生物化学蛋白质结构和功能的关系课件.ppt
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- 生物化学 蛋白质 结构 功能 关系 课件
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1、资料仅供参考,不当之处,请联系改正。一、肌红蛋白的结构与功能资料仅供参考,不当之处,请联系改正。肌红蛋白 肌红蛋白(肌红蛋白(myoglobin,Mb)主要存在于)主要存在于肌肉中,是哺乳动物细胞主要是肌细胞贮存和肌肉中,是哺乳动物细胞主要是肌细胞贮存和分配氧的蛋白质。肌红蛋白由一条多肽链和一分配氧的蛋白质。肌红蛋白由一条多肽链和一个辅基血红素(个辅基血红素(heme)构成,相对分子量)构成,相对分子量16700,含含153个氨基酸残基。除去血红素后仅剩下的肽个氨基酸残基。除去血红素后仅剩下的肽链部分称为珠蛋白(链部分称为珠蛋白(globin),它和血红蛋白的),它和血红蛋白的、亚基有明显的同
2、源性,它们的构象和功亚基有明显的同源性,它们的构象和功能也极为相似。血红素非共价地结合在珠蛋白能也极为相似。血红素非共价地结合在珠蛋白的疏水空穴中。的疏水空穴中。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。肌红蛋白的结构myoglobin资料仅供参考,不当之处,请联系改正。辅基血红素 血红素由原卟啉血红素由原卟啉(protoporphyrin )中)中间结合一个间结合一个Fe原子构成,原卟啉原子构成,原卟啉是由是由4个吡咯个吡咯环通过甲叉桥连接而成的扁平环状化合物。卟啉环通过甲叉桥连接而成的扁平环状化合物。卟啉环中央结合环中央结合Fe原子,原子,Fe原子通常是八面体配位,原子通常是八面体配位,应该有
3、应该有6个配位键,其中个配位键,其中4个配位键与个配位键与4个吡咯环个吡咯环的的N原子相连,另两个配位键分布在卟啉环的上原子相连,另两个配位键分布在卟啉环的上下。下。Fe原子可以是二价的或三价的,相应的血红原子可以是二价的或三价的,相应的血红素称为素称为亚铁亚铁血红素(血红素(ferroheme,heme)和高铁)和高铁血红素(血红素(ferriheme,hematin),相应的肌红蛋),相应的肌红蛋白称为白称为亚铁亚铁肌红蛋白(肌红蛋白(ferromyoglobin)和高铁)和高铁肌红蛋白(肌红蛋白(ferrimyoglobin,metmyoglobin)。)。 资料仅供参考,不当之处,请联
4、系改正。肌红蛋白的辅基血红素hemeprotoporphyrin 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。O2与肌红蛋白的结合 血红素中的铁的第血红素中的铁的第5个配位键与珠蛋白的第个配位键与珠蛋白的第93(或(或F8)位)位His残基的咪唑基残基的咪唑基N结合,这个结合,这个His称称为近侧为近侧His,而,而O2与与Fe的第的第6个配位键结合。在肌个配位键结合。在肌红蛋白没有结合红蛋白没有结合O2时,这个部位是空的。高铁肌时,这个部位是空的。高铁肌红蛋白不能与红蛋白不能与O2结合,结合,H2O分子代替分子代替O2成为第成为第6个个配体。配体。 在血红素结合在血红素结合O2的一侧,还有一个的一侧
5、,还有一个His残基,残基,即第即第64(或(或E7)位)位His残基,称为远侧残基,称为远侧His。由于。由于这个远侧这个远侧His的存在,使得的存在,使得O2的结合受到空间位阻。的结合受到空间位阻。在氧合肌红蛋白中,在氧合肌红蛋白中, O2的两个原子与的两个原子与Fe不成一条不成一条直线,而是倾斜了直线,而是倾斜了30。资料仅供参考,不当之处,请联系改正。氧合肌红蛋白中血红素铁离子的6个配体近侧近侧His远侧远侧His资料仅供参考,不当之处,请联系改正。CO的毒性作用 第第6个配位位置的空间位阻很重要。游离在溶个配位位置的空间位阻很重要。游离在溶液中的铁卟啉结合液中的铁卟啉结合CO的能力比
6、结合的能力比结合O2强强25000倍,倍,但在肌红蛋白中,血红素对但在肌红蛋白中,血红素对CO的亲和力仅比对的亲和力仅比对O2的亲和力大的亲和力大250倍。肌红蛋白(还有血红蛋白)降倍。肌红蛋白(还有血红蛋白)降低对低对CO的亲和力,可以有效地防止代谢过程中产的亲和力,可以有效地防止代谢过程中产生的少量生的少量CO占据它们的占据它们的O2结合部位。尽管如此,结合部位。尽管如此,当空气中当空气中CO的含量达到的含量达到0.06%0.08%即有中毒即有中毒的危险,达到的危险,达到0.1%则会导致死亡。则会导致死亡。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。O2 2和CO与肌红蛋白血红素Fe()的结合F
7、ree hemewith imidazoleMb:CO Complex Oxymyoglobin资料仅供参考,不当之处,请联系改正。肌红蛋白的蛋白质部分的作用 通常情况下,通常情况下,O2分子与分子与Fe()紧密接触)紧密接触会使会使Fe()氧化成)氧化成Fe(),溶液中游离的),溶液中游离的亚铁血红素很容易被氧化成高铁血红素,但在亚铁血红素很容易被氧化成高铁血红素,但在肌红蛋白中,由于血红素处于疏水环境中,血肌红蛋白中,由于血红素处于疏水环境中,血红素红素Fe()不容易被氧化。)不容易被氧化。 同样是血红素,与不同的蛋白质结合后,具同样是血红素,与不同的蛋白质结合后,具有不同的功能,如在细胞
8、色素有不同的功能,如在细胞色素C中,血红素起中,血红素起可逆电子载体的作用,过氧化氢酶中,血红素可逆电子载体的作用,过氧化氢酶中,血红素催化催化H2O2歧化成歧化成H2O和和O2 。资料仅供参考,不当之处,请联系改正。肌红蛋白血红素Fe原子的位移 肌红蛋白血红素在没有与肌红蛋白血红素在没有与O2结合时,铁原结合时,铁原子是向第子是向第 5 配位体方向(配位体方向(His F8)突出的。当)突出的。当与与O2结合时,铁原子被拉回到卟啉平面。结合时,铁原子被拉回到卟啉平面。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。肌红蛋白血红素Fe原子的位移资料仅供参考,不当之处,请联系改正。肌红蛋白结合氧的定量分析
9、2MbO2OMb 22MbOOMbK 22MbMbOMbOY肌红蛋白与肌红蛋白与O2结合的反应式为结合的反应式为其解离常数为其解离常数为K , 令令Y 为肌红蛋白的氧饱和分数,即为肌红蛋白的氧饱和分数,即将改写为将改写为KOMbMbO22资料仅供参考,不当之处,请联系改正。肌红蛋白结合氧的定量分析将代入得将代入得 , 22MbKOMbKOMbY122KOKOYKOOY22 根据根据henry定律,溶于液体的任一种气体的浓度定律,溶于液体的任一种气体的浓度与液体上面的该气体的分压成正比,即与液体上面的该气体的分压成正比,即 O2= = A p (O2) 式中式中A 为比例系数,为比例系数,p (
10、O2)为氧气的分压。为氧气的分压。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。肌红蛋白结合氧的定量分析将代入得将代入得KOpAOpAY)()(22AKOpOpY)()(22KOpOpY)()(22资料仅供参考,不当之处,请联系改正。肌红蛋白的氧结合曲线 实验中实验中 p (O2) 可以测得,氧分压可以测得,氧分压常用常用Torr为为单位。单位。Y 值可用分光光度法测定,因为肌红蛋白值可用分光光度法测定,因为肌红蛋白结合了结合了O2 时会引起吸收光谱的改变。时会引起吸收光谱的改变。Y 对对 p (O2) 作图所得的曲线称为氧结合曲线。作图所得的曲线称为氧结合曲线。 1 Torr = 133 Pa =
11、1 mmHg 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。肌红蛋白的氧结合曲线KOpOpY)()(22双曲线方程双曲线方程资料仅供参考,不当之处,请联系改正。Hill作图 为氧结合肌红蛋白的分数与没有结合为氧结合肌红蛋白的分数与没有结合氧的肌红蛋白的分数之比。氧的肌红蛋白的分数之比。 YY1KOpOpKOpOpKOpOpKOpOpYY)()()()()()(1)()(122222222两边取对数得两边取对数得 KOpYY)(lg)1lg(2KOpYYlg)(lg)1lg(2资料仅供参考,不当之处,请联系改正。Hill作图 以以 对对 作图作图称为称为Hill作图,肌红作图,肌红蛋白的蛋白的Hill图是
12、一条直线。当图是一条直线。当 时(时(50%的肌红的肌红蛋白结合了氧),蛋白结合了氧), ,这时,这时 ,这一点的斜率称为这一点的斜率称为Hill系数,肌红蛋白的系数,肌红蛋白的Hill系数等系数等于于1,说明,说明O2分子彼此独立地与肌红蛋白结合分子彼此独立地与肌红蛋白结合。 )1lg(YY)(lg2Op11YY0)1lg(YY502)(PKOp资料仅供参考,不当之处,请联系改正。氧与肌红蛋白结合的Hill图资料仅供参考,不当之处,请联系改正。肌红蛋白的贮氧和输氧作用 线粒体中氧浓度线粒体中氧浓度为为010 torr,静脉血氧浓度为,静脉血氧浓度为15 torr或更高些。肌红蛋白的或更高些。
13、肌红蛋白的P 50为为2 torr,所以在,所以在大多数情况下,肌红蛋白是高度氧合的,是氧的贮大多数情况下,肌红蛋白是高度氧合的,是氧的贮存库。如果由于肌肉收缩使线粒体中氧含量下降,存库。如果由于肌肉收缩使线粒体中氧含量下降,它就可以立即供应氧。它就可以立即供应氧。资料仅供参考,不当之处,请联系改正。肌红蛋白的贮氧和输氧作用 肌红蛋白也有利于细胞内氧从细胞的内表面向肌红蛋白也有利于细胞内氧从细胞的内表面向线粒体转运,因为这种运转是顺浓度梯度的,细胞线粒体转运,因为这种运转是顺浓度梯度的,细胞内表面的氧浓度约为内表面的氧浓度约为10 torr(肌红蛋白的氧饱和度(肌红蛋白的氧饱和度约为约为80%
14、),而线粒体内的氧浓度约为),而线粒体内的氧浓度约为1 torr(肌红(肌红蛋白的氧饱和度约为蛋白的氧饱和度约为25%),肌红蛋白可以从细胞),肌红蛋白可以从细胞内表面结合氧,而运到线粒体内表面结合氧,而运到线粒体中释放氧。中释放氧。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。二、血红蛋白的结构与功能资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白 血红蛋白(血红蛋白(hemoglobin,Hb)存在于红)存在于红细胞中,它的主要功能是在血液中结合并转细胞中,它的主要功能是在血液中结合并转运氧气,它在肺中与氧气结合,运输到全身运氧气,它在肺中与氧气结合,运输到全身各处组织中,再释放出氧气。各处组织中,再
15、释放出氧气。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。人体内有正常功能的血红蛋白 发育阶段血红蛋白名称链或样链链或样链亚基组成胚胎胚胎2 22 2胎儿胎儿HbF2 22 2出生到死亡出生到死亡HbA2 22 2出生到死亡出生到死亡HbA22 22 2资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白的氨基酸组成 链或链或样链样链由由141个氨基酸残基组成,个氨基酸残基组成,链或链或样链由样链由146个氨基酸残基组成,而肌红蛋个氨基酸残基组成,而肌红蛋白的肽链由白的肽链由153个个氨基酸残基组成,它们都叫珠氨基酸残基组成,它们都叫珠蛋白。同一类型不同希腊字母代表的链有个别蛋白。同一类型不同希腊字母代表的链
16、有个别氨基酸残基不同。氨基酸残基不同。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白的三维结构11221122资料仅供参考,不当之处,请联系改正。Hb的链、链和Mb链构象的相似性 血红蛋白血红蛋白链、链、链及肌红蛋白链的三级结链及肌红蛋白链的三级结构非常相似,但这三种肽链的氨基酸序列有很大构非常相似,但这三种肽链的氨基酸序列有很大不同,不同,141个氨基酸残基位置中只有个氨基酸残基位置中只有27个位置的残个位置的残基在这三种肽链中是相同的。基在这三种肽链中是相同的。 Mb Hb Hb资料仅供参考,不当之处,请联系改正。不同物种血红蛋白氨基酸序列的比较 比较了多种(从七腮鳗到人)不同的血红蛋比较
17、了多种(从七腮鳗到人)不同的血红蛋白的氨基酸序列,证明序列中有白的氨基酸序列,证明序列中有9个位置的残基个位置的残基是所有研究过的血红蛋白所共有的,这些称为高是所有研究过的血红蛋白所共有的,这些称为高度保守的残基。度保守的残基。 血红蛋白内部的非极性残基可以换成另一种血红蛋白内部的非极性残基可以换成另一种非极性残基而功能不变。非极性残基而功能不变。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白氧合时亚基的移动 血红蛋白分子中,血红蛋白分子中,亚基的接触有两类,一亚基的接触有两类,一类是类是1 11 1接触和接触和2 22 2接触,这类接触称为装配接触,这类接触称为装配接触;另一类是接触;另一类
18、是1 12 2接触和接触和2 21 1接触,这类接接触,这类接触称为滑动接触。氧合时,每个触称为滑动接触。氧合时,每个二聚体半分子二聚体半分子作为一个刚体移动,这两个二聚体彼此滑动。我们作为一个刚体移动,这两个二聚体彼此滑动。我们将其中一个二聚体看作不动,另一个二聚体将绕一将其中一个二聚体看作不动,另一个二聚体将绕一个设想的偏心轴个设想的偏心轴旋转旋转15,并平移,并平移0.08nm。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白氧合时亚基的移动 去氧血红蛋白去氧血红蛋白 1111的移动过程的移动过程 氧合血红蛋白氧合血红蛋白资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白氧合时铁原子的移动 在去
19、氧血红蛋白中,铁在去氧血红蛋白中,铁原子向近侧原子向近侧His方向凸方向凸起约起约0.06nm。氧合时,铁原子的体积缩小,向卟。氧合时,铁原子的体积缩小,向卟啉环平面靠近约啉环平面靠近约0.039nm,并牵拉近侧,并牵拉近侧His往血红往血红素平面移动,这些移动,传递到亚基的界面,使素平面移动,这些移动,传递到亚基的界面,使得亚基间的相互得亚基间的相互位置发生变化。位置发生变化。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白氧合时铁原子的移动 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白的两种构象态 血红蛋白有两种主要构象态,血红蛋白有两种主要构象态,一种是一种是T态即紧张态即紧张态(态(te
20、nse state),另一种是),另一种是R态即松弛态(态即松弛态(relaxed state)。)。O2对对R态的亲和力明显地高于对态的亲和力明显地高于对T态的亲和态的亲和力,并且力,并且O2的结合更稳定了的结合更稳定了R态。缺氧时态。缺氧时T态更加稳态更加稳定,因此定,因此T态是去氧血红蛋白的主要构象,态是去氧血红蛋白的主要构象,R态是氧态是氧合血红蛋白的主要构象。合血红蛋白的主要构象。T态血红蛋白结合态血红蛋白结合O2后转后转变成变成R态态,并使得分子内一些盐桥断裂。,并使得分子内一些盐桥断裂。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。去氧血红蛋白中各亚基间的盐桥资料仅供参考,不当之处,请联
21、系改正。血红蛋白的别构效应 血红蛋白是一个四聚体蛋白,它与肌红蛋白血红蛋白是一个四聚体蛋白,它与肌红蛋白相比,出现了一些新的性质。血红蛋白的氧合具相比,出现了一些新的性质。血红蛋白的氧合具有正协同同促效应,即一个有正协同同促效应,即一个O2的结合促进同一分的结合促进同一分子其它亚基与子其它亚基与O2的结合。具有这种性质的蛋白质的结合。具有这种性质的蛋白质称为别构蛋白(其它蛋白质也有负协同效应的)。称为别构蛋白(其它蛋白质也有负协同效应的)。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白的协同性氧结合24OHb 42)(OHb)(4242OHbOHbK KOpOpY)()(2424 假设假设O2
22、与与Hb的结合是一种的结合是一种“全或无全或无”的方式,的方式,其结合反应式为其结合反应式为则解离常数则解离常数K 为为 按照前面肌红蛋白结合按照前面肌红蛋白结合O2的定量分析的推导的定量分析的推导方法,方法,Hb的氧饱和分数的氧饱和分数Y 的表达式为的表达式为资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白与肌红蛋白氧合曲线的比较资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白的实际氧合曲线推导氧合曲线推导氧合曲线实际氧合曲线实际氧合曲线图中的图中的n为为Hill系数系数资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白推导氧合曲线误差的原因 血红蛋白结合血红蛋白结合O2并不是并不是“全或无全或无”的,各
23、个亚的,各个亚基结合基结合O2是依次进行的,并且前面亚基结合了是依次进行的,并且前面亚基结合了O2对对后面亚基与后面亚基与O2的结合有促进作用。实际测定的的结合有促进作用。实际测定的n=2.8,若若n=1,则无协同作用,若,则无协同作用,若n 1则有正协同作用。对则有正协同作用。对于血红蛋白来说,当于血红蛋白来说,当 n=4 时正协同作用最大,即当时正协同作用最大,即当1个个O2与与1个亚基结合后,另外个亚基结合后,另外3个亚基也同时与个亚基也同时与O2结合。实际情况是结合。实际情况是n=2.8。这样,。这样,Hb对第对第4个个O2的亲的亲和力约为与第和力约为与第1个个O2亲和力的亲和力的30
24、0倍。倍。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白运输氧的效率 在肺泡中,氧分压为在肺泡中,氧分压为100 torr,工作肌肉的毛,工作肌肉的毛细血管中约为细血管中约为20 torr,血红蛋白在肺泡中,血红蛋白在肺泡中Y是是0.97,在肌肉毛细血管中在肌肉毛细血管中Y是是0.25,释放的,释放的O2是两个是两个Y值值之差,即之差,即Y=0.72。这个差值越大,运输这个差值越大,运输O2的效率的效率就越高。肌红蛋白不能担当此项工作。就越高。肌红蛋白不能担当此项工作。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。血红蛋白别构的异种效应 血红蛋白与血红蛋白与O2的结合受其它分子的调节,的结合受其它分子
25、的调节,如如 H+、 C O2和和 2 , 3 - 二 磷 酸 甘 油 酸 (二 磷 酸 甘 油 酸 ( 2 , 3 -bisphosphate glycerate,BPG)等。虽然它们)等。虽然它们在蛋白质分子上的结合部位离血红素很远,但在蛋白质分子上的结合部位离血红素很远,但这些分子极大地影响这些分子极大地影响Hb的氧合性质,这是别构的氧合性质,这是别构效应中的异种效应。效应中的异种效应。 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。2,3-二磷酸甘油酸2,3-bisphosphate glycerate,BPG资料仅供参考,不当之处,请联系改正。Bohr效应 组织中代谢作用产生组织中代谢作用产生
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