第32章rna的生物合成与加工.ppt课件.ppt
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- 32 rna 生物 合成 加工 ppt 课件
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1、第第3232章章 RNARNA的生物合成与加工的生物合成与加工转录产物有转录产物有mRNAmRNA、tRNAtRNA、rRNArRNA。原核细胞的原核细胞的mRNAmRNA为单顺反子或多顺反子。为单顺反子或多顺反子。真核细胞的真核细胞的mRNAmRNA为单顺反子。为单顺反子。有义链,编码链;反义链,模板链有义链,编码链;反义链,模板链E.coliE.coli 的的RNARNA聚合酶中,聚合酶中,2 2称为核心酶。称为核心酶。因子辨认模板因子辨认模板DNADNA的起始位点。的起始位点。基因的转录基因的转录 mRNA mRNA的合成的合成 基因转录是以基因转录是以DNADNA为模板合成与其碱基顺为
2、模板合成与其碱基顺序互补的序互补的mRNAmRNA的过程。的过程。 细胞生长周期的某个阶段,细胞生长周期的某个阶段,DNADNA双螺旋解双螺旋解开成为转录模板,在开成为转录模板,在RNARNA聚合酶催化下,聚合酶催化下,合成合成mRNAmRNA。mRNAmRNA不能自我复制,即其本不能自我复制,即其本身不能作为复制模板,因此在转录过程身不能作为复制模板,因此在转录过程中即使出现某些差错,也不会遗传下去。中即使出现某些差错,也不会遗传下去。 基因表达的第一步基因表达的第一步 以以D. S. DNA中的一条单链作为转录的模板中的一条单链作为转录的模板 在在依赖依赖DNA的的RNA聚合酶聚合酶的作用
3、下的作用下 模板单链模板单链 DNA的极性方向为的极性方向为3 5, 而非模板单链而非模板单链 DNA的极性方向与的极性方向与RNA链相同,均为链相同,均为5 3.DNA(书写书写DNA序列时,仅写非模板序列,可不注明极性方向序列时,仅写非模板序列,可不注明极性方向)3-TACTCAT-5RNA 5-AUGAGUA-35-ATGAGTA-3 Non-template (sense strand)template (antisense strand)若若 干干 基基 本本 概概 念念 按按A U,C G 配对的原则,合成配对的原则,合成RNA分子分子 某一基因只以一条单链某一基因只以一条单链DN
4、A DNA 为模板进行转录(为模板进行转录(不对称转录不对称转录) RNA RNA的转录包括的转录包括promotion, elongation, termination promotion, elongation, termination 三过程三过程 从启动子(从启动子(promoterpromoter)到终止子()到终止子(terminatorterminator)称)称为转录单位为转录单位 (transcriptional unittranscriptional unit) 原核生物中的转录单位多为原核生物中的转录单位多为 polycistron in operonpolycistro
5、n in operon 转录原点记为转录原点记为+1+1,其上游记为负值,下游记为正值,其上游记为负值,下游记为正值 真核生物中的转录单位多为真核生物中的转录单位多为monocistron, No operonmonocistron, No operon +1+1 - -10 10 +10+10upstreamupstreamstart start pointpointdownstreamdownstream转录过程转录过程mRNA合成注意:注意:RNARNA聚合酶与启动子结合启始转录聚合酶与启动子结合启始转录 RNARNA的合成从的合成从5 5,到到3 3,模板是模板是3 3,到到5 5,
6、只有一条只有一条DNADNA链可以转录链可以转录 转录后转录后DNADNA恢复双链结构恢复双链结构体外,两条体外,两条DNADNA均可转录均可转录DNADNA以全保留的方式转录以全保留的方式转录核心酶可以延伸,核心酶可以延伸,因子启始合成、识别启动子因子启始合成、识别启动子转录速度比复制慢,与翻译速度相近转录速度比复制慢,与翻译速度相近因子的存在影响核心酶的构象:因子的存在影响核心酶的构象:降低了酶与降低了酶与DNADNA的结合常数与停留时间的结合常数与停留时间增加了与启动子的结合常数和停留时间增加了与启动子的结合常数和停留时间起始后起始后因子脱离,因子脱离,RNARNA延伸延伸不同的不同的因
7、子识别不同类型的启动子因子识别不同类型的启动子转录过程的选择性抑制转录过程的选择性抑制放线菌素放线菌素D D是原核和真核细胞是原核和真核细胞RNARNA聚合酶的聚合酶的专一抑制剂。专一抑制剂。利福平利福平是原核细胞是原核细胞RNARNA聚合酶的抑制剂。聚合酶的抑制剂。-鹅膏蕈碱鹅膏蕈碱是真核细胞是真核细胞RNARNA聚合酶的抑聚合酶的抑制剂。制剂。一、转录的不对称性一、转录的不对称性 转录转录(transcription)(transcription)的不对称性就是指以的不对称性就是指以双链双链DNADNA中的一条链作为模板进行转录,从中的一条链作为模板进行转录,从而将遗传信息由而将遗传信息由
8、DNADNA传递给传递给RNARNA。有意义链有意义链反意义链反意义链555533335555对于不同的基因来说,其转录信息可以存在于两对于不同的基因来说,其转录信息可以存在于两条不同的条不同的DNADNA链上。能够转录链上。能够转录RNARNA的那条的那条DNADNA链称为链称为有意义链有意义链( (模板链),而与之互补的另一条模板链),而与之互补的另一条DNADNA链链称为称为反意义链反意义链(编码链)。(编码链)。二、转录的连续性二、转录的连续性 RNARNA转录合成时,以转录合成时,以DNADNA作为模板,在作为模板,在RNARNA聚合酶的催化下,连续合成一段聚合酶的催化下,连续合成一
9、段RNARNA链,链,各条各条RNARNA链之间无需再进行连接。链之间无需再进行连接。 合成的合成的RNARNA中,如只含一个基因的遗传信中,如只含一个基因的遗传信息,称为息,称为单顺反子单顺反子;如含有几个基因的遗;如含有几个基因的遗传信息,则称为传信息,则称为多顺反子多顺反子。 三、转录的单向性三、转录的单向性RNARNA转录合成时,只能向一个方向进行聚转录合成时,只能向一个方向进行聚合,所依赖的模板合,所依赖的模板DNADNA链的方向为链的方向为3535,而而RNARNA链的合成方向为链的合成方向为5353。 四、有特定的起始和终止位点四、有特定的起始和终止位点 RNARNA转录合成时,
10、只能以转录合成时,只能以DNADNA分子中的某一分子中的某一段作为模板,故存在特定的起始位点和特段作为模板,故存在特定的起始位点和特定的终止位点,特定起始点和特定终止点定的终止位点,特定起始点和特定终止点之间的之间的DNADNA链构成一个链构成一个转录单位转录单位,通常由,通常由转录区和有关的调节顺序构成。转录区和有关的调节顺序构成。 一、底物一、底物四种核糖核苷酸,即四种核糖核苷酸,即ATPATP,GTPGTP,CTPCTP,UTPUTP。 二、模板二、模板以一段单链以一段单链DNADNA作为模板。作为模板。 三、三、RNARNA聚合酶聚合酶这是一种不同于引物酶的依赖这是一种不同于引物酶的依
11、赖DNADNA的的RNARNA聚聚合酶。该酶在单链合酶。该酶在单链DNADNA模板以及四种核糖模板以及四种核糖核苷酸存在的条件下,不需要引物,即可核苷酸存在的条件下,不需要引物,即可从从5353聚合聚合RNARNA。 亚亚基基 功功能能 与与模模板板DNA结结合合 起起始始和和催催化化合合成成 识识别别起起始始点点,稳稳定定全全酶酶 转转录录的的特特异异性性 原核生物中的原核生物中的RNARNA聚合酶全酶由五个亚基构成,即聚合酶全酶由五个亚基构成,即2 2。 亚基与转录起始点的识别亚基与转录起始点的识别有关,而在转录合成开始后有关,而在转录合成开始后被释放,余下的部分(被释放,余下的部分(2
12、2)被称为)被称为核心酶,与核心酶,与RNARNA链的聚合链的聚合有关。有关。 大肠杆菌大肠杆菌RNARNA聚合酶全酶聚合酶全酶Rifampin是是RNA合成起始的抑制剂合成起始的抑制剂 种种类类 亚亚细细胞胞定定位位 对对-鹅鹅膏膏蕈蕈碱碱敏敏感感性性 功功能能 RNA pol 核核仁仁 不不敏敏感感 合合成成rRNA前前体体 RNA pol 核核基基质质 极极敏敏感感 合合成成HnRNA RNA pol 核核基基质质 敏敏感感 合合成成tRNA前前体体 snRNA及及5S rRNA 真核生物中的真核生物中的RNARNA聚合酶可按其对聚合酶可按其对-鹅膏鹅膏蕈碱敏感性而分为三种,它们均由蕈碱
13、敏感性而分为三种,它们均由10101212个大小不同的亚基所组成,结构非常复杂,个大小不同的亚基所组成,结构非常复杂,其功能也不同。其功能也不同。 酵母酵母RNARNA聚合酶聚合酶和和四、终止因子四、终止因子 1 1蛋白蛋白:这是一种六聚体的蛋白质,:这是一种六聚体的蛋白质,亚基的分子量为亚基的分子量为50kd50kd。该蛋白因子能识别。该蛋白因子能识别终止信号,并能与终止信号,并能与RNARNA紧密结合,导致紧密结合,导致RNARNA的释放。的释放。 2 2nusAnusA蛋白:为一分子量蛋白:为一分子量69kd69kd的酸性的酸性蛋白,它能与蛋白,它能与RNARNA及及RNARNA聚合酶相
14、结合,在终聚合酶相结合,在终止部位使两者被释放。止部位使两者被释放。 NusA protein ; 69 Kd, acid protein RNApol-attaching factor Impel RNApol. pausing in terminator for 1-15 and waiting for Rho factor to stop transcription of RNA After initiation substituting NusA + core E (antitermination N protein utilization substance) 五、激活因子五、激活因
15、子 目前已知激活因子为目前已知激活因子为降解产物基因激活蛋白降解产物基因激活蛋白(CAPCAP),又称为),又称为cAMPcAMP受体蛋白(受体蛋白(CRPCRP)。是。是一种二聚体蛋白质,亚基分子量为一种二聚体蛋白质,亚基分子量为23kd23kd。该。该蛋白与蛋白与cAMPcAMP结合后,刺激结合后,刺激RNARNA聚合酶与起始聚合酶与起始部位结合,从而起始转录过程。部位结合,从而起始转录过程。 一、识别一、识别 原核生物原核生物RNARNA聚合酶中的聚合酶中的因子识别转录起始点,因子识别转录起始点,并促使核心酶结合形成全酶复合物。并促使核心酶结合形成全酶复合物。 被辨认的区段就是位于转录起
16、始点被辨认的区段就是位于转录起始点-35-35区的区的TTGACATTGACA序列序列。 RNARNA聚合酶识别聚合酶识别酶与该区结合后,即滑动至酶与该区结合后,即滑动至-10-10区的区的TATAATTATAAT序列序列(PribnowPribnow盒)盒) ,并启动转录。有利于,并启动转录。有利于DNADNA局部局部解开双链解开双链 原核生物中转录起始区的共同序列原核生物中转录起始区的共同序列 R -35 B -10I +1 Sextama BoxPribnow BoxInitiationl位于基因上游,与位于基因上游,与RNARNA聚合酶识别、结聚合酶识别、结合并起始转录有关的一些合并起
17、始转录有关的一些DNADNA顺序称为顺序称为启启动子动子(promoter)promoter)。 l转录起始的第一个核苷酸是转录起始的第一个核苷酸是pppGpppG或或pppApppA Core promoter region including Sextama Box ; RNApol. recognition site (R site)TTGAC (Sextama Box)-35 site RNApol. loosely binding sitePribnow Box ; TATAAT (pribnow Box) -10 site RNApol. firmly binding site (
18、B site)Initiation site ; +1 RNA transcriptional startpoint (I site) A/G-35 (R)-10 (B)+1 (I)RNAl Sextama Box 与与Pribnow Box 间距间距17bp, 有利于有利于RNApol启动启动l Sextama Box or Pribnow Box mut. 间距间距趋近趋近于于17 bp,up mutation间距间距远离远离于于17 bp,down mutation17bp的的间距间距较较17bp的的序列序列对转录更为重要对转录更为重要Sextama Box and Pribnow Bo
19、x mut. 转录率下降转录率下降100X 转录率下降转录率下降1000X因子;因子; 重复使用重复使用(Re-usable) 使使 Holo-enzyme识别识别Sextama Box, 与模板链结合与模板链结合 修饰修饰 RNApol 构型,构型,降低全酶与降低全酶与DNA的非专一性结合力的非专一性结合力(107/mol) 增强全酶与增强全酶与R, B site的专一性结合力的专一性结合力 (1014/mol)导致导致RNA链的延伸缓慢链的延伸缓慢Promoter与与factor 间的结合专效性间的结合专效性 决定了决定了 strong promoter & weak promoter 不
20、同启动子的不同启动子的-35,-10区序列间存在较为区序列间存在较为 保守的标准序列保守的标准序列( 标准启动子标准启动子 ) 启动子中启动子中-35, -10 区序列的差异影响与区序列的差异影响与 RNApol 中中 因子的结合能力因子的结合能力 factor is responsible for recognition of consensus sequence of promoter and only required for initiation.l真核生物的转录起始区上游也存在一段富真核生物的转录起始区上游也存在一段富含含TATA的顺序,被称为的顺序,被称为HognessHognes
21、s盒盒或或TATATATA盒。盒。 l除此之外,在真核生物中还可见到其他除此之外,在真核生物中还可见到其他带共性的序列,如带共性的序列,如CAATCAAT盒及盒及GCGC盒盒等。等。Promoter for basic transcription ( class II recognized by RNA polymerase II ) l Cap site ; initiation point (+1) Capping m7GpppA/G-70 -AUG-(in mRNA)1-4Kb -70 -30 +1 GC island CAAC/T box TATA box Cap Enhancer U
22、PE core promoter Promoter (basic factor) Initiation region PyPyANT/(A)PyPy Promoter for basic transcription l TATA box / Hogness box / Goldberg-Hogness box (-30) Rich AT and rich GC flanked rich GC-T A T A A (T) A A (T)-rich GC 82 97 93 85 63 (37) 83 50 (37)1-4Kb -70 -30 +1 GC island CAAC/T box TATA
23、 box Cap Enhancer UPE core promoter Promoter (basic factor) Promoter for basic transcription l GC island (C no methylated) and CAAT box (CAT box UPE) (-70) GCGC-GGC(T)CAATCT- Response to effect of transcription Range 30 bp 1-4Kb -70 -30 +1 GC island CAAC/T box TATA box Cap Enhancer UPE core promoter
24、 Promoter (basic factor) l Promoter functions CAAT box (modulator) controlling transcriptional efficiency (cause GC island) TATA box (selector) controlling starting point and efficiency I site (initiator)determination initiation point and capping of mRNA 真核生物的转录起真核生物的转录起始较为复杂。目前始较为复杂。目前已知已知RNARNA聚合酶
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