蛋白质的生物合成课件.ppt
- 【下载声明】
1. 本站全部试题类文档,若标题没写含答案,则无答案;标题注明含答案的文档,主观题也可能无答案。请谨慎下单,一旦售出,不予退换。
2. 本站全部PPT文档均不含视频和音频,PPT中出现的音频或视频标识(或文字)仅表示流程,实际无音频或视频文件。请谨慎下单,一旦售出,不予退换。
3. 本页资料《蛋白质的生物合成课件.ppt》由用户(三亚风情)主动上传,其收益全归该用户。163文库仅提供信息存储空间,仅对该用户上传内容的表现方式做保护处理,对上传内容本身不做任何修改或编辑。 若此文所含内容侵犯了您的版权或隐私,请立即通知163文库(点击联系客服),我们立即给予删除!
4. 请根据预览情况,自愿下载本文。本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
5. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007及以上版本和PDF阅读器,压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 蛋白质 生物 合成 课件
- 资源描述:
-
1、第十六章第十六章 蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成主要内容主要内容一、一、蛋白质的合成体系蛋白质的合成体系二、二、蛋白质合成的过程蛋白质合成的过程三、蛋白质合成与药物三、蛋白质合成与药物四、蛋白质合成后的折叠与加工四、蛋白质合成后的折叠与加工五、蛋白质的转运与定位五、蛋白质的转运与定位六、蛋白质合成的调控六、蛋白质合成的调控蛋白质生物合成体系的基本组成蛋白质生物合成体系的基本组成u基本原料基本原料 20种编码氨基酸种编码氨基酸u模合成板模合成板 mRNAu搬运工搬运工 tRNAu合成场所合成场所 核糖体(核糖体(rRNA-蛋白质复合物)蛋白质复合物)u主要酶和蛋白质因子主要酶和蛋白质因子 氨基
2、酰氨基酰-tRNA合成酶、转合成酶、转肽酶、起始因子、延长因子、释放因子等等肽酶、起始因子、延长因子、释放因子等等u能源物质能源物质 ATP、GTPu无机离子无机离子 Mg2+、 K+第一节第一节 蛋白质的合成体系蛋白质的合成体系一、一、mRNA是蛋白质生物合成的模板是蛋白质生物合成的模板 从从mRNA 5-端起始密码子端起始密码子AUG到到3-端终止端终止密码子之间的核苷酸序列,称为密码子之间的核苷酸序列,称为开放阅读框架开放阅读框架(open reading frame, ORF)。Start of genetic messageCapEndTail5-端非翻译区端非翻译区 5 3 3-端
3、非翻译区端非翻译区 开放阅读框架开放阅读框架 (一)阅读框架)(一)阅读框架) 原核生物翻译模板原核生物翻译模板mRNAumRNA为多顺反子,即一条为多顺反子,即一条mRNA链可以翻译出链可以翻译出多种功能相关的蛋白质多种功能相关的蛋白质u多顺反子的基因与基因间可能有多顺反子的基因与基因间可能有间隔序列间隔序列,也可,也可能出现相互重叠的现象能出现相互重叠的现象umRNA为单顺反子,即一条为单顺反子,即一条mRNA链只能翻链只能翻译出一条多肽链译出一条多肽链u真核生物为断裂基因,故转录后的真核生物为断裂基因,故转录后的hnRNA需切除内含子、连接外显子才能成为有活性需切除内含子、连接外显子才能
4、成为有活性的的mRNA真核生物翻译模板真核生物翻译模板mRNA(二)遗传密码(二)遗传密码5GCAGTACATGTC 33 c g t c a t g t a c a g 5编码链编码链模板链模板链5GCAGUACAUGUC 3mRNAN Ala Val His Val C蛋白质蛋白质转录转录翻译翻译在在mRNA的开放阅读框架区,以每的开放阅读框架区,以每3个相邻的核苷个相邻的核苷酸为一组,代表一种氨基酸酸为一组,代表一种氨基酸(或其他信息或其他信息),这种三,这种三联体形式的核苷酸序列称为联体形式的核苷酸序列称为密码子密码子(codon)。特殊功能的密码子特殊功能的密码子起始密码子:起始密码
5、子:AUG终止密码子:终止密码子:UAA、UAG、UGA(无意义密(无意义密码子)码子)遗遗传传密密码码表表一、蛋白质的合成体系一、蛋白质的合成体系mRNA遗传密码的特点遗传密码的特点(1)方向性)方向性(directional) 翻译时遗传密码的阅读方向是翻译时遗传密码的阅读方向是53,即读码,即读码从从mRNA的起始密码子的起始密码子AUG开始,按开始,按53的方向的方向逐一阅读,直至终止密码子。逐一阅读,直至终止密码子。 NC肽链延伸方向肽链延伸方向53读码方向读码方向3. mRNA遗传密码的特点遗传密码的特点(2)连续性)连续性(non-punctuated) 编码蛋白质氨基酸序列的各
6、个三联体密码连续编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码子及密码子的各碱基之间既无间隔也无阅读,密码子及密码子的各碱基之间既无间隔也无交叉。交叉。AlaValHisMet终止密码终止密码mRNA序列可能存在的的三种阅读框架序列可能存在的的三种阅读框架但往往只有一种阅读方式是正确的但往往只有一种阅读方式是正确的框移突变框移突变 基因损伤引起基因损伤引起mRNA阅读框架内的碱基发生插阅读框架内的碱基发生插入或缺失,则有可能导致翻译阅读框架的改变,这入或缺失,则有可能导致翻译阅读框架的改变,这种基因突变称为种基因突变称为移码突变移码突变。缬缬 脯脯 苏苏 天冬天冬缬缬 丙丙 酪酪 甘甘缬缬
7、 丙丙 丝丝 精精(3)简并性)简并性(degeneracy) 1种氨基酸可具有种氨基酸可具有2个或个或2个以上的密码子为其个以上的密码子为其编码的特性称为遗传密码的编码的特性称为遗传密码的简并性简并性。 在遗传密码表中,只有在遗传密码表中,只有1个密码子的氨基酸仅个密码子的氨基酸仅为为蛋氨酸蛋氨酸和和色氨酸色氨酸,其余,其余18个氨基酸都有两个以上个氨基酸都有两个以上的密码子。的密码子。简并性简并性l为同一种氨基酸编码的各密码子称为为同一种氨基酸编码的各密码子称为密码子家族密码子家族,又称为又称为同义密码子同义密码子或或简并性密码子简并性密码子。l简并性主要发生在简并性主要发生在密码子的第三
8、位碱基,故该碱密码子的第三位碱基,故该碱基改变时往往不影响氨基酸的翻译,基因的这种基改变时往往不影响氨基酸的翻译,基因的这种突变称为突变称为同义突变同义突变。 ACUACCACAACG苏氨酸苏氨酸UGUUGCUGAUGG缬氨酸缬氨酸 CUU CUCUUG CUAUUA CUG亮氨酸亮氨酸错义突变、无义突变错义突变、无义突变u错义突变错义突变 是编码某种氨基酸的密码子经碱基替是编码某种氨基酸的密码子经碱基替换以后换以后,变成编码另一种氨基酸的密码子变成编码另一种氨基酸的密码子,从而使从而使多肽链的氨基酸种类和序列发生改变。多肽链的氨基酸种类和序列发生改变。如:如: GAG GUG谷氨酸谷氨酸 缬
9、氨酸缬氨酸u无义突变无义突变 是指由于某个碱基的改变使代表某种是指由于某个碱基的改变使代表某种氨基酸的密码子突变为终止密码子,从而使肽链氨基酸的密码子突变为终止密码子,从而使肽链合成提前终止。合成提前终止。 如:如: UAC UAA酪氨酸酪氨酸 终止密码终止密码(4)摆动性)摆动性(wobble) 反密码子与密码子之间的配对有时并不严格遵反密码子与密码子之间的配对有时并不严格遵守常见的碱基配对规律的现象称为守常见的碱基配对规律的现象称为摆动性摆动性。 摆动性仅发生在摆动性仅发生在tRNA反密码子的第反密码子的第1个核苷酸个核苷酸与与mRNA密码子的第密码子的第3个核苷酸之间的碱基配对。个核苷酸
10、之间的碱基配对。tRNA反密码子反密码子第第1位碱基位碱基IUGACmRNA密码子密码子第第3位碱基位碱基U, C, AA, GU, CUG摆动性摆动性异亮氨酸异亮氨酸U(同义突变)(同义突变)1 2 33 2 1(5)通用性通用性(universal) 从简单的病毒到高等的人类,几乎使用同一套从简单的病毒到高等的人类,几乎使用同一套遗传密码,因此,遗传密码表中的这套遗传密码,因此,遗传密码表中的这套“通用密码通用密码”基本上适用于生物界的所有物种,具有通用性。基本上适用于生物界的所有物种,具有通用性。 密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。祖先
11、。密码子通用性的例外密码子通用性的例外 动物动物线粒体线粒体及植物及植物叶绿体叶绿体内的部分密码子与通内的部分密码子与通用密码子不同。用密码子不同。 通用密码通用密码 线粒体密码线粒体密码AUA 异亮异亮 蛋、起始蛋、起始AGA 精精 终止终止AGG 精精 终止终止UGA 终止终止 色色1. tRNA的分子结构的分子结构l 3端端CCA氨基酸结合位点(氨基酸臂)氨基酸结合位点(氨基酸臂)l 氨基酰氨基酰tRNA合成酶识别位点(二氢尿嘧啶环)合成酶识别位点(二氢尿嘧啶环)l 核糖体识别位点(核糖体识别位点(TC环)环)l 密码子识别位点(反密码环)密码子识别位点(反密码环) tRNA tRNA有
12、超过有超过2020种。一种氨基酸可与多种对应的种。一种氨基酸可与多种对应的tRNAtRNA结合,而一种结合,而一种tRNAtRNA只能转运一种特定的氨基酸。只能转运一种特定的氨基酸。二、二、tRNA搬运氨基酸搬运氨基酸tRNA的二级结构的二级结构2. 氨基酸的活化与氨基酰氨基酸的活化与氨基酰-tRNA合成酶合成酶(1)氨基酸的活化反应)氨基酸的活化反应(2)氨基酰)氨基酰-tRNA合成酶合成酶(3)氨基酰)氨基酰-tRNA的表示方法的表示方法 Asp-tRNAAsp、Met-tRNAMet等等等等 起始氨基酰起始氨基酰-tRNA表示方法表示方法l真核生物:真核生物:Met-tRNAiMetl原
13、核生物:原核生物:fMet-tRNAifMetfMet-tRNAfMet-tRNAi iMetMet的生成是一碳化合物转移和的生成是一碳化合物转移和利用的过程之一,反应由转甲酰基酶催化,甲利用的过程之一,反应由转甲酰基酶催化,甲酰基从酰基从N N1010- -甲酰四氢叶酸转移到甲硫氨酸的甲酰四氢叶酸转移到甲硫氨酸的-氨基上。氨基上。 1. 核糖体的组成核糖体的组成 核糖体又称核蛋白体,是由核糖体又称核蛋白体,是由rRNA和多种蛋白和多种蛋白质结合而成的一种大的核糖核蛋白颗粒,是蛋白质质结合而成的一种大的核糖核蛋白颗粒,是蛋白质生物合成的场所。生物合成的场所。三、三、rRNA与核糖体与核糖体核蛋
14、白体的组成核蛋白体的组成2. 核糖体的结构核糖体的结构 原核生物核糖体内的主要活性部位:原核生物核糖体内的主要活性部位:mRNA结合部位结合部位氨基酰氨基酰tRNA结合部位(氨基酰位,结合部位(氨基酰位,A位)位)肽酰肽酰tRNA结合部位(肽酰位,结合部位(肽酰位,P位)位)tRNA排出部位(排出位,排出部位(排出位,E位;位;真核生物无真核生物无E位位)转肽酶部位(肽基转移酶,完成肽键的缩合)转肽酶部位(肽基转移酶,完成肽键的缩合)转位酶部位(使核糖体在转位酶部位(使核糖体在mRNA上滑动)上滑动)核糖体活性部位核糖体活性部位3. 核糖体核糖体RNA的功能的功能u组装核糖体的大亚基、小亚基组
15、装核糖体的大亚基、小亚基u催化肽键的生成催化肽键的生成 转肽酶转肽酶实际上是一种实际上是一种核酶。核酶。在原核生物转肽酶在原核生物转肽酶活性位于活性位于23S rRNA;在真核生物则位于;在真核生物则位于28S rRNA。16S rRNA中一些重要的功能位点中一些重要的功能位点4.多聚核糖体多聚核糖体 氨基酸活化氨基酸活化 肽链合成的起始肽链合成的起始 肽链的延长肽链的延长 肽链的终止肽链的终止第二节第二节 原核生物蛋白质合成的过程原核生物蛋白质合成的过程(1)氨基酸的活化反应)氨基酸的活化反应氨基酸氨基酸 + tRNA + ATP氨基酰氨基酰-tRNA合成酶合成酶氨基酰氨基酰-tRNA +
16、AMP + PPi一、一、 氨基酸的活化与氨基酰氨基酸的活化与氨基酰-tRNA合成酶合成酶氨基酰氨基酰-tRNA合成酶作用机理合成酶作用机理 氨基酸氨基酸ATP-E 氨基酰氨基酰-AMP-E PPi 氨基酰氨基酰-AMP-EtRNA 氨基酰氨基酰-tRNAAMPE氨基酰氨基酰-tRNA合成酶作用特点合成酶作用特点l 氨基酰氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和合成酶对底物氨基酸和tRNA都都有高有高度特异性度特异性l 氨基酰氨基酰-tRNA合成酶具有高效的合成酶具有高效的校正活性校正活性氨基酰氨基酰-tRNA合成酶具有高度特异性合成酶具有高度特异性氨基酰氨基酰-tRNA合成酶具有高效的校正活性合
17、成酶具有高效的校正活性动力学校正动力学校正化学校正化学校正酶的特异性酶的特异性酯酶水解活性酯酶水解活性氨基酸活化的意义氨基酸活化的意义:(1)有利于在核糖体上形成肽键有利于在核糖体上形成肽键。(2)利于将氨基酸正确送到核糖体特定位置。)利于将氨基酸正确送到核糖体特定位置。参与翻译的蛋白质因子参与翻译的蛋白质因子l 起始因子起始因子(initiation factor,IF)l 延长因子延长因子(elongation factor,EF)l 释放因子释放因子(release factor,RF)二、二、翻译的起始翻译的起始参与参与原核生物原核生物翻译的蛋白质因子翻译的蛋白质因子种类种类生物学功能
18、生物学功能起始因子起始因子IF-1IF-1占据占据A A位防止结合其他位防止结合其他tRNAtRNAIF-2IF-2促进起始促进起始tRNAtRNA与小亚基结合与小亚基结合IF-3IF-3促进大小亚基分离,提高促进大小亚基分离,提高P P位对结合起始位对结合起始tRNAtRNA的敏感性的敏感性延长因子延长因子EF-TuEF-Tu促进氨基酰促进氨基酰-tRNA-tRNA进入进入A A位,结合并分解位,结合并分解GTPGTPEF-TsEF-Ts调节亚基调节亚基EF-GEF-G有转位酶活性,促进有转位酶活性,促进mRNA-mRNA-肽酰肽酰-tRNA-tRNA由由A A位移至位移至P P位,促进位,
19、促进tRNAtRNA卸载与释放卸载与释放释放因子释放因子RF-1RF-1特异识别特异识别UAAUAA、UAGUAG,诱导转肽酶转变为酯酶,诱导转肽酶转变为酯酶RF-2RF-2特异识别特异识别UAAUAA、UGAUGA,诱导转肽酶转变为酯酶,诱导转肽酶转变为酯酶RF-3RF-3可与核蛋白体其他部位结合,有可与核蛋白体其他部位结合,有GTPGTP酶活性,能介导酶活性,能介导RF-1RF-1及及RF-2RF-2与核蛋白体的相互作用与核蛋白体的相互作用1. 原核生物的翻译起始过程原核生物的翻译起始过程(1)核蛋白体大小亚基分离)核蛋白体大小亚基分离(2)mRNA在小亚基定位结合在小亚基定位结合(3)起
20、始)起始fMet-tRNAifMet的结合的结合 (4)核蛋白体大亚基结合)核蛋白体大亚基结合IF-3IF-1(1)核蛋白体大小亚基分离)核蛋白体大小亚基分离A U G53IF-3IF-1(2)mRNA在小亚基定位结合在小亚基定位结合mRNA在核蛋白体小亚基上准确定位机制在核蛋白体小亚基上准确定位机制 在各种在各种mRNA起始起始AUG上游约上游约813核苷酸部核苷酸部位,存在一段由位,存在一段由49个核苷酸组成的一致序列,富个核苷酸组成的一致序列,富含嘌呤碱基,如含嘌呤碱基,如-AGGAGG-,称为,称为SD序列序列(Shine-Dalgarno sequence),又称核蛋白体结),又称核
21、蛋白体结合位点(合位点(ribosomal binding site, RBS)。)。 一条多顺反子一条多顺反子mRNA序列上的每个基因编码序序列上的每个基因编码序列均拥有各自的列均拥有各自的SD序列和起始序列和起始AUG。u小亚基中的小亚基中的16S-rRNA 3-端有一富含嘧啶碱基的端有一富含嘧啶碱基的短序列,如短序列,如-UCCUCC-,通过与,通过与SD序列序列碱基互补碱基互补而使而使mRNA与小亚基结合。与小亚基结合。umRNA序列上紧接序列上紧接SD序列后的序列后的小核苷酸序列小核苷酸序列,可,可被核蛋白体小亚基蛋白被核蛋白体小亚基蛋白rpS-1识别并结合。识别并结合。mRNA在核
22、蛋白体小亚基上准确定位机制在核蛋白体小亚基上准确定位机制多顺反子中通常存在多个多顺反子中通常存在多个SD序列序列IF-3IF-1IF-2GTPA U G53(3)起始氨基酰)起始氨基酰tRNA结合到小亚基结合到小亚基IF-3IF-1IF-2GTPGDPPiA U G53(4)核蛋白体大亚基结合,起始复合物形成)核蛋白体大亚基结合,起始复合物形成IF-3IF-1A U G53IF-2GTPIF-2-GTPGDPPi起始复合物形成过程起始复合物形成过程三、三、翻译的延伸翻译的延伸核糖体循环核糖体循环延长因子及其功能延长因子及其功能EFeEF生物学功能生物学功能EF-TueEF-1a a结合结合GT
23、P, 携带氨基酰携带氨基酰-tRNA进入进入A位位EF-TseEF-1bgbg GTP交换蛋白交换蛋白, 使使EF-Tu上的上的GDP交换交换成成GTPEF-GeEF-2单体单体G蛋白蛋白, 具有具有GTPase活性活性, 水解水解GTP, 发挥转位酶作用发挥转位酶作用, 促进肽酰促进肽酰-tRNA由由A位移至位移至P位位肽链延长在核蛋白体上连续循环式进行,又称为核肽链延长在核蛋白体上连续循环式进行,又称为核蛋白体循环蛋白体循环(ribosomal cycle)。 翻译延伸包括以下三步:翻译延伸包括以下三步:(1)进位)进位(positioning)(2)成肽)成肽(peptide bond
24、formation)(3)转位)转位(translocation) 每轮循环使多肽链增加一个氨基酸残基。每轮循环使多肽链增加一个氨基酸残基。(1)进位)进位 是指一个氨基酰是指一个氨基酰-tRNA按照按照mRNA模板的指令模板的指令进入并结合到核蛋白体进入并结合到核蛋白体A位的过程。位的过程。进位进位Tu TsGTPGDPA U G53TuTsGTP进位进位(1)进位)进位(2)成肽)成肽 成肽是在转肽酶成肽是在转肽酶(peptidase)的催化下,核蛋白的催化下,核蛋白体体P位上起始氨基酰位上起始氨基酰-tRNA的的N-甲酰甲硫氨酰基或甲酰甲硫氨酰基或肽酰肽酰-tRNA的肽酰基转移到的肽酰基
25、转移到A位并与位并与A位上氨基酰位上氨基酰-tRNA的的a a-氨基结合形成肽键的过程。氨基结合形成肽键的过程。 (二)翻译的延伸(二)翻译的延伸成肽成肽成肽成肽P位位A位位P位位A位位(1)进位)进位(2)成肽)成肽(3)转位)转位 转位是在转位是在转位酶转位酶EF-G的催化下,核蛋白体向的催化下,核蛋白体向mRNA的的3-端端移动一个密码子的距离移动一个密码子的距离,使,使mRNA序序列上的下一个密码子进入核蛋白体的列上的下一个密码子进入核蛋白体的A位、而占据位、而占据A位的肽酰位的肽酰-tRNA移入移入P位的过程。位的过程。(二)翻译的延伸(二)翻译的延伸转位转位fMetA U G53f
展开阅读全文