北京大学生物化学课件 蛋白质生物合成.ppt
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1、12本章主要内容本章主要内容蛋白质合成体系蛋白质合成体系 mRNA与遗传密码与遗传密码 tRNA是氨基酸与密码子之间的是氨基酸与密码子之间的“特异接头特异接头” rRNA(核糖体核糖体)是肽链合成的是肽链合成的“装配机装配机”蛋白质的合成过程蛋白质的合成过程 氨基酸的活化与转运氨基酸的活化与转运 肽链合成的起动、延长肽链合成的起动、延长 、终止、终止 真核生物蛋白质合成的特点真核生物蛋白质合成的特点翻译后加工与蛋白质合成后分泌翻译后加工与蛋白质合成后分泌 肽链合成后的加工与修饰肽链合成后的加工与修饰 复合蛋白质的形成和亚单位的聚合复合蛋白质的形成和亚单位的聚合 分泌蛋白的合成与分泌分泌蛋白的合
2、成与分泌蛋白质合成与某些医学问题蛋白质合成与某些医学问题 分子病以及蛋白质生物合成的阻断剂分子病以及蛋白质生物合成的阻断剂3蛋白质是生命活动的物质基础蛋白质是生命活动的物质基础蛋白质具有高度种属特异性蛋白质具有高度种属特异性蛋白质由生物体自行合成蛋白质由生物体自行合成4 反转录反转录DNA复制复制RNA复制复制DNA RNA 蛋白质蛋白质转录转录翻译翻译5翻译翻译(translation)蛋白质生物合成即翻译过程,是以蛋白质生物合成即翻译过程,是以mRNA为模板、由为模板、由氨基酸氨基酸通过肽键结合,形成特通过肽键结合,形成特定多肽链的过程。定多肽链的过程。这样,这样,mRNA分子中的分子中的
3、遗传信息被具体地翻译成为蛋白质的遗传信息被具体地翻译成为蛋白质的氨基氨基酸排列顺序酸排列顺序6第一节第一节 蛋白质合成体系蛋白质合成体系Section 1 THE MACHINERY OF PROTEIN SYNTHESIS三种三种RNA: mRNA模板模板 tRNA 特异的特异的“搬运工具搬运工具” rRNA“装配机装配机”20种种氨基酸原料氨基酸原料酶与蛋白质因子:酶与蛋白质因子:如如 IFeIF 、EF、 RF无机离子及能量:无机离子及能量:ATP、GTP7一一 蛋白质合成机制研究的三大成就蛋白质合成机制研究的三大成就20世纪世纪50年代初,年代初,Zamecnik证明证明核糖体核糖体是
4、蛋白质合成的场所是蛋白质合成的场所Three Advances for Deducing Protein Synthesis同位素标同位素标记氨基酸记氨基酸大鼠大鼠数小时或数天数小时或数天数分钟数分钟肝细胞各细胞器肝细胞各细胞器均有标记蛋白质均有标记蛋白质肝细胞核糖体肝细胞核糖体有标记蛋白质有标记蛋白质8Hoagland和和Zamecnik发现了发现了“活化活化”的氨基酸的氨基酸氨基酰氨基酰tRNAs (1955)20世纪世纪60年代确定年代确定RNA在蛋白质合成在蛋白质合成中的信息转换作用中的信息转换作用DNAmRNAProteintRNA adaptor91949 Cold Spring
5、Harbor Symposium. The man busy taking notes is Paul Zamecnik. Also in picture J. S. Fruton (L), K. Linderstrom-Lang (R). 1966 Cold Spring Harbor Symposium. Mahlon Hoagland (R) in discussion with Ernest Borek (L). 10Paul Zamecnik in his office at Massachusetts General Hospital, 1999. Mahlon Hoagland
6、at his home in Vermont, 1999. 11二二 mRNA与遗传密码与遗传密码 mRNA and Genetic Code遗传密码遗传密码mRNA的作用:的作用:翻译的直接模板翻译的直接模板 mRNA(4字符字符) 蛋白质蛋白质(20字符字符)?12在在mRNA分子上,从分子上,从5端端3端,每相邻的端,每相邻的3个个核苷酸组成一组,在蛋白质合成时,对应某一核苷酸组成一组,在蛋白质合成时,对应某一种氨基酸,这就是种氨基酸,这就是遗传密码遗传密码(Genetic Code)相邻的三个核苷酸称为相邻的三个核苷酸称为密码子密码子(codon)或三联或三联体密码体密码(triple
7、t) 遗传密码遗传密码 13遗传密码表遗传密码表P35514简并性简并性 (Degeneracy)起始密码和终止密码起始密码和终止密码 ( Initiation codon & Termination codons)方向性与无间隔性方向性与无间隔性 (Polarity & Commaless)通用性通用性 (Universal)遗传密码的特点:遗传密码的特点:15(一一) 简并性简并性(Degeneracy)一种氨基酸对应多个密码子的现象称为一种氨基酸对应多个密码子的现象称为简并简并A,G,C,U 共可组成共可组成64(43)种密码子)种密码子 61 种密码子:代表不同的氨基酸种密码子:代表不
8、同的氨基酸 3 种密码子:种密码子: 代表终止密码子代表终止密码子组成人体蛋白质的氨基酸:组成人体蛋白质的氨基酸:20种种16遗传密码举例:遗传密码举例:UUAUUGCUUCUCCUACUG亮氨酸亮氨酸(Leu)AUG 蛋氨酸蛋氨酸(Met)UUUUUC苯丙氨酸苯丙氨酸(Phe)ACUACCACAACG苏氨酸苏氨酸(Thr)17(二二) 起始密码与终止密码起始密码与终止密码(initiation codon & termination codons) 起动信号起动信号起动信号位于起动信号位于mRNA5端附近端附近起动信号最适上下文序列为:起动信号最适上下文序列为: CCCCAUGGAGAUG蛋
9、氨酸蛋氨酸甲硫氨酸甲硫氨酸(Met)initiation codonUAAUAGUGA 终止信号终止信号termination codons终止信号不代表任何氨基酸密码子终止信号不代表任何氨基酸密码子18(三三) 方向性与无间隔性方向性与无间隔性 方向性:方向性: 密码子的排列是从密码子的排列是从mRNA 5 3端端 起动信号位于起动信号位于 5 端;终止信号位于端;终止信号位于3端端 无间隔性:无间隔性: 密码子在密码子在mRNA上是上是连续的连续的 相邻密码子之间既无间断也无交叉重叠相邻密码子之间既无间断也无交叉重叠 如插入或缺失碱基可导致如插入或缺失碱基可导致移码突变移码突变(Polar
10、ity & Commaless)(frame shift mutation)19A U G G G C U C C A U C G G C G C A U A A startcodonmethionineglycineserineisoleucineglycinealanine stopcodoncodon 2 codon 3 codon 4 codon 5 codon 6 codon 7codon 153密码子的方向性和无间隔性密码子的方向性和无间隔性从从mRNA 5 端起始密码子端起始密码子AUG到到3 端终止密码子之间的核苷端终止密码子之间的核苷酸序列,各个三联密码子连续排列编码一个蛋白
11、质多肽链酸序列,各个三联密码子连续排列编码一个蛋白质多肽链开放阅读框开放阅读框 (open reading frame, ORF)20密码子阅读框即无间隔也不重叠密码子阅读框即无间隔也不重叠蛋蛋氨氨酸酸天天冬冬酰酰胺胺精精氨氨酸酸谷谷氨氨酸酸甘甘氨氨酸酸AUG AAUAGAG AAGGCCG碱基丢失碱基丢失赖赖氨氨酸酸丙丙氨氨酸酸酪酪氨氨酸酸UU 一个碱基突变一个碱基突变第三个碱基改变第三个碱基改变 C21(四四) 通用性通用性(Universal)从病毒、细菌到人从病毒、细菌到人 ,所有生物均使用同一套密码子,所有生物均使用同一套密码子说明各种生物在进化上具有同源性说明各种生物在进化上具有同
12、源性通用性是相对的通用性是相对的 线粒体中:线粒体中:UAG不代表不代表终止信号终止信号而是代表而是代表色氨酸色氨酸 AGA、AGG:终止密码子终止密码子 AUA:起始密码子;蛋氨酸起始密码子;蛋氨酸 某些细菌:某些细菌:GUG也可作启动信号也可作启动信号223 tRNA是氨基酸与密码子之间的是氨基酸与密码子之间的“特异接头特异接头”tRNA, the adaptor of an amino acid to its codon23tRNA转运特点转运特点tRNA转运氨基酸具有特异性转运氨基酸具有特异性 一种一种tRNA对应一种氨基酸对应一种氨基酸 一种氨基酸可由多种一种氨基酸可由多种 tRNA
13、转运转运 tRNA上的上的反密码子反密码子识别识别mRNA上的密码子上的密码子, 使所携带的氨基酸准确对号入座使所携带的氨基酸准确对号入座氨基酸结合于氨基酸结合于tRNA的的3末端末端(CCA-OH)而活化而活化如如 丙氨酰丙氨酰tRNA (Ala-tRNAAla) 蛋氨酰蛋氨酰tRNA (Met-tRNAmet ) 起动蛋起动蛋氨酰氨酰tRNA (fMet-tRNA fMet /Met-tRNA iMet ) 甲酰蛋氨酰甲酰蛋氨酰tRNAtRNA( (原核原核) )蛋氨酰蛋氨酰tRNAtRNA( (真核真核) ) 2453mRNAtRNA353535反密码子与密码子的配对:反密码子与密码子的
14、配对:(1)反向)反向 (2)不稳定(摆动性)不稳定(摆动性)wobble25密码子、反密码子配对的摆动现象密码子、反密码子配对的摆动现象tRNA反密码子反密码子第第1位碱基位碱基IUGACmRNA密码子密码子第第3位碱基位碱基U C AA GU CUG反密码子反密码子的第的第 1 1、2 2、3 3个核苷酸个核苷酸与与密码子密码子的第的第 3 3、2 2、1 1个核苷酸配对个核苷酸配对26 Example of Base-pairing Wobble27四四 核糖体是肽链合成的核糖体是肽链合成的“装配机装配机”Ribosome,the Machinery for Synthesis of P
15、eptide Chain28 核糖体组成核糖体组成 大、小两个亚基大、小两个亚基 主要成分是多种蛋白质主要成分是多种蛋白质rRNA29核糖体的组成核糖体的组成5S,5.8S,28S-rRNA21种种原核原核真核真核小亚基小亚基rRNA蛋白质蛋白质rRNA蛋白质蛋白质大亚基大亚基16S-rRNA 18S-rRNA33种种5S,23S-rRNA49种种34种种大大 小小30 S40 S大大 小小50 S60 S核糖体核糖体大大 小小70 S80 S核糖体功能区:核糖体功能区: 受位受位 (氨基酰位氨基酰位, A位位) acceptor site (aminoacyl site)给位给位 (肽位肽位
16、, P位位): donor site (peptidyl site)排出位(排出位( E位位,原核)原核)exit site 31 2 2t tRNARNA停靠位点停靠位点结合结合AA-tRNA结合肽酰结合肽酰-tRNA和起始和起始Met-tRNA真核生物核糖体结构模式真核生物核糖体结构模式32蛋白质合成的高效性多核糖体蛋白质合成的高效性多核糖体(polysome)(真核)(真核)33蛋白质合成的高效性多核糖体蛋白质合成的高效性多核糖体(polysome)(原核)(原核)34第二节第二节 蛋白质的合成过程蛋白质的合成过程Section 2 PROCESS OF PROTEIN SYNTHESI
17、S氨基酸的活化氨基酸的活化活化氨基酸的转运活化氨基酸的转运活化氨基酸在核糖体上的缩合活化氨基酸在核糖体上的缩合(核糖体循环核糖体循环) 肽链合成启动(肽链合成启动(initiation) 肽链延长(肽链延长(elongation) 肽链合成的终止(肽链合成的终止(termination) 35 一一 氨基酸的活化与转运氨基酸的活化与转运Activation and Transfer of Amino Acids(一)氨基酸的活化与转运是酶促需能反应(一)氨基酸的活化与转运是酶促需能反应tRNA氨基酰氨基酰- tRNAMg2+ Mn2+Amino acidAmino acidATP +amino
18、acyl-tRNA synthetase35氨基酰氨基酰-tRNA合成酶合成酶36氨基酰氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸合成酶对底物氨基酸和和tRNA都有都有高度特异性高度特异性氨基酰氨基酰-tRNA合成酶具有合成酶具有校正活性校正活性 (二二) 氨基酰氨基酰-tRNA合成酶保证翻译的忠实性合成酶保证翻译的忠实性 (aminoacyl-tRNA synthetase)(proofreading activity) 37二二 肽链合成的起动肽链合成的起动(原核生物)(原核生物) Initiation in Ribosome Cycle需要因子:需要因子:Mg2、GTP、ATP、起动因子起动因子
19、(IF)模板模板mRNA核糖体核糖体大小亚基大小亚基组成组成起动复合体起动复合体fMet-tRNAfMet38原核起动因子原核起动因子(initiation factor, IF): IF2: 促进小亚基与促进小亚基与fmet-tRNAfmet结合结合; GTP酶活性(酶活性(GTP GDP+Pi) IF3: 抑制大、小亚基过早聚合抑制大、小亚基过早聚合; 促进小亚基与促进小亚基与mRNA结合结合 IF1: 辅助辅助IF2、IF3 39起动复合体形成过程起动复合体形成过程核糖体大小亚基分离核糖体大小亚基分离mRNA在小亚基定位结合在小亚基定位结合起始氨基酰起始氨基酰-tRNA的结合的结合 (3
20、0S起始复合物形成起始复合物形成)核糖体大亚基结合核糖体大亚基结合(70S起始复合物形成起始复合物形成)40IF-3IF-11. 核糖体大小亚基分离核糖体大小亚基分离41A U G53IF-3IF-12. mRNA在小亚基定位结合在小亚基定位结合42S-D序列序列 (Shine-Dalgarno sequence)43IF-3IF-1IF-2GTP3. 起始氨基酰起始氨基酰tRNA( fMet-tRNAfMet )结合结合到小亚基到小亚基 , 30S起动复合体形成起动复合体形成A U G53444. 核糖体大亚基结合核糖体大亚基结合, 70S起动复合体形成起动复合体形成IF-3IF-1IF-2
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