从而调节酶活性这类酶称为共价修饰酶-物理与电子科课件.ppt
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1、第十章第十章 酶的作用机制和酶的调节酶的作用机制和酶的调节一、酶的活性部位一、酶的活性部位二、酶催化反应的独特性质二、酶催化反应的独特性质三、影响酶催化效率的有关因素三、影响酶催化效率的有关因素四、酶催化反应机制的实例四、酶催化反应机制的实例五、酶活性的调节控制五、酶活性的调节控制六、同工酶六、同工酶楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国一、酶的活性部位一、酶的活性部位活性中心:酶分子中结合底物并起催化作用的少数氨基活性中心:酶分子中结合底物并起催化作用的少数氨基酸残基,包括底物结合部位(决定酶的专一性)、催化酸残基,包括底物结合部位(决定酶的专一性)、催化部位
2、(决定酶所催化反应的性质)。部位(决定酶所催化反应的性质)。频率最高的活性中心的氨基酸残基:频率最高的活性中心的氨基酸残基:SerSer、HisHis、CysCys、TyrTyr、AspAsp、GluGlu、LysLys。不需要辅酶的酶:活性中心是酶分子在三维结构上比较不需要辅酶的酶:活性中心是酶分子在三维结构上比较靠近的少数几个氨基酸残基或是这些残基的某些基团。靠近的少数几个氨基酸残基或是这些残基的某些基团。 需要辅酶的酶:辅酶分子或辅酶分子的某一部分结构往需要辅酶的酶:辅酶分子或辅酶分子的某一部分结构往往就是活性中心的组成部分。往就是活性中心的组成部分。(一)酶活性部位的特点(一)酶活性部
3、位的特点楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国接触残基:接触残基:R1、R2、R6、R8、R9、R163辅助残基:辅助残基:R3、R4、R5、R164、R165结构残基:结构残基:R10、R162、R169非贡献残基:其它非贡献残基:其它楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国酶蛋白酶蛋白必需残基必需残基非必需残基非必需残基活性中心活性中心活性中心外活性中心外接触残基接触残基辅助残基辅助残基结构残基结构残基结合残基结合残基催化基团催化基团(1 1)接触残基:)接触残基:结合基团,催化基团。结合基团,催化基团。(2 2)辅助残基:)辅
4、助残基:不与底物接触,辅助酶与底物结合,协助不与底物接触,辅助酶与底物结合,协助接触残基。接触残基。上述两类残基构成上述两类残基构成酶活性中心酶活性中心。(3 3)结构残基:)结构残基:维持酶分子三维构象,与酶活性相关,但维持酶分子三维构象,与酶活性相关,但不在酶活性中心范围内,属于酶活性中心以外的必需残基。不在酶活性中心范围内,属于酶活性中心以外的必需残基。上述三类残基统称酶的上述三类残基统称酶的必需基团必需基团(4 4)非贡献残基(非必需基团)非贡献残基(非必需基团)可能在免疫,酶活性调节,运输转移,防止降解等方面起作可能在免疫,酶活性调节,运输转移,防止降解等方面起作用。用。 酶活性部位
5、的特点:酶活性部位的特点:(1 1)活性部位在酶分子的总体中只占相当小的部分,)活性部位在酶分子的总体中只占相当小的部分,往往只占整个酶分子体积的往往只占整个酶分子体积的1%-2%1%-2% ;(2 2)酶的活性部位是一个三维实体,)酶的活性部位是一个三维实体,具有三维空间结具有三维空间结构构。 活性中心的空间构象不是刚性的,在与底物接触活性中心的空间构象不是刚性的,在与底物接触时表现出一定的柔性和运动性。(邹承鲁研究酶变性的时表现出一定的柔性和运动性。(邹承鲁研究酶变性的工作)工作)(3 3)通过诱导契合酶和底物结合;)通过诱导契合酶和底物结合;(4 4)酶的活性部位是位于酶表面的一个裂隙内
6、,裂隙)酶的活性部位是位于酶表面的一个裂隙内,裂隙内是一个相当疏水的环境,从而有利于同底物的结合;内是一个相当疏水的环境,从而有利于同底物的结合;(5 5)底物通过次级键较弱的力结合到酶上。)底物通过次级键较弱的力结合到酶上。楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(二)研究酶活性部位的方法(二)研究酶活性部位的方法(1 1)通过酶的专一性:)通过酶的专一性:研究酶的专一性底物的结构特研究酶的专一性底物的结构特点、酶的竞争性抑制剂结构特点等。点、酶的竞争性抑制剂结构特点等。(2 2)酶的化学修饰法:)酶的化学修饰法:例如例如1.1.用用共价修饰的试剂共价修饰的试剂
7、作用作用于酶,查明保持酶活力的必需基团;于酶,查明保持酶活力的必需基团;2.2.亲和标记(合成亲和标记(合成底物类似物);底物类似物);3.3.SHSH保护剂的使用。保护剂的使用。(3 3)X X射线晶体衍射法射线晶体衍射法(4 4)分子生物学的方法)分子生物学的方法楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国二、酶催化反应的独特性质二、酶催化反应的独特性质(1 1)酶反应分为两类:仅涉及)酶反应分为两类:仅涉及电子转移电子转移和涉及和涉及电子和电子和质子两者或者其他基团的转移质子两者或者其他基团的转移。(2 2)催化作用是以氨基酸侧链上的功能基团和辅酶为)催化作用是
8、以氨基酸侧链上的功能基团和辅酶为媒介。媒介。(3 3)酶催化反应的最适)酶催化反应的最适pHpH范围通常狭小。范围通常狭小。(4 4)酶分子很大,而活性部位通常只比底物稍大一些,)酶分子很大,而活性部位通常只比底物稍大一些,一个巨大的酶结构对稳定活性部位的构象是必要的。一个巨大的酶结构对稳定活性部位的构象是必要的。(5 5)酶具有复杂的折叠结构。)酶具有复杂的折叠结构。楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国三、影响酶催化效率的有关因素三、影响酶催化效率的有关因素(一)底物和酶的邻近效应与定向效应(一)底物和酶的邻近效应与定向效应邻近效应:邻近效应:酶与底物形成中
9、间复合物后使底物之间、酶酶与底物形成中间复合物后使底物之间、酶的催化基团与底物之间相互靠近,提高了反应基团的有的催化基团与底物之间相互靠近,提高了反应基团的有效浓度。效浓度。定向效应:定向效应:由于酶的构象作用,底物的反应基团之间、由于酶的构象作用,底物的反应基团之间、酶与底物的反应基团之间正确取向的效应。酶与底物的反应基团之间正确取向的效应。酶把底物分子从溶液中富集出来,使它们固定在活性中酶把底物分子从溶液中富集出来,使它们固定在活性中心附近,反应基团相互邻近,同时使反应基团的分子轨心附近,反应基团相互邻近,同时使反应基团的分子轨道以正确方位相互交叠,反应易于发生。道以正确方位相互交叠,反应
10、易于发生。楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国邻近效应与定向效应对反应速度的影响:邻近效应与定向效应对反应速度的影响:使底物浓度在活性中心附近很高使底物浓度在活性中心附近很高酶对底物分子的电子轨道具有导向作用酶对底物分子的电子轨道具有导向作用酶使分子间反应转变成分子内反应酶使分子间反应转变成分子内反应邻近效应和定向效应对底物起固定作用邻近效应和定向效应对底物起固定作用 楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(二)底物的形变和诱导契合(二)底物的形变和诱导契合酶
11、中某些基团可使底物分子的敏感键中某些基团的电子云酶中某些基团可使底物分子的敏感键中某些基团的电子云密度变化,产生电子张力,降低了底物的活化能。密度变化,产生电子张力,降低了底物的活化能。酶从低活性形式转变为高酶从低活性形式转变为高活性形式,利于催化。活性形式,利于催化。底物形变,利于形成底物形变,利于形成ESES复复合物。合物。底物构象变化,过度态结底物构象变化,过度态结构,大大降低活化能。构,大大降低活化能。ZnZnGlu270Tyr248Arg145底物底物 (三)酸碱催化(三)酸碱催化酶分子的一些功能基团起瞬时质子供体或质子受体的作用。酶分子的一些功能基团起瞬时质子供体或质子受体的作用。
12、影响酸碱催化反应速影响酸碱催化反应速度的两个因素度的两个因素酸碱强度酸碱强度(pK(pK值)。值)。组氨酸咪唑基组氨酸咪唑基的解离的解离常数为常数为6 6,在,在pH6pH6附近附近给出质子和结合质子给出质子和结合质子能力相同,能力相同,是最活泼是最活泼的催化基团的催化基团。给出质子或结合质给出质子或结合质子的速度。咪唑基最子的速度。咪唑基最快,半寿期小于快,半寿期小于1010-10-10秒秒(四)共价催化(四)共价催化酶作为亲核基团或亲电基团,与底物形成一个反应活性酶作为亲核基团或亲电基团,与底物形成一个反应活性很高的共价中间物。很高的共价中间物。酶亲核基团:酶亲核基团:Ser-OHSer-
13、OH,CysCys-SH-SH,His-NHis-N、Asp-COOHAsp-COOH;底物亲电中心:磷酰基(底物亲电中心:磷酰基(-P=O-P=O),),酰基(酰基(-C=O-C=O),糖基(),糖基(GluGlu-C-OH-C-OH)某些辅酶,如焦磷酸硫胺素和磷某些辅酶,如焦磷酸硫胺素和磷酸吡哆醛等也可以参与共价催化酸吡哆醛等也可以参与共价催化作用。作用。催化剂通过与底物形成反应活性很高的共价过渡产物,催化剂通过与底物形成反应活性很高的共价过渡产物,使反应活化能降低,从而提高反应速度的过程,称为使反应活化能降低,从而提高反应速度的过程,称为共共价催化价催化。(五)金属离子催化(五)金属离子
14、催化金属酶(金属酶(metalloenzyme):metalloenzyme):含紧密结合的金属离子,含紧密结合的金属离子,FeFe2+2+、CuCu2+2+、ZnZn2+2+、MnMn2+2+、CoCo3+3+。金属金属- -激活酶(激活酶(metal-activated enzyme):metal-activated enzyme):含松散结合的含松散结合的金属离子,金属离子,NaNa+ +、K K+ +、MgMg2+2+、CaCa2+2+。金属离子参加的四种主要催化途径金属离子参加的四种主要催化途径(1 1)通过结合底物为反应定向)通过结合底物为反应定向(2 2)通过自身价数的改变参加氧
15、化还原反应)通过自身价数的改变参加氧化还原反应(3 3)屏蔽底物或酶活性中心的负电荷)屏蔽底物或酶活性中心的负电荷(4 4)金属离子通过水的离子化促进亲核催化。)金属离子通过水的离子化促进亲核催化。楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(六)多元催化和协同效应(六)多元催化和协同效应在酶催化反应中,常常是几个基元催化反应配合在一在酶催化反应中,常常是几个基元催化反应配合在一起共同起作用。起共同起作用。楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(七)活性部位微环境的影响(七)活性部位微环境的影响 疏水环境疏水环境介电常数低,加强极性基团
16、间的作用。介电常数低,加强极性基团间的作用。电荷环境电荷环境在酶活性中心附近,往往有一电荷离子,可稳定过渡在酶活性中心附近,往往有一电荷离子,可稳定过渡态的离子态的离子 四、酶催化反应机制的实例四、酶催化反应机制的实例(一)溶菌酶(一)溶菌酶(lysozymelysozyme)NAG:N-乙酰氨基葡萄糖乙酰氨基葡萄糖NAM:N-乙酰氨基葡萄糖乳酸乙酰氨基葡萄糖乳酸 酶切位点酶切位点Asp52Glu35(极性区)(极性区)(非极性区)(非极性区)C1+非极性区非极性区极性区极性区HO - E环环H2O(广义酸碱催化)(广义酸碱催化)(二)(二)RNaseRNase A A 楚雄师范学院化学与生命
17、科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(三)羧肽酶(三)羧肽酶 A A 楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国ZnZn 145楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(四)丝氨酸蛋白酶(胰凝乳蛋白酶)(四)丝氨酸蛋白酶(胰凝乳蛋白酶)His57Asp102Ser195Asp102His57Ser195His57102AspSer195A.酶分子中的电荷中继网酶分子中的电荷中继网B.加上底物后,从加上底物后,从Ser转移一个质子给转移一个质子给His,带正
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