分子生物学原理-RNA的生物合成PPT课件.ppt
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1、2022-5-25分子生物学原理第第 十十 一一 章章RNA的生物合成的生物合成(转录转录)RNA Biosynthesis, Transcription2022-5-25分子生物学原理转转录录RNADNA 转录转录 (transcription) 生物体以生物体以DNA为模板合成为模板合成RNA的过程的过程 。 也就是把也就是把DNA的碱基序列抄录成的碱基序列抄录成RNA的的碱基序列。碱基序列。2022-5-25分子生物学原理复制与转录的异同点复制与转录的异同点 相同点:相同点: 不同点不同点: 复制复制 转录转录 以以DNA作模板作模板 双链复制双链复制 模板链模板链 需需4种种NTP d
2、NTP NTP 碱基配对碱基配对 A=T A=U,T=A 合成方向合成方向53 依赖依赖DNA的聚合酶的聚合酶 DDDP DDRP 多聚核苷酸大分子多聚核苷酸大分子 半保留式子代半保留式子代 mRNA、 tRNA、rRNA2022-5-25分子生物学原理参与转录的物质参与转录的物质原料原料: : NTP (ATP, UTP, GTP, CTP) 模板模板: : DNA酶酶: : RNA聚合酶聚合酶(RNA polymerase, RNA-pol)其他蛋白质因子其他蛋白质因子2022-5-25分子生物学原理模板和酶模板和酶Templates and Enzymes第一节第一节2022-5-25分
3、子生物学原理一、转录模板一、转录模板 结构基因:结构基因:strucural gene 能转录出能转录出mRNA然后指导蛋白质生成然后指导蛋白质生成 的部分。的部分。 模板链:模板链:template strand 可作为模板转录成可作为模板转录成RNA的一股链。的一股链。也也称作称作有意义链有意义链或或Watson链链。 编码链:编码链:coding strand 相对于模板链的另一股链。相对于模板链的另一股链。也称为也称为反反义链义链或或Crick链链。 2022-5-25分子生物学原理模板模板: 转录、翻译的序列比较转录、翻译的序列比较5 GCATTAGCTAGCTACTAGC 3 DN
4、A3 cgtaatcgatcgatgatcg 5 双链双链 转录转录5 GCAUUAGCUAGCUACUAGC 3 mRNA 翻译翻译N Ala Leu Ala Ser Try C 肽肽链链2022-5-25分子生物学原理转录的不对称性转录的不对称性 不对称转录不对称转录:asymmetric transcription DNA双链对一个基因而言,一股可转录,双链对一个基因而言,一股可转录,另一股不转录。另一股不转录。 模板链与编码链相对而言模板链与编码链相对而言2022-5-25分子生物学原理5 5 3 3 3 3 5 5 模板链模板链编码链编码链编码链编码链模板链模板链结构基因结构基因转录
5、方向转录方向转录方向转录方向2022-5-25分子生物学原理二、二、 RNA聚合酶聚合酶 转录酶:依赖转录酶:依赖DNA的的RNA聚合酶聚合酶 DNA dependent RNA polymerase DDRP 2022-5-25分子生物学原理原核生物的原核生物的RNA聚合酶聚合酶 大肠杆菌的大肠杆菌的RNA聚合酶聚合酶: 2 其中其中 2称为称为核心酶核心酶:只有转录功能:只有转录功能 亚基:辨别转录起始点亚基:辨别转录起始点 + 2=全酶全酶 受利福平或利福霉素(结核菌药物)的特受利福平或利福霉素(结核菌药物)的特异性抑制。异性抑制。2022-5-25分子生物学原理核心酶核心酶 (core
6、 enzyme)全酶全酶 (holoenzyme) 2022-5-25分子生物学原理RNA聚合酶全酶在转录起始区的结合聚合酶全酶在转录起始区的结合 2022-5-25分子生物学原理原核生物的原核生物的RNA聚合酶聚合酶亚基功能决定转录的特异性在转录的全过程起作用酶与 DNA 模板结合的主要成分辨别转录起始点2022-5-25分子生物学原理真核生物的真核生物的RNA聚合酶聚合酶IIIIII转录产物45s-rRNAhnRNA5s-rRNA,tRNA,snRNA对鹅膏蕈碱的反应耐受极敏感中度敏感RNA聚合酶聚合酶II可认为是真核生物中最重要的可认为是真核生物中最重要的RNA聚合酶聚合酶2022-5-
7、25分子生物学原理三、模板与酶的辨认结合三、模板与酶的辨认结合原核生物一个转录区段可视为一个转录单原核生物一个转录区段可视为一个转录单位,称为位,称为操纵子操纵子(operon),包括若干个,包括若干个结构基因结构基因及其上游及其上游(upstream)的的调控序列调控序列。 5 3 3 5 结构基因结构基因调控序列调控序列RNA-polRNA聚合酶结合模板聚合酶结合模板DNA的部位,称为的部位,称为启启动子动子(promoter)。2022-5-25分子生物学原理三、模板与酶的辨认结合三、模板与酶的辨认结合启动区的保守序列启动区的保守序列原核生物有两个元件原核生物有两个元件-35bp的的辨认
8、位点辨认位点:5-TTGACA-10bp的的Pribnow盒盒: 5-TATAATPu真核生物有多个元件真核生物有多个元件(如如-30的的Hogness或或TATA盒盒)。2022-5-25分子生物学原理RNA聚合聚合酶保护法酶保护法目目 录录2022-5-25分子生物学原理开始转录开始转录T T G A C AA A C T G T-35 区区(Pribnow box)T A T A A T Pu A T A T T A Py-10 区区1-30-5010-10-40-205 3 3 5 原核生物启动子保守序列原核生物启动子保守序列RNA-pol辨认位点辨认位点(recognition si
9、te) 5 5 RNA聚合酶保护区聚合酶保护区结构基因结构基因3 3 2022-5-25分子生物学原理 TATA盒盒 CAAT盒盒 GC盒盒 增强子增强子 顺式作用元件顺式作用元件 结构基因结构基因-GCGC-CAAT-TATA转录起始转录起始真核生物启动子保守序列真核生物启动子保守序列2022-5-25分子生物学原理转录过程转录过程The Process of Transcription 第二节第二节 2022-5-25分子生物学原理(一)转录起始(一)转录起始转录起始需解决两个问题:转录起始需解决两个问题:1. RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域
10、。起始区域。2. DNA双链解开,使其中的一条链作为转录双链解开,使其中的一条链作为转录的模板。的模板。一、原核生物的转录过程一、原核生物的转录过程2022-5-25分子生物学原理2. DNA双链解开双链解开1. RNA聚合酶全酶聚合酶全酶( 2)与模板结合与模板结合 3. 在在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应,聚合酶作用下发生第一次聚合反应,形成转录起始复合物形成转录起始复合物RNApol ( 2) - DNA - pppGpN- OH 3 转录起始复合物转录起始复合物:5 -pppG -OH + NTP 5 -pppGpN - OH 3 + ppi转录起始过程转录起始过程2022-5-
11、25分子生物学原理转录起始中的事件转录起始中的事件 解链解链 形成转录空泡形成转录空泡 为首的为三磷酸为首的为三磷酸GTP或或ATP 转录起始复合物转录起始复合物(RNA-聚合酶全酶聚合酶全酶-DNA-pppGpN-OH) 第一个磷酯键形成后,第一个磷酯键形成后, 亚基从转录起亚基从转录起始复合物中脱落下来。始复合物中脱落下来。RNA聚合酶沿聚合酶沿DNA链向前移动。链向前移动。2022-5-25分子生物学原理转录空泡转录空泡(transcription bubble):RNA-pol (核心酶)(核心酶) DNA RNA2022-5-25分子生物学原理(二)转录延长(二)转录延长1. 亚基脱
12、落,亚基脱落,RNApol聚合酶核心酶变构,聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着与模板结合松弛,沿着DNA模板前移;模板前移; 2. 在在核心酶核心酶作用下,作用下,NTP不断聚合,不断聚合,RNA链链不断延长。不断延长。(NMP) n + NTP (NMP) n+1 + PPi2022-5-25分子生物学原理转录的延长转录的延长 转录的延长是以转录的延长是以5到到3的方向进行的。的方向进行的。 (NMP)n+NTP(NMP)n+1+PPi 以以G=C、A=U、T=A碱基配对。碱基配对。 转录完成部分的转录完成部分的DNA重新形成双链。重新形成双链。 较长的较长的RNA链上有核糖体结合,说明
13、在链上有核糖体结合,说明在某些情况下,某些情况下,转录的同时,翻译已经开转录的同时,翻译已经开始进行了。始进行了。2022-5-25分子生物学原理2022-5-25分子生物学原理转录的过程转录的过程2022-5-25分子生物学原理转录的延长转录的延长2022-5-25分子生物学原理5 3 DNA原核生物转录过程中的羽毛状现象原核生物转录过程中的羽毛状现象核糖体核糖体RNARNA聚合酶聚合酶2022-5-25分子生物学原理(三)转录的终止(三)转录的终止 转录终止转录终止:是:是RNA聚合酶在模板上的某聚合酶在模板上的某一位置一位置停顿,停顿,RNA链从转录复合物上脱链从转录复合物上脱离出来。离
14、出来。 分为分为依赖依赖Rho因子的转录终止因子的转录终止和和不依赖不依赖Rho因子的转录终止因子的转录终止。2022-5-25分子生物学原理1、依赖、依赖Rho因子的转录终止因子的转录终止 Rho因子的因子的左右是使左右是使RNA-DNA杂化双链的杂化双链的短链变性,短链变性,从而有利于从而有利于转录产物从转录产物从转录复合物转录复合物中释放出来。中释放出来。2022-5-25分子生物学原理A T P1. 依赖依赖 Rho因子的转录终止因子的转录终止2022-5-25分子生物学原理2. 非依赖非依赖 Rho因子的转录终止因子的转录终止DNA模板上靠近终止处,有些特殊的碱模板上靠近终止处,有些
15、特殊的碱基序列,转录出基序列,转录出RNA后,后,RNA产物形成特殊产物形成特殊的结构来终止转录。的结构来终止转录。2022-5-25分子生物学原理2、非依赖、非依赖Rho因子的转录终止因子的转录终止2022-5-25分子生物学原理5UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU. 3 5UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU. 3 RNA 5 TTGCAGCCTGACAAATCAGGCTGATGGCTGGTGACTTTTTAGTCACCAGCCTTTTT
16、. 3 DNA UUUU. UUUU.5UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU. 3茎环茎环(stem-loop)/发夹发夹(hairpin)结构结构2022-5-25分子生物学原理茎环结构使转录终止的机理茎环结构使转录终止的机理 使使RNA聚合酶变构,转录停顿;聚合酶变构,转录停顿; 使转录复合物趋于解离,使转录复合物趋于解离,RNA产物释放。产物释放。5 pppG5 3 3 5 RNA-pol2022-5-25分子生物学原理不依赖不依赖Rho因子的转录终止模式因子的转录终止模式 RNA 聚合酶DNA 转录产物RNA链
17、出现茎链出现茎-环结构,促进环结构,促进转录的终止。转录的终止。1.这样的结构改变这样的结构改变RNA聚合酶聚合酶的构象,使酶不再向下移动。的构象,使酶不再向下移动。2.DNA和和RNA各自形成自己的各自形成自己的局部双链,使杂化链更加不稳局部双链,使杂化链更加不稳定,以致转录复合物趋于解定,以致转录复合物趋于解体。体。接着的一串寡聚接着的一串寡聚U,则更是促则更是促进进RNA新链从模板上脱落的新链从模板上脱落的促进因素。促进因素。2022-5-25分子生物学原理二、真核生物的转录起始二、真核生物的转录起始(一)转录起始(一)转录起始真核生物的转录起始上游区段比原核生物真核生物的转录起始上游区
18、段比原核生物多样化,转录起始时,多样化,转录起始时,RNA-pol不直接结合模不直接结合模板,其起始过程比原核生物复杂。板,其起始过程比原核生物复杂。2022-5-25分子生物学原理转录起始点转录起始点TATA盒盒CAAT盒盒GC盒盒 增强子增强子顺式作用元件顺式作用元件(cis-acting element)1. 转录起始前的上游区段转录起始前的上游区段 AATAAA切离加尾切离加尾 转录终止点转录终止点 修饰点修饰点 外显子外显子 翻译起始点翻译起始点内内含含子子 OCT-1 OCT-1:ATTTGCAT八聚体八聚体2022-5-25分子生物学原理2. 转录因子转录因子 能直接、间接辨认和
19、结合转录上游区段能直接、间接辨认和结合转录上游区段DNA的蛋白质,现已发现数百种,统称为的蛋白质,现已发现数百种,统称为反反式作用因子式作用因子(trans-acting factors)。 反式作用因子中,直接或间接结合反式作用因子中,直接或间接结合RNA聚合酶的,则称为聚合酶的,则称为转录因子转录因子(transcriptional factors, TF)。 2022-5-25分子生物学原理参与参与RNA-pol转录的转录的TF 蛋白激酶活性,使蛋白激酶活性,使CTD磷磷酸化酸化TFHATPase57( ) 34( )TFE解螺旋酶解螺旋酶30,74TFF促进促进RNA-pol结合及作结
20、合及作为其他因子结合的桥梁为其他因子结合的桥梁33TFB稳定稳定TFD-DNA复合物复合物12,19,35TFA辅助辅助TBP-DNA结合结合TAF*结合结合TATA盒盒TBP* 38TFD功功能能亚基组成,分子量亚基组成,分子量(kD)转录因子转录因子蛋白激酶活性,使蛋白激酶活性,使CTD磷磷酸化酸化TFHATPase57( ) 34( )TFE解螺旋酶解螺旋酶30,74TFF促进促进RNA-pol结合及作结合及作为其他因子结合的桥梁为其他因子结合的桥梁33TFB稳定稳定TFD-DNA复合物复合物12,19,35TFA辅助辅助TBP-DNA结合结合TAF*结合结合TATA盒盒TBP* 38T
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