作用方式作用方式 DNA 连接酶催化的条件连接酶催化的条件 功能功能1) DNA 连接酶连接酶(DNA ligase)作用方式作用方式 连接连接 DNA 链链 3 -OH 末端和相邻末端和
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