生物竞赛课件:RNA的生物合成.ppt
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- 生物 竞赛 课件 RNA 合成
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1、1 RNA RNA的生物合成的生物合成 (一)模板和酶(一)模板和酶 (二)以(二)以 DNADNA为模板合成为模板合成 RNA RNA 的过程的过程 (三)以(三)以 RNARNA为模板合成为模板合成 RNA RNA 的过程的过程 (四)(四)RNA RNA 的转录后加工的转录后加工2 (一)模板和酶(一)模板和酶 1. 1.转录模板转录模板 2.RNA 2.RNA 聚合酶聚合酶 3.3.酶与模板的辨认结合酶与模板的辨认结合3 1. 1.转录模板转录模板 基因中双链基因中双链 DNA DNA 中仅有一股链被转录。中仅有一股链被转录。 把被转录的一股链称为把被转录的一股链称为模板链模板链(te
2、mplate strandtemplate strand)或称或称反义链(反义链(anti-anti-sense strandsense strand),另一股链因与合成的另一股链因与合成的 RNA RNA 有相同的编码而称为有相同的编码而称为编码链(编码链(coding coding strandstrand)或称或称有意义链(有意义链(sense strandsense strand) 。 生成的生成的 mRNAmRNA与模板链是互补的,与编与模板链是互补的,与编码链完全相同,只是其中以码链完全相同,只是其中以 U U 代替了代替了 T T。4 DNARNA肽转录翻译G C A G U A
3、 C A U G U C53c g t c a t g t a c a g53G C A G T A C A T G T C53NCAlaValHisVal355 1.RNA 1.RNA 聚合酶聚合酶 (1 1)原核生物的)原核生物的 RNA RNA 聚合酶聚合酶 (2 2)真核生物的)真核生物的 RNA RNA 聚合酶聚合酶6 RNA RNA 聚合酶催化底物合成时形成磷酸二酯键。聚合酶催化底物合成时形成磷酸二酯键。合成的方向是合成的方向是 5 533:即:即 RNA RNA 聚合酶是沿着模聚合酶是沿着模板链的板链的 3 5 3 5 方向移动。方向移动。 RNA RNA 聚合酶需要的条件:聚合
4、酶需要的条件: (1 1)模板)模板 双链双链 DNA DNA 或单链或单链 DNA DNA 均可作模板;均可作模板; (2 2)活化的底物)活化的底物 需要需要 4 4 种三磷酸的核苷酸,种三磷酸的核苷酸,ATPATP、GTPGTP、UTP UTP 及及 CTP CTP 为反应底物;为反应底物; (3 3)二价金属离子)二价金属离子 主要是主要是 MgMg2+ 2+ 和和 MnMn2+ 2+ 。 RNA RNA 聚合酶聚合酶7 PPi由RNA聚合酶催化的链延长反应的机制RH OOHHHOH2C碱基HHOH OOHHHOH2C碱基HHOH OOHHH2C碱基HH-OPOOOR DNA板链模 D
5、NA板链模O-OOOP-POOOOPO-OH OOHHHOH2C碱基HH8 (1 1)原核生物的)原核生物的 RNA RNA 聚合酶聚合酶 大肠杆菌的大肠杆菌的 RNA RNA 聚合酶(聚合酶( 450Ku 450Ku )它)它由由 4 4 种,种,5 5个亚基个亚基组成。组成。 整个酶的亚基组成整个酶的亚基组成是是2 2,称为,称为 全酶全酶 。没有。没有亚基的亚基的 RNA RNA 聚合酶称为聚合酶称为核心核心酶酶。 全酶的作用全酶的作用是识别起始,而是识别起始,而核心酶的作用核心酶的作用是延长转录及辨认转录终止。是延长转录及辨认转录终止。9 各亚基的作用各亚基的作用 亚基亚基 决定哪些基
6、因被转录;决定哪些基因被转录; 亚基亚基 与转录过程有关(催化);与转录过程有关(催化); 亚基亚基 结合结合 DNA DNA 模板(开链);模板(开链); 亚基亚基 辨认起始点,参与解开辨认起始点,参与解开 DNA DNA 双双链,找到模板链链,找到模板链。10 (2 2)真核生物的)真核生物的 RNA RNA 聚合聚合酶酶 在真核生物中则有在真核生物中则有 3 3 种类型的种类型的 RNA RNA 聚合酶。聚合酶。 RNA RNA 聚合酶聚合酶: : 定位核仁,转录定位核仁,转录18S18S、5.8S 5.8S 和和 28S rRNA28S rRNA。 RNA RNA 聚合酶聚合酶: :
7、定位核原生质,转录定位核原生质,转录 mRNA mRNA 前前体体和和 hnRNAhnRNA 。 RNA RNA 聚合酶聚合酶 : : 定位核原生质,转录定位核原生质,转录 tRNAtRNA 和和 5S RNA5S RNA。11 RNA RNA 聚合酶含有聚合酶含有两个核苷酸两个核苷酸结合位点结合位点 起始部位起始部位 结合底物结合底物 ATP ATP 或或 GTP GTP ,所以被转录的模板所以被转录的模板 DNA DNA 第一个碱基通常第一个碱基通常是是TTPTTP(胸腺嘧啶)。转录与复制不同,(胸腺嘧啶)。转录与复制不同,不需要引物不需要引物,因而,因而合成的合成的 RNA RNA 第一
8、个核第一个核苷酸常常是苷酸常常是 5pppA 5pppA 或或 5pppG5pppG。 延伸部位延伸部位 结合下一个核苷酸底物。结合下一个核苷酸底物。12 酶与模板的辨认结合酶与模板的辨认结合 转录是转录是不连续、分区段不连续、分区段进行的。进行的。每一转每一转录区段可视为录区段可视为一个一个转录单位转录单位,包括若干个包括若干个结构基因结构基因及其上游(及其上游(upstreamupstream)的)的调控序调控序列。列。 RNA RNA 聚合酶结合到特异聚合酶结合到特异 DNA DNA 序列上序列上(调控序列中,称为(调控序列中,称为启动子,启动子,promoterpromoter)。)。
9、 13 转录起始时,转录起始时, RNA RNA 聚合酶结合在被转录聚合酶结合在被转录的的 DNA DNA 区段上,结合的特定部位称为区段上,结合的特定部位称为启动子(启动子(promoterpromoter)。它是它是 20 20 至至 200 200 个碱基的特定顺序。个碱基的特定顺序。 通常将通常将 DNADNA上被转录的第一个碱基以十上被转录的第一个碱基以十1 1 代代表;第二个为表;第二个为 十十2 2 。十。十1 1 之前的碱基为之前的碱基为 1 1 ,第,第二个为二个为-2-2,。启动子的位置启动子的位置在被转录碱基之前所在被转录碱基之前所以顺序号均为负。以顺序号均为负。习惯上也
10、将习惯上也将 + +1 1 以下的转录方向以下的转录方向称称“下游下游”,-1 -1 以上称以上称“上游上游”,启动子在,启动子在转录转录单位单位的上游区。的上游区。 启启 动动 子子14 原核生物的启动子原核生物的启动子 存在两个共同的顺序:存在两个共同的顺序: -10 -10 顺序顺序 也称为也称为 PribnowPribnow 顺序顺序(pribnowpribnow box box), ,基本顺序:基本顺序:TATAATGTATAATG。被看被看作作是双螺旋打开是双螺旋打开, ,形成启动复合物的区域形成启动复合物的区域。 -35 -35 顺序顺序 被认为被认为是是酶结合的起始部位酶结合的
11、起始部位。15 RNA poRNA po与与 35 35 区辨认结合后,酶向下区辨认结合后,酶向下游移动,到达游移动,到达 10 10 区,酶已跨入了区,酶已跨入了转录起始转录起始点点,形成相对稳定的,形成相对稳定的酶酶DNADNA复合物复合物,就可以,就可以开始转录。开始转录。DNARNA 产物PPP5531+区-10区35-转录起始点基因转录区启动子无义链 编码链( )5有义链 模板链( )3TATAATTTGACA 反义链(模板链)35 有意义链(编码链)53A原核生物启动子模式图原核生物启动子模式图16 存在两个共同的顺序:存在两个共同的顺序: -25 -25 区区 有有 TATA T
12、ATA 盒盒,又称为,又称为 HognessHogness盒盒,基本上都由基本上都由A A、T T 碱基所组成,其碱基所组成,其功能功能与聚合酶与聚合酶的定位有关的定位有关,DNA DNA 双链在此解开,并双链在此解开,并决定转录的决定转录的起始位点起始位点。 - 7 5- 7 5 区区 有有 C A A TC A A T 盒盒 , 其 一 致 的 序 列 为, 其 一 致 的 序 列 为GGTCAATCTGGTCAATCT,CAAT CAAT 盒盒与转录的起始频率有关与转录的起始频率有关。 除启动子外,真核生物基因组中还有一个称除启动子外,真核生物基因组中还有一个称为为增强子增强子(enha
13、ncerenhancer)的序列,它能极大地促进的序列,它能极大地促进启动子的转录活性启动子的转录活性。 真核生物的启动子真核生物的启动子17 DNA转录起始点启动子基因转录区53区11040-区-25真核生物启动子模式图Hogness 能在能在很远距离很远距离(大于几(大于几kb)对启动子产生影响;)对启动子产生影响; 无论位于启动子无论位于启动子上游或下游都能发挥作用上游或下游都能发挥作用。 增强子作用的主要特点增强子作用的主要特点18(二)以(二)以DNADNA为模板合成为模板合成RNARNA的过程的过程 1. 1.原核生物的转录原核生物的转录 2.2.真核生物的转录真核生物的转录 19
14、 (1 1)转录起始)转录起始 当当 RNA RNA 聚合酶聚合酶的的亚基亚基找到其找到其识别位点识别位点时,时,全酶就与启动子的全酶就与启动子的-35 -35 区序列结合形成一个区序列结合形成一个封闭封闭的启动子复合物的启动子复合物。在这一区段,酶与模板的结合。在这一区段,酶与模板的结合很松弛,酶随即移向很松弛,酶随即移向-10 -10 区,并跨入了区,并跨入了转录起始转录起始点点,形成,形成开放的启动子复合物开放的启动子复合物。底物底物 ATP ATP 或或 GTP GTP 与与RNA RNA 聚合酶聚合酶起始部位起始部位结合结合,延伸部位延伸部位结合结合下一个核苷酸。下一个核苷酸。生成第
15、一个磷酸酯键之后,生成第一个磷酸酯键之后,因因子从全酶解离下来,核心酶在子从全酶解离下来,核心酶在 DNA DNA 链上向下游链上向下游滑动,进入滑动,进入延长阶段延长阶段。 1. 原核生物的转录原核生物的转录20 (2 2)转录延长)转录延长 转录延长的化学反应,在原核生物和真转录延长的化学反应,在原核生物和真核生物之间没有太多的区别,只是核生物之间没有太多的区别,只是催化的催化的 RNA RNA 聚合酶不同聚合酶不同。转录的延长在转录的延长在“转录泡转录泡”上进行,上进行,转录泡转录泡 (transcription transcription bubblebubble)是一个)是一个含有核
16、心酶、含有核心酶、DNA DNA 和新生和新生 RNA RNA 的区域的区域,在这个区域里含有一段解链,在这个区域里含有一段解链的的 DNA DNA “泡泡”。在转录泡里,杂交链中。在转录泡里,杂交链中生成的生成的 RNA 3-OH RNA 3-OH 不断结合新进来的核不断结合新进来的核糖核苷三磷酸,使链不断延长。糖核苷三磷酸,使链不断延长。21转录示意图转录示意图(1)(1)22恢复螺旋恢复螺旋解螺旋解螺旋转录示意图转录示意图(2)(2)编码链编码链模板链模板链23 转录时,转录时,DNA DNA 双链中约有双链中约有 17 17 个个 bpbp 被解被解开开。原核生物原核生物延长速率大约是
17、延长速率大约是每秒钟每秒钟 50 50 个核个核苷酸,转录泡移动苷酸,转录泡移动 170nm 170nm 的距离的距离。在。在“泡泡”里里新合成的新合成的 RNA RNA 与模板与模板 DNA DNA 链形成一链形成一杂交的双杂交的双螺旋螺旋,此段双螺旋长约,此段双螺旋长约 12 bp12 bp。 在在 RNA RNA 聚合酶沿着聚合酶沿着 DNA DNA 模板移动的整个过模板移动的整个过程中形成的程中形成的 RNA-DNA RNA-DNA 杂交链杂交链的长度及的长度及 DNA DNA 未未解开的区域长度均保持不变解开的区域长度均保持不变。这表明。这表明:在在 RNA RNA 聚合酶后面的聚合
18、酶后面的 DNA DNA 重新形成螺旋的速率和前面重新形成螺旋的速率和前面螺旋被酶解开的速率是一样的。螺旋被酶解开的速率是一样的。24 RNA RNA 聚合酶聚合酶没有没有核酸外切酶活性核酸外切酶活性,不能对进,不能对进入入RNA RNA 链的核苷酸进行校正,所以链的核苷酸进行校正,所以转录的错误转录的错误频率是每频率是每 10104 4 或或 10105 5 中有中有 1 1 个错误,是个错误,是 DNA DNA 复制中错误的复制中错误的 10105 5 倍。倍。这种准确性虽较这种准确性虽较 DNA DNA 复制低,但由于复制低,但由于 RNA RNA 转录产物很多,极少数有转录产物很多,极
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