细菌耐药机制研究进展(特选材料)课件.ppt
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- 细菌 耐药 机制 研究进展 选材 课件
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1、细菌耐药机制研究进展细菌耐药机制研究进展浙江大学医学院附属第一医院浙江大学医学院附属第一医院俞云松俞云松1优选内容Antibiotic interactions with gram negative organismsAntibiotic interactions with gram negative organismspenicillin binding proteinspenicillin binding proteinsOmpFOmpFOmpCOmpC CephalosporinsCephalosporins slower diffusion due toslower diffusion
2、 due tobulk and ionic chargesbulk and ionic charges ImipenemImipenem Rapid diffusion due to small sizeRapid diffusion due to small sizeand zwitterionic and zwitterionic +/- charge)+/- charge)PBP3PBP3PBP2PBP2PBP1aPBP1aPB1bPB1bBeta Lactamases(hydrolyzing enzymes)CBD/RR2优选内容3优选内容一、外膜孔蛋白减少或丢失一、外膜孔蛋白减少或丢
3、失 细胞内抗生素浓度降低细胞内抗生素浓度降低 膜孔蛋白膜孔蛋白(OprD): 4优选内容细胞外膜上的细胞外膜上的某些特殊蛋白是某些特殊蛋白是一种非特异性的、一种非特异性的、跨越细胞膜的水跨越细胞膜的水溶性物质扩散通溶性物质扩散通道。道。膜膜 孔孔 蛋蛋 白白5优选内容革革 兰兰 阴阴 性性 细细 菌菌 细细 胞胞 膜膜6优选内容某些细菌本身存在的膜孔蛋白较少或蛋白通道较小,使某些细菌本身存在的膜孔蛋白较少或蛋白通道较小,使一些抗菌药物不能进入菌体内部,称为一些抗菌药物不能进入菌体内部,称为“内在性耐药内在性耐药”或或“固有性耐药固有性耐药”(intrinsically resistant),)
4、,即这种耐即这种耐药并非是由于任何染色体的突变或是耐药质粒的获得所药并非是由于任何染色体的突变或是耐药质粒的获得所致。致。如如铜绿假单胞菌铜绿假单胞菌的细胞外膜上没有大多数革兰阴性细菌的细胞外膜上没有大多数革兰阴性细菌所具有的典型的高渗透性孔蛋白,它的孔蛋白通道对小所具有的典型的高渗透性孔蛋白,它的孔蛋白通道对小分子物质的渗透速度仅为典型孔蛋白通道的分子物质的渗透速度仅为典型孔蛋白通道的1%。 “先天不足先天不足”7优选内容一些具有高渗透性外膜且对抗菌药物敏感的细菌可以通过一些具有高渗透性外膜且对抗菌药物敏感的细菌可以通过降低外膜的渗透性而发展成为耐药菌,即原有的降低外膜的渗透性而发展成为耐药
5、菌,即原有的孔蛋白通孔蛋白通道由于细菌发生突变而使该孔蛋白通道关闭或消失道由于细菌发生突变而使该孔蛋白通道关闭或消失,则细,则细菌就会对该抗菌药物产生很高的耐药性。菌就会对该抗菌药物产生很高的耐药性。 亚胺培南是一种非典型的亚胺培南是一种非典型的-内酰胺类抗菌药物,主要是通内酰胺类抗菌药物,主要是通过一个特殊的孔蛋白通道过一个特殊的孔蛋白通道OprD2的扩散进入细菌的,一旦的扩散进入细菌的,一旦这一孔蛋白通道消失,则产生耐药性。这一孔蛋白通道消失,则产生耐药性。 “后天获得后天获得”8优选内容产气肠杆菌从亚胺培能敏感株变为耐药株产气肠杆菌从亚胺培能敏感株变为耐药株9优选内容亚胺培南敏感及耐药的
6、亚胺培南敏感及耐药的产气肠杆菌产气肠杆菌PFGE图图C1 C2:亚胺培南敏感亚胺培南敏感C3 C4:亚胺培南耐药亚胺培南耐药10优选内容亚胺培南敏感及耐药亚胺培南敏感及耐药的产气肠杆菌的产气肠杆菌SDS图图C1 C2:亚胺培南敏感亚胺培南敏感C3 C4:亚胺培南耐药亚胺培南耐药11优选内容PCR扩增扩增Omp36全长及序列分析全长及序列分析IS903 98%(约(约1000bp)12优选内容插入序列引起插入序列引起OprD2缺失(铜绿)缺失(铜绿)ISPa1328约约2000bpOprD213优选内容细菌产生一种或多种水解酶或钝化酶来水解细菌产生一种或多种水解酶或钝化酶来水解或修饰进入细胞内的
7、抗菌药物,使之到达靶位或修饰进入细胞内的抗菌药物,使之到达靶位之前失去活性之前失去活性细菌产生的灭活酶主要有:细菌产生的灭活酶主要有:v -内酰胺酶内酰胺酶v 氨基糖苷类钝化酶氨基糖苷类钝化酶v 氯霉素乙酰转移酶氯霉素乙酰转移酶v MLS钝化酶钝化酶二、二、 产生灭活酶产生灭活酶14优选内容 超广谱超广谱 - -内酰胺酶(内酰胺酶(ESBLsESBLs) 高产高产AmpCAmpC酶酶 碳青霉烯酶碳青霉烯酶 最主要的耐药因素最主要的耐药因素 对对 - -内酰胺抗生素造成威胁内酰胺抗生素造成威胁 - -内酰胺酶内酰胺酶临床上最重要的临床上最重要的 - -内酰胺酶内酰胺酶15优选内容是是质粒质粒介导
8、的能够水解头孢他啶、头孢噻肟等亚氨介导的能够水解头孢他啶、头孢噻肟等亚氨基基-内酰胺类及氨曲南等单环酰胺类抗生素,并可被内酰胺类及氨曲南等单环酰胺类抗生素,并可被克拉维酸等克拉维酸等-内酰胺酶抑制剂所抑制的一类内酰胺酶抑制剂所抑制的一类-内酰胺内酰胺酶。酶。ESBLs在分子生物学分类中属于在分子生物学分类中属于A类酶,在类酶,在Bush分类分类中属于中属于2be类酶。类酶。超广谱超广谱 -内酰胺酶内酰胺酶(extended-spectrum -lactamases,ESBLs)16优选内容ESBLs的分类根据基因同源性不同分为:根据基因同源性不同分为:TEM型型 80SHV型型 46CTX-M
9、型型 37OXA型型 18其它型其它型 20http:/www.lahey.org/studies/webt.htm.CTX-M-1组组CTX-M-2组组CTX-M-8组组CTX-M-9组组17优选内容北北京京浙浙江江新新疆疆郑郑州州基基因因型型ECKPECKPECKPECKP合合计计CTX-M-14237763295372209CTX-M-3161661385257CTX-M-245598229CTX-M-22268CTX-M-933CTX-M-281113CTX-M-1311CTX-M-2711CTX-M-2911SHV-12311510SHV-51214SHV-222CTX-M-14+C
10、TX-M -224134416CTX-M-14+CTX-M -322CTX-M-14+SHV-12134CTX-M-3+SHV-1211CTX-M-9+SHV-1211CTX-M-22+SHV-1211CTX-M-24+SHV-1211CTX-M-14+CTX-M -22+SHV-1211CTX-M-14+CTX-M -22+SHV-1211未未检检出出 ESBLs 基基 因因型型7814689144合合计计5543109614226586400中国中国400400株株大肠大肠埃希埃希菌和菌和肺炎肺炎克雷克雷伯菌伯菌的基的基因型因型分布分布18优选内容32家医院家医院 1994-2003年年大
11、肠杆菌及肺炎克雷伯菌产大肠杆菌及肺炎克雷伯菌产ESBLs百分率百分率0102030405060701994199519961998199920002001200220032004年份年份百分比百分比大肠杆菌大肠杆菌肺炎克雷伯菌肺炎克雷伯菌19优选内容头孢菌素酶头孢菌素酶 大部分肠杆菌科细菌如肠杆菌属菌大部分肠杆菌科细菌如肠杆菌属菌种、弗劳地枸橼酸杆菌、摩根摩根菌、种、弗劳地枸橼酸杆菌、摩根摩根菌、普鲁菲登菌属菌种粘质沙雷菌等都能产普鲁菲登菌属菌种粘质沙雷菌等都能产生染色体介导的生染色体介导的AmpC酶。酶。20优选内容 阴沟肠杆菌阴沟肠杆菌21优选内容ACT-1,DHA-1,CMY (Peki
12、ng)DHA-1,CIT,ACT-1 (Shanghai) DHA-1 (Zhejiang)DHA-1,ACT-1 (GuangZhou)DHA-1 is The Predominant Type in ChinaMap of China22优选内容克隆片段克隆片段PCR产物产物1100bp共共6432bp ORF1ORF2ORF3ORF4ORF5ORF6IS26orf-1 DHA-1 ampR qacE1 sul15232 bp23优选内容指所有能明显水解亚胺培南或美罗培南等碳青指所有能明显水解亚胺培南或美罗培南等碳青霉烯类抗生素的一类霉烯类抗生素的一类内酰胺酶内酰胺酶分别属于分别属于Amb
13、ler分子分类中的分子分类中的A类、类、B类、类、D类类酶酶 。 碳青霉烯酶碳青霉烯酶 24优选内容 天然来源碳青霉烯酶天然来源碳青霉烯酶 嗜麦芽寡养单胞菌的嗜麦芽寡养单胞菌的L1酶酶 获得性碳青霉烯酶(获得性碳青霉烯酶(Ambler分子分类)分子分类) B类酶(金属酶):类酶(金属酶):IMP、VIM类及类及SPM-1 A类酶:类酶:NMC-A、KPC-1、GES-2等等 D类酶:类酶:OXA-23至至OXA-27、40、48、54碳青霉烯酶按其来源可分为碳青霉烯酶按其来源可分为25优选内容金属酶金属酶 染色体编码的金属酶:染色体编码的金属酶:BC ,L1,TUS-1,MUS-1,Sfh-1
14、,Mbl1b,大多来源于环境寄生菌。大多来源于环境寄生菌。 获得性金属酶:获得性金属酶:IMP VIM SPM GIM-1 SIM-1,位于位于可转移的基因元件可转移的基因元件上,造成区域性传播。上,造成区域性传播。26优选内容IMP型金属酶型金属酶 IMPIMP型金属酶型金属酶GenBankGenBank上已公布上已公布2121种,比较它们相互之种,比较它们相互之间的序列表明:间的序列表明:IMPIMP型金属酶大致可以分为两组:型金属酶大致可以分为两组: 1 1)IMP-1IMP-1、IMP3-7IMP3-7、IMP9IMP91111、IMP-16IMP-16 2 2)IMP-2IMP-2和
15、和IMP-8IMP-8、1212、1313、1919、20 20 27优选内容中国中国 IMP-4 2001年香港年香港 鲍曼鲍曼 2001年广州年广州 杨格枸橼酸杆菌杨格枸橼酸杆菌 、铜绿、铜绿 IMP-1 2004年年12月月 江苏无锡江苏无锡 铜绿铜绿 IMP-8 2001 台湾台湾 铜绿铜绿28优选内容VIM型金属酶型金属酶 VIMVIM型金属酶型金属酶 与与IMPIMP类金属酶同源性类金属酶同源性 4040,但两类金属酶的,但两类金属酶的动力学性质相似,编码基因都位于整合子上。动力学性质相似,编码基因都位于整合子上。 目前目前VIMVIM型金属酶型金属酶GenBankGenBank上
16、已公布上已公布1212种,比较它们相互之间的种,比较它们相互之间的序列可将序列可将VIMVIM金属酶大致分为三组:金属酶大致分为三组: 1 1)VIM-1VIM-1、4 4、5 5、11a11a 2 2)VIM-2VIM-2、3 3、6 6、8 8、9 9、1010、11b11b 3 3)VIM-7VIM-729优选内容VIM型金属酶分布型金属酶分布 VIM-1 1999年年 意大利意大利 铜绿铜绿 氧化木糖产碱杆菌氧化木糖产碱杆菌 恶臭假单恶臭假单胞胞 20032004希腊希腊 大肠大肠 肺克肺克 法国法国 肺克肺克 VIM-2 2000 法国法国 铜绿铜绿 意大利意大利 希腊希腊 日本日本
17、 韩国韩国 葡萄葡萄牙牙 西班牙西班牙 波兰波兰 克罗地亚克罗地亚 智利智利 阿根廷阿根廷 美国美国 中国中国 VIM-3 2001年年 台湾地区台湾地区 铜绿铜绿 VIM-4 2002年年 希腊希腊 铜绿铜绿 2003 瑞典瑞典 铜绿铜绿 2004 意大意大利利 肺克肺克 阴沟阴沟 2004 波兰波兰 铜绿铜绿30优选内容 VIM-5 2004 土耳其土耳其 肺克肺克 铜绿铜绿 VIM-6 2004 新加坡新加坡 恶臭假单胞恶臭假单胞 VIM-7 2004 美国美国 铜绿铜绿 VIM-8 哥伦比亚哥伦比亚 铜绿铜绿 VIM-9,10 英国英国 VIM-11 阿根廷阿根廷 意大利意大利VIM型
18、金属酶分布型金属酶分布31优选内容假单胞菌假单胞菌北京北京(27)上海上海(32)杭州杭州(27)广州广州(32)成都成都(22)金属酶表金属酶表型阳性菌型阳性菌株数株数35310百分率百分率11.115.611.13.10.0金属酶基金属酶基因型阳性因型阳性菌株数菌株数36410百分率百分率11.118.814.83.10.032优选内容 VIM-2基因整合子结构图A: B2, B3, B28, H19, H26, H54, G4 结构同In72B: S5, S9, S10, S11, S12(S15、H22除外) intI1 attI1 aacA4 59-b VIM-2 59-be aad
19、B 59-be 3-CS intI1 attI1 aacA4 59-be VIM-2 59-be 3-CSAB33优选内容 H22H26 g4 s5 s9 s10 s11 s12 s15 b2 b3 b28 w19w54Marker50kbAB H22H26 g4 s5 s9 s10 s11 s12 s15 b2 b3 b28 w19w54Marker34优选内容类酶类酶包括阴沟肠杆菌、粘质沙雷菌中由染色体介导的NMC-A、Sme-1Sme-3、IMI-1酶,以及肺炎克雷伯菌中质粒介导的KPC-1-4酶、铜绿假单胞菌中质粒介导的GES-2酶。碳青霉烯类抗生素水解酶碳青霉烯类抗生素水解酶35优选
20、内容二株产二株产IMI-1阴沟肠杆菌阴沟肠杆菌PFGE结果结果36优选内容AntibioticsMIC(mg/l)E cloacaeE C600 E.coli C600E8 E.coli DH5 E.coli pT103Imipenem320.38320.2532Ciprofloxacin0.0640.250.250.006008Amikacin4220.250.38Cefepime20.0640.0640.1250.047Ceftazidime160.50.380.50.25Cefotaxime120.050.1250.0940.047Cefoperazone2560.51.50.0474C
21、efoperazone/Sulbactam1280.25262Piperacillin/Tazobactam2562424Ticarcilliin/ClavulanicAcid2561232432Ampicillin/Sulbactam2568641.5NDE cloacae 8, E C600, E.coli C600E8,E.coli pT103和和E.coli DH5 对抗菌药物的体外抗菌活性对抗菌药物的体外抗菌活性37优选内容阴沟肠杆菌、接合菌质粒电泳图谱阴沟肠杆菌、接合菌质粒电泳图谱 54kb 15kb38优选内容Schematic representation of the clo
22、ned E.coRfragmentIS903IMI-2Imi-2RIS903IS2903bp 921bp 882bp 876bp 921bp10629bp(GenBank accession number : AY780889 )39优选内容抗菌药物肺炎克雷伯菌亚胺培南32亚胺培南/克拉维酸16美罗培南32美罗培南/克拉维酸16厄他培南256头孢他啶256头孢他啶/克拉维酸256头孢噻肟256头孢噻肟/克拉维酸256头孢吡肟256头孢曲松256头孢西丁256氨曲南256头孢哌酮/舒巴坦256哌拉西林/三唑巴坦256环丙沙星32阿米卡星256多重耐药肺炎克雷伯菌多重耐药肺炎克雷伯菌40优选内容转
23、化试验 抽提亚胺培南耐药的肺炎克雷伯菌质粒 转化DH5,在含1g/ml的亚胺培南的MH平板上筛选 成功筛选到亚胺培南耐药的转化菌(转化质粒约60kb)染色体带61kb41优选内容PCR PCR筛选内酰胺酶耐药基因包括TEM-1、SHV、CTX-M-1、CTX-M-9、OXA-48、VIM 、 OXA-10和KPC-1 以肺炎克雷伯菌质粒DNA为模板PCR阳性为TEM、SHV和KPC 转化菌和克隆菌只有KPC阳性 PCR产物测序分别为TEM-1、SHV-12和KPC-242优选内容转化菌质粒(亚胺培南耐药基因克隆)EcoR, Hind,Nhe等酶切酶切NhepTeasy VectorpTeasy
24、 Vector1.5kb在含亚胺培南在含亚胺培南1 g/ml MH平板筛选平板筛选43优选内容克隆片段测序 对重组质粒的插入片段进行步移测序,获得1554bp核苷酸 DNAssist软件分析,1个开放读码框(ORF) 经GenBank Blast程序分析,该ORF与KPC-2 ( GenBank注册号:AY210886) 的核苷酸序列同源性为100% 44优选内容D类酶类酶 (OXA酶)酶)在在Bush分群中属于分群中属于2d类,对苯唑西林的水解活性很强。类,对苯唑西林的水解活性很强。OXA型碳青霉烯酶对亚胺培南的水解活性较低,对头型碳青霉烯酶对亚胺培南的水解活性较低,对头孢他啶、头孢噻肟、氨
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