(生物化学教学课件)第13章 rna的生物合成(5-1, lmj2015).ppt
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- 生物化学教学课件第13章 rna的生物合成5-1 lmj2015 生物化学 教学 课件 13 rna 生物 合成 lmj2015
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1、上午5时45分1 D N AD N A 指 导 的指 导 的 R N AR N A 合 成合 成 , 也 称 为, 也 称 为 转 录转 录(transcription)(transcription)。是生物体内。是生物体内RNARNA的主要合成方的主要合成方式,也是本章介绍的主要内容。式,也是本章介绍的主要内容。 RNARNA指导的指导的RNARNA合成合成(RNA-dependent RNA (RNA-dependent RNA synthesis)synthesis),也称,也称RNARNA复制复制(RNA replication)(RNA replication),是逆是逆转录病毒以外
2、的转录病毒以外的RNARNA病毒病毒, ,在宿主细胞以病毒单链在宿主细胞以病毒单链RNARNA为模板合成为模板合成RNARNA的方式。的方式。上午上午5时时45分分2转录转录RNADNA 是指生物体以是指生物体以DNADNA为模板合成为模板合成RNARNA的过程。的过程。意指将意指将DNADNA碱基序列转抄为碱基序列转抄为RNARNA碱基序列碱基序列。不需引物不需引物) )3上午5时45分双链双链DNADNA中只有中只有一股链作为一股链作为模板模板( (不对称转录不对称转录) );结构基因结构基因(2(22.52.5万个基因万个基因) )双链双链DNADNA的两股链均作为的两股链均作为模板模板
3、( (半保留复制半保留复制) );全基因全基因(3 X 10(3 X 109 9 bpbp) )NTPsNTPsdNTPsdNTPsA-UA-U、T-AT-A、G-CG-CA-TA-T、G-CG-CRNARNA聚合酶聚合酶( (不需引物不需引物) ),缺乏校读功能缺乏校读功能DNADNA聚合酶聚合酶( (需需RNARNA引物引物) ),有较读功能有较读功能5 5 3 3 5 5 3 3 单链单链RNARNA子代双链子代双链DNADNA上午5时45分4上午5时45分5学习要求:学习要求: 掌握掌握复制与转录的主要区别;转录、不对称转复制与转录的主要区别;转录、不对称转录、模板链、编码链的概念;原
4、核生物录、模板链、编码链的概念;原核生物 RNA 聚合酶聚合酶全酶、核心酶的组成和作用;真核生物全酶、核心酶的组成和作用;真核生物 RNA 聚合酶聚合酶的主要类型和产物,转录因子的概念。的主要类型和产物,转录因子的概念。 人类基因组编码蛋白质的基因约为人类基因组编码蛋白质的基因约为2 22.52.5万万个,个,但但通常通常只有只有2%2%15%15%的基因处于转录活性状态。的基因处于转录活性状态。 是指是指在转录过程中,能在转录过程中,能够够按碱基配对规律指导按碱基配对规律指导RNARNA合成的那股合成的那股DNADNA单链,也称单链,也称为为或或。 是指是指与模板链对应的不被转录的那股与模板
5、链对应的不被转录的那股DNADNA单链,单链,也称作也称作或或。上午5时45分65 5GCA GGCA GT TA CAA CAT T G GT TC C3 33 3cgt cat gta cagcgt cat gta cag5 55 5GCA GGCA GU UA CAA CAU U G GU UC C3 3 mRNA转录转录翻译翻译DNADNA双链双链上午5时45分7 在不同的在不同的DNA 转录区段中,模板链并非总在同转录区段中,模板链并非总在同一股一股DNA链上。链上。 在一个在一个DNA转录区段中,只有模板链被转录,转录区段中,只有模板链被转录,而编码链不转录;而编码链不转录;图图1
6、3-1 RNA 的不对称转录的不对称转录上午5时45分8 (DNA dependent RNA polymerase, RNA pol)pppG pN O H + ( N TP) n D N A 模 板R N A 聚 合 酶 ( 核 心 酶 )pppG pN ( pN ) n + nPPi上午5时45分9亚基亚基+ 核心酶核心酶 (core enzyme) 全酶全酶 (holoenzyme) 上午5时45分1036,512 与核心酶亚基的正确聚合有关,控制与核心酶亚基的正确聚合有关,控制转录的速率。能与启动子结合。转录的速率。能与启动子结合。150,618 聚合功能聚合功能(催化催化),被利福
7、平结合抑制,被利福平结合抑制155,613 结合结合DNA 模板,兼有解链功能模板,兼有解链功能11,000 功能尚不清楚功能尚不清楚70,263 辨认起始位点,促进酶与启动子结合辨认起始位点,促进酶与启动子结合表表13-2 大肠杆菌大肠杆菌(EColi)RNA 聚合酶各亚基的功能聚合酶各亚基的功能上午5时45分11PS1S2S3启动子启动子O(Promoter)调控序列调控序列结构基因结构基因 操纵子操纵子 结合结合RNARNA聚合酶聚合酶表达功能蛋白表达功能蛋白?CAP结合位点结合位点原核生物转录的基本单位。原核生物转录的基本单位。上午5时45分12RNA聚合酶保护法聚合酶保护法先把一段基
8、因分离出先把一段基因分离出来后,与提纯的来后,与提纯的RNA聚合酶混合聚合酶混合;加入核酸外切酶作用加入核酸外切酶作用一定时间一定时间;总有一段总有一段4060 bp的的DNA片段由于片段由于RNA聚聚合酶的结合而免于被合酶的结合而免于被降解。降解。对这段受保护的对这段受保护的DNA序列进行分析。序列进行分析。上午5时45分13RNARNA聚合酶聚合酶保护区保护区结构基因结构基因终止点终止点- -10转录开始转录开始 + +1- -35TTGACAAACTGTTATAATATATTA(Pribnow box)RNA pol辨认结合区辨认结合区转录起始区转录起始区共有序列共有序列上午5时45分1
9、4 转录起点的上游约转录起点的上游约-10-10处找到处找到6bp6bp的保守序列的保守序列TATAATTATAAT,称为,称为-10-10序列序列或或PribnowPribnow盒盒(box)(box);与真核;与真核细胞和古生菌中的细胞和古生菌中的TATA BoxTATA Box功能相似。功能相似。 T A T A T A T A A A T T 80% 95% 45% 60% 50% 96% 80% 95% 45% 60% 50% 96% RNA RNA polpol(RNA (RNA 聚合酶聚合酶) )紧密结合;紧密结合; 形成开放启动复合体;形成开放启动复合体; 使使RNA RNA
10、polpol定向转录定向转录-10-10序列的突变不影响序列的突变不影响RNApolRNApol与启动子的结合与启动子的结合速度,可是会降低双链解开的速度。速度,可是会降低双链解开的速度。上午5时45分15 3232( (相对分子质量相对分子质量32,000)32,000)识别、结合热激蛋识别、结合热激蛋白(白(heat shock proteinheat shock protein,HspHsp)基因转录启动子。)基因转录启动子。 6060( (相对分子质量相对分子质量60,000)60,000)在氮饥饿时开启某在氮饥饿时开启某些可利用其他氮源的基因。些可利用其他氮源的基因。上午5时45分1
11、6P70S1S2S3?P32H1H2H3?P60N1N2N3?1 1 45S 45S rRNArRNA是是5.8S5.8S、 18S18S和和28S rRNA28S rRNA的前体。的前体。2 2 hnRNAhnRNA是是mRNAmRNA的前体。的前体。种类种类胞内定位胞内定位转录产物转录产物对鹅膏蕈碱的敏感性对鹅膏蕈碱的敏感性RNA-pol RNA-pol 核仁核仁45S 45S 1 1耐受耐受、piRNApiRNA4 4、miRNAmiRNA5 5RNA-pol RNA-pol 核质核质、5S 5S 、snRNAsnRNA6 6中度中度RNA-pol RNA-pol 核质核质siRNAsi
12、RNA7 7不详不详RNA-pol mtRNA-pol mt线粒体线粒体线粒体线粒体RNAsRNAs敏感敏感3 37 7 具有重要的基因表达调节作用的非编码具有重要的基因表达调节作用的非编码RNARNA。 鬼笔鹅膏蕈鬼笔鹅膏蕈真核生物的真核生物的RNARNA聚合酶聚合酶、亚基的功能亚基的功能 50 kD中亚基中亚基 1 亚基亚基 小亚基小亚基 (10) /(7) /(11) 亚基亚基(识别起始点识别起始点)128 kD大亚基大亚基 2 和和 亚基亚基(催化催化) n=20-60, n=20-60,与种属有关与种属有关, ,称称羧基末端结构域羧基末端结构域(CTD); (CTD); 含带羟基的含
13、带羟基的Y(Y(酪酪)S()S(丝丝)T()T(苏苏),),可被磷酸化可被磷酸化; ; polpol的磷酸化在从转录起始过渡到延长中起重的磷酸化在从转录起始过渡到延长中起重要作用。要作用。上午5时45分18第二节第二节 原核生物原核生物RNA合成合成过程过程上午5时45分19学习要求:学习要求:熟悉熟悉原核生物原核生物 RNA 聚合酶与模板辨认结合;原聚合酶与模板辨认结合;原核转录起始、延长和两类转录终止过程的特点。核转录起始、延长和两类转录终止过程的特点。了了解解 -35区、区、-10区、上游、下游等概念。区、上游、下游等概念。需需RNARNA聚合酶全酶聚合酶全酶 原核生物原核生物RNARN
14、A聚合酶聚合酶可可直接与模板直接与模板DNADNA结结合合启动转录启动转录。仅需核心酶催化仅需核心酶催化终止终止(termination)(termination): 依赖依赖因子的转录终止因子的转录终止机制机制;非依赖非依赖因子的转录终止机制。因子的转录终止机制。上午5时45分20转录过程可分为三个阶段转录过程可分为三个阶段:图图13-5 原核生物转录的起始原核生物转录的起始 RNA RNA 聚合酶聚合酶()结合到结合到DNADNA的的启动子上而启动转录。启动子上而启动转录。上午5时45分21启动子复合物启动子复合物promoter complex)promoter complex)闭合启动
15、子复合物闭合启动子复合物(closed promoter complex)(closed promoter complex)开放启动子复合物开放启动子复合物(open promoter complex)(open promoter complex)转录起始复合物转录起始复合物(RNA(RNA聚合酶聚合酶-DNA-DNA-pppGpppG- -pNpN-OH)-OH)向下移动到向下移动到-10-10区区TATATATA盒跨盒跨入转录起始点入转录起始点启动子的启动子的-10-10区局部解链区局部解链RNARNA链链5 5端头两个核苷酸产端头两个核苷酸产生生3 3 ,5,5 - -磷酸二酯键磷酸二酯
16、键因子辨认启动子因子辨认启动子-35-35序列序列RNARNA聚合酶结合到启动聚合酶结合到启动子上子上上午5时45分22pppGpN OH + (NTP)n DNA模板RNA聚合酶(核心酶)pppGpN(pN)n + nPPi 因子从转录起始复合物上的脱落因子从转录起始复合物上的脱落,导致导致RNARNA聚聚合酶构象随之发生改变,使核心酶沿着模板链的合酶构象随之发生改变,使核心酶沿着模板链的3 3 55 方向滑行。方向滑行。 核心酶向下游滑动时,双链核心酶向下游滑动时,双链DNADNA边解旋边解链边解旋边解链;同时同时,核心酶按照碱基配对规律,不断使核心酶按照碱基配对规律,不断使NTPsNTP
17、s在在5 5 - -pppGpN-OHpppGpN-OH的的3 3 端羟基上逐个聚合。端羟基上逐个聚合。上午5时45分23 碱基配对的稳定性是碱基配对的稳定性是G GC CA AT TA AU U; RNA/DNA RNA/DNA杂交杂交结构不及结构不及DNADNADNA DNA 双链稳定。双链稳定。上午5时45分24 转录延长与蛋白质合成同时进行。转录延长与蛋白质合成同时进行。 同一同一DNA模板上有多个转录同时在进行;模板上有多个转录同时在进行;多聚核糖体多聚核糖体(polysome) 上午5时45分25图图13-713-7电子显微镜下原核生物的羽毛状转录现象电子显微镜下原核生物的羽毛状转
18、录现象上午5时45分261. 1. 识别结合识别结合富含富含C C的的RNARNA区区功能功能3. 3. ATPaseATPase活性活性2. 2. 解螺旋酶活性解螺旋酶活性 1969 1969年年RobertsRoberts在在T4T4噬菌体感染噬菌体感染E Ecolicoli的研究中的研究中首次首次发现了能控制转录终止的蛋白发现了能控制转录终止的蛋白质,命名为质,命名为Rho()Rho()因子因子。六聚体蛋白六聚体蛋白上午5时45分27因子因子53RNA-pol富含富含C53RNA-pol+ATP因子因子因子识别结合因子识别结合RNARNA富含富含C C区使区使RNA RNA polpol
19、变构停顿;变构停顿;ATPaseATPase活性水解活性水解ATPATP释能使产物释能使产物RNARNA释放。释放。解螺旋酶活性使解螺旋酶活性使RNA/DNARNA/DNA杂交双链解离;杂交双链解离;上午5时45分28 DNA DNA模板转录终止区有模板转录终止区有,以及其后出现的,以及其后出现的;上午5时45分29 转录的转录的RNARNA区段会形成区段会形成的的多个连续的多个连续的U U使转录终止。使转录终止。 位于核心酶覆盖区域内位于核心酶覆盖区域内形成形成的的RNARNA茎茎- -环结构可导致环结构可导致核心酶构象变化,阻止转录向下游推进。核心酶构象变化,阻止转录向下游推进。 RNA
20、RNA茎茎- -环结构之后多个连续环结构之后多个连续U U所形成的所形成的A AU U配对最配对最不稳定,促使不稳定,促使RNA/DNARNA/DNA解解链脱落链脱落。图图13-9 原核生物非依原核生物非依赖赖因子转录终止模式因子转录终止模式上午5时45分30 Transcription is DNA directed RNA synthesis, Transcription is DNA directed RNA synthesis, catalyzed by enzyme RNA polymerase. The DNA double catalyzed by enzyme RNA poly
21、merase. The DNA double helix must on line to expose its template strand, helix must on line to expose its template strand, so RNA polymerase can add the right ribonucleotide so RNA polymerase can add the right ribonucleotide triphosphate monomer to the growing RNA transcript. triphosphate monomer to
22、 the growing RNA transcript. RNA polymerase read the template strand from 3 RNA polymerase read the template strand from 3 prime to 5 prime end, and the RNA transcript grows prime to 5 prime end, and the RNA transcript grows from its own 5 prime to 3 prime end. The DNA double from its own 5 prime to
23、 3 prime end. The DNA double helix extends rewind. When the RNA polymerase helix extends rewind. When the RNA polymerase reaches the end of the template region, the enzyme reaches the end of the template region, the enzyme and new transcript are released.and new transcript are released.上午5时45分31上午5时
24、45分32学习要求:学习要求:熟悉熟悉真核转录因子,转录前起始复合物和真核真核转录因子,转录前起始复合物和真核转录的三个阶段。转录的三个阶段。 一、一、mRNAmRNA的合成的合成 指存指存在在真真核生物基因转录起始点上游核生物基因转录起始点上游,与转录有与转录有关的关的各种各种序列序列;即;即在同一在同一DNA分子上具有可影响或调分子上具有可影响或调控转录的各种控转录的各种片片段段。图图13-10 真核生物真核生物RNA聚合酶聚合酶识别的启动子区序列识别的启动子区序列*Y表示嘌呤脱氧核苷酸表示嘌呤脱氧核苷酸上午5时45分33RNARNA上午5时45分34 转录因子有很多种类,转录因子有很多种
25、类,相相对对应于应于RNARNA聚合酶聚合酶、和和的的TFTF,分别称为,分别称为TFTF、TFTF和和TF TF 。 TFTF又可分为又可分为TF ATF A、TFBTFB 、TFTF等。等。 大多含有锌指、螺旋大多含有锌指、螺旋- -转角转角- -螺旋等模体螺旋等模体;可与可与RNA-RNA-polpol和和DNADNA组成组成RNA-pol-RNA-pol-蛋白质蛋白质-DNA-DNA复合物复合物启动转录。启动转录。 某些某些TFTF或其亚基或其亚基( (TFTF F F小亚基小亚基) )与原核生物与原核生物因子因子在序列上有不同程度的一致性。在序列上有不同程度的一致性。上午5时45分3
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