蛋白质翻译后加工及转运课件.ppt
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1、第十章第十章 多肽链折叠与翻译后加工多肽链折叠与翻译后加工2contents10.1 10.1 翻译后加工翻译后加工10.2 10.2 翻译后的定向与分拣翻译后的定向与分拣310.1 10.1 翻译后加工翻译后加工a:多肽链的剪切(内切)、修剪(外切):多肽链的剪切(内切)、修剪(外切) 切除去除某段氨基酸序列才能有活性切除去除某段氨基酸序列才能有活性前胰岛素原的后加工前胰岛素原的后加工b: N末端末端fMet或或Met的切除;的切除; N末端添加氨基酸末端添加氨基酸 去甲酰化酶;氨肽酶;氨酰去甲酰化酶;氨肽酶;氨酰tRNAtRNA: :蛋白质转移酶蛋白质转移酶d:特定氨基酸的修饰:特定氨基酸
2、的修饰 aaaa侧链的修饰包括磷酸化,乙酰化,甲基化,羧基化,侧链的修饰包括磷酸化,乙酰化,甲基化,羧基化,羟基化,糖基化羟基化,糖基化, ,等等。等等。c:二硫键形成:二硫键形成 通过两个通过两个CysCys的氧化作用生成。的氧化作用生成。e:蛋白质拼接:蛋白质拼接(Protein splicing is autocatalytic) 将一条多肽链内部的一段氨基酸序列切除,同时将两端将一条多肽链内部的一段氨基酸序列切除,同时将两端的蛋白质序列连接在一起的后加工方式。的蛋白质序列连接在一起的后加工方式。 被切除的序列称为被切除的序列称为内含肽内含肽(intein); 被保留并连接在一起的序列称
3、为被保留并连接在一起的序列称为外显肽外显肽(extein)。 Protein splicing is the autocatalytic process by which an intein is removed from a protein and the exteins on either side become connected by a standard peptide bond. 6蛋白质拼接图解蛋白质拼接图解 1990:Kane PM在酵母液泡中发现第一个在酵母液泡中发现第一个inteinH+-ATPase的催化亚基的催化亚基(内含肽内含肽)An intein is the pa
4、rt that is removed from a protein that is processed by protein splicing.(外显肽)(外显肽)Extein sequences remain in the mature protein that is produced by processing a precursor via protein splicing.蛋白质的剪接蛋白质的剪接由内含肽催化由内含肽催化。内含肽能以两侧外显肽直接相连的方式使自己从蛋白质上催化解离。内含肽能以两侧外显肽直接相连的方式使自己从蛋白质上催化解离。这些内含肽长度不等,仅仅存在于单细胞生物中。这
5、些内含肽长度不等,仅仅存在于单细胞生物中。8红海束毛藻的红海束毛藻的RIR基因的表达基因的表达 mRNA前体含前体含有有3个内含子;个内含子;蛋白质前体含蛋白质前体含有有4个内含肽。个内含肽。 RIP:核苷酸还原酶:核苷酸还原酶f:多肽链的折叠:多肽链的折叠依据折叠是否需要分子伴侣及需要何种分子伴侣,依据折叠是否需要分子伴侣及需要何种分子伴侣,细胞内蛋白质的折叠可分为:细胞内蛋白质的折叠可分为:We do not know what proportion of proteins can self-assemble as opposed to those that require assista
6、nce from a chaperone. 哪些蛋哪些蛋白能自我折叠,哪些需要分子伴侣的帮助,目前依然未知。白能自我折叠,哪些需要分子伴侣的帮助,目前依然未知。1.自我折叠(自我折叠( Self-assembly,不依赖分子伴侣,不依赖分子伴侣的折叠);的折叠);2.受热激蛋白受热激蛋白70(Hsp70)帮助的折叠;)帮助的折叠;3.受受hsp70和伴侣蛋白复合物帮助的折叠;和伴侣蛋白复合物帮助的折叠;10蛋白质折叠的三条途径蛋白质折叠的三条途径绝大多数蛋白质通过前绝大多数蛋白质通过前两种途径进行折叠。两种途径进行折叠。由于蛋白质折叠异常而造成由于蛋白质折叠异常而造成分子聚集甚至沉淀或不能正分
7、子聚集甚至沉淀或不能正常转运到位所引起的疾病还常转运到位所引起的疾病还有有老年性痴呆症、囊性纤维老年性痴呆症、囊性纤维病变、家族性高胆固醇症、病变、家族性高胆固醇症、家族性淀粉样蛋白症、某些家族性淀粉样蛋白症、某些肿瘤、白内障等肿瘤、白内障等。由于分子。由于分子伴侣在蛋白质折叠中至关重伴侣在蛋白质折叠中至关重要的作用,分子伴侣本身的要的作用,分子伴侣本身的突变显然会引起蛋白质折叠突变显然会引起蛋白质折叠异常而引起异常而引起折叠病折叠病。 自我自我折叠折叠受热激蛋白受热激蛋白70(Hsp70)帮)帮助的折叠助的折叠受受hsp70和和伴侣蛋白复伴侣蛋白复合物帮助的合物帮助的折叠折叠111蛋白质的自
8、我折叠蛋白质的自我折叠Self-assembly refers to the ability of a protein (or of a complex of proteins) to form its final structure without the intervention of any additional components (such as chaperones). Eg:核糖核酸酶:核糖核酸酶蛋白质翻译后折叠成有活性的形式:不必借助于其他蛋蛋白质翻译后折叠成有活性的形式:不必借助于其他蛋白质的帮助,自身就能完成。白质的帮助,自身就能完成。122蛋白质的折叠有时需要有分子伴侣
9、蛋白质的折叠有时需要有分子伴侣(Chaperone)受热激蛋白受热激蛋白70(Hsp70)帮助的折叠)帮助的折叠受受hsp70和伴侣蛋白复合物帮助的折叠和伴侣蛋白复合物帮助的折叠 分子伴侣:分子伴侣:是指能够结合和稳定另外一种蛋白质是指能够结合和稳定另外一种蛋白质的不稳定构象,并能通过有控制的结合和释放,的不稳定构象,并能通过有控制的结合和释放,促进新生多肽链的折叠、多聚体的装配或降解及促进新生多肽链的折叠、多聚体的装配或降解及细胞器蛋白的跨膜运输的一类蛋白质。细胞器蛋白的跨膜运输的一类蛋白质。 这个是从这个是从功能功能上定义的,凡具有这种功能的蛋白上定义的,凡具有这种功能的蛋白质都是分子伴侣
10、,但它们的质都是分子伴侣,但它们的结构可以完全不同结构可以完全不同。13分子伴侣的分类可分为两大类:可分为两大类:Hsp60:存在于真核生物的线粒:存在于真核生物的线粒体(哺乳动物中称为体(哺乳动物中称为Hsp58)、)、叶绿体中,原核生物中称为叶绿体中,原核生物中称为GroEL。Hsp90主要与主要与hsp70协同作用,但主要是针对一些参与信号转导途径中的特协同作用,但主要是针对一些参与信号转导途径中的特殊的蛋白质,尤其是类固醇激素受体和信号传导途径中的激酶。殊的蛋白质,尤其是类固醇激素受体和信号传导途径中的激酶。Hsp90、Hsp70、Hsp60都是高度保守的蛋白质家族。都是高度保守的蛋白
11、质家族。寡聚体结构寡聚体结构:I类和类和II类蛋白质类蛋白质寡聚体,可作用于许多腔内蛋寡聚体,可作用于许多腔内蛋白的折叠白的折叠独立个体结构独立个体结构:Hsp70和其他和其他相关的蛋白质,可作用于许多相关的蛋白质,可作用于许多靶蛋白的折叠靶蛋白的折叠分子伴侣分子伴侣This is accomplished by binding to reactive surfaces in the target protein that are exposed during the assembly process, and preventing those surfaces from interactin
12、g with other regions of the protein to form an incorrect conformation. 通过通过控制活性表面的可接近性控制活性表面的可接近性来影响折叠的进程。来影响折叠的进程。Chaperones function by preventing formation of incorrect structures rather than by promoting formation of correct structures.折叠过程是一个正确途径和错误途径相互竞争的过程。折叠过程是一个正确途径和错误途径相互竞争的过程。伴侣分子在功能伴侣分子在
13、功能上:阻止错误结构的形成,更甚于促进正确结构的形成。上:阻止错误结构的形成,更甚于促进正确结构的形成。没有分子伴侣存在的情况下没有分子伴侣存在的情况下:蛋白质的疏水性区域通常活性蛋白质的疏水性区域通常活性不高,翻译后通常会随机聚集不高,翻译后通常会随机聚集在一起。在一起。有分子伴侣存在的情况下有分子伴侣存在的情况下:分子伴分子伴侣侣与没有折叠的蛋白相互作用,阻与没有折叠的蛋白相互作用,阻止它们的不正确折叠并指导正确折止它们的不正确折叠并指导正确折叠。叠。活性表面之间的相互作用会促进蛋白质的折叠。而这些活性表面通常是由暴露的氨活性表面之间的相互作用会促进蛋白质的折叠。而这些活性表面通常是由暴露
14、的氨基酸的疏水性侧链组成。它们的相互作用能够形成一个疏水核心。当新生肽链在核基酸的疏水性侧链组成。它们的相互作用能够形成一个疏水核心。当新生肽链在核糖体上时,其疏水侧链片段很容易聚集。这种结合随机发生,会使得蛋白质不容易糖体上时,其疏水侧链片段很容易聚集。这种结合随机发生,会使得蛋白质不容易折叠成正确的构象。折叠成正确的构象。162.1受热激蛋白受热激蛋白70(Hsp70)帮助的折叠)帮助的折叠A typical Hsp70 has two domains: the N-terminal domain is an ATPase; and the C-terminal domain binds
15、the substrate polypeptide.When bound to ATP, Hsp70 binds and releases substrates rapidly; when bound to ADP, the reactions are slow. Recycling between these states is regulated by two other proteins, Hsp40 (DnaJ) and GrpE. Hsp70为单体蛋白,典型的为单体蛋白,典型的Hsp70有两个基本的结构域:有两个基本的结构域:N端是端是ATPase,C端结构域则结合底物多肽端结构域则
16、结合底物多肽。与。与 ATP结合时,结合时,Hsp70可可迅速结合并释放底物;与迅速结合并释放底物;与 ADP结合时,反应速度较慢。结合时,反应速度较慢。 这两种状这两种状态的转换需要态的转换需要Hsp40 (DnaJ)和和GrpE这两种蛋白质因子的调控。这两种蛋白质因子的调控。Different members of the Hsp70 class function on various types of target proteins. 17作用机制作用机制通过通过ATP水解功水解功能来改变底物蛋白的折叠构象能来改变底物蛋白的折叠构象从核糖体上出来(新生肽链)或刚从膜通道上出来(或者发生变
17、从核糖体上出来(新生肽链)或刚从膜通道上出来(或者发生变性)的底物蛋白还是未折叠状态,可吸引伴侣分子与之原位结合,性)的底物蛋白还是未折叠状态,可吸引伴侣分子与之原位结合,通过通过ATP水解功能来改变底物蛋白的折叠构象水解功能来改变底物蛋白的折叠构象。the Hsp70 system consists of individual proteins that bind to, and act on, the substrates whose folding is to be controlled. it controls the interactions between exposed reac
18、tive regions of the protein, enabling it to fold into the correct conformation in situ(原位)(原位). The components of the system are Hsp70, Hsp40, and GrpE. The Hsp70 and Hsp40 proteins bind individually to the substrate proteins. They use hydrolysis of ATP to provide the energy for changing the structu
19、re of the substrate protein.Frydman, J. (2001). . Annu. Rev. Biochem. 70, 603-647. What feature does Hsp70 recognize in a target protein?Hsp70识别蛋白质的区域主要是在一段疏水性强的区域识别蛋白质的区域主要是在一段疏水性强的区域It binds to a linear stretch of amino acids embedded in a hydrophobic(疏水性疏水性) context. This is precisely the sort of
20、 motif that is buried in the hydrophobic core of a properly folded, mature protein. Its exposure therefore indicates that the protein is nascent or denatured. Motifs of this nature occur about every 40 amino acids. Binding to the motif prevents it from misaggregating with another one.Hsp70可结合一段处于疏水核
21、心的线性氨基酸可结合一段处于疏水核心的线性氨基酸这通常是正确折叠的这通常是正确折叠的成熟蛋白质的疏水核心基序。如果它暴露在蛋白质表面,说明这个蛋白成熟蛋白质的疏水核心基序。如果它暴露在蛋白质表面,说明这个蛋白质是新合成或变性的。质是新合成或变性的。 约约40个氨基酸就有一个类似的基序。与这些基个氨基酸就有一个类似的基序。与这些基序的结合可阻止其与另一个蛋白质的错误聚集。序的结合可阻止其与另一个蛋白质的错误聚集。2.2受受hsp70和伴侣蛋白复合物帮助的折叠和伴侣蛋白复合物帮助的折叠分子伴侣系统构成一个很大的寡聚复合体,分子伴侣系统构成一个很大的寡聚复合体,在其内部,底物蛋白进在其内部,底物蛋白
22、进行折叠,折叠之后再出来行折叠,折叠之后再出来。 伴侣蛋白形成伴侣蛋白形成笼状的结构笼状的结构,将部分折叠,将部分折叠的蛋白质彼此隔离开来,进行依赖于的蛋白质彼此隔离开来,进行依赖于ATP的折叠。这提供了一种理的折叠。这提供了一种理想的折叠环境。想的折叠环境。GroEL/GroES系统在所有生物中都有。在真核生物细胞质中则有系统在所有生物中都有。在真核生物细胞质中则有TRiC系统。系统。a chaperonin system consists of a large oligomeric assembly (represented as a cylinder). This assembly fo
23、rms a structure into which unfolded proteins are inserted. The protected environment directs their folding. There are two types of chaperonin system. GroEL/GroES is found in all classes of organism. TRiC is found in eukaryotic cytosol. 20E.Coli的伴侣蛋白是的伴侣蛋白是GroEL/GroES复合物复合物10.2 10.2 蛋白质翻译后的定向与分拣蛋白质翻译
24、后的定向与分拣细胞胞质中合成的蛋白质最终的细胞胞质中合成的蛋白质最终的定位可分为两类定位可分为两类:Protein sorting (targeting) is the direction of different types of proteins for transport into or between specific organelles. 蛋白质的蛋白质的分拣分拣 (sorting ) 或或定位定位 (targeting)指的是不同类型的指的是不同类型的蛋白质横穿各种膜结构以寻找其目的地的过程。蛋白质横穿各种膜结构以寻找其目的地的过程。与膜结合的蛋白质与膜结合的蛋白质(内质网、高尔
25、基体、溶酶体、内体(内质网、高尔基体、溶酶体、内体endosome以及分泌到胞外的蛋白)以及分泌到胞外的蛋白)定位于:定位于:ER-Golgi系统及胞外系统及胞外不与膜结合的蛋白质不与膜结合的蛋白质(细胞质、细胞核、线粒体、质体(细胞质、细胞核、线粒体、质体(叶绿体叶绿体)、过氧化物酶体等的蛋白)过氧化物酶体等的蛋白)定位于:细胞器定位于:细胞器定位于细胞器的蛋白质是在胞质的定位于细胞器的蛋白质是在胞质的游离的核糖体中合游离的核糖体中合成(翻译后转运途径)成(翻译后转运途径); Proteins that are imported into cytoplasmic organelles are
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