生物化学第36章兰州大学经典课件RNA的生物合成和加工.ppt
- 【下载声明】
1. 本站全部试题类文档,若标题没写含答案,则无答案;标题注明含答案的文档,主观题也可能无答案。请谨慎下单,一旦售出,不予退换。
2. 本站全部PPT文档均不含视频和音频,PPT中出现的音频或视频标识(或文字)仅表示流程,实际无音频或视频文件。请谨慎下单,一旦售出,不予退换。
3. 本页资料《生物化学第36章兰州大学经典课件RNA的生物合成和加工.ppt》由用户(三亚风情)主动上传,其收益全归该用户。163文库仅提供信息存储空间,仅对该用户上传内容的表现方式做保护处理,对上传内容本身不做任何修改或编辑。 若此文所含内容侵犯了您的版权或隐私,请立即通知163文库(点击联系客服),我们立即给予删除!
4. 请根据预览情况,自愿下载本文。本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
5. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007及以上版本和PDF阅读器,压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 生物化学 36 兰州大学 经典 课件 RNA 生物 合成 加工
- 资源描述:
-
1、第36章 RNA的生物合成和加工(Biosynthesis and processing of RNA )一、一、DNA指导下指导下RNA的合成的合成二、二、RNA的转录后加工的转录后加工三、在三、在RNA指导下指导下RNA和和DNA的合成的合成遗传信息的流向转录和转录后的加工 贮存于贮存于DNA中的遗传信息须通过转录和翻译而中的遗传信息须通过转录和翻译而得到表达。在转录过程中,以得到表达。在转录过程中,以DNA的一条链作模板,的一条链作模板,在在RNA聚合酶的催化下,利用聚合酶的催化下,利用4种种NTP为原料,合为原料,合成与成与模板链模板链互补的互补的RNA分子。与分子。与DNA模板链互补
2、模板链互补的另一条的另一条DNA单链为单链为意义链意义链。 细胞内的各种细胞内的各种RNA都是通过转录产生的(某些都是通过转录产生的(某些RNA病毒除外,它们有病毒除外,它们有RNA的复制),转录出的的复制),转录出的RNA通常需要经过各种加工才能成为成熟的、有功通常需要经过各种加工才能成为成熟的、有功能的能的RNA产物。产物。DNA意义链、模板链和RNA、蛋白质的关系非模板链非模板链模板链模板链非模板链也叫意非模板链也叫意义链或编码链义链或编码链一、DNA指导下RNA的合成 在在DNA指导下合成指导下合成RNA称为转录。在称为转录。在DNA长长链上有许多基因,也有许多转录起始点和转录终止链上
3、有许多基因,也有许多转录起始点和转录终止点,形成相应的转录单位。一个转录单位可以只含点,形成相应的转录单位。一个转录单位可以只含一个基因,称为单顺反子(一个基因,称为单顺反子(monocistron);也可以);也可以含多个基因,称为多顺反子(含多个基因,称为多顺反子(multicistron)。)。 在每一个转录起始点附近都有特殊的序列,只在每一个转录起始点附近都有特殊的序列,只有具有这种特殊序列才能在此处起始转录,这种特有具有这种特殊序列才能在此处起始转录,这种特殊的序列叫启动子(殊的序列叫启动子(promoter)。)。转录单位转录单位转录受到严格的调控 基因的转录是一种有选择的过程,随
4、着不同基因的转录是一种有选择的过程,随着不同的细胞类型、生长发育的不同阶段、外界环境条的细胞类型、生长发育的不同阶段、外界环境条件的变化而转录不同的基因。转录是基因表达调件的变化而转录不同的基因。转录是基因表达调控中最重要的层次。控中最重要的层次。核酸合成酶类DNA指导的指导的DNA聚合酶:聚合酶:DNA聚合酶聚合酶 (DNA-dirceted DNA polymerase,DDDP)DNA指导的指导的RNA聚合酶:聚合酶:RNA聚合酶聚合酶 (DNA-directed RNA polymerase,DDRP)RNA指导的指导的RNA聚合酶:聚合酶:复制酶复制酶 (RNA-directed R
5、NA polymerase,RDRP)RNA指导的指导的DNA聚合酶:聚合酶:反转录酶(逆转录酶)反转录酶(逆转录酶) (RNA-directed DNA polymerase,RDDP)(一)DNA指导的RNA聚合酶 DNA指导的指导的RNA聚合酶简称聚合酶简称RNA聚合酶,聚合酶,它以它以4种种NTP为底物,需要为底物,需要DNA模板,模板,RNA链的链的合成方向也是合成方向也是53,5端的第一个核苷酸的端的第一个核苷酸的5位带有位带有3个磷酸,其后每加入一个核苷酸脱去一个磷酸,其后每加入一个核苷酸脱去一个焦磷酸,形成磷酸二酯键。个焦磷酸,形成磷酸二酯键。RNA链合成的起始链合成的起始不需
6、要引物。不需要引物。RNA聚合酶没有校对功能。聚合酶没有校对功能。大肠杆菌RNA聚合酶 细菌的细菌的mRNA、rRNA和和tRNA都由同一种都由同一种RNA聚合酶转录。聚合酶转录。RNA聚合酶的转录速度在聚合酶的转录速度在37约为约为50个核苷酸个核苷酸/s,与多肽链的合成速度,与多肽链的合成速度(15个氨基酸个氨基酸/s)大致相当。)大致相当。 大肠杆菌大肠杆菌RNA聚合酶由聚合酶由5种种6个亚基组成,个亚基组成,2 2,其中其中2 2是是核心酶核心酶。 大肠杆菌大肠杆菌RNA聚合酶各亚基的性质和功能聚合酶各亚基的性质和功能亚基亚基基因基因分子量分子量亚基亚基数目数目功功 能能rpoA40,
7、0002酶的装配酶的装配与启动子上游元件及活化因子结合与启动子上游元件及活化因子结合rpoB155,0001结合核苷酸底物结合核苷酸底物催化磷酸二酯键形成催化磷酸二酯键形成rpoC160,0001与模板与模板DNA结合结合rpoD32,00092,0001识别启动子识别启动子促进转录的起始促进转录的起始9,0001未知未知因子的功能 因子的功能在于因子的功能在于引导引导RNA聚合酶稳定地聚合酶稳定地结合到结合到DNA启动子上,启动子上,因子有多种,不同类型因子有多种,不同类型的启动子由不同的的启动子由不同的因子识别。因子识别。因子的存在对因子的存在对核心酶的构象有较大影响,它导致核心酶的构象有
8、较大影响,它导致RNA聚合酶聚合酶对对DNA的一般序列及启动子序列的亲和力有很的一般序列及启动子序列的亲和力有很大不同,极大地降低了酶与大不同,极大地降低了酶与DNA一般序列的结一般序列的结合常数和停留时间,同时又大大增加了酶与启动合常数和停留时间,同时又大大增加了酶与启动子的结合常数和停留时间。子的结合常数和停留时间。RNA聚合酶与启动子的结合 全酶可通过扩散与全酶可通过扩散与DNA任意部位结合,这种任意部位结合,这种结合是疏松的,随后酶结合的结合是疏松的,随后酶结合的DNA部位迅速被置部位迅速被置换,也可以说是酶在换,也可以说是酶在DNA上不断地变换结合位点,上不断地变换结合位点,直到遇上
9、启动子序列,随即由疏松结合变成牢固结直到遇上启动子序列,随即由疏松结合变成牢固结合。此处合。此处DNA双链被局部解开,转录开始。双链被局部解开,转录开始。转录转录开始后开始后因子脱落,转录进入延伸阶段。因子脱落,转录进入延伸阶段。 大肠杆菌RNA聚合酶与DNA的相互作用因子与核心酶因子与核心酶全酶全酶全酶与全酶与DNA复合复合物物核心酶钳住核心酶钳住DNA因子脱落因子脱落大肠杆菌的RNA转录17bp起始起始双链双链DNA局部解开局部解开磷酸二酯磷酸二酯键形成键形成终止阶段终止阶段解链区到达解链区到达基因终点基因终点延长阶段延长阶段5 3 RNA 启动子(启动子(promoter) 终止子终止子
10、(terminator)5 RNA聚合酶聚合酶 5 3 5 3 5 5 3 离开离开真核生物RNA聚合酶 真核真核生物生物RNA聚合酶主要有聚合酶主要有3类,通常有类,通常有814个亚基,并含有个亚基,并含有Zn2+。它们分别负责合成不同类型。它们分别负责合成不同类型的的RNA, ,利用它们对抑制剂利用它们对抑制剂- -鹅膏蕈碱的敏感性的鹅膏蕈碱的敏感性的差异可以辨别它们。差异可以辨别它们。 真核生物真核生物RNA聚合酶自身不能识别和结合到启聚合酶自身不能识别和结合到启动子上,它也没有动子上,它也没有因子,而是需要在启动子上由因子,而是需要在启动子上由多种转录因子(各种参与转录的蛋白质)和多种
11、转录因子(各种参与转录的蛋白质)和RNA聚聚合合酶组装成活性转录复合物才能起始转录。酶组装成活性转录复合物才能起始转录。真核生物RNA聚合酶的种类和性质酶的种类酶的种类功功 能能对抑制剂的敏感性对抑制剂的敏感性RNA聚合酶聚合酶转录转录45S rRNA前体,经加工前体,经加工产生产生5.8S、18S和和28S rRNA对对鹅膏蕈碱鹅膏蕈碱不敏感不敏感RNA聚合酶聚合酶转录所有编码蛋白质的基因和转录所有编码蛋白质的基因和大多数大多数snRNA对对鹅膏蕈碱鹅膏蕈碱敏感敏感RNA聚合酶聚合酶转录小转录小RNA的基因,包括的基因,包括tRNA、5S rRNA、U6 snRNA和和scRNA对对鹅膏蕈碱
12、鹅膏蕈碱中等敏感中等敏感真核生物细胞器RNA聚合酶 真核细胞的线粒体和叶绿体中也有自己的真核细胞的线粒体和叶绿体中也有自己的RNA聚合酶,它们分别转录线粒体和叶绿体中的基因。聚合酶,它们分别转录线粒体和叶绿体中的基因。线粒体和叶绿体线粒体和叶绿体RNA聚合酶不同于细胞核聚合酶不同于细胞核RNA聚合聚合酶,它们的结构较简单,类似于原核生物的酶,它们的结构较简单,类似于原核生物的RNA聚聚合酶,能催化线粒体中和叶绿体中各种合酶,能催化线粒体中和叶绿体中各种RNA的转录,的转录,并被原核生物并被原核生物RNA聚合酶的抑制剂利福平等抑制。聚合酶的抑制剂利福平等抑制。(二)启动子和转录因子 启动子是一个
13、转录单位的控制起始转录的序启动子是一个转录单位的控制起始转录的序列。列。 转录因子是与启动子或其上游的调控序列结转录因子是与启动子或其上游的调控序列结合,并能调节转录的蛋白质因子。合,并能调节转录的蛋白质因子。RNA聚合酶与DNA的结合 习惯习惯上上DNA的序列按其意义链来描述。从左到的序列按其意义链来描述。从左到右右相当于相当于53方向。转录单位的起点核苷酸编号为方向。转录单位的起点核苷酸编号为+1,往右依次为,往右依次为+2,+3, 从从+1往往5上游编号依次上游编号依次为为-1,-2, 当当RNA聚合酶全酶最初与聚合酶全酶最初与DNA结合时,它覆盖结合时,它覆盖的长度的长度为为7580b
14、p,从启动子的,从启动子的- 55 +20。在转录。在转录起始阶段结束时,起始阶段结束时,因子被释放,核心酶覆盖的长度因子被释放,核心酶覆盖的长度约为约为60bp。到核心酶再向前移动若干核苷酸后,核。到核心酶再向前移动若干核苷酸后,核心酶进入延伸阶段,只覆盖心酶进入延伸阶段,只覆盖3040bp。大肠杆菌RNA聚合酶在转录的起始阶段缩短覆盖DNA的长度原核生物启动子 在原核基因启动子中,有一个位于在原核基因启动子中,有一个位于-10的的pribnow box(TATAAT)和位于)和位于-35的的sextama box (TTGACA)。这两个序列是决定启动子强)。这两个序列是决定启动子强度的重
15、要因素。度的重要因素。Pribnow box是是RNA聚合酶的牢固聚合酶的牢固结合位点及解链位点,结合位点及解链位点,sextama box是是RNA聚合酶聚合酶的识别位点。在的识别位点。在-10区和区和-35区之间的序列并不重要,区之间的序列并不重要,然而这两个区之间的距离却十分重要。天然启动然而这两个区之间的距离却十分重要。天然启动子中这段距离大多为子中这段距离大多为1520bp,实验表明这段距离,实验表明这段距离为为17bp时转录效率最高。时转录效率最高。 大肠杆菌启动子共有序列的功能sextama box pribnow box真核生物启动子 真核生物启动子真核生物启动子有有3类,分别
16、由类,分别由RNA聚合聚合酶酶、起始转录,起始转录需要许多转录因起始转录,起始转录需要许多转录因子的参与,启动子的识别也是靠转录因子的作用。子的参与,启动子的识别也是靠转录因子的作用。 类别类别启动子控制的基因有许多拷贝,往往启动子控制的基因有许多拷贝,往往成簇存在。成簇存在。RNA聚合酶聚合酶转录转录45S rRNA前体,经加工前体,经加工产生产生5.8S、18S和和28S rRNA类别启动子的结构 类别类别启动子由两部分保守序列组成:启动子由两部分保守序列组成:1.1.核心启动子核心启动子(core promoter)位于转录起点附近,)位于转录起点附近,从从- -45 + +20;2.上
17、游控制元件上游控制元件(upstream control element)位于)位于- -180 - -107。 两部分都有富含两部分都有富含GC的区域。的区域。RNA聚合酶聚合酶对对其转录需要两种转录因子的参与。其转录需要两种转录因子的参与。真核生物类别启动子的转录因子 UBF1和和SL1是参与类别是参与类别启动子转录的两种转录因启动子转录的两种转录因子,其中子,其中UBF1为单链蛋白,为单链蛋白,SL1为四聚体蛋白。为四聚体蛋白。真核生物的类别启动子类别类别启动子包含启动子包含4 4类控制元件:类控制元件: 基本启动子(基本启动子(basal promoter) 起始子(起始子(initi
18、ator) 上游元件(上游元件(upstream element) 应答元件(应答元件(response element)RNA聚合酶聚合酶转录所有编码蛋白质的基因和转录所有编码蛋白质的基因和大多数大多数snRNA几种真核基因的基本启动子 类别类别启动子中的基本启动子序列为中心在启动子中的基本启动子序列为中心在- -25 - -30左右的左右的7bp保守区,根据基本启动子中保守序保守区,根据基本启动子中保守序列的特点,也将其称为列的特点,也将其称为TATA BOX。RNA聚合酶和转录因子在启动子上的装配TF: transcription factor转录起始复合物的装配CTD: C-termi
展开阅读全文