9.蛋白质结构与功能-PPT课件.ppt
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- 蛋白质 结构 功能 PPT 课件
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1、一、什么是蛋白质一、什么是蛋白质? 蛋白质蛋白质(protein)是由许多是由许多氨基酸氨基酸(amino acids)通过通过肽键肽键(peptide bond)相连相连形成的形成的高分子含氮化合物高分子含氮化合物。二、蛋白质的生物学重要性二、蛋白质的生物学重要性 1. 蛋白质是生物蛋白质是生物 体重要组成成分体重要组成成分分布广分布广:所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各个部分都含所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各个部分都含有蛋白质。有蛋白质。含量高含量高:蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,占人体干重的占人体干重的45,某些组织含量更高,例如,某些组织含量更
2、高,例如脾、肺及横纹肌等高达脾、肺及横纹肌等高达80。2. 蛋白质具有重要的生物学功能蛋白质具有重要的生物学功能 1 1)作为生物催化剂(酶)作为生物催化剂(酶)2 2)代谢调节代谢调节作用作用3 3)免疫保护免疫保护作用作用4 4)物质的转运和存储物质的转运和存储5 5)运动与支持运动与支持作用作用6 6)参与细胞间)参与细胞间信息传递信息传递3. 氧化供能氧化供能主要有主要有C、H、O、N和和S。 有些蛋白质含有少量有些蛋白质含有少量磷磷P或金属元素或金属元素铁、锰、锌、铜、钴、钼铁、锰、锌、铜、钴、钼,个别蛋白质还含有个别蛋白质还含有碘碘 I。各种蛋白质的各种蛋白质的含氮量很接近,平均为
3、含氮量很接近,平均为16。l 1克样品中蛋白质的含量克样品中蛋白质的含量 ( g % )= 每克样品含氮克数每克样品含氮克数/16一、氨基酸一、氨基酸 组成蛋白质的基本单位组成蛋白质的基本单位存在存在自然界中的氨基酸有自然界中的氨基酸有300余种余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种,种, 且均属且均属 L-氨基酸(甘氨酸除外)氨基酸(甘氨酸除外)。C+NH3COO-H1. 非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸2. 极性中性氨基酸极性中性氨基酸3. 酸性氨基酸酸性氨基酸:天冬,谷天冬,谷DQ4. 碱性氨基酸:赖,精,组碱性氨基酸:赖,精,组(一)氨基酸的分类(一)
4、氨基酸的分类* * 20 20种氨基酸的英文名称、缩写符号及分类如下种氨基酸的英文名称、缩写符号及分类如下: :甘氨酸甘氨酸 glycine Gly G 5.97丙氨酸丙氨酸 alanine Ala A 6.00缬氨酸缬氨酸 valine Val V 5.96亮氨酸亮氨酸 leucine Leu L 5.98 异亮氨酸异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02 苯丙氨酸苯丙氨酸 phenylalanine Phe F 5.48脯氨酸脯氨酸 proline Pro P 6.301. 非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸色氨酸色氨酸 tryptophan Try W 5.89丝氨酸丝氨酸
5、 serine Ser S 5.68酪氨酸酪氨酸 tyrosine Try Y 5.66 半胱氨酸半胱氨酸 cysteine Cys C 5.07 蛋氨酸蛋氨酸 methionine Met M 5.74天冬酰胺天冬酰胺 asparagine Asn N 5.41 谷氨酰胺谷氨酰胺 glutamine Gln Q 5.65 苏氨酸苏氨酸 threonine Thr T 5.602. 极性中性氨基酸极性中性氨基酸天冬氨酸天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97谷氨酸谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22赖氨酸赖氨酸 lysine Lys K 9.74精氨酸精氨
6、酸 arginine Arg R 10.76组氨酸组氨酸 histidine His H 7.593. 酸性氨基酸酸性氨基酸4. 碱性氨基酸碱性氨基酸几种特殊氨基酸几种特殊氨基酸1. 1.脯氨酸脯氨酸(亚氨基酸)(亚氨基酸)2. 2.半胱氨酸半胱氨酸 脱氢脱氢 变成变成 胱氨酸胱氨酸CH2CHCOO-NH2+CH2CH2CH2CHCOO-NH2+CH2CH2-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3 半胱氨酸半胱氨酸 脱氢变成脱氢变成 胱氨酸胱氨酸+胱氨酸胱氨酸二硫键二硫键-HH-OOC-CH-CH2
7、-SH+NH3-OOC-CH-CH2-SH+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3(二)氨基酸的理化性质(二)氨基酸的理化性质1. 两性解离及等电点两性解离及等电点2. 紫外吸收:紫外吸收:酪氨酸、色氨酸酪氨酸、色氨酸280 nm芳香氨基酸:酪氨酸、色氨酸、苯丙氨酸芳香氨基酸:酪氨酸、色氨酸、苯丙氨酸3. 茚三酮反应茚三酮反应 :氨基酸与茚三生成蓝紫色氨基酸与茚三生成蓝紫色570nm处。处。氨基酸定量分析氨基酸定量分析方法。方法。 二、肽二、肽肽键肽键 -羧基羧基与与 -氨基氨基脱水缩合脱水缩合(一)肽(一)肽(peptide)NH2-CH-CHOOH甘
8、甘氨氨酸酸NH2-CH-CHOOH甘甘氨氨酸酸NH-CH-CHOHO OH甘甘氨氨酸酸+-HOH甘氨酰甘氨酸甘氨酰甘氨酸肽键NH2-CH-C-N-CH-COOHHHHONH2-CH-C-N-CH-COOHHHHO* * 肽肽是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。* * 两分子氨基酸缩合形成二肽,三分子氨两分子氨基酸缩合形成二肽,三分子氨基酸缩合则形成三肽基酸缩合则形成三肽* * 肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为不全,被称为氨基酸残基氨基酸残基(residue)。* * 由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡由
9、十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相连由更多的氨基酸相连形成的肽称形成的肽称多肽多肽(polypeptide)。N 末端:多肽链中有末端:多肽链中有自由氨基自由氨基的一端的一端C 末端:多肽链中有末端:多肽链中有自由羧基自由羧基的一端的一端多肽链有两端多肽链有两端* 多肽链多肽链(polypeptide chain)是指许多氨基是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。酸之间以肽键连接而成的一种结构。N末端末端C末端末端牛核糖核酸酶牛核糖核酸酶(二)(二) 几种生物活性肽几种生物活性肽 1. 谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathione, GSH)三
10、肽缩合?三肽缩合?GSH过氧过氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH还原酶还原酶NADPH+H+ NADP+ 体内许多激素属寡肽或多肽体内许多激素属寡肽或多肽 神经肽神经肽(neuropeptide)2. 多肽类激素及神经肽多肽类激素及神经肽三、蛋白质的分类三、蛋白质的分类 * * 根据蛋白质组成成分根据蛋白质组成成分 单纯蛋白质单纯蛋白质结合蛋白质结合蛋白质 = = 蛋白质部分蛋白质部分 + + 非蛋白质部分非蛋白质部分* * 根据蛋白质形状根据蛋白质形状 纤维状纤维状蛋白质蛋白质球状球状蛋白质蛋白质蛋白质的分子结构包括蛋白质的分子结构包括 一级结构一级结构(prima
11、ry structure)二级结构二级结构(secondary structure)三级结构三级结构(tertiary structure)四级结构四级结构(quaternary structure)高级高级结构结构定义定义蛋白质的一级结构指多肽链中蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列氨基酸的排列顺序。顺序。一、蛋白质的一、蛋白质的一级结构一级结构主要的化学键主要的化学键肽键肽键,有些蛋白质还包括,有些蛋白质还包括二硫键二硫键。 一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。功能的基础。二、蛋白质的二、蛋白质的二级结构二级结构蛋白质分子中某一段肽链的蛋白
12、质分子中某一段肽链的局部空间局部空间结构结构,即该段肽链主链,即该段肽链主链骨架原子的相对空骨架原子的相对空间位置间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象,并不涉及氨基酸残基侧链的构象 。定义定义 主要的化学键主要的化学键: 氢键氢键 (一)肽单元(一)肽单元参与肽键的参与肽键的6个原子个原子C 1、C、O、N、H、C 2位于同一平面,位于同一平面,C 1和和C 2在平面上所处的位置在平面上所处的位置为反式为反式(trans)构型构型,此同一平,此同一平面上的面上的6个原子构成了所谓的个原子构成了所谓的肽肽单元单元 (peptide unit) 。 蛋白质二级结构的主要形式蛋白质二级结构的主要形式
13、 - -螺旋螺旋 ( -helix ) - -折叠折叠 ( -pleated sheet ) - -转角转角 ( -turn ) 无规卷曲无规卷曲 ( random coil ) motif :锌指结构(二)(二) - -螺旋螺旋(三)(三) - -折叠折叠(四)(四) -转角和无规卷曲转角和无规卷曲 - -转角转角无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。分肽链结构。 (五)模体(五)模体在许多蛋白质分子中,可发现二个或在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个三个具有二级结构的肽段,在空间上相互具有二级结构的肽段,在空间上相互接近接近,形成一个特殊的
14、空间构象,被称为,形成一个特殊的空间构象,被称为模体模体(motif)。钙结合蛋白中结钙结合蛋白中结合钙离子的模体合钙离子的模体 锌指结构锌指结构 (六)氨基酸残基的侧链对二级结构形成(六)氨基酸残基的侧链对二级结构形成的影响的影响蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成 - -螺旋螺旋或或-折叠,它就会出现相应的二级结构。折叠,它就会出现相应的二级结构。 三、蛋白质的三、蛋白质的三级结构三级结构疏水键、离子键、氢键和疏水键、离子键、氢键和 Van der Waals力力等。等。 主要的化学键主
15、要的化学键整条肽链整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中即肽链中所有原子在三维空间的排布位置所有原子在三维空间的排布位置。(一)(一) 定义定义 肌红蛋白肌红蛋白 (Mb) N 端端 C端端纤连蛋白分子的结构域纤连蛋白分子的结构域 (二)结构域(二)结构域大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,各数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,各行使其功能,称为行使其功能,称为结构域结构域(domain) 。(三)分子伴侣:拨乱反正,形成四级结构(三)分子伴侣:拨乱反正,形成四级结构分
16、子伴侣分子伴侣(chaperon)通过提供一个保护环境从通过提供一个保护环境从而而加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构。* * 分子伴侣可逆地分子伴侣可逆地与未折叠肽段的疏水部分结合与未折叠肽段的疏水部分结合随随后松开,如此重复进行可后松开,如此重复进行可防止错误的聚集防止错误的聚集发生,发生,使肽链正确折叠。使肽链正确折叠。 * * 分子伴侣也可分子伴侣也可与错误聚集的肽段结合与错误聚集的肽段结合,使之解聚,使之解聚后,再诱导其正确折叠。后,再诱导其正确折叠。 * * 分子伴侣在蛋白质分子折叠过程中二硫键的正确分子伴侣在蛋白质分子折叠过程中二硫键的正确
17、形成起了重要的作用。形成起了重要的作用。 亚基之间的结合力主要是亚基之间的结合力主要是疏水疏水作用,其次作用,其次是是氢键和离子键氢键和离子键。四、蛋白质的四级结构四、蛋白质的四级结构蛋白质分子中各蛋白质分子中各亚基的空间排布亚基的空间排布及亚基接及亚基接触部位的布局和相互作用,称为触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级蛋白质的四级结构结构。有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链,有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链,每一条多肽链都有完整的三级结构,称为蛋白每一条多肽链都有完整的三级结构,称为蛋白质的质的亚基亚基 (subunit)。血红蛋白血红蛋白的四级结构的四级结构 一级一级 原子分布原子分布
18、 肽键肽键二级二级 一条肽链局部空间一条肽链局部空间 氢氢三级三级 一条肽链整体空间一条肽链整体空间 离子离子 范德华范德华 疏水疏水 氢氢四级四级 两条肽链互相空间两条肽链互相空间 疏水疏水 离子离子 氢氢(一)一级结构是空间构象的基础(一)一级结构是空间构象的基础 一、蛋白质一级结构与功能的关系一、蛋白质一级结构与功能的关系 牛核糖核酸酶的牛核糖核酸酶的一级结构一级结构二二硫硫键键 天然状态,天然状态,有催化活性有催化活性 尿素、尿素、 -巯基乙醇巯基乙醇 去除尿素、去除尿素、-巯基乙醇巯基乙醇非折叠状态,无活性非折叠状态,无活性(二)一级结构与功能的关系(二)一级结构与功能的关系例:镰刀
19、形红细胞贫血例:镰刀形红细胞贫血N-val his leu thr pro glu glu C(146) HbS 肽链肽链HbA 肽肽 链链N-val his leu thr pro val glu C(146) 这种由这种由蛋白质分子发生变异蛋白质分子发生变异所导致的疾病,所导致的疾病,称为称为“分子病分子病”。(一)肌红蛋白与血红蛋白的结构(一)肌红蛋白与血红蛋白的结构 二、蛋白质空间结构与功能的关系二、蛋白质空间结构与功能的关系 Hb与与Mb一样能可逆地与一样能可逆地与O2结合,结合, Hb与与O2结合后称为结合后称为氧合氧合Hb。氧合。氧合Hb占总占总Hb的百分的百分数(称数(称百分饱
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