苯丙氨酸的紫外吸收峰为260nm课件.ppt
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- 苯丙氨酸 紫外 吸收 260 nm 课件
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1、第四章 蛋白质化学 2 2 蛋白质的分子组成第一节 3 3 一、蛋白质的元素组成 4 4 含氮量由于体内含氮物质以蛋白质为主,因此,通过测定含由于体内含氮物质以蛋白质为主,因此,通过测定含氮量即可大致推算出样本中蛋白质的含量,这是凯氏定氮量即可大致推算出样本中蛋白质的含量,这是凯氏定氮法测定蛋白质含量的依据。氮法测定蛋白质含量的依据。100g样品蛋白质的含量(样品蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数每克样品含氮克数100/16100 =每克样品含氮克数每克样品含氮克数6.25100 5 5 蛋白质用酸、碱或酶水解均可得到含有不同氨蛋白质用酸、碱或酶水解均可得到含有不同氨基酸的混合液,因此氨基
2、酸(基酸的混合液,因此氨基酸(amino acid)是蛋白)是蛋白质的基本结构单位。质的基本结构单位。 二、蛋白质的基本结构单位 6 6 (一)氨基酸的结构v存在于自然界中的氨基酸有存在于自然界中的氨基酸有300余种,余种, 但组成蛋白质但组成蛋白质的氨基酸只有的氨基酸只有20种,称为基本氨基酸。这些氨基酸有种,称为基本氨基酸。这些氨基酸有相应的遗传密码,也称为编码氨基酸(相应的遗传密码,也称为编码氨基酸(coding amino acid)或标准氨基酸()或标准氨基酸(standard amino acid)。)。 L-氨基酸 D-氨基酸 7 7 (二)氨基酸的分类根据根据R侧链理化性质不同
3、可分为:侧链理化性质不同可分为: 1. 非极性疏水氨基酸非极性疏水氨基酸 2. 极性中性氨基酸极性中性氨基酸 3. 酸性氨基酸酸性氨基酸 4. 碱性氨基酸碱性氨基酸 8 8 1.非极性疏水氨基酸分类分类名称名称缩写缩写分子量分子量等电点等电点非极性疏水氨基酸甘氨酸GlycineGly(G)75.055.97丙氨酸AlanineAla(A)89.066.00缬氨酸ValineVal(V)117.095.96亮氨酸LeucineLeu(L)131.115.98异亮氨酸IsoleucineIle(I)131.115.02脯氨酸ProlinePro(P)115.136.30苯丙氨酸Phenylalan
4、inePhe(F)165.095.48甲硫氨酸(蛋氨酸)MethionineMet(M)149.155.74 9 9 2.极性中性氨基酸分类名称缩写分子量等电点极性中性氨基酸丝氨酸SerineSer(S)105.06 5.68苏氨酸ThreonineThr(T)119.08 6.16天冬酰胺AsparagineAsn(N)132.125.41谷氨酰胺GlutamineGln(Q)146.155.65酪氨酸TyrosineTyr(Y)181.095.66半胱氨酸Cysteine Cys(C) 121.125.07天冬氨酸AspartateAsp(D)133.602.77 10 10 4. 碱性氨
5、基酸分类名称缩写分子量等电点碱性氨基酸赖氨酸LyaineLys(K) 146.13 9.74 精氨酸ArginineArg(R) 174.14 10.76 组氨酸HistidineHis(H) 155.16 7.59 11 11 一般情况下,非极性疏水氨基酸在水溶液中的溶解度一般情况下,非极性疏水氨基酸在水溶液中的溶解度较极性中性氨基酸要小,酸性氨基酸的侧链含有羧基呈酸较极性中性氨基酸要小,酸性氨基酸的侧链含有羧基呈酸性电离,碱性氨基酸的侧链含有氨基、胍基和咪唑基呈碱性电离,碱性氨基酸的侧链含有氨基、胍基和咪唑基呈碱性电离。性电离。 氨基酸还可根据其氨基酸还可根据其R侧链的化学结构进行分类,如
6、芳香侧链的化学结构进行分类,如芳香族氨基酸包括苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸;含硫氨基酸包族氨基酸包括苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸;含硫氨基酸包括半胱氨酸和甲硫氨酸;含有羟基的氨基酸包括苏氨酸、括半胱氨酸和甲硫氨酸;含有羟基的氨基酸包括苏氨酸、丝氨酸和酪氨酸。丝氨酸和酪氨酸。 12 12 (三)氨基酸的理化性质 1两性电离与等电点两性电离与等电点2芳香族氨基酸具有紫外吸收特性芳香族氨基酸具有紫外吸收特性3茚三酮反应茚三酮反应 13 13 当溶液为某一当溶液为某一pH值时,氨基酸主要以兼性离子值时,氨基酸主要以兼性离子的形式存在,分子中所含的正负电荷数目相等,的形式存在,分子中所含的正负电荷数目相等,净电
7、荷为净电荷为0。这一。这一pH值即为氨基酸的等电点(值即为氨基酸的等电点(pI)。 在在pI时,氨基酸在电场中既不向正极也不向负极时,氨基酸在电场中既不向正极也不向负极移动,即处于两性离子状态。移动,即处于两性离子状态。 氨基酸的等电点 14 14 芳香族氨基酸因含苯环,具有共轭双键,可吸收一定波长芳香族氨基酸因含苯环,具有共轭双键,可吸收一定波长的紫外光,其中酪氨酸和色氨酸的紫外吸收峰为的紫外光,其中酪氨酸和色氨酸的紫外吸收峰为280nm,苯,苯丙氨酸的紫外吸收峰为丙氨酸的紫外吸收峰为260nm。其吸光度(。其吸光度(A280)与氨基酸的)与氨基酸的浓度在一定范围内成正比关系。浓度在一定范围
8、内成正比关系。 芳香族氨基酸具有紫外吸收特性 三种芳香族氨基酸的紫外吸收峰 15 15 氨基酸与茚三酮水合物共热时,氨基酸发生氧化氨基酸与茚三酮水合物共热时,氨基酸发生氧化脱氨、脱羧,而茚三酮水合物被还原,其还原物与氨脱氨、脱羧,而茚三酮水合物被还原,其还原物与氨结合,再与另一分子茚三酮缩合成为蓝紫色的化合物结合,再与另一分子茚三酮缩合成为蓝紫色的化合物,后者最大吸收峰在,后者最大吸收峰在570nm处。这一性质常被用于氨处。这一性质常被用于氨基酸的定性和定量分析。基酸的定性和定量分析。 茚三酮反应 16 16 三、肽键和肽 (一)肽键一个氨基酸的羧基和另一个氨基酸的氨基缩合一个氨基酸的羧基和另
9、一个氨基酸的氨基缩合脱去一分子水形成的化学键。脱去一分子水形成的化学键。CHCR1H2NCOOHH NCOOHHHHCR1H2NCONCR2COOHHHH2OR2+肽键的形成 17 17 肽键具有特殊性质。从键长看,肽键键长(肽键具有特殊性质。从键长看,肽键键长(0.132nm)介于)介于CN单键(单键(0.146nm)和双键()和双键(0.124nm)之间,具有部分双)之间,具有部分双键的性质,不能自由旋转;从键角看,肽键中键与键的夹角均键的性质,不能自由旋转;从键角看,肽键中键与键的夹角均为为120。因此,与肽键相连的。因此,与肽键相连的6个原子(个原子(C、C、O、N、H、C)始终处在同
10、一平面上,构成刚性的)始终处在同一平面上,构成刚性的“肽键平面肽键平面”(peptide bond plane),又称),又称“酰胺平面酰胺平面”或肽单元(或肽单元(peptide unit)。)。肽单肽单元元中,与中,与C-N相连的氢和氧原子与两个相连的氢和氧原子与两个碳原子呈碳原子呈反向分布。反向分布。肽键平面 18 18 (二)肽 多个氨基酸通过肽键相连形成的化合物称为肽。多个氨基酸通过肽键相连形成的化合物称为肽。 由由2个氨基酸形成的肽称为二肽。个氨基酸形成的肽称为二肽。 3个氨基酸形成的肽称为三肽。个氨基酸形成的肽称为三肽。 一般一般10个以下氨基酸形成的肽称为寡肽个以下氨基酸形成的
11、肽称为寡肽(oligopeptide),由,由10个以上氨基酸形成的肽称为多个以上氨基酸形成的肽称为多肽(肽(polypeptide)。)。 组成多肽的氨基酸单元称为氨基酸残基。组成多肽的氨基酸单元称为氨基酸残基。 19 19 多肽链多肽链中形成肽键的原子和多肽链中形成肽键的原子和碳原子交替重复排列构成主碳原子交替重复排列构成主链骨架,而伸展在主链两侧的链骨架,而伸展在主链两侧的R基被称为侧链。蛋白质分子基被称为侧链。蛋白质分子结构可含有一条或多条共价主链和许多侧链结构可含有一条或多条共价主链和许多侧链。多肽链的结构具有方向性。一条多肽链有两个末端,有自多肽链的结构具有方向性。一条多肽链有两个
12、末端,有自由由-氨基的一端称为氨基末端或氨基的一端称为氨基末端或N端;有自由端;有自由-羧基的一端称羧基的一端称为羧基末端或为羧基末端或C端。肽链中的氨基酸因形成肽键而分子不完整端。肽链中的氨基酸因形成肽键而分子不完整被称为氨基酸残基。被称为氨基酸残基。HCR1H2NCONCR2HHCONHCONCCOHHO HRnN 端C端主 链骨 架侧 链 20 20 (三)生物活性肽体内存在着许多具有生物活性的低分子量肽,有体内存在着许多具有生物活性的低分子量肽,有三肽,有寡肽或多肽,如谷胱甘肽、抗利尿激素、三肽,有寡肽或多肽,如谷胱甘肽、抗利尿激素、血管紧张素血管紧张素II、-内啡肽、催产素及表皮生长
13、因子等内啡肽、催产素及表皮生长因子等。这些活性肽在代谢调节、神经传导等方面起着重。这些活性肽在代谢调节、神经传导等方面起着重要作用。要作用。 21 21 中文名称中文名称英文名称及缩写英文名称及缩写氨基酸数目氨基酸数目生理功能生理功能抗利尿激素antidiuretic hormone,ADH9肽维持体内水平衡和渗透压催产素pitocin,oxytocin9肽强烈刺激子宫收缩促甲状腺激素释放激素thyrotropin releasing factor,TRH3肽促进垂体分泌促甲状腺释放激素脑啡肽enkephalin5肽与痛觉的调节及情绪活动有关-内啡肽endorphin,-EP31肽主要涉及疼痛
14、、心血管和免疫等相关功能P物质Substance P,SP11肽传递痛觉,使肠管收缩等作用表皮生长因子Epidermal growth factor,EGF53肽调节表皮细胞生长、分化,促进创伤愈合血管紧张素angiotensin 8肽使血管收缩,刺激醛固酮分泌,升高血压 体内重要的生物活性肽 22 22 第 二 节蛋白质的分子结构与分类 23 23 蛋白质是生物大分子,由许多氨基酸通过肽键连蛋白质是生物大分子,由许多氨基酸通过肽键连接形成。具有生理功能的蛋白质都具有有序的三维接形成。具有生理功能的蛋白质都具有有序的三维空间结构。蛋白质的分子结构分为一级结构和空间空间结构。蛋白质的分子结构分为
15、一级结构和空间结构,空间结构又称高级结构,包括二级、三级和结构,空间结构又称高级结构,包括二级、三级和四级结构等。四级结构等。一级结构是基础,决定蛋白质的空间结构。一级结构是基础,决定蛋白质的空间结构。 24 24 一、蛋白质的一级结构蛋白质的一级结构(蛋白质的一级结构(primary structure)是指)是指多肽链中氨基酸残基的组成和排列顺序。蛋白质分多肽链中氨基酸残基的组成和排列顺序。蛋白质分子中氨基酸排列顺序是由遗传密码决定的,是蛋白子中氨基酸排列顺序是由遗传密码决定的,是蛋白质作用的特异性、空间结构的差异性和生物学功能质作用的特异性、空间结构的差异性和生物学功能多样性的基础。蛋白
16、质一级结构中除肽键外,有些多样性的基础。蛋白质一级结构中除肽键外,有些还含有少量的二硫键,是由两分子半胱氨酸残基的还含有少量的二硫键,是由两分子半胱氨酸残基的巯基脱氢而生成的,可存在于肽链内,也可存在于巯基脱氢而生成的,可存在于肽链内,也可存在于肽链间。肽链间。 25 25 例如人的胰岛素是由两条多肽链共例如人的胰岛素是由两条多肽链共51个氨基酸个氨基酸残基构成,其中残基构成,其中A链包括链包括21个氨基酸残基,个氨基酸残基,B链包链包括括30个氨基酸残基。个氨基酸残基。A链和链和B链之间有两个二硫键链之间有两个二硫键连接。在连接。在A链第链第6位与第位与第11位的两个半胱氨酸残基位的两个半胱
17、氨酸残基之间还有一个链内二硫键。之间还有一个链内二硫键。 26 26 人胰岛素的一级结构 27 27 二、 蛋白质的空间结构蛋白质分子的空间结构又称立体结构、高级结蛋白质分子的空间结构又称立体结构、高级结构和三维构象等。天然蛋白质的多肽链由于分子内构和三维构象等。天然蛋白质的多肽链由于分子内单键的旋转形成复杂的卷曲和折叠,构成蛋白质特单键的旋转形成复杂的卷曲和折叠,构成蛋白质特定的三维空间结构,包括二级结构、三级结构和四定的三维空间结构,包括二级结构、三级结构和四级结构。蛋白质分子的空间结构是决定蛋白质性质级结构。蛋白质分子的空间结构是决定蛋白质性质和功能的结构基础。和功能的结构基础。 28
18、28 (一)蛋白质二级结构蛋白质的二级结构是指肽链的主链骨架原子若干肽蛋白质的二级结构是指肽链的主链骨架原子若干肽单位各自沿一定的轴折叠而形成的有规则的构象。单位各自沿一定的轴折叠而形成的有规则的构象。只涉及主链构象及链内只涉及主链构象及链内/ /间形成的氢键。间形成的氢键。主要有主要有 螺旋、螺旋、 折叠、折叠、 转角、无规卷曲转角、无规卷曲。 29 29 1. 螺旋 螺距螺距0.54nm,含,含3.6个个AA残基,残基,链内形成氢键与轴平行,多为右手螺旋链内形成氢键与轴平行,多为右手螺旋。 30 30 螺旋 31 31 v由两由两/ /多条多条伸展的肽链伸展的肽链,通过,通过链间的链间的交
19、联而形成。交联而形成。v肽链主链呈肽链主链呈折叠构象。折叠构象。 32 32 33 33 3. 转角v肽链主链骨架肽链主链骨架180的回折结构。的回折结构。 特点:特点:v由由4个连续的氨基酸残基组成。个连续的氨基酸残基组成。v第一个残基第一个残基C=Ov第四个残基第四个残基NHl形成氢键形成氢键 34 34 O ( 氢 键 ) H C(NHCHCO) N R 35 35 泛指没有规律性的多肽片段。泛指没有规律性的多肽片段。 4. 无规卷曲(random coil) 36 36 (二) 蛋白质的超二级结构 蛋白质的超二级结构是指两个或两个以上的二蛋白质的超二级结构是指两个或两个以上的二级结构在
20、空间折叠中彼此靠近,相互作用形成有规级结构在空间折叠中彼此靠近,相互作用形成有规则的二级结构的聚集体,完成特定的生物学功能。则的二级结构的聚集体,完成特定的生物学功能。 37 37 38 38 39 39 40 40 41 41 蛋白质的的结构域是指位于超二级结构和三级蛋白质的的结构域是指位于超二级结构和三级结构间的一个层次。是蛋白质分子空间结构内独立结构间的一个层次。是蛋白质分子空间结构内独立折叠单元,通常是几个超二级结构单元的组合。折叠单元,通常是几个超二级结构单元的组合。 结构域存在的原因: 1. 1.局域分别折叠比整条肽链折叠在动力学上更为局域分别折叠比整条肽链折叠在动力学上更为合理。
21、合理。 2. 2.结构域之间由肽链连接,有利于结构的调整。结构域之间由肽链连接,有利于结构的调整。 (三)蛋白质的结构域 42 42 SSSS30k 40k 20k 75k60k35k 30kH2N-COOHAH2N-COOHB肝素肝素纤维蛋白纤维蛋白肌动蛋白肌动蛋白细胞细胞胶原蛋白胶原蛋白 纤维纤维蛋白蛋白肝素肝素 纤维蛋白纤维蛋白纤连蛋白分子的结构域 举例 43 43 (四)蛋白质的三级结构 蛋白质的三级结构是指在二级结构、超二级结蛋白质的三级结构是指在二级结构、超二级结构或结构域的基础上,由于侧链构或结构域的基础上,由于侧链R基的相互作用,基的相互作用,进一步盘曲折叠构成的特定空间结构,
22、包括整条肽进一步盘曲折叠构成的特定空间结构,包括整条肽链中全部氨基酸残基的所有原子在三维空间的排布链中全部氨基酸残基的所有原子在三维空间的排布位置。位置。 维系力有氢键、疏水作用、离子键、范德华力。维系力有氢键、疏水作用、离子键、范德华力。 44 44 (五)蛋白质的四级结构 蛋白质的四级结构是指由两条或两条以上的具有独蛋白质的四级结构是指由两条或两条以上的具有独立三级结构的多肽链相互作用,经非共价键连接成特立三级结构的多肽链相互作用,经非共价键连接成特定空间构象。定空间构象。 亚基:指四级结构中每条具有完整三级结构的多肽亚基:指四级结构中每条具有完整三级结构的多肽链。链。 维持力:是离子键、
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