系统的酶化学-非常好资料课件.ppt
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1、 第一节第一节 酶通论酶通论 第二节第二节 酶促反应动力学酶促反应动力学 第三节第三节 酶的作用机制酶的作用机制 第四节第四节 酶的活性调节酶的活性调节第一节第一节 酶通论酶通论一、酶的研究历史一、酶的研究历史l1857巴斯德提出酒精发酵是巴斯德提出酒精发酵是酵母细胞活动的结果酵母细胞活动的结果。 1分子分子Glc2分子乙醇分子乙醇+2分子分子CO2 从从Glc开始,开始,经过经过12种酶催化,种酶催化,12步反应,生成乙醇。步反应,生成乙醇。 1897Buchner兄弟证明发酵与细胞的活动无关,兄弟证明发酵与细胞的活动无关,不含细胞的酵母汁也能进行乙醇发酵不含细胞的酵母汁也能进行乙醇发酵。
2、1913Michaelis和和Menten提出提出米氏学米氏学说说酶促动力学原理。酶促动力学原理。 1926Sumner首次从刀豆中提出脲酶结首次从刀豆中提出脲酶结晶,并晶,并证明具有蛋白质性质证明具有蛋白质性质。 1930年年Northrop等得到了胃蛋白酶、等得到了胃蛋白酶、胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶的结晶,并进胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶的结晶,并进一步证明了一步证明了酶是蛋白质酶是蛋白质。 J.B.SumnerJ.H.Northropl 1969 化学合成核糖核酸酶。化学合成核糖核酸酶。l 1967-1970 从从E.coli 中发现第中发现第I、第、第II类限制性类限制性 核酸内切酶。核酸内切
3、酶。 20世纪世纪80年代发现年代发现某些某些RNA有催化活性,有催化活性,还有还有一些抗体也有催化活性,一些抗体也有催化活性,甚至甚至有些有些DNA也有催化活性,也有催化活性,使酶是蛋白质的传统概念受使酶是蛋白质的传统概念受到很大冲击。到很大冲击。 某些某些RNA有催化活性有催化活性( ribozyme,核酶),核酶) 1982年美国年美国T. Cech等人发现四膜虫的等人发现四膜虫的rRNA前前体能在完全没有蛋白质的情况下进行自我加工,发体能在完全没有蛋白质的情况下进行自我加工,发现现RNA有催化活性有催化活性 。 Thomas Cech University of Colorado at
4、 Boulder, USA 1983年美国年美国S.Altman等研究等研究RNaseP(由(由20%蛋蛋白质和白质和80%的的RNA组成),发现组成),发现RNaseP中的中的RNA可催化可催化E. coli tRNA的前体加工。的前体加工。 Sidney Altman Yale University New Haven, CT, USA Cech和和Altman各自独立地发现了各自独立地发现了RNA的催化活的催化活性,并命名这一类酶为性,并命名这一类酶为ribozyme(核酶)(核酶),2人共人共同获同获1989年诺贝尔化学奖。年诺贝尔化学奖。 1Cell vol 31, 147157,1
5、982年。 2Sci. Amer. Vol 255, 6475,1986。 抗体酶(抗体酶(abzyme) 抗体:与抗原特异结合的免疫球蛋白。抗体:与抗原特异结合的免疫球蛋白。 抗体酶:指具有催化功能的抗体分子,在抗体分子的可变区抗体酶:指具有催化功能的抗体分子,在抗体分子的可变区 (即肽链的(即肽链的N端)是识别抗原的活性区域,这部分区端)是识别抗原的活性区域,这部分区 域被赋予了酶的属性。域被赋予了酶的属性。 1986年美国年美国Schultz和和Lerner两个实验室同时在两个实验室同时在Science上上发表论文,报道他们成功地运用单克隆抗体技术制备了具有发表论文,报道他们成功地运用单
6、克隆抗体技术制备了具有酶活性的抗体(酶活性的抗体(catalytic antibody)。)。有些有些DNA也有催化活性也有催化活性(脱氧核酶,(脱氧核酶,Deoxyribozyme ) 1995年年Cuenoud等发现有些等发现有些DNA分子亦分子亦具有催化活性。具有催化活性。 酶及生物催化剂概念的发展克隆酶、遗传修饰酶克隆酶、遗传修饰酶蛋白质工程新酶蛋白质工程新酶生物催化剂生物催化剂(Biocatalyst)蛋白质类:蛋白质类: Enzyme (天然酶、生物工程酶天然酶、生物工程酶)核酸类:核酸类:Ribozyme ; Deoxyribozyme模拟生物催化剂模拟生物催化剂二、酶的概念二、
7、酶的概念 酶酶是一类由活性细胞产生的具有催化作是一类由活性细胞产生的具有催化作用和高度专一性的特殊用和高度专一性的特殊蛋白质或核酸蛋白质或核酸。简单说,酶是一类由活性细胞产生的简单说,酶是一类由活性细胞产生的生生物催化剂物催化剂。三、酶作为生物催化剂的特点三、酶作为生物催化剂的特点 1高效性高效性 2专一性专一性 3反应条件温和反应条件温和 4. 酶的催化活性可调节控制酶的催化活性可调节控制 酶的催化效率比化学催化剂高酶的催化效率比化学催化剂高10107 -7 -10101313 倍,比非倍,比非催化反应高催化反应高10108 -8 -10102020 倍。倍。 例如:过氧化氢分解例如:过氧化
8、氢分解 2H2H2 2O O2 2 2H 2H2 2O + OO + O2 2 用用Fe+ Fe+ 催化,效率为催化,效率为6 61010-4-4 mol/mol mol/molS S,而用过,而用过氧化氢酶催化,效率为氧化氢酶催化,效率为6 6 10106 6 mol/molmol/molS S。 用用 - -淀粉酶催化淀粉水解,淀粉酶催化淀粉水解,1 1克结晶酶在克结晶酶在6565 C C条条件下可催化件下可催化2 2吨淀粉水解。吨淀粉水解。1 1高效性高效性E+SP+ EES能量能量水平水平反应过程反应过程 G E1 E2转换数转换数(turnover number, TN or kca
9、t): 每秒钟或每分钟,每个酶分子转换底物的分每秒钟或每分钟,每个酶分子转换底物的分子数,或每秒钟或每分钟每摩尔酶转换底物的摩子数,或每秒钟或每分钟每摩尔酶转换底物的摩尔数。尔数。 即酶只能对特定的一种或一类底物起作用,这种即酶只能对特定的一种或一类底物起作用,这种专一性是由酶蛋白的立体结构所决定的。可分为:专一性是由酶蛋白的立体结构所决定的。可分为: 绝对专一性:有些酶只作用于一种底物,催化一个绝对专一性:有些酶只作用于一种底物,催化一个 反应,反应, 而不作用于任何其它物质。而不作用于任何其它物质。 相对专一性:这类酶对结构相近的一类底物都有作相对专一性:这类酶对结构相近的一类底物都有作
10、用。包括用。包括键专一性和基团专一性键专一性和基团专一性。 立体异构专一性:这类酶不能辨别底物不同的立体异构立体异构专一性:这类酶不能辨别底物不同的立体异构 体,只对其中的某一种构型起作用,而体,只对其中的某一种构型起作用,而 不催化其他异构体。包括不催化其他异构体。包括光学专一性光学专一性 和几何异构专一性和几何异构专一性。2 2专一性专一性 基团基团(group)专一性。如专一性。如 -葡萄糖苷酶,葡萄糖苷酶,催化由催化由 -葡萄糖所构成的糖苷水解,但葡萄糖所构成的糖苷水解,但对于糖苷的另一端没有严格要求。对于糖苷的另一端没有严格要求。 键键(Bond)专一性。如酯酶催化酯的水解,专一性。
11、如酯酶催化酯的水解,对于酯两端的基团没有严格的要求。对于酯两端的基团没有严格的要求。相对专一性相对专一性 酶促反应一般在常温、常压、中性酶促反应一般在常温、常压、中性pH pH 条件下进行。条件下进行。 高温或其它苛刻的物理或化学条件,高温或其它苛刻的物理或化学条件,将引起酶的失活。将引起酶的失活。3 3反应条件温和反应条件温和4.4.酶的催化活性可调节控制酶的催化活性可调节控制 如抑制剂调节、共价修饰调节、反馈如抑制剂调节、共价修饰调节、反馈调节、酶原激活及激素控制等。调节、酶原激活及激素控制等。某些酶催化活力与辅酶、辅基及金属某些酶催化活力与辅酶、辅基及金属离子有关离子有关。(一)根据酶的
12、化学组成分类:(一)根据酶的化学组成分类:1 单纯酶:单纯酶:只含有蛋白质成分,如:只含有蛋白质成分,如:脲酶、溶菌脲酶、溶菌 酶、淀粉酶、脂肪酶、核糖核酸酶等。酶、淀粉酶、脂肪酶、核糖核酸酶等。2 结合酶结合酶:含有蛋白成分(酶蛋白):含有蛋白成分(酶蛋白)决定酶的专一性决定酶的专一性 和非蛋白成分(辅助因子)和非蛋白成分(辅助因子)传递电子、原子或某传递电子、原子或某 些化学基团(决定反应类型)。些化学基团(决定反应类型)。 四、酶的分类四、酶的分类全酶全酶 = 酶蛋白酶蛋白 + 辅助因子辅助因子辅助因子辅助因子与酶蛋白结合比较疏松的小分子有机物。与酶蛋白结合比较疏松的小分子有机物。与酶蛋
13、白结合紧密的小分子有机物。与酶蛋白结合紧密的小分子有机物。金属离子作为辅助因子。金属离子作为辅助因子。金属离子金属离子 辅酶辅酶辅基辅基酶蛋白和辅助因子单独存在均无催化活性,只有二者酶蛋白和辅助因子单独存在均无催化活性,只有二者结合为全酶才有催化活性。结合为全酶才有催化活性。 参与的酶促反应主要为氧化参与的酶促反应主要为氧化- -还原反还原反应或基团转移反应。应或基团转移反应。 大多数辅酶的前体主要是水溶性大多数辅酶的前体主要是水溶性 B B 族维生素。许多维生素的生理功能族维生素。许多维生素的生理功能与辅酶的作用密切相关。与辅酶的作用密切相关。辅酶在酶促反应中的作用特点辅酶在酶促反应中的作用
14、特点 辅酶在催化反应过程中,直接参加了反应。辅酶在催化反应过程中,直接参加了反应。 每一种辅酶都具有特殊的功能,可以特定地催每一种辅酶都具有特殊的功能,可以特定地催某一类型的反应。某一类型的反应。 同一种辅酶可以和多种不同的酶蛋白结合形成同一种辅酶可以和多种不同的酶蛋白结合形成不同的全酶。不同的全酶。 一般来说,全酶中的辅酶决定了酶所催化的类一般来说,全酶中的辅酶决定了酶所催化的类型(反应专一性),而酶蛋白则决定了所催化型(反应专一性),而酶蛋白则决定了所催化的底物类型(底物专一性)。的底物类型(底物专一性)。(二)根据酶蛋白结构特点分类(二)根据酶蛋白结构特点分类 单体酶:单体酶:由一条或多
15、条共价相连的肽链组成的酶分子。由一条或多条共价相连的肽链组成的酶分子。一般为水解酶。一般为水解酶。 寡聚酶寡聚酶:由两条或多条肽链组成的酶分子。由两条或多条肽链组成的酶分子。为大多数为大多数酶。酶。 多酶复合体:多酶复合体:由多种酶彼此镶嵌成的复合体由多种酶彼此镶嵌成的复合体, 它们相它们相互配合依次进行互配合依次进行,催化,催化连续的连续的 一系列一系列相关相关反应。反应。丙酮丙酮酸脱氢酶复合体。酸脱氢酶复合体。 多功能酶:多功能酶:一条多肽链上含有两种或两种以上催化活一条多肽链上含有两种或两种以上催化活性的酶,往往是基因融合的产物。性的酶,往往是基因融合的产物。脂肪酸合成酶。脂肪酸合成酶。
16、五、酶的命名五、酶的命名(1 1)习惯命名方法)习惯命名方法 1.1.根据作用根据作用底物底物来命名,如来命名,如淀粉酶淀粉酶、蛋白酶蛋白酶等。等。2.2.根据所催化的根据所催化的反应的类型反应的类型命名,如命名,如脱氢酶脱氢酶、转转移酶移酶等。等。3.3.两个原则结合起来命名,如两个原则结合起来命名,如丙酮酸脱羧酶丙酮酸脱羧酶等。等。4.4.根据酶的根据酶的来源或其它特点来源或其它特点来命名,如来命名,如胃蛋白酶、胃蛋白酶、胰蛋白酶胰蛋白酶等。等。(2)(2)国际系统命名法国际系统命名法 系统名称包括底物名称、构型、反应性质。系统名称包括底物名称、构型、反应性质。例如:例如: 酶催化的反应酶
17、催化的反应: : 谷氨酸谷氨酸 + + 丙酮酸丙酮酸 - -酮戊二酸酮戊二酸 + + 丙氨酸丙氨酸 习惯名称习惯名称: :谷丙转氨酶谷丙转氨酶 系统名称系统名称: :丙氨酸:丙氨酸: - -酮戊二酸氨基转移酶酮戊二酸氨基转移酶 (3)酶的国际分类法及编号酶的国际分类法及编号 国际酶学委员会根据酶催化的反应类型,将国际酶学委员会根据酶催化的反应类型,将酶分为六大类,分别用酶分为六大类,分别用1、2、3、4、5、6的编号来表示。的编号来表示。 氧化氧化- -还原酶催化氧化还原酶催化氧化- -还原反应。还原反应。 主要包括脱氢酶主要包括脱氢酶(dehydrogenase)(dehydrogenase
18、)和氧化酶和氧化酶(Oxidase)(Oxidase)。 如如: :乳酸乳酸(Lactate)(Lactate)脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。CH3CHCOOHOHNAD+H+CH3CCOOHONADH1 氧化氧化-还原酶还原酶 OxidoreductaseAH2 + B(O2)+ BH2(H2O2,H2O)A 转移酶催化基团转移反应,即将一个底物分子的转移酶催化基团转移反应,即将一个底物分子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。基团或原子转移到另一个底物的分子上。例如,例如, 谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。CH3CHCOOHNH2HOOCC
19、H2CH2CCOOHOHOOCCH2CH2CHCOOHNH2CH3CCOOHO2 转移酶转移酶 TransferasevAX + BA +BX 水解酶催化底物的加水分解反应。水解酶催化底物的加水分解反应。 主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。 例如,脂肪酶例如,脂肪酶(Lipase)(Lipase)催化的脂的水解反应:催化的脂的水解反应:3 3 水解酶水解酶 hydrolasehydrolaseH2OCOOCH2CH3RRCOOHCH3CH2OH AOH+BHAB + H2O 裂合酶催化从底物分子中移去一个基团或裂合酶催化从底物分子中移去一个基团或原
20、子形成双键的反应及其逆反应。原子形成双键的反应及其逆反应。 主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。 例如,例如, 延胡索酸水合酶催化的反应。延胡索酸水合酶催化的反应。HOOCCH=CHCOOHH2OHOOCCH2CHCOOHOH4 裂合酶裂合酶 LyaseABA+B 异构酶催化各种同分异构体的相互转化,即异构酶催化各种同分异构体的相互转化,即底物分子内基团或原子的重排过程。底物分子内基团或原子的重排过程。例如,例如,6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。OCH2OHOHOHOHOHOCH2OHCH2OHOHOHOH5 异构酶异构酶 Isome
21、raseAB常见的有消旋和变旋、醛酮异构、顺反异构和变位酶类常见的有消旋和变旋、醛酮异构、顺反异构和变位酶类。 合成酶,又称为连接酶,能够催化合成酶,又称为连接酶,能够催化C-CC-C、C-OC-O、C-N C-N 以及以及C-S C-S 键的形成反应。键的形成反应。这类反应必须与这类反应必须与ATPATP分解反应相互偶联分解反应相互偶联。 A + B + ATP + H2O =AB + ADP +PiA + B + ATP + H2O =AB + ADP +Pi 例如,丙酮酸羧化酶催化的反应例如,丙酮酸羧化酶催化的反应: : 丙酮酸丙酮酸 + CO2 + ATP + H2O + CO2 +
22、ATP + H2O 草酰乙酸草酰乙酸+ ADP +Pi+ ADP +Pi 6 合成酶合成酶 Ligase or Synthetase 核酶是唯一的非蛋白酶。它是一类特殊的核酶是唯一的非蛋白酶。它是一类特殊的RNARNA,能够催化能够催化RNARNA分子中的磷酸酯键的水解及其逆反分子中的磷酸酯键的水解及其逆反应。应。33333333335555555555BBBBBPPP+POHPPBBBBPPPPPBP 7 核酶(催化核酸)核酶(催化核酸) ribozyme 乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶 EC 1. 1. 1. 27第1大类,氧化还原酶第1亚类,氧化基团CHOH第1亚亚类,H受体为NAD+该酶在亚亚类
23、中的顺序编号每个酶都有一个有四个数字组成的编号每个酶都有一个有四个数字组成的编号六、六、酶活力酶活力的测定的测定 1.酶活力酶活力:又称为酶活性,指又称为酶活性,指酶催化一定化学酶催化一定化学反应的能力反应的能力。通常。通常以在一定条件下酶所催化的以在一定条件下酶所催化的化学反应化学反应(初初)速度来表示速度来表示。 因此酶活力可用因此酶活力可用单位时间内底物的减少量或单位时间内底物的减少量或产产物的增加量物的增加量表示表示,单位为浓度,单位为浓度/单位时间。单位时间。 研究酶促反应速度,以酶促反应的初速度研究酶促反应速度,以酶促反应的初速度为准(底物消耗低于为准(底物消耗低于5%)。)。 酶
24、促反应的速度曲线酶促反应的速度曲线2.酶活力测定的基本原理酶活力测定的基本原理 一般对酶的测定不是直接测定其酶蛋白浓度一般对酶的测定不是直接测定其酶蛋白浓度, , 而是测定其催化化学反应的能力。这是基于而是测定其催化化学反应的能力。这是基于 在最优化条件下在最优化条件下( (最适温度、最适最适温度、最适pHpH、最适缓冲液等、最适缓冲液等) ), 当底物足够(过量,当底物足够(过量, SE ) , 在酶促反应的初始阶段,在酶促反应的初始阶段, 酶促反应的速度(初速度)与酶的浓度成正比酶促反应的速度(初速度)与酶的浓度成正比 (即(即V=KV=KE E)。故酶活力测定的是化学反应速度,)。故酶活
25、力测定的是化学反应速度, 一定条件下可代表酶活性分子浓度。一定条件下可代表酶活性分子浓度。3.3.酶活力的表示方法酶活力的表示方法(1)(1)酶活力单位酶活力单位U U (UnitUnit):是衡量酶活力大小的计量单位是衡量酶活力大小的计量单位, ,又称又称酶单位,酶单位,规定条件(最适条件)下一定时间内催化完规定条件(最适条件)下一定时间内催化完成一定化学反应量所需的酶量。成一定化学反应量所需的酶量。 根据不同情况有几种酶活力单位:根据不同情况有几种酶活力单位: 国际单位国际单位IUIU:19611961年,在最适条件下每分钟转化年,在最适条件下每分钟转化1mol 1mol 底物所需要的酶量
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