选修三.1.2.基因工程的基本操作程序课件.ppt
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- 选修 1.2 基因工程 基本 操作 程序 课件
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1、基因工程的基本操作程序基因工程的基本操作程序n(1)目的基因的获取)目的基因的获取n(2)n(3)将目的基因导入受体细胞)将目的基因导入受体细胞n(4)目的基因的检测与鉴定)目的基因的检测与鉴定基因基因表达载体表达载体的构建的构建一、目的基因的获取一、目的基因的获取1.什么叫基因文库?什么叫基因文库? 将含有某种生物不同基因的许多将含有某种生物不同基因的许多DNA片断,导入到片断,导入到中,中,各个受体菌分别含有这种生物的不同各个受体菌分别含有这种生物的不同基因,称为基因文库。基因,称为基因文库。基因文库基因文库 基因组文库基因组文库部分基因文库部分基因文库(cDNA文库)文库)基因组基因组D
2、NADNA文库文库cDNAcDNA文库文库基因组基因组DNADNA文库与文库与cDNAcDNA文库的比较文库的比较补:原核细胞的基因结构补:原核细胞的基因结构非非编码区编码区非非编码区编码区编码区编码区编码区上游编码区上游 编码区下游编码区下游 与与RNARNA聚合酶结合位点聚合酶结合位点启动子启动子终止子终止子 RNARNA聚合酶能够识别调控序列中的结合位点,聚合酶能够识别调控序列中的结合位点,并与其结合。并与其结合。 转录开始后,转录开始后,RNARNA聚合酶沿聚合酶沿DNADNA分子移动,分子移动,并以并以DNADNA分子的一条链为模板合成分子的一条链为模板合成RNARNA。 转录完毕后
3、,转录完毕后,RNARNA链释放出来,紧接着链释放出来,紧接着RNARNA聚合酶也从聚合酶也从DNADNA模板链上脱落下来。模板链上脱落下来。不能转录为信使不能转录为信使RNARNA,不能不能 编码蛋白质。编码蛋白质。:能转录相应的信使:能转录相应的信使RNARNA,能能 编码蛋白质编码蛋白质 编编码码区区非非编编码码区区原原核核细细胞胞的的 基基因因结结构构有调控遗传信息表达的核有调控遗传信息表达的核 苷酸序列,在该序列中,苷酸序列,在该序列中, 最重要的是位于编码区上最重要的是位于编码区上 游的游的RNARNA聚合酶结合位点。聚合酶结合位点。非非编码区编码区非非编码区编码区编码区编码区编码
4、区上游编码区上游 编码区下游编码区下游 启动子启动子终止子终止子补:真核细胞的基因结构补:真核细胞的基因结构编码区编码区非编码区非编码区非编码区非编码区与与RNARNA聚合酶聚合酶结合位点结合位点内含子内含子 外显子外显子 能够编码蛋白质的序列叫做外显子能够编码蛋白质的序列叫做外显子 不能够编码蛋白质的序列叫做内含子不能够编码蛋白质的序列叫做内含子启动子启动子终止子终止子编码区上游编码区上游 编码区下游编码区下游 内含子:内含子: 外显子:外显子: 真真核核细细胞胞的的 基基因因结结构构编码区编码区非编码区非编码区外显外显子:能编码蛋白质的序列子:能编码蛋白质的序列内含子:不能编码蛋白质的序列
5、内含子:不能编码蛋白质的序列:有调控作用的核苷酸序列,:有调控作用的核苷酸序列, 包括位于编码区上游的包括位于编码区上游的RNARNA 聚合酶结合位点。聚合酶结合位点。非非编码序列:编码序列: 包括非编码区和内含子包括非编码区和内含子结构基因结构基因外显子外显子内含子内含子转录、加工修饰转录、加工修饰mRNA原核细胞原核细胞真核细胞真核细胞不同点不同点编码区是编码区是_的的编码区是间隔的、编码区是间隔的、_的的相同点相同点都由都由能够编码蛋白质的能够编码蛋白质的_ _ _ 和具和具有调控作用的有调控作用的_ 区组成的区组成的原核细胞与真核细胞的基因结构比较原核细胞与真核细胞的基因结构比较思思考
6、考编码相同数目氨基酸的蛋白质,原核编码相同数目氨基酸的蛋白质,原核细胞与真核细胞基因结构一样长吗?细胞与真核细胞基因结构一样长吗?连续连续不连续不连续编码区编码区非编码非编码DNAmRNA蛋白质蛋白质转录转录翻译翻译基因组基因组文库与文库与部分基部分基因文库因文库的关系的关系小小大大无无有有无无有有某种生物的部分基因某种生物的部分基因 某种生物的全部基因某种生物的全部基因可以可以部分基因可以部分基因可以基因文库与基因库 基因库是指某一生物群体中的全部基因。 基因文库与基因克隆基因克隆是只包含某些特定基因或DNA片段的克隆。基因文库中包含着为数众多的克隆,建成后可供随时选取其中任何一个基因克隆之
7、用。 基因组文库的构建模式图基因组文库的构建模式图通过对通过对受体菌受体菌的培养的培养而储存而储存基因基因2.2.基因文库的构建方法基因文库的构建方法(1 1) 鸟枪法鸟枪法(2 2) 反转录法反转录法(3 3)直接分离法直接分离法(1 1)鸟枪法:)鸟枪法:供体细胞中的供体细胞中的DNADNA许多许多DNADNA片段片段运载体运载体限制酶限制酶与载体连接与载体连接受体细胞受体细胞产生特定性状产生特定性状导入导入外源外源DNADNA扩增扩增目的基因目的基因分离分离( (直接分离法直接分离法) ) 以目的基因转录成的以目的基因转录成的信使信使RNA为模板,为模板,再再反转录酶反转录酶的催化下反转
8、录成互补的单链的催化下反转录成互补的单链DNA,然后在,然后在DNA聚合酶的作用下合成双链聚合酶的作用下合成双链DNA,即,即cDNA,从而获得所需的基因。,从而获得所需的基因。(2 2)反转录法反转录法(cDNAcDNA文库的构建方法文库的构建方法)上述三种目的基因提取的方法有何优缺点?上述三种目的基因提取的方法有何优缺点?优点优点缺点缺点鸟枪法鸟枪法反转录法反转录法根据已知氨基根据已知氨基酸合成酸合成DNADNA法法操作简便操作简便广泛使用广泛使用工作量大,盲目,工作量大,盲目,分离出来的有时并分离出来的有时并非一个基因非一个基因专一性强专一性强操作过程麻烦,操作过程麻烦,mRNAmRNA
9、很不稳定,要很不稳定,要求的技术条件较高求的技术条件较高专一性最强专一性最强仅限于合成核苷酸仅限于合成核苷酸对较少的简单基因对较少的简单基因依据:目的基因的有关信息。依据:目的基因的有关信息。如:根据基因的核苷酸序列;如:根据基因的核苷酸序列; 基因的功能;基因的功能; 基因在染色体上的位置;基因在染色体上的位置; 基因的转录产物基因的转录产物mRNA; 基因翻译产物蛋白质等特性。基因翻译产物蛋白质等特性。u基因文库基因文库中不是直接保管相应基因,中不是直接保管相应基因,而是而是保存受体菌保存受体菌,菌中含基因。,菌中含基因。1234522557294时间(min)温度()PCR反应PCR反应
10、条件PCR过程PCR的特点适温延伸3高温变性1低温退火2重复13步2530轮目的DNA片段扩增100万倍以上DNA双螺旋DNA单链与引物复性DNA变性形成2条单链子链延伸DNA加倍模板DNA95PCR的基本原理nPCR反应条件nPCR过程nPCR的特点50引物1引物2DNA引物PCR的基本原理nPCR反应条件nPCR过程nPCR的特点引物1引物2DNA引物72Taq酶Taq酶PCR的基本原理nPCR反应条件nPCR过程nPCR的特点72第1轮结束第2轮开始PCR的基本原理nPCR反应条件nPCR过程nPCR的特点955072TaqTaqTaqTaqPCR的基本原理nPCR反应条件nPCR过程n
11、PCR的特点72第2轮结束 概念:概念:PCRPCR全称为全称为_,是一项,是一项 在生物在生物_复制复制_的核酸合成技术。的核酸合成技术。 前提条件:前提条件:_; 原料:原料:_、_ _ 、 _、 _。原理:原理:_方式:以方式:以_方式扩增,即方式扩增,即_(n n为扩增为扩增循循 环的次数)环的次数)结果:结果:聚合酶链式反应聚合酶链式反应体外体外特定特定DNADNA片段片段DNADNA复制复制已知基因的核苷酸序列已知基因的核苷酸序列四种脱氧核苷酸四种脱氧核苷酸DNADNA引物引物热稳定热稳定DNADNA聚合酶聚合酶指数指数2 2n n使目的基因的片段在短时间内成百万倍地扩增使目的基因
12、的片段在短时间内成百万倍地扩增模板模板DNADNAn 过程:过程:变性、退火、延伸三步曲变性、退火、延伸三步曲变性:变性:加热至加热至90909595双链双链DNADNA解链成解链成为单链为单链DNADNA退火:退火:冷却至冷却至55556060部分引物与模部分引物与模板的单链板的单链DNADNA的特定的特定互补部位相配对和互补部位相配对和结合结合延伸:延伸:加热至加热至70707575以目的基因为以目的基因为模板,合成互补的模板,合成互补的新新DNADNA链链变性变性退火退火延伸延伸过程:过程:a a、DNADNA变性(变性(90-9590-95):双链):双链DNADNA模板模板 在热作用
13、下,在热作用下,_断裂,形成断裂,形成_b b、退火(退火(复性复性55-6555-65):系统温度降低,引):系统温度降低,引 物与物与DNADNA模板结合,形成局部模板结合,形成局部_。 c c、延伸(延伸(70-7570-75):在):在TaqTaq酶的作用下,从酶的作用下,从 引物的引物的55端端33端延伸,合成与模板互补端延伸,合成与模板互补 的的_。 氢键氢键单链单链DNADNA双链双链DNADNA链链思考?思考?1 1个个DNADNA分子进行分子进行PCRPCR扩增扩增, ,循环循环4 4次,次,理论上至少需要几个引物?理论上至少需要几个引物?2(2n-1)(n为循环次数为循环次
14、数)(24-1)2=30n模板模板DNAn 特异性引物特异性引物n耐热耐热DNA聚合酶聚合酶n dNTPsn Mg2+ PCRPCR体系基本组成成分体系基本组成成分一对寡核苷酸序列:与目的基因一对寡核苷酸序列:与目的基因的起始段互补的起始段互补PCRPCR总结:总结:PCR的基本反应步骤的基本反应步骤变性变性90-95C延伸延伸70-75C退火退火55-60CPCRPCR总结:总结:()40 50 60 70 80 90 100100 80 60 40 20PCR技术扩增与技术扩增与DNA复制的比较复制的比较PCRPCR技术技术DNADNA复制复制相相同同点点原理原理原料原料条件条件不不同同点
15、点解旋解旋方式方式场所场所酶酶结果结果碱基互补配对碱基互补配对四种脱氧核苷酸四种脱氧核苷酸模板、能量、酶模板、能量、酶DNADNA在高温下在高温下变性解旋变性解旋解旋酶催化解旋酶催化体外复制体外复制细胞核内细胞核内热稳定的热稳定的DNADNA聚合酶聚合酶 细胞内的细胞内的DNADNA聚合酶聚合酶大量的大量的DNADNA片段片段形成整个形成整个DNADNA分子分子PCR的基本原理nPCR反应条件nPCR过程nPCR的特点重复30轮后230=1,073,741,824模板DNA第1轮扩增第2轮扩增第3轮扩增第4轮扩增第5轮扩增第6轮扩增理想拷贝数=2n n 循环次数实际拷贝数=(1+x)n X 平
16、均效率,约为0.85 n 循环次数 根据已知蛋白质根据已知蛋白质的氨基酸序列,推测的氨基酸序列,推测出相应的出相应的mRNAmRNA序列,序列,然后按照碱基互补配然后按照碱基互补配对原则,推测出它的对原则,推测出它的结构基因的核苷酸序结构基因的核苷酸序列,再通过化学方法,列,再通过化学方法,以单核苷酸为原料合以单核苷酸为原料合成目的基因成目的基因。蛋白质的氨基酸序列蛋白质的氨基酸序列mRNAmRNA的核苷酸序列的核苷酸序列结构基因的核苷酸序列结构基因的核苷酸序列推测推测推测推测目的基因目的基因化学合成化学合成(三)化学方法人工合成目的基因(三)化学方法人工合成目的基因q从基因文库中获取从基因文
17、库中获取q利用利用PCRPCR技术扩增技术扩增q利用化学方法人工合成利用化学方法人工合成归纳:获取目的基因的方法归纳:获取目的基因的方法 用一定的用一定的_切割切割 质粒,使其出现一个切质粒,使其出现一个切 口,露出口,露出_。 用用_切断目切断目 的基因,使其产生的基因,使其产生_ _ _。 将切下的目的基因片段插入质粒的将切下的目的基因片段插入质粒的_处,处, 再加入适量再加入适量_,形成了一个重组,形成了一个重组 DNADNA分子(重组质粒)分子(重组质粒)限制酶限制酶黏性末端黏性末端同一种限制酶同一种限制酶相同的黏性末端相同的黏性末端切口切口DNADNA连接酶连接酶1.1.过程过程:
18、:二、二、构建构建表达表达载体载体 核心核心质粒质粒DNADNA分子分子限制酶处理限制酶处理一个切口一个切口两个黏性末端两个黏性末端两个切口两个切口获得目的基因获得目的基因DNADNA连接酶连接酶重组重组DNADNA分子(重组质粒)分子(重组质粒)同一种同一种过程过程: :2.2.基因表达载体的目的基因表达载体的目的(1 1)使目的基因在受体细胞中稳定存在)使目的基因在受体细胞中稳定存在并可以遗传给下一代;并可以遗传给下一代;(2 2)使目的基因能够表达和发挥作用。)使目的基因能够表达和发挥作用。 科学家在培育抗虫棉时,经历了多次失败,科学家在培育抗虫棉时,经历了多次失败,才获得成功。才获得成
19、功。 起初把苏云金芽孢杆菌的起初把苏云金芽孢杆菌的抗虫基因抗虫基因插入载插入载体质粒中,然后导入棉花的受精卵中,结果抗体质粒中,然后导入棉花的受精卵中,结果抗虫基因在棉花体内没有表达。虫基因在棉花体内没有表达。 然后在插入抗虫基因的质粒中插入然后在插入抗虫基因的质粒中插入启动子启动子( (抗虫基因首端抗虫基因首端) ),导入棉花受精卵,长成的棉,导入棉花受精卵,长成的棉花植株还是没有抗虫能力。科学家又在有启动花植株还是没有抗虫能力。科学家又在有启动子、抗虫基因的质粒中插入子、抗虫基因的质粒中插入终止子终止子( (抗虫基因末抗虫基因末端端) ),导入棉花受精卵,结果成长的植株,有了,导入棉花受精
20、卵,结果成长的植株,有了抗虫能力。抗虫能力。 作为基因工程表达载体,作为基因工程表达载体,只需含有目的基因就可以完成任务只需含有目的基因就可以完成任务吗?为什么?(吗?为什么?(P P1515) 不可以。不可以。 因为目的基因在表达载体中得到表因为目的基因在表达载体中得到表达并发挥作用,达并发挥作用,还需要有其他控制元件还需要有其他控制元件,如启动子、终止子和标记基因等。如启动子、终止子和标记基因等。 必须构建上述元件的必须构建上述元件的是:是:(1 1) 生物之间进行基因交流,只有使用生物之间进行基因交流,只有使用受体生物自受体生物自身基因身基因的启动子才能比较有利于基因的表达;的启动子才能
21、比较有利于基因的表达;(2 2) 通过通过cDNAcDNA文库获得的目的基因没有启动子,只文库获得的目的基因没有启动子,只将编码序列导入受体生物中无法转录;将编码序列导入受体生物中无法转录;(3 3) 目的基因是否导入受体生物中需要有筛选标记;目的基因是否导入受体生物中需要有筛选标记;(4 4) 为了增强目的基因的表达水平,往往还要增加一为了增强目的基因的表达水平,往往还要增加一些其他调控元件,如增强子些其他调控元件,如增强子(增强基因启动子工作效率增强基因启动子工作效率的顺式作用序列,能够在相对于启动子的任何方向和任的顺式作用序列,能够在相对于启动子的任何方向和任何位置何位置( (上游或下游
22、上游或下游) )上都发挥作用。上都发挥作用。)等;等;(5 5) 有时需要确定目的基因表达的产物存在于细胞的有时需要确定目的基因表达的产物存在于细胞的什么部位,往往要加上可以标识存在部位的基因(或做什么部位,往往要加上可以标识存在部位的基因(或做成目的基因与标识基因的融合基因),如绿色荧光蛋白成目的基因与标识基因的融合基因),如绿色荧光蛋白基因等。基因等。3.3.基因表达载体的组成:基因表达载体的组成:它们有什么作用?它们有什么作用?a、目的基因、目的基因b、启动子、启动子c、终止子、终止子d、标记基因、标记基因调节基调节基 因因操纵基操纵基 因因结构基因结构基因RNA聚合酶聚合酶半乳糖苷酶半
23、乳糖苷酶 酶酶 酶酶 RNA聚合酶聚合酶启动子启动子RNA聚合酶聚合酶启动子启动子:位于基因首端的一段特殊的位于基因首端的一段特殊的DNA片断,片断,它是它是RNA聚合酶识别和结合的部位,有了它才能聚合酶识别和结合的部位,有了它才能驱动基因转录出驱动基因转录出mRNA,最终获得蛋白质。,最终获得蛋白质。思考思考1: 表达载体为什么一定要有启动子?表达载体为什么一定要有启动子?n(1 1)生物之间进行基因交流,只有使)生物之间进行基因交流,只有使用受体生物自身基因的启动子才能有用受体生物自身基因的启动子才能有利于基因的表达;利于基因的表达;n(2 2)通过)通过cDNAcDNA文库获得的目的基因
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