2017年宁波大学博士专业课考试试题3824生物信息学.pdf

1、宁波大学宁波大学 20172017 年博士研究生招生考试初试试题年博士研究生招生考试初试试题( (A A 卷卷) ) (答案必须写在考点提供的答题纸上) 科目科目代码代码: 3824 科目名称：科目名称： 生物信息学生物信息学 第 1 页 共 2 页 一、一、名词解释（每小题名词解释（每小题 3 分，共分，共 15 分）。分）。 1. 比较基因组学 2. Contig 3. 直系同源 4. 蛋白质组 5. 系统生物学 二、二、选择题（每小题选择题（每小题 2 分，共分，共 26 分）。分）。 1. ortholog 的含义是_。 A. 直系同源 B. 旁系同源 C. 直接进化 D. 间接进化

2、2. UTR 的含义是_。 A. 编码区 B. 非编码区 C. 低复杂度区域 D. 开放阅读框 3. 基本局部比对搜索工具是_。 A. Mega B. ClustalW C. BLAST D. GCG 4. 将核酸序列按照 6 条链翻译成蛋白质序列后搜索蛋白质序列数据库使用的程序是_。 A. blastp B. blastx C. tblastn D. tblastx 5. 常用系统发育分析软件是_。 A. BLAST B. BOWTIE C. PHYLIP D. FASTA 6. 人类基因组大小大约是_Mb。 A. 130 B. 300 C. 3000 D. 30000 7. 根据研究发现，

3、人类基因组中真正编码蛋白质的区域仅占 DNA 序列的_。 A. 1-5% B. 5-10% C. 10-15% D. 15-20% 8. 以下哪一项不属于启动子研究范围？_ A. CpG 岛预测 B. 转录起始点预测 C. 糖基化修饰 D. 甲基化检测 9. INDEL 指_。 A. 点突变 B. 基因组小片段插入 C. 拷贝数变异 D. 序列扩增 10. 常用于差异表达分析的统计方法是_。 A. 2x检验 B. t检验 C. logistic 回归 D. cox 回归 11. 目前应用于基因芯片表达数据统计分析的主要方法是_。 A. 2x检验 B. 相关分析 C. 聚类分析 D.正态性分布检

4、验 12. 从头预测真核基因的原因有_。 A. 外显子/内含子边界难以确定 B. 内含子长度可能只有几个碱基对 C. 编码区域的 GC 含量并不总是与非编码区相同 D. 以上三个方面的原因 宁波大学宁波大学 20172017 年博士研究生招生考试初试试题年博士研究生招生考试初试试题( (A A 卷卷) ) (答案必须写在考点提供的答题纸上) 科目科目代码代码: 3824 科目名称：科目名称： 生物信息学生物信息学 第 2 页 共 2 页 13. 下列 Fasta 格式正确的是_。 A. seq1: agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaacta

5、aacactccctta B. seq1 agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta C. seq1:agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta D. seq1agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta 三、填空题（每空三、填空题（每空 1 分，共分，共 10 分）。分）。 1. 初级序列数据库包含：_、_和 DDBJ。 2. 常用的进化分析算法有_、_和_。 3

6、. 预测蛋白质三级结构的三种方法是_、_和_。 4. 人类基因组计划要完成的 4 张图谱为_、_、遗传图谱和基因图谱。 四、简答题（每小题四、简答题（每小题 8 分，共分，共 24 分）。分）。 1. 序列的相似性与同源性有什么区别与联系？ 2. 基因组注释的内容包括哪些？ 3. ChIP-seq 技术有哪些应用？ 五、综合分析题（五、综合分析题（25 分）。分）。 1. 某研究者为研究基因 A 在大肠癌中的功能，构造了基因 A 过表达的 HCT116 细胞系，以空载体转染的 HCT116 细胞系为对照，分别选择 3 个生物学重复样本，进行 RNA-seq，得到测序数据。 1）如何基于 RNA-seq 数据鉴定新转录本？（8 分） 2）获得基因表达谱后可以作何基础分析？（7 分） 3）怎样结合其他数据库的资源进行调节网络的分析？（10 分）