自然界所有的生命物体都由三类物质组成课件.ppt
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1、化学生物学生物化学基础刘刘 洛洛 生生Tel: 82378E-mail: 关于我们的书参考书目参考书目v生物化学生物化学 古练权,古练权, 高等教育出版社高等教育出版社v医学生物化学医学生物化学 周爱儒,人民卫生出版社周爱儒,人民卫生出版社v生物化学生物化学( (上下)上下) 王镜岩,王镜岩, 高等教育出版社高等教育出版社学习成绩评议方式学习成绩评议方式1 1、课堂小作业、自学笔记、课堂小作业、自学笔记10%10%2 2、文献综述、文献综述10%10%。3 3、期末考试:全面的复习、书上及课堂、期末考试:全面的复习、书上及课堂 讲过的内容讲过的内容80%80%绪 论 化学生物学与生物化学定义化
2、学生物学与生物化学定义 生物化学的基本内容生物化学的基本内容 化学生物学主要研究方向简介化学生物学主要研究方向简介: 化学、生物化学与其他学科的关系化学、生物化学与其他学科的关系 学习过程中应注意的问题学习过程中应注意的问题化学生物学化学生物学 通过用化学的理论和方法研究通过用化学的理论和方法研究生命现象生命现象、生命过程、生命过程的化学基础,通过探索干预和调整疾病发生发展的途径的化学基础,通过探索干预和调整疾病发生发展的途径和和机理机理,为,为新药新药发现中提供必不可少的理论依据。发现中提供必不可少的理论依据。是采用化学的手段是采用化学的手段, ,如运用如运用小分子小分子或人工设计或人工设计
3、合合成的分子成的分子作为配体来作为配体来直接直接改变生物分子的功能。改变生物分子的功能。 在某种意义上在某种意义上, , 使用小分子使用小分子调节调节目标蛋白质目标蛋白质, ,这这与制药公司发展新药类似与制药公司发展新药类似. . 生物化学生物化学研究生命现象化学本质的科学。研究生命现象化学本质的科学。具体讲:具体讲:用化学的理论和方法研究生物体的化学用化学的理论和方法研究生物体的化学组成、结构、功能和生命活动过程中物质及能量组成、结构、功能和生命活动过程中物质及能量变化规律变化规律、阐明生命现象的化学本质阐明生命现象的化学本质的学科。的学科。简单讲:简单讲:是生命的化学。是生命的化学。 生物
4、化学的基本内容包括生物化学的基本内容包括 : 发现和阐明构成生命物体的分子基础发现和阐明构成生命物体的分子基础 生物分子生物分子的的化学组成化学组成、结构结构和和性质性质 ; 生物分子生物分子的的结构、功能结构、功能与与生命现象生命现象的关系的关系 ; 生物分子生物分子在在生物机体中生物机体中的的相互作用相互作用及其及其变化规律变化规律。 生物体的化学组成生物体的化学组成 在地在地 球上存在的球上存在的 92 种天然元素中种天然元素中 , 只有只有 28 种元种元素在生物体内被发现。素在生物体内被发现。自然界所有的生命物体都由三类物质组成自然界所有的生命物体都由三类物质组成 : : 水水 约占
5、生物体质量的三分之二约占生物体质量的三分之二 , , 生物分子生物分子 约占三分之一约占三分之一 , , 无机离子无机离子 约占百分之一。约占百分之一。 元素组成:元素组成:C、H、O、N、P、S 及微量元素。及微量元素。 基本成分:基本成分: (1)蛋白质、核酸、多糖、脂类蛋白质、核酸、多糖、脂类 生物体四大基本组成,作为生物体骨架,生物体四大基本组成,作为生物体骨架, 提供能量。提供能量。 (2)维生素、激素、有机酸维生素、激素、有机酸次生物质次生物质 酶、维生素、激素酶、维生素、激素三者又称为三者又称为催化调节物质催化调节物质。 (3)无机盐和水无机盐和水 常见无机盐常见无机盐K、Na
6、、Ca、Mg盐等。盐等。 新陈代谢新陈代谢 生物体与外界环境进行生物体与外界环境进行物质交换物质交换与与 能量交换能量交换的过程。的过程。 同化作用:同化作用:对外物的吸收、加工和转化构成自对外物的吸收、加工和转化构成自 身的身的合成过程合成过程。 异化作用:异化作用:对内、外物对内、外物分解排泄过程分解排泄过程。生物体的生物体的物质代谢、能量转换物质代谢、能量转换和和代谢调节代谢调节代谢调控代谢调控是近代生物化学研究的一个重要方面是近代生物化学研究的一个重要方面生物体生物体活细胞活细胞内的内的数万数万个反应能在同一时间个反应能在同一时间互不干互不干扰、互相配合、有条不紊扰、互相配合、有条不紊
7、地在各自代谢途径中进行,地在各自代谢途径中进行,而且在而且在合成、分解速度和数量合成、分解速度和数量上,都恰到好处地合上,都恰到好处地合乎生物体的各种需要。乎生物体的各种需要。 生物体的信息代谢生物体的信息代谢 核酸核酸是遗传信息的携带者是遗传信息的携带者 蛋白质是蛋白质是生命信息表达生命信息表达 : 它的它的合成合成构成了生物体内遗传信息传递构成了生物体内遗传信息传递 的主要通路,的主要通路, 它的它的生物生物活性活性是表现生命活力所必需是表现生命活力所必需 生物体信息代谢的表征是生物体信息代谢的表征是分子生物学的研究核心。分子生物学的研究核心。化学与之生命的化学 2020世纪世纪7070年
8、后期,年后期,化学家化学家在应用在应用有机化学、分析化有机化学、分析化学的理论和方法在学的理论和方法在分子水平上分子水平上研究生命现象的化学研究生命现象的化学本质本质形成了形成了生物化学的分支生物化学的分支生物有机化学、生生物有机化学、生物分析化学物分析化学。 随后开始有意识地深入探讨生命体的无机化学组成随后开始有意识地深入探讨生命体的无机化学组成(除碳、氮、氧、氢之外的各种无机元素)与活动(除碳、氮、氧、氢之外的各种无机元素)与活动状况,又促成了生物化学与无机化学的结合,从而状况,又促成了生物化学与无机化学的结合,从而出现了新的边缘学科出现了新的边缘学科-生物无机化学生物无机化学。 目前化学
9、家开始尝试用:目前化学家开始尝试用: 外源性活性小分子为探针,去探讨生物体中的分外源性活性小分子为探针,去探讨生物体中的分子间相互作用和细胞发育与分化的调控作用及其子间相互作用和细胞发育与分化的调控作用及其所包括的分子机制所包括的分子机制。 用化学的和生物学的技术、工具、理论来系用化学的和生物学的技术、工具、理论来系统研究生命体系,统研究生命体系,开创化学生物学研究领域开创化学生物学研究领域。 例如:食物、药物、农药和有例如:食物、药物、农药和有毒物质等。毒物质等。这些化学物质通这些化学物质通常被称为常被称为生理活性物质生理活性物质。它们对生物体内发生的生它们对生物体内发生的生物化学过程的调控
10、作用。物化学过程的调控作用。经过生活和实践的检验,人们发现,自己所服用的经过生活和实践的检验,人们发现,自己所服用的药物、所吃的食物和使用的用品以及家居环境中无处药物、所吃的食物和使用的用品以及家居环境中无处不存在化合物所造成的危害。不存在化合物所造成的危害。 营养食物营养食物 水果 蔬菜 谷物肉类 豆制品 蛋类 农药农药转基因转基因 抗生素抗生素激素激素瘦肉精瘦肉精 苏丹红苏丹红激素激素 石膏石膏卤水卤水吊白块吊白块 农药农药增熟剂增熟剂保鲜剂保鲜剂 农药农药增熟剂增熟剂保鲜剂保鲜剂 化学成化学成分分? 药物与毒物 毒物毒物在一定条件下,较在一定条件下,较小剂量即能够对机体产生损小剂量即能够
11、对机体产生损害作用或使机体出现异常反害作用或使机体出现异常反应的应的外源化学物外源化学物称为称为毒物毒物。 毒物与药物之间并毒物与药物之间并无绝对界无绝对界 限限,某种外源化学物在某些,某种外源化学物在某些特定的条件下可能是有毒的,特定的条件下可能是有毒的,而在另外一些条件下又可能而在另外一些条件下又可能是无毒的。是无毒的。 反式脂肪酸反式脂肪酸 (trans-fatty acids TFAstrans-fatty acids TFAs ” ” ) 俗称的人造脂肪(人造黄油)。俗称的人造脂肪(人造黄油)。 是制造植物油的过程中通过微生物与氢化技术产生是制造植物油的过程中通过微生物与氢化技术产生
12、的的人造植物油脂。人造植物油脂。 人造植物油脂:人造植物油脂:能延长食品的保质期能延长食品的保质期,增加食物的,增加食物的可口程度可口程度,可以让糕点变得更酥脆;,可以让糕点变得更酥脆;固定食品形状,固定食品形状,使其看上去比较美观。使其看上去比较美观。(过的食用毒害人体过的食用毒害人体) 长期以来长期以来,人们一直认为人造脂肪来自植物油,不会,人们一直认为人造脂肪来自植物油,不会像动物脂肪那样导致肥胖,像动物脂肪那样导致肥胖,多吃无害多吃无害。 含多不饱和脂肪的红花油、玉米油、棉子油可以含多不饱和脂肪的红花油、玉米油、棉子油可以减低减低胆固醇水平胆固醇水平,但是当氢化为反式脂肪酸时但是当氢化
13、为反式脂肪酸时,作用恰恰,作用恰恰相反,他们虽然不象饱和脂肪危害大,但是他们相反,他们虽然不象饱和脂肪危害大,但是他们升高升高血液胆固醇水平。血液胆固醇水平。 研究结果显示,对于研究结果显示,对于心血管疾病心血管疾病的发生的发生发展发展,人造脂,人造脂肪负有极大的责任,肪负有极大的责任,它导致心血管疾病的几率是饱和它导致心血管疾病的几率是饱和脂肪酸的脂肪酸的3-53-5倍,倍,甚至还会损害人们的甚至还会损害人们的认知功能。认知功能。 说明一下说明一下 反式脂肪酸问题并非食品安全问题,这反式脂肪酸问题并非食品安全问题,这只只是是一个一个营养问题营养问题, 不要过多的食用垃圾食品,不要过多的食用垃
14、圾食品, 为什么某些金属离子会引发疾病?会致癌?其真为什么某些金属离子会引发疾病?会致癌?其真正的化学本质是什么?正的化学本质是什么? 为什么表面活性剂对人体具有毒性?如何引起的?为什么表面活性剂对人体具有毒性?如何引起的? 为什么化学物质能够引起癌症?治疗癌症的药物为什么化学物质能够引起癌症?治疗癌症的药物是如何起作用的?是如何起作用的? 为什么毒品可以上瘾?为什么毒品可以上瘾?为什么?为什么? 揭示生命运动的化学本质揭示生命运动的化学本质发展生命调控的化学方法发展生命调控的化学方法提供生命研究的化学技术提供生命研究的化学技术 化学生物学的基本任务运用化学的原理、语言和工具认识生命问题运用化
15、学的原理、语言和工具认识生命问题 化学生物学主要研究方向简介化学生物学主要研究方向简介:(1) 蛋白质结构功能预测与分子设计蛋白质结构功能预测与分子设计 在后基因组时代所要解决的基本问题:在后基因组时代所要解决的基本问题: 基因产物基因产物蛋白质的结构、功能及调控机制蛋白质的结构、功能及调控机制。 _ 蛋白质蛋白质氨基酸序列氨基酸序列与其与其空间结构空间结构的关系。的关系。 利用利用理论理论及及模拟模拟的方法研究蛋白质序列与结构的关系,的方法研究蛋白质序列与结构的关系, 发展蛋白质结构预测的新方法;发展蛋白质结构预测的新方法; 通过蛋白质通过蛋白质-蛋白质、蛋白质蛋白质、蛋白质-小分子相互作用
16、研究进行小分子相互作用研究进行蛋白质功蛋白质功能预测能预测;在此基础上进行具有全新结构或;在此基础上进行具有全新结构或功能蛋白质功能蛋白质的的设计设计,并,并进行实验进行实验验证验证。(2) 蛋白质折叠及生物分子识别机制研究蛋白质折叠及生物分子识别机制研究与蛋白质结构预测相对应的问题是与蛋白质结构预测相对应的问题是: 蛋白质在溶液中是蛋白质在溶液中是如何折叠及组装如何折叠及组装成生物活性状态的。成生物活性状态的。利用利用圆二色光谱圆二色光谱、荧光光谱荧光光谱、微量量热微量量热与分子生物学实验及理与分子生物学实验及理论模拟相结合研究论模拟相结合研究: 蛋白质的折叠过程、蛋白质的折叠过程、 蛋白质
17、与其它分子识别的机制,蛋白质与其它分子识别的机制, 以及蛋白质自组装成为复杂结构的机理。以及蛋白质自组装成为复杂结构的机理。 (3) 基于结构的药物设计基于结构的药物设计 利用利用高通量高通量虚拟筛选及合理设计的方法进行虚拟筛选及合理设计的方法进行 药物先导物的发现,针对疾病相关的蛋白质药物先导物的发现,针对疾病相关的蛋白质靶标开展药物设计、合成及生物活性评价。靶标开展药物设计、合成及生物活性评价。 同时着重研究同时着重研究药物设计药物设计中的难点问题,如:中的难点问题,如: 药物与受体作用自由能计算、药物与受体作用自由能计算、 药物与受体作用结合过程中受体构象变化、药物与受体作用结合过程中受
18、体构象变化、 化合物毒副作用计算等。化合物毒副作用计算等。 (4)功能功能基因组和蛋白质组研究热点基因组和蛋白质组研究热点 以以功能基因功能基因开发为基础的开发为基础的“基因产业基因产业”正在形成:正在形成: 基因是基因是新兴生物制药新兴生物制药业的源头,业的源头, 对基因结构及其功能的阐明、发现对基因结构及其功能的阐明、发现 和鉴定具有重要和鉴定具有重要功能蛋白功能蛋白的的基因基因, 将是将是21世纪生物高技术企业开发新产品的基础,世纪生物高技术企业开发新产品的基础, 可为新药的开发带来决定性的影响。可为新药的开发带来决定性的影响。 美国科学家利用 小白鼠大脑癌细胞基因克隆出正常的鼠胚胎。操
19、作方法 从肿瘤细胞中取出受损DNA的细胞核, 注入到小鼠的卵细胞中。试验结果:卵细胞通过某种形式纠正了遗传错误, 发育成了一个正常胚胎。说明什么?某些基因被活化的同时,某些基因的信 号被关闭,调节了胚胎形成和发育Genentech 公司第一个基因工程公司第一个基因工程公司1976年:年: 27岁的风险投资人岁的风险投资人Robert Swanson与与 Herb Boyer教授(教授(University of California)共饮了几杯啤酒,讨论了基因工程技术的商业共饮了几杯啤酒,讨论了基因工程技术的商业前景。讨论结束时,他们决定建立一个公司,前景。讨论结束时,他们决定建立一个公司,并
20、取名为并取名为Genentech(Genetic Engineering Technology)。)。Genentech的骄人业绩1976Genentech创立创立1977首次在微生物里生产了人蛋白生长激素抑制素首次在微生物里生产了人蛋白生长激素抑制素1978克隆了人胰岛素基因克隆了人胰岛素基因1979克隆了人生长激素素基因克隆了人生长激素素基因1980公司上市,募集公司上市,募集$ 35million1982第一个基因重组药(人胰岛素)上市(转让给第一个基因重组药(人胰岛素)上市(转让给Lilly公司)公司)1984第一个第一个VIII因子,转让给因子,转让给Cutter Biologica
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