(农学课件)09 蛋白质的生物合成1.ppt
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1、第九章第九章 蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成第一节 蛋白质合成体系的重要组成部分蛋白质合成体系的重要组成部分第二节 蛋白质的合成过程蛋白质的合成过程第三节 蛋白质合成后的运送蛋白质合成后的运送(一)蛋白质生物合成体系的重要组分 蛋白质生物合成体系的重要组分主要包括mRNA 、tRNA 、rRNA、有关的酶以及几十种蛋白质因子。其中,mRNA是蛋白质生物合成的直接模板。tRNA的作的作用体现在三个方面用体现在三个方面:3CCA接受氨基酸;反密码子识别mRNA链上的密码子;连接多肽链和核糖体。rRNA和几十种蛋白质组成合成蛋白质的场所棗核糖体。 遗传密码的特点遗传密码的特点:无标点性、无重叠性;
2、通用性和例外;简并性;变偶性。知识要点(二)蛋白质白质生物合成的过程 蛋白质生物合成的过程分四个步骤:氨基酸活化、氨基酸活化、肽链合成的起始、延伸、终止和释放肽链合成的起始、延伸、终止和释放。 其中,氨基酸活化即氨酰tRNA的合成,反应由特异的氨酰tRNA合成酶催化,在胞液中进行。氨酰tRNA合成酶既能识别特异的氨基酸,又能辩认携带该氨酰基的一组同功受体tRNA分子。 肽链合成的起始对于大肠杆菌等原核细胞来说,是70S起始复合物的形成。它需要核糖体30S和50S亚基、带有起始密码子AUG的mRNA、fMet-tRNAf 、起始因子IF1、IF2、IF3(分子量分别为10 000、80 000和
3、21 000的蛋白质)以及GTP和Mg2+的参加。 肽链合成的延伸需要7070S S起始起始复合物、氨酰复合物、氨酰- -tRNAtRNA、三种延伸因子三种延伸因子:一种是热不稳定的EF-Tu,另一种是热稳定的EF-Ts,第三种是依赖GTP的EF-G以及GTP和Mg2+。 肽链合成的终止和释放需要三个终止因子RF1、RF2、RF3蛋白的参与。 比较真核细胞蛋白质生物合成与原核细胞的不同。(三)蛋白质合成后的修饰 蛋白质合成后的几种修饰方式蛋白质合成后的几种修饰方式:氨基末端的甲酰甲硫氨酸的切除、肽链的折叠、氨基酸残基的修饰、切去一段肽链。蛋白质合成的蛋白质合成的场所场所是核糖体是核糖体, ,原
4、料原料是是2020种种L-L-氨氨基酸,反应所需基酸,反应所需能量能量由由ATPATP、GTPGTP提供,此外还有提供,此外还有MgMg2+2+、K K+ + 等金属离子参与。等金属离子参与。蛋白质合成体系主要由蛋白质合成体系主要由mRNAmRNA、tRNAtRNA、rRNArRNA、有有关的酶以及几十种蛋白质因子组成。关的酶以及几十种蛋白质因子组成。A G C C T GA G C C T GU C G G A CU C G G A CSer Asp SerSer Asp Ser一些概念、定义1,翻译(translation):在蛋白质合成期间,将存在于mRNA上代表一个多肽的核苷酸残基序列
5、转换为多肽链氨基酸残基序列的过程。2,遗传密码(genetic code):核酸中的核苷酸残基序列与蛋白质中的氨基酸残基序列之间的对应关系。;连续的3个核苷酸残基序列为一个密码子,特指一个氨基酸。标准的遗传密码是由64个密码子组成的,几乎为所有生物通用。3,起始密码子(iniation codon):指定蛋白质合成起始位点的密码子。最常见的起始密码子是蛋氨酸密码:AUG序列,该序列编码着一个指定的氨基酸 ,tRNA 的反密码子与mRNA的密码子互补。4,终止密码子(termination codon):任何tRNA分子都不能正常识别的,但可被特殊的蛋白结合并引起新合成的肽链从翻译机器上释放的密
6、码子。存在三个终止密码子:UAG ,UAA和UGA。5,密码子(condon):mRNA(或DNA)上的三联体核苷酸残基6,反密码子(anticodon):tRNA分子的反密码子环上的三联体核苷酸残基序列。在翻译期间,反密码子与mRNA中的互补密码子结合。7,简并密码子(degenerate codon):也称为同义密码子。是指编码相同的氨基酸的几个不同的密码子。 8,氨基酸臂(amino arm):也称为接纳茎。tRNA分子中靠近3端的核苷酸序列和5端的序列碱基配对,形成的可接收氨基酸的臂(茎)。9,TC臂(TC arm):tRNA中含有胸腺嘧啶核苷酸-假尿嘧啶核苷酸-胞嘧啶核苷酸残基序列的
7、茎-环结构。10,氨酰-tRNA(aminoacyl-tRNA):在氨基酸臂的3端的腺苷酸残基共价连接了氨基酸的tRNA分子。11,同工tRNA(isoacceptor tRNA):结合相同氨基酸的不同的tRNA分子。12,摆动(wobble):处于密码子3端的碱基与之互补的反密码子5端的碱基(也称为摆动位置),例如I可以与密码子上3端的U,C和A配对。由于存在摆动现象,所以使得一个tRNA反密码子可以和一个以上的mRAN密码子结合。13,氨酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase):催化特定氨基酸激活并共介结合在相应的tRNA分子3端的酶。14,翻译起始复合物(
8、translation initiation complex):由核糖体亚基,一个mRNA模板,一个起始的tRNA分子和起始因子组成并组装在蛋白质合成起始点的复合物。15,读码框(reading frame):代表一个氨基酸序列的mRNA分子的非重叠密码序列。一个mRNA读码框是由转录起始位置(通常是AUG密码)确定的。16,SD序列(Shine-Dalgarno sequence):mRNA中用于结合原核生物核糖体的序列。17,肽酰转移酶(peptidy transeferace):蛋白质合成期间负责转移肽酰基和催化肽键形成的酶。18,嘌吟毒素(puromycin):通过整合到生长着的肽链,
9、引起肽链合成提前终止来抵制多肽名链合成的一种抗生素。19,开放读码框(open reading frame):DNA或RNA序列中一段不含终止密码的连续的非重叠核苷酸密码20,信号肽(signal peptide):常指新合成多肽链中用于指导蛋白质夸膜转移(定位)的N-末端氨基酸序列(有时不一定在N端)。第一节第一节 蛋白质合成体系的重要组分蛋白质合成体系的重要组分一、一、mRNAmRNA和遗传密码和遗传密码二、二、tRNAtRNA三、三、rRNArRNA和核糖体和核糖体一、一、mRNAmRNA和遗传密码和遗传密码l mRNAmRNA由由DNADNA经转录合成,携带着经转录合成,携带着DNAD
10、NA的遗传信息,然的遗传信息,然后作为模板通过翻译将遗传信息传递给蛋白质,即后作为模板通过翻译将遗传信息传递给蛋白质,即由它直接决定多肽链中由它直接决定多肽链中AAAA的顺序。所以的顺序。所以mRNAmRNA为模板为模板的蛋白质合成过程被称为的蛋白质合成过程被称为翻译翻译或或转译转译。l mRNAmRNA分子中四种不同碱基(分子中四种不同碱基(A A、G G、C C和和U U)构成特定构成特定顺序决定蛋白质分子中顺序决定蛋白质分子中2020种种AAAA所构成的序列。所构成的序列。l 大量实验证明大量实验证明mRNAmRNA上相邻三个碱基编码一种上相邻三个碱基编码一种AAAA,因因而被称为碱基三
11、联体或密码子。而被称为碱基三联体或密码子。 四种核苷酸,能有四种核苷酸,能有4 43 3 =64=64组密码子组密码子l 19661966年已经完全查清了年已经完全查清了2020种基本氨基酸所对应的种基本氨基酸所对应的6161个密码子。其中有一个密码子也作为肽链合成的起个密码子。其中有一个密码子也作为肽链合成的起始密码子始密码子, , 另外还有三个终止密码子。另外还有三个终止密码子。l遗传密码的发现遗传密码的发现19611961年,年,M.M.NirenbergNirenberg等人提出。等人提出。 4 43 3 =64=64大肠杆菌中,以多聚大肠杆菌中,以多聚U U做为做为mRNAmRNA,
12、即即polyUpolyU+20+20种放种放射性同位素标记的氨基酸,大肠杆菌合成体系射性同位素标记的氨基酸,大肠杆菌合成体系,在外,在外界环境合适下,合成了一条多聚苯丙氨酸(界环境合适下,合成了一条多聚苯丙氨酸(phephe)肽肽链。链。UUUUUU为为phephe的三联体密码。的三联体密码。发现具有密码子功能的最短链为三个核苷酸,并且发现具有密码子功能的最短链为三个核苷酸,并且含含3 3 - -OHOH和和5 5 - -磷酸基的三核苷酸最有效。磷酸基的三核苷酸最有效。阅读方向为阅读方向为5 5 -3-3 。至。至19661966年,年,2020中氨基酸对应的中氨基酸对应的6161个密码子和三
13、个终止密码子全部被查清。个密码子和三个终止密码子全部被查清。 遗遗 传传 密密 码码阅读方向为阅读方向为5-35-3 遗传密码的特点遗传密码的特点 密码子的密码子的方向性方向性 密码子的密码子的阅读方向及它们在阅读方向及它们在mRNAmRNA由起始信号到终止信由起始信号到终止信号的排列方向均为号的排列方向均为5 5 -3-3,与,与mRNAmRNA链合成时延伸方向相链合成时延伸方向相同。同。 密码子的简并性密码子的简并性 64-3=6164-3=61个代表个代表2020种氨基酸,仅甲硫氨酸、色氨酸只有种氨基酸,仅甲硫氨酸、色氨酸只有一个密码子。一个氨基酸可以有几个不同的密码子,编一个密码子。一
14、个氨基酸可以有几个不同的密码子,编码同一个氨基酸的一组密码子称为码同一个氨基酸的一组密码子称为同义密码子同义密码子。这种现。这种现象称为象称为密码子的简并性密码子的简并性。 密码子的密码子的连续性(读码)(连续性(读码)(无标点、无重叠)无标点、无重叠) 从正确起点开始至终止信号,密码子的排列是连续的。既不存从正确起点开始至终止信号,密码子的排列是连续的。既不存在间隔(无标点),也无重叠。在在间隔(无标点),也无重叠。在mRNAmRNA分子上插入或删去一个碱基,分子上插入或删去一个碱基,会使该点以后的读码发生错误,称为移码,由这种情况引起的突变会使该点以后的读码发生错误,称为移码,由这种情况引
15、起的突变称为移码突变。称为移码突变。密码子的基本通用性(近于完全通用)密码子的基本通用性(近于完全通用) 对于高等、低等生物都适用,只有一个例外:真核生物对于高等、低等生物都适用,只有一个例外:真核生物线粒体线粒体DNADNA。(。(P397P397)一些原核生物中利用终止密码翻一些原核生物中利用终止密码翻译译AAAA(UGA-UGA-TrpTrp 硒代半胱氨酸)硒代半胱氨酸)33起始密起始密码子码子55起始密码子和终止密码子起始密码子和终止密码子6464种密码子中,种密码子中,AUGAUG为甲硫氨酸的密码子,又是肽链合为甲硫氨酸的密码子,又是肽链合成的起始密码子,成的起始密码子,UAAUAA
16、,UAGUAG,UGAUGA为终止密码子,不编为终止密码子,不编码任何氨基酸,而成为肽链合成的终止部位(无义密码码任何氨基酸,而成为肽链合成的终止部位(无义密码子)。子)。密码子的摆动性密码子的摆动性(变偶性)(变偶性)如丙氨酸:如丙氨酸:GCUGCU,GCCGCC,GCAGCA,GCGGCG,只第三位不同只第三位不同 ,显,显然密码子的专一性基本取决于前两位碱基,第三位碱基然密码子的专一性基本取决于前两位碱基,第三位碱基有较大灵活性。发现有较大灵活性。发现tRNAtRNA上的反密码子与上的反密码子与mRNAmRNA上的密码上的密码子配对时,密码子的第一位、第二位碱基配对是严格的,子配对时,密
17、码子的第一位、第二位碱基配对是严格的,第三位碱基可以有一定变动,这种现象称为密码的摆动第三位碱基可以有一定变动,这种现象称为密码的摆动性或变偶性(性或变偶性(wobblewobble)。)。I IA A、U U、C C配对。配对。二、二、tRNAtRNA: :v在蛋白质合成中,起着运载氨基酸的作用,按照在蛋白质合成中,起着运载氨基酸的作用,按照mRNAmRNA链上的密码子所决定的氨基酸顺序将氨基酸转运到核链上的密码子所决定的氨基酸顺序将氨基酸转运到核糖体的特定部位。糖体的特定部位。v同功受体同功受体tRNAtRNA: :一种氨基酸可以有一种以上一种氨基酸可以有一种以上tRNAtRNA作为作为运
18、载工具。把运载工具。把携带相同氨基酸而反密码子不同的一组携带相同氨基酸而反密码子不同的一组tRNAtRNA称为同功受体称为同功受体tRNAtRNA反密码子反密码子 tRNAtRNA分子上三个特定的碱基组成一个反密码子,位于分子上三个特定的碱基组成一个反密码子,位于反密码子环上。反密码子环上。ltRNAtRNA有两个关键部位:有两个关键部位: 3 3端端CCACCA:接受氨基酸,形成氨酰接受氨基酸,形成氨酰- -tRNAtRNA。需需ATPATP提供活化氨基提供活化氨基酸所需的能量。酸所需的能量。 与与mRNAmRNA结合部位结合部位反密码子部位(反密码子部位(tRNAtRNA的接头作用)的接头
19、作用)35ICCA-OH53CCA-OHG G CC C G密码子与反密码子的密码子与反密码子的阅读方向均为阅读方向均为55 3 3,两者反向平行配对。两者反向平行配对。tRNAtRNA凭借自身的反密码子与凭借自身的反密码子与mRNAmRNA链链上的密码子上的密码子相识别,把所带氨基酸放到肽链的一定位置。相识别,把所带氨基酸放到肽链的一定位置。tRNAtRNA分子的突变与校正基因分子的突变与校正基因GAG(Asn)UAGH3NGlnCOO-有活力有活力H3NCOO-无活力无活力基因突变基因突变H3NTyrCOO-有活力有活力AUGUACAUCtRNAtRNA突变突变三、三、rRNArRNA及核
20、糖体及核糖体 核糖体是由几十种蛋白质和几种核糖体是由几十种蛋白质和几种rRNArRNA组成的亚细胞组成的亚细胞颗粒颗粒, ,其中蛋白质与其中蛋白质与rRNArRNA的重量比约为的重量比约为1:21:2。核糖体是蛋核糖体是蛋白质合成的场所。白质合成的场所。 核糖体的存在形态有三种:单核糖体、核糖体亚核糖体的存在形态有三种:单核糖体、核糖体亚基和多核糖体基和多核糖体。 真核生物:游离核糖体或与内质网结合真核生物:游离核糖体或与内质网结合原核生物:游离核糖体或与原核生物:游离核糖体或与mRNAmRNA结合成串状的结合成串状的多核糖体多核糖体 ( (提高翻译效率提高翻译效率) )。核糖体亚基的聚合(核
21、糖体亚基的聚合(1010mmolmmol/L/L)与解聚与解聚(0.1(0.1mmolmmol/L)/L)与与MgMg2+2+浓度有关浓度有关1.1.不同来源核糖体的大小和不同来源核糖体的大小和RNARNA组成组成原核生物原核生物核糖体(核糖体(S)S)亚基(亚基(S)S)rRNArRNA (S) (S)真核生物真核生物806040285.851850703023516 大肠杆菌中大肠杆菌中3030S S的亚基能单独与的亚基能单独与mRNAmRNA结合成结合成3030S S核糖体核糖体- -mRNAmRNA复复合体,后者与合体,后者与tRNAtRNA可以专一性可以专一性结合。结合。5050S
22、S亚基不能单独与亚基不能单独与 mRNAmRNA结合,但可以非专一地与结合,但可以非专一地与tRNAtRNA结合,结合, 50 50S S亚基上有两个亚基上有两个tRNAtRNA结合位点:结合位点:氨酰基位点氨酰基位点- -A A;肽酰基位点肽酰基位点- -P P。还有一个还有一个GTPGTP结结合位点。合位点。2. 2. 核糖体存在两个重要的核糖体存在两个重要的tRNAtRNA的结合部位的结合部位(大肠杆菌)(大肠杆菌)P P位和位和A A位,二者紧密连接,各占一个密码子的距离。位,二者紧密连接,各占一个密码子的距离。P P:结合起始的氨酰结合起始的氨酰- -tRNAtRNA和肽基和肽基-
23、-tRNAtRNA,A A:结合新掺入的氨酰结合新掺入的氨酰- - tRNAtRNA。P P位上肽酰位上肽酰- - tRNAtRNA上的羧基与进入上的羧基与进入A A位的氨酰位的氨酰- - tRNAtRNA上上的氨基形成新的肽键的氨基形成新的肽键P P位上位上tRNAtRNA卸下肽链成为无负卸下肽链成为无负载的载的tRNAtRNA核糖体核糖体移动一个密码子的距离,移动一个密码子的距离,A A位上的位上的肽酰肽酰- - tRNAtRNA又回到又回到P P位,位,A A位又空,再进行下一次循环。位又空,再进行下一次循环。PA533.3.多核糖体多核糖体 大肠杆菌大肠杆菌由由一定数目的单个核糖体与一
24、定数目的单个核糖体与一个一个mRNA mRNA 分子结合而成的念珠状结构。分子结合而成的念珠状结构。每个核糖体可独立完成一条肽链的合成,每个核糖体可独立完成一条肽链的合成,所以在多核糖体上可以同时进行多条肽链所以在多核糖体上可以同时进行多条肽链的合成,提高了翻译的效率。的合成,提高了翻译的效率。第二节第二节 蛋白质的合成过程蛋白质的合成过程 一、一、氨基酸的活化氨基酸的活化 二、二、肽链合成的起始肽链合成的起始 三、三、肽链的延伸肽链的延伸 四、四、肽链合成的终止与释放肽链合成的终止与释放 五、五、真核细胞蛋白质生物合成真核细胞蛋白质生物合成 六、六、肽链合成后加工和折叠肽链合成后加工和折叠一
25、、氨基酸的活化一、氨基酸的活化l氨基酸在掺入肽链前必须活化,在氨基酸在掺入肽链前必须活化,在胞液中胞液中进行。进行。l氨基酸的活化是指各种参加蛋白质合成的氨基酸的活化是指各种参加蛋白质合成的AAAA与携带它的相应的与携带它的相应的tRNAtRNA结合成结合成氨酰氨酰- - tRNAtRNA的过程。活化反应在的过程。活化反应在氨酰氨酰- -tRNA tRNA 合成合成酶酶的催化下进行。的催化下进行。l活化反应分两步进行:活化反应分两步进行:1 1、 活化活化 : AA-AMP-EAA-AMP-E复合物的形成复合物的形成E-CR1-C-O P-O- CH2= O OH-O腺嘌呤 OH OH ONH
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