蛋白质纯化技术课件.ppt
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- 蛋白质 纯化 技术 课件
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1、蛋白质的分离纯化与鉴定蛋白质的分离纯化与鉴定Isolation, Purification and Identification of Isolation, Purification and Identification of ProteinProtein分子生物学圣经分子生物学圣经分子克隆实验指南分子克隆实验指南为什么要纯化蛋白质?为什么要纯化蛋白质?理论意义:理论意义:深入研究某种蛋白质的功能深入研究某种蛋白质的功能以及作用机制,如信号通路中的蛋白以及作用机制,如信号通路中的蛋白质质应用价值应用价值-蛋白质工程蛋白质工程 医药、工业、科研医药、工业、科研 作为药物靶点作为药物靶点蛋白质是生
2、命功能的执行者蛋白质是生命功能的执行者蛋白质工程中进行蛋白质纯化的必要性蛋白质工程中进行蛋白质纯化的必要性 首先,需要单一的蛋白质作为实验材料,首先,需要单一的蛋白质作为实验材料,研究其结构与功能研究其结构与功能; 其次,其次,对蛋白质进行修饰改造对蛋白质进行修饰改造时需要单时需要单一的蛋白质作为原材料;一的蛋白质作为原材料; 最后,为了生产性能更优良的蛋白质,最后,为了生产性能更优良的蛋白质,需要对设计改造过的蛋白质进行大量纯需要对设计改造过的蛋白质进行大量纯化,从而化,从而开发出相关产品开发出相关产品。本章概要本章概要蛋白质纯化方法蛋白质纯化方法蛋白质纯化原则蛋白质纯化原则纯化步骤纯化步骤
3、蛋白质的鉴定蛋白质的鉴定一、蛋白纯化方法一、蛋白纯化方法蛋白质纯化的根据:蛋白质纯化的根据: 不同的蛋白质,理化性质不同。不同的蛋白质,理化性质不同。理化性质不同的原因:理化性质不同的原因: 氨基酸的数目和序列不同。氨基酸的数目和序列不同。1.1.与蛋白质分离纯化相关的理化特性与蛋白质分离纯化相关的理化特性分子大小分子大小分子形状分子形状带电特性带电特性溶解特性溶解特性与配体特异性结合不同与配体特异性结合不同吸附性质吸附性质变性和复性变性和复性1.11.1分子大小分子大小蛋白质分子大小主要取决于:蛋白质分子大小主要取决于: 蛋白质肽链的数目蛋白质肽链的数目 每条肽链的氨基酸残基数目。每条肽链的
4、氨基酸残基数目。几百几百 百万百万 DaDa常用方法常用方法 透析透析 超滤超滤 凝胶过滤凝胶过滤 离心离心 透析透析(dialysis)(dialysis)利用利用透析袋透析袋把大把大分子蛋白质与小分子蛋白质与小分子化合物分开分子化合物分开的方法。的方法。 超滤法超滤法 应用应用正压或离心力正压或离心力使蛋白质溶液透过使蛋白质溶液透过有一定截留分子量有一定截留分子量的超滤膜的超滤膜,达到浓,达到浓缩蛋白质溶液的目缩蛋白质溶液的目的。的。 超滤法超滤法 应用应用正压或离心力正压或离心力使蛋白质溶液透过使蛋白质溶液透过有一定截留分子量有一定截留分子量的超滤膜的超滤膜,达到浓,达到浓缩蛋白质溶液的
5、目缩蛋白质溶液的目的。的。凝胶过滤凝胶过滤 是按照天然蛋白质是按照天然蛋白质相对分子相对分子质量大小质量大小进行分离的技术,又称进行分离的技术,又称为为分子筛层析或排阻层析分子筛层析或排阻层析。 超速离心超速离心离心离心(centrifugationcentrifugation):利用机械的快:利用机械的快速旋转所产生的离心力,将不同密度的速旋转所产生的离心力,将不同密度的物质分离开来的方法。物质分离开来的方法。 超速离心法超速离心法 (ultracentrifugation)(ultracentrifugation):6060万万 g g , 6 6万万88万万 r/minr/min。可用来
6、测定。可用来测定蛋白质分子量。蛋白质分子量。超速离心超速离心1.21.2分子形状分子形状形状形状 蛋白质在蛋白质在离心离心通过溶液时,或通过通过溶液时,或通过膜膜、凝凝胶过滤填料颗粒胶过滤填料颗粒或或电泳凝胶电泳凝胶中时,都会受中时,都会受到分子形状的影响。到分子形状的影响。方法方法 梯度离心梯度离心 电泳电泳1.31.3电荷电荷原理原理蛋白质的净电荷与蛋白质蛋白质的净电荷与蛋白质等电点等电点pIpI以以及及环境环境pHpH值值有关(有关(pHpIpHpI,),)方法方法电泳电泳离子交换层析离子交换层析1.41.4溶解度溶解度原理原理 蛋白质分子表面蛋白质分子表面亲水性和疏水性带电基团亲水性和
7、疏水性带电基团不同不同,因此在溶剂中的溶解度不同。,因此在溶剂中的溶解度不同。 通过通过改变改变pHpH、离子强度离子强度或或加入有机试剂加入有机试剂,促进蛋白质分子的凝聚进而形成沉淀。促进蛋白质分子的凝聚进而形成沉淀。方法:沉淀法方法:沉淀法 盐析法(盐析法(eg. eg. 硫酸铵)硫酸铵) 有机溶剂沉淀法(有机溶剂沉淀法(eg. eg. 丙酮)丙酮) 等电点沉淀法等电点沉淀法 蛋白质在高浓度中性盐溶液中会沉淀析出,蛋白质在高浓度中性盐溶液中会沉淀析出,称为称为盐析。盐析。 盐析原理:盐析原理: 高浓度盐离子破坏蛋白质高浓度盐离子破坏蛋白质分子表面的水化分子表面的水化膜膜,影响蛋白质,影响蛋
8、白质分子表面所带电荷分子表面所带电荷,从而,从而引起蛋白质沉淀,但通常不会引起蛋白质引起蛋白质沉淀,但通常不会引起蛋白质的变性。的变性。盐析法盐析法1.51.5配体特异性结合配体特异性结合 原理原理 生物大分子的某些特定结构区域能够生物大分子的某些特定结构区域能够特异性识特异性识别其他分子别其他分子并并可逆结合可逆结合,生物分子间的这种结,生物分子间的这种结合能力称为合能力称为亲和力亲和力。 方法方法 将具有亲和力的两个分子中的一个固定在不溶将具有亲和力的两个分子中的一个固定在不溶性基质上,利用分子间亲和力的特异性和可逆性基质上,利用分子间亲和力的特异性和可逆性对另一个分子进行分离纯化。性对另
9、一个分子进行分离纯化。 分类分类 免疫亲和层析免疫亲和层析 生物亲和层析生物亲和层析 金属螯合亲和层析金属螯合亲和层析1.61.6吸附性质吸附性质 原理原理 蛋白质可吸附在不同材料的表面,如金蛋白质可吸附在不同材料的表面,如金属、陶瓷、塑料等。属、陶瓷、塑料等。 方法方法 疏水层析疏水层析1.71.7变性和复性变性和复性 原理原理 变性:变性:蛋白质在一定的理化条件下会失去原有蛋白质在一定的理化条件下会失去原有的空间结构、生物学功能及部分理化特性。的空间结构、生物学功能及部分理化特性。 复性:复性:当变性条件去除后恢复原有的空间结构当变性条件去除后恢复原有的空间结构及生物学功能。及生物学功能。
10、 方法方法 如,利用尿素的变性和复性方法,从包涵体中如,利用尿素的变性和复性方法,从包涵体中纯化原核表达蛋白纯化原核表达蛋白2. 2. 分离方法分离方法在实验操作上,分为:在实验操作上,分为:沉淀法沉淀法离心法离心法电泳法电泳法超滤法超滤法相分配法相分配法层析法层析法* *不可能有一套统一的方法适用于分离纯不可能有一套统一的方法适用于分离纯化所有的蛋白质,化所有的蛋白质,* *但每一种蛋白质但每一种蛋白质可能可能都有一套适合的分都有一套适合的分离纯化程序,离纯化程序,* *而且所用的主要技术手段都基本相同。而且所用的主要技术手段都基本相同。NoteNote二、蛋白质纯化的总原则和纯化步骤二、蛋
11、白质纯化的总原则和纯化步骤总原则总原则以合理的效率、速度、收率和纯度,以合理的效率、速度、收率和纯度,将目标蛋白从细胞的全部其他成分,将目标蛋白从细胞的全部其他成分,特别是从杂蛋白中分离出来,特别是从杂蛋白中分离出来,同时仍保留其生物学活性和化学完整同时仍保留其生物学活性和化学完整性。性。二、蛋白质纯化的总原则和纯化步骤二、蛋白质纯化的总原则和纯化步骤步骤步骤选择实验材料,实验材料预处理选择实验材料,实验材料预处理蛋白质的提取蛋白质的提取蛋白质的粗分级蛋白质的粗分级蛋白质的细分级蛋白质的细分级蛋白质的鉴定蛋白质的鉴定 蛋白质纯化的前期准备蛋白质纯化的前期准备 关于蛋白质我们已知什么?关于蛋白质
12、我们已知什么?最好的来源?最好的来源?蛋白质纯度要求?活性要求?蛋白质纯度要求?活性要求?纯化蛋白的量?纯化蛋白的量?如何进行鉴定?如何进行鉴定?纯化时间长短?纯化时间长短?最终花费?最终花费?纯化方案?纯化方案?1 1、选择实验材料及预处理、选择实验材料及预处理选择实验材料选择实验材料 物种的选择物种的选择 组织的选择组织的选择实验材料预处理实验材料预处理 液体材料液体材料过滤过滤离心离心 固体材料固体材料洗涤:自来水洗涤:自来水蒸馏水蒸馏水提取缓冲液提取缓冲液材料破碎:材料破碎:材料破碎材料破碎机械剪碎机械剪碎研磨研磨反复冻融法反复冻融法超声破碎法超声破碎法高压匀浆法高压匀浆法酶解法酶解法
13、2 2、蛋白质的提取、蛋白质的提取提取分离原则提取分离原则 尽可能多地提取目的蛋白,同时避免活性尽可能多地提取目的蛋白,同时避免活性丢失丢失(温度过高、(温度过高、 pHpH、有机试剂、金属、有机试剂、金属离子、蛋白酶等因素)离子、蛋白酶等因素) 选择合适的选择合适的pHpH、选择合适的离子强度、选择合适的离子强度2 2、蛋白质的提取、蛋白质的提取 提取液成分的确定提取液成分的确定 pH pH 缓冲液:缓冲液:Tris-HCl, Tris-Gly, Gly-HCl, Tris-HCl, Tris-Gly, Gly-HCl, 柠檬酸柠檬酸- -柠檬酸钠柠檬酸钠 离子:离子:动物动物 NaCl,
14、NaCl, 植物植物KClKCl 还原剂还原剂: :DTTDTT 蛋白酶抑制剂:蛋白酶抑制剂:EDTA, PMSFEDTA, PMSF 金属离子螯合剂金属离子螯合剂: : EDTA, EGTAEDTA, EGTA去污剂去污剂:SDS, CHAPS, Triton X-100, :SDS, CHAPS, Triton X-100, Tween-20Tween-20甘油甘油 温度温度 04043 3、蛋白质的粗分级(粗提)、蛋白质的粗分级(粗提) 使用蛋白质提取缓冲液提取实验材料后,使用蛋白质提取缓冲液提取实验材料后,蛋白提取液中目标蛋白质的浓度往往较低,蛋白提取液中目标蛋白质的浓度往往较低,采取
15、一些简单的方法采取一些简单的方法使目标蛋白质浓缩,使目标蛋白质浓缩,同时去除大量的杂质同时去除大量的杂质。 常用的实验技术:常用的实验技术:沉淀法(盐析、有机溶沉淀法(盐析、有机溶剂沉淀、等电点沉淀)、超速离心、透析、剂沉淀、等电点沉淀)、超速离心、透析、超滤超滤4 4、蛋白质的细分级、蛋白质的细分级 粗分级只是使蛋白质得到浓缩和初步分离粗分级只是使蛋白质得到浓缩和初步分离纯化,多数情况下纯化,多数情况下还要根据蛋白质分子大还要根据蛋白质分子大小、分子形状、分子表面特征或分子带电小、分子形状、分子表面特征或分子带电状况进一步纯化状况进一步纯化。 常用的实验技术:常用的实验技术:层析层析4.1.
16、 4.1. 层析层析( chromatography chromatography )固定相:凝胶固定相:凝胶流动相:缓冲液流动相:缓冲液原理:原理:BioGelA agaroseBioGel P acrylamideSephadex glucose (dextrose)Sepharose agaroseSephacryl glucose + acrylamideSephacel cellulose 层析装置层析装置(Chromatographic equipmentChromatographic equipment)蠕动泵蠕动泵层析柱层析柱检测器检测器记录仪记录仪部分收集器部分收集器 4.1
17、. 4.1. 层析层析( chromatography chromatography ) 分子筛层析分子筛层析( Gel filtration Gel filtration ) 离子交换层析离子交换层析( Ion exchange Ion exchange ) 疏水作用层析疏水作用层析( Hydrophobic interaction Hydrophobic interaction ) 亲和层析亲和层析( Affinity Affinity )可编辑4.1.1 4.1.1 分子筛层析分子筛层析 (Gel filtrationGel filtration) 原理原理 也称为凝胶过滤、排阻层析。是
18、以也称为凝胶过滤、排阻层析。是以多孔凝胶多孔凝胶材材料为支持物,当蛋白质溶液流经此支持物时,料为支持物,当蛋白质溶液流经此支持物时,分子大小不同分子大小不同的蛋白质所受到的的蛋白质所受到的阻滞作用不同阻滞作用不同而而先后流出先后流出,从而达到分离纯化的目的。,从而达到分离纯化的目的。 凝胶介质凝胶介质 葡聚糖葡聚糖 (glucoseglucose) 琼脂糖琼脂糖 (agaroseagarose) 聚丙烯酰胺(聚丙烯酰胺(acrylamideacrylamide) 纤维素(纤维素(cellulosecellulose)分子筛层析分子筛层析Gel filtration chromatography
19、Gel filtration chromatographyHydrophilicNo spontaneous binding to proteins.Chemically and physically stableRigid to allow a high linear flow-rate亲水亲水对蛋白质亲和力低对蛋白质亲和力低物理化学性质稳定物理化学性质稳定流速稳定流速稳定分子筛层析分子筛层析Gel filtration chromatographyGel filtration chromatography分子筛层析分子筛层析Gel filtration chromatographyGel
20、filtration chromatography 分子筛层析分子筛层析Gel filtration chromatographyGel filtration chromatography 4.1.2 4.1.2 离子交换层析离子交换层析( Ion exchange Ion exchange )原理原理 在一定的在一定的pHpH条件下,不同的蛋白质带有的条件下,不同的蛋白质带有的电荷的种类和数量不同电荷的种类和数量不同,因此它们,因此它们与带电与带电的凝胶颗粒间的电荷相互作用不同的凝胶颗粒间的电荷相互作用不同。 利用蛋白质和带电凝胶之间作用力的差别,利用蛋白质和带电凝胶之间作用力的差别,把蛋白
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