第十章-dna生物合成-复制201幻灯片课件.ppt
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1、DNADNA的生物合成的生物合成(复制)(复制)DNA BiosynthesisDNA Biosynthesis第第 九九 章章本章内容本章内容第一节第一节 DNADNA复制的特点复制的特点第二节第二节 DNADNA复制的酶学复制的酶学第三节第三节 DNADNA生物合成过程生物合成过程第四节第四节 逆转录逆转录第五节第五节 DNADNA损伤与修复损伤与修复 DNADNA是生物遗传的主要物质基础,生物体的是生物遗传的主要物质基础,生物体的遗传信息以密码的形式编码在遗传信息以密码的形式编码在DNADNA分子上,表现分子上,表现为特定的核苷酸排列顺序,并通过为特定的核苷酸排列顺序,并通过DNADNA
2、的复制由的复制由亲代传递给子代。在后代的生长发育过程中,亲代传递给子代。在后代的生长发育过程中,遗传信息自遗传信息自DNADNA转录给转录给RNA,RNA,然后翻译成特异的蛋然后翻译成特异的蛋白质,以执行各种生命功能,使后代表现出与白质,以执行各种生命功能,使后代表现出与亲代相似的遗传性状。亲代相似的遗传性状。 中心法则中心法则19581958年年,Crick,Crick在总结了遗传信息从在总结了遗传信息从DNADNA到蛋白质的到蛋白质的流动方向之后,提出了中心法则(流动方向之后,提出了中心法则(central dogmacentral dogma) 中心法则中心法则 代表了大多数生物遗传信息
3、贮存和表代表了大多数生物遗传信息贮存和表达的规律,并奠定了在分子水平上研究生命科学达的规律,并奠定了在分子水平上研究生命科学关键问题的理论基础。关键问题的理论基础。从从DNADNA到蛋白质,通过转录和翻译,用基因的遗到蛋白质,通过转录和翻译,用基因的遗传信息在细胞内合成有功能意义的各种蛋白质,传信息在细胞内合成有功能意义的各种蛋白质,这就是这就是基因表达(基因表达(gene expressiongene expression)。)。 19701970年,年,TeminTemin阐明了反转录现象的机制阐明了反转录现象的机制 Reverse transcriptionDNADNA复制的特点复制的特
4、点第一节第一节一、半保留复制一、半保留复制(semiconservative(semiconservative replication)replication)(一)概念(一)概念(二)实验依据:密度梯度实验(二)实验依据:密度梯度实验(三)生物学意义:(三)生物学意义: 1.1.保证遗传信息传递的忠实性保证遗传信息传递的忠实性 2.2.遗传和变异的统一遗传和变异的统一(一)(一)DNADNA半保留复制概念半保留复制概念 DNADNA进行复制时,双螺旋结构解开而成两股单进行复制时,双螺旋结构解开而成两股单链,各自作为模板(链,各自作为模板(templatetemplate),用于合成新的),用
5、于合成新的互补链(互补链(complementary strand complementary strand )。子代细胞出)。子代细胞出现新的现新的DNADNA双链,其中双链,其中一股单链是从亲代完整地接一股单链是从亲代完整地接受过来的,另一股单链完全重新合成,受过来的,另一股单链完全重新合成,即两个子即两个子细胞的细胞的DNADNA双链,都和母细胞双链,都和母细胞DNADNA碱基序列完全一碱基序列完全一致。致。AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTGAGGTACTGCCACTGG
6、TCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC+母链母链DNA 复制过程中形成复制过程中形成的复制叉的复制叉子代子代DNA 19581958年由年由M. MeselsonM. Meselson 和和 F. Stahl F. Stahl 所完成的实所完成的实验所证明。验所证明。将大肠杆菌在含将大肠杆菌在含1515N N的培养基中培养约十五代,的培养基中培养约十五代,使其使其DNADNA中的碱基氮均转变为中的碱基氮均转变为1515N N。然后将大肠杆。然后将大肠杆菌移至只含菌移至只含1414N N的培养基中同步培养一代、二代、的培养基中同步培养一代、二代
7、、三代。分别提取三代。分别提取DNADNA,作密度梯度离心,将具有,作密度梯度离心,将具有不同密度的不同密度的DNADNA分离开。分离开。(二)(二)DNADNA半保留复制的实验证明半保留复制的实验证明密度梯度实验密度梯度实验 实验结果支持实验结果支持半保留复制半保留复制的设想。的设想。含重氮含重氮-DNA的细菌的细菌培养于普培养于普通培养液通培养液 第一代第一代继续培养于继续培养于普通培养液普通培养液 第二代第二代梯度离心结果梯度离心结果二、双向复制二、双向复制(bidirectional replication)(bidirectional replication) 原核生物复制时,原核生
8、物复制时,DNADNA从起始点从起始点(origin)(origin)向向两个方向解链,形成两个延伸方向相反的复制叉,两个方向解链,形成两个延伸方向相反的复制叉,称为双向复制。称为双向复制。A. A. 环状双链环状双链DNADNA及复制起始点及复制起始点B. B. 复制中的两个复制叉复制中的两个复制叉C. C. 复制接近终止点复制接近终止点(termination, ter(termination, ter) )oriterA B C53oriorioriori535533553复制子复制子3真核生物复制多个起始点真核生物复制多个起始点三、半不连续复制三、半不连续复制(semi-discont
9、inuous (semi-discontinuous replication)replication)顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,这股链称为这股链称为领头链。领头链。另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称为为随从链随从链。复制中的不连续片段称为。复制中的不连续片段称为岡崎片段岡崎片段(okazaki(okazaki fragment) fragment)。 领头链连续复制而随从链不连续复制,就是领头链连续复制而
10、随从链不连续复制,就是复制复制的半不连续性。的半不连续性。3 5 3 5 解链方向解链方向3 5 3 3 5 领头链领头链(leading strand)随从链随从链(lagging strand)四、需要四、需要RNARNA引物引物(primer)(primer) DNADNA聚合酶不能直接聚合游离的聚合酶不能直接聚合游离的dNTPdNTP,必须由一,必须由一段核酸片段提供段核酸片段提供33OHOH末端。末端。DNADNA复制的酶学复制的酶学第二节第二节一、一、DNADNA复制的体系复制的体系 (一)底物:(一)底物:dNTPdNTP, N=A,T,C,G, N=A,T,C,G (二)模板:
11、(二)模板:DNADNA单链单链 (三)引物:(三)引物:RNARNA,提供,提供3 3 -OH-OH末端使末端使dNTPdNTP可可以依次聚合以依次聚合 (四)酶和蛋白质因子:(四)酶和蛋白质因子:(dNMP)n + dNTP (dNMP)n+1 + PPi 二、二、DNADNA复制的酶学复制的酶学 (一)(一)解螺旋酶解螺旋酶(helicasehelicase) 可以将可以将DNADNA双链解开成为单链。大肠杆菌中双链解开成为单链。大肠杆菌中发现的解螺旋酶为发现的解螺旋酶为DnaBDnaB。(二)(二)DNADNA拓扑异构酶拓扑异构酶DNADNA (topoisomerasetopoiso
12、merase) 通过切断并连接通过切断并连接DNADNA双链中的一股或双股,改变双链中的一股或双股,改变DNADNA分子拓扑构象,避免分子拓扑构象,避免DNADNA分子打结、缠绕、连环,在复制分子打结、缠绕、连环,在复制的全程中都起作用。的全程中都起作用。 类型:拓扑异构酶类型:拓扑异构酶I I和拓扑异构酶和拓扑异构酶IIII。l拓扑异构酶拓扑异构酶I I:能切断能切断DNADNA双链中一股并再连接断双链中一股并再连接断端,反应不需端,反应不需ATPATP供能;供能;l拓扑异构酶拓扑异构酶IIII:能使能使DNADNA双链同时发生断裂和再连双链同时发生断裂和再连接,需接,需ATPATP供能。供
13、能。1010 8 8 局部解链后局部解链后 解链过程中,解链过程中,DNADNA分子会过度拧紧、打结、分子会过度拧紧、打结、缠绕、连环等现象。缠绕、连环等现象。(三)(三)DNADNA单链结合蛋白单链结合蛋白 (single chain binding protein-SSBsingle chain binding protein-SSB) 可以维持模板的单链状态并保护模板不受核可以维持模板的单链状态并保护模板不受核酸酶的降解。随着酸酶的降解。随着DNADNA双链的不断解开,双链的不断解开,SSBSSB能不能不断的与之结合、解离。断的与之结合、解离。(四)引物酶(四)引物酶(primasepr
14、imase) 是一种是一种RNARNA聚合酶,在复制的起始点处以聚合酶,在复制的起始点处以DNADNA为模板,催化合成一小段互补的为模板,催化合成一小段互补的RNARNA。引物酶能直。引物酶能直接在单链接在单链DNADNA模板上催化游离的模板上催化游离的NTPNTP合成一小段合成一小段RNARNA,并由这一小段并由这一小段RNARNA引物提供引物提供3-OH3-OH, 经经DNADNA聚合酶聚合酶催化链的延伸。催化链的延伸。 (五)(五)DNADNA聚合酶聚合酶 全称:全称:依赖依赖DNADNA的的DNADNA聚合酶聚合酶 (DNA-dependent (DNA-dependent DNA p
15、olymerase)DNA polymerase) 简称:简称:DNA-polDNA-pol 活性活性: 5 53 3 的聚合活性的聚合活性 5 53 3 核酸外切酶活性核酸外切酶活性 3 35 5 核酸外切酶活性核酸外切酶活性 5 A G C T T C A G G A T A 3 | | | | | | | | | | |3 T C G A A G T C C T A G C G A C 5 3 5 外切酶活性外切酶活性 5 3 外切酶活性外切酶活性?能切除突变的能切除突变的 DNA片段。片段。能辨认错配的碱基对,并将其水解。能辨认错配的碱基对,并将其水解。 1 1、原核生物的、原核生物的
16、DNADNA聚合酶聚合酶催化催化DNA聚合聚合参与参与DNA损损伤的应急状伤的应急状态修复态修复修复合成、修复合成、切除引物、切除引物、填补空隙填补空隙功能功能2040400分子数分子数/细胞细胞1011亚基数亚基数+-+5 外切酶活性外切酶活性+ 5 外切酶活性外切酶活性+5 聚合酶活性聚合酶活性pol IIIpol IIpol I功能功能:对复制中的错误进行校读,对复制和对复制中的错误进行校读,对复制和修复中出现的空隙进行填补。修复中出现的空隙进行填补。DNA-pol (109kD)323个氨基酸个氨基酸小片段小片段5 核酸外切酶活性核酸外切酶活性大片段大片段/Klenow 片段片段 60
17、4个氨基酸个氨基酸DNA聚合酶活性聚合酶活性 5 核酸外切酶活性核酸外切酶活性N 端端C 端端木瓜蛋白酶木瓜蛋白酶DNA-pol Klenow片段是实验室合成片段是实验室合成DNA,进行,进行分子生物学研究中常用的工具酶。分子生物学研究中常用的工具酶。 DNA-pol (120kD) DNA-pol II基因发生突变,细菌依然能存活。基因发生突变,细菌依然能存活。 它参与它参与DNA损伤的应急状态修复。损伤的应急状态修复。 功能功能是原核生物复制延长中真正起催化作用的酶。是原核生物复制延长中真正起催化作用的酶。 DNA-pol (250kD) 2 2、真核生物的、真核生物的DNADNA聚合酶聚
18、合酶DNA-pol 起始引发,有引物酶活性起始引发,有引物酶活性DNA-pol 参与低保真度的复制参与低保真度的复制 DNA-pol 在线粒体在线粒体DNA复制中起催化作用复制中起催化作用DNA-pol 延长子链的主要酶,有解螺旋酶活性延长子链的主要酶,有解螺旋酶活性DNA-pol 校读、修复和填补缺口校读、修复和填补缺口(六)(六)DNADNA连接酶连接酶 (DNA ligaseDNA ligase) 连接连接DNADNA链链3 3 -OH-OH末端和相邻末端和相邻DNADNA链链5 5 -P-P末端,末端,使二者生成磷酸二酯键,从而把两段相邻的使二者生成磷酸二酯键,从而把两段相邻的DNAD
19、NA链链连接成一条完整的链。连接成一条完整的链。POO-O-OHO5POO-O-O335DNA连接酶连接酶ATPADP5353酶-AMP-P-DNA酶-AMPEnzyme-三、三、DNADNA复制的保真性复制的保真性(一)酶学依据:(一)酶学依据: 1.1.核酸外切酶活性和校读;核酸外切酶活性和校读; 2.2.复制的保真性和碱基选择。复制的保真性和碱基选择。(二)机制:(二)机制: 1.1.遵守严格的碱基配对规律;遵守严格的碱基配对规律; 2.2.聚合酶在复制延长中对碱基的选择功能;聚合酶在复制延长中对碱基的选择功能; 3.3.复制出错时有即时的校读功能。复制出错时有即时的校读功能。DNADN
20、A生物合成过程生物合成过程第三节第三节一、原核生物一、原核生物DNADNA生物合成生物合成(一)起始阶段(一)起始阶段 1.1.辨认起始点,形成单链辨认起始点,形成单链 2.2.合成引发体合成引发体 3.3.合成引物合成引物E.coliE.coli复制起始点复制起始点 oriCoriC GATTNTTTATTT GATCTNTTNTATT GATCTCTTATTAG 1 13 17 29 32 44 1 13 17 29 32 44 TGTGGATTA-TTATACACA-TTTGGATAA-TTATCCACA58 66 166 174 201 209 237 24558 66 166 174
21、 201 209 237 245 串联重复序列串联重复序列 反向重复序列反向重复序列5 3 5 3 3个个13bp串联重复序列:串联重复序列:AT丰富,易丰富,易解链解链4个个9bp (2组)反向重复序列组)反向重复序列复制子 Dna A Dna B、 Dna CDNA拓扑异构酶拓扑异构酶引物引物酶酶SSB3 5 3 5 引发体和引物引发体和引物含有解螺旋酶、含有解螺旋酶、DnaCDnaC蛋白、引物酶和蛋白、引物酶和DNADNA复复制起始区域的复合结构称为制起始区域的复合结构称为引发体。引发体。 理顺理顺DNA链链拓扑异构酶拓扑异构酶 (gyrA, B)稳定已解开的单链稳定已解开的单链单链单链
22、DNA结合蛋白结合蛋白SSB催化催化RNA引物生成引物生成引物酶引物酶DnaG (dnaG)运送和协同运送和协同DnaBDnaC (dnaC)解开解开DNA双链双链解螺旋酶解螺旋酶DnaB (dnaB)辨认起始点辨认起始点DnaA (dnaA)蛋白质(基因)蛋白质(基因)通用名通用名功能功能原核生物复制起始的相关蛋白质原核生物复制起始的相关蛋白质3 5 3 5 引物是由引物酶催化合成的短链引物是由引物酶催化合成的短链RNARNA分子。分子。 引物引物3 HO5引物引物酶酶(二)延长阶段(二)延长阶段 复制的延长指在复制的延长指在DNA-polDNA-pol催化下,催化下,dNTPdNTP以以d
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