重组DNA技术2之表达系统PPT课件.ppt
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1、 体外表达:无细胞表达系统体外表达:无细胞表达系统 原核表达系统:大肠杆菌表达系统等原核表达系统:大肠杆菌表达系统等 体内表达:体内表达: 酵母表达系统酵母表达系统 真核表达系统真核表达系统 昆虫细胞表达系统昆虫细胞表达系统 哺乳动物细胞表达系统哺乳动物细胞表达系统 动物动物/植物表达系统(转基因动物植物表达系统(转基因动物/植物)植物) v体外翻译系统又称无细胞蛋白质合成系统,是体外翻译系统又称无细胞蛋白质合成系统,是一种相对胞内表达系统而言的开放型表达系统。一种相对胞内表达系统而言的开放型表达系统。 l优点:内源型优点:内源型mRNA干扰很小,操作程序简单,获干扰很小,操作程序简单,获得重
2、组蛋白周期很短。主要用于蛋白质快速分析鉴得重组蛋白周期很短。主要用于蛋白质快速分析鉴定;基因转录和翻译调控机理研究;分子间的相互定;基因转录和翻译调控机理研究;分子间的相互作用的研究。作用的研究。l缺点:缺点: 昂贵;昂贵; 操作要求高;操作要求高; 表达量不够高。表达量不够高。 v特点:产量高、生长速度快、操作容易、成本低。 v缺点:l翻译后加工修饰体系不完善:无糖基化、酰基化等l一般表达获得的蛋白常常以变性状态存在,不具有生物学活性。 v目前较常用的表达载体是具有可诱导的T7启动子的表达载体,大部分蛋白均可获得表达而且表达量较高,表达量可占细菌总蛋白的25以上。lT7RNA聚合酶来源于T7
3、噬菌体,期活性高于大肠杆菌RNA聚合酶很多倍,而且较少发生转录中止l它只识别自己的启动序列,不能启动大肠杆菌DNA的转录,对抑制大肠杆菌RNA聚合酶的抗生素如利福平有抗性,因而可在利福平存在的条件下,使目的基因得到大量扩增l正常大肠杆菌并不表达T7RNA聚合酶,为了能利用T7启动子表达外源基因,将T7RNA聚合酶基因置于lacUV5启动子控制下,整合到大肠杆菌染色体,构建了能被IPTG诱导表达T7RNA聚合酶的大肠杆菌菌株l常用宿主细胞有BL21(DE3)、JM109(DE3)等v还有受温度变化诱导的具有噬菌体PL启动子调控 的载体等。 常见的大肠杆菌商业化表达系统有:1、pET system
4、 and pETBlue system(Novagen公司),是原核蛋白表达中应用最多的系统。具有可溶性蛋白生产、二硫键形成、蛋白外运和多肽生产等专用载体和宿主菌。目前共有包括40多种载体、15种不同宿主菌和配套齐全的用于有效检测和纯化目标蛋白的相关产品。 l基本结构由T7启动子、核糖体结合位点、信号肽序列、多克隆位点、T7转录终止信号、氨苄青霉素抗性基因核质粒复制位点等l有可以表达N端融合、C端融合和非融合蛋白的不同质粒。也可以表达非分泌性蛋白2、pBAD表达系统(Invitrogen公司),可控制蛋白质的生产水平低于其成为不溶性蛋白的域值。通过与硫氧还蛋白的融合来增加溶解度 3、QIAex
5、press Expression System(Qiagen公司 )。按表达蛋白的部位分: 分泌表达; 外周质及膜上表达 ; 胞内表达。外源基因在原核细胞中的表达形式 在原核细胞中表达外源基因时,可产生融合型、非融合型。 原则上应能够使外源基因表达效率高,蛋白质产量高,不易被细菌分解,而且产物易被提取、纯化。 外源基因在大肠杆菌中表达的一种简便方法是使其表达为融合蛋白,也就是说要表达的外源基因连接在一段原核基因的下游,蛋白质的N末端由原核DNA序列或其他DNA序列编码,C端由外源DNA的完整序列编码,这样的蛋白质由1条短的原核多肽或具有其他功能的多肽和外源蛋白质结合在一起,故称为融合蛋白。转录
6、和翻译起始从正常的大肠杆菌序列开始,故通常可以产生高水平的融合蛋白;融合蛋白往往比天然的外源蛋白更加稳定;产生的融合蛋白较大,容易从蛋白质凝胶电泳中区别出夹,而且融合蛋白带可以从凝胶上切下,经冷冻于燥,磨成粉末后即可作为抗原;有些融合蛋白带有信号肽,可以分泌到细胞外。这有助于蛋白质的分离和纯化。 6His Tag融合 半乳糖苷酶融合 trpE融合蛋白 谷胱甘肽S转移酶(GST)融合 硫氧还蛋白(Trx)融合 麦芽糖结合蛋白(MBP)融合 碱性磷酸酶(phoA)启动子和信号序列 帮助可溶化帮助可溶化帮助分泌到周质帮助分泌到周质可用亲和层析纯化可用亲和层析纯化 融合表达的蛋白,在分离纯化过程中往往
7、需要去除表达时额外引入的融合片段。因此需要用不同方法将其裂解,通常有:1、化学裂解法:特异识别特定的氨基酸残基或一组氨基酸残基。但化学裂解法裂解位点的特异性低,有时可能对目标蛋白产生不必要修饰如:甲酸、溴化氰等 2、酶解法:反应条件温和,具有高度的特异性。常用的酶有Xa因子、凝血酶、肠激酶、凝乳酶、胶原酶等。但酶解法成本高 ,反应时间长,更重要的是蛋白酶本身不可避免地混入目标蛋白中,造成新的污染,提高纯化的复杂性。 3、IMPACT系统(intein mediated purification with an affinity chitin-binding Tag) 该系统是由枯草杆菌来源的几
8、丁质结合域(5kD,chitin binding domain,用于亲和纯化)和酵母蛋白质剪接元件 intein组成一个双效的融合标签。 intein在较低的温度和还原条件下发生自身介导的N端裂解,释放出与之相连的目的蛋白。因此融合蛋白无需蛋白酶裂解即可实现目的蛋白与fusion tag的精确切割。但含有较多二硫键的蛋白不适合这一系统。 为减少所需蛋白质在宿主体内被蛋白酶降解。或者使蛋白质能够在体外正确折叠和便于提纯,经常需要将被表达的蛋白质分泌到细胞外,因此要用分泌型载体。一些在胞内被蛋白酶降解的蛋白质在细胞周质中很稳定;一些在胞内无活性的蛋白质在分泌后便具有活性,分泌可能使蛋白质能够正确折
9、叠;产生的蛋白质没有氨基末端甲硫氨酸,因为切割位点在信号肽与编码序列之间,甲硫氨酸会影响许多蛋白质的活性。v蛋白质能够在大肠杆菌中进行分泌,至少要具备3个要素:有一段信号肽;在成熟蛋白质内有适当的与分泌相关的氨基酸序列;细胞内有相应的转运机制。v信号肽长度一般为1530个氨基酸残基v真核生物和原核生物的信号肽在结构上都有以下特征:信号肽一般都不长,在氨基末端有一段带正电荷的氨基酸序列,往往是精氨酸或赖氨酸残基,其数目为13个;有一个高度疏水的核心区,含亮氨酸或异亮氨酸残基,位置可以从带正电荷的氨基酸延伸到含切割位点的区域;含有能被信号肽酶水解的切割位点,这个位点常常在丙氨酸之后,有的是在甘氨酸
10、或丝氨酸之后 分泌型载体也有缺点,例如目的蛋白质的产量往往很低,以及信号肽不能被切除或切在错误位置上等。 指在细菌内表达的蛋白质以真核蛋白质mRNA的AUG为起始,在其氨基端不含任何细菌多肽序列。 优点:表达产物的生物学功能接近于生物体内天然蛋白质。 缺点:容易被细菌蛋白酶破坏。v表达的蛋白质经常是不溶的,会在细菌内与细菌杂蛋白、核酸等成分形成不溶性聚合体即包含体(inclusion body),尤其当表达目的蛋白量超过细菌体总蛋白量10%时,就很容易形成包涵体v生成包涵体的原因可能有是蛋白质合成速度太快,多肽链相互缠绕,影响了多肽链的正确折叠,导致疏水基团外露等。 包含体的形成有利于防止蛋白
11、酶对表达蛋白的降解,并且非常有利于分离表达产物。但包含体形成后,表达蛋白不具有生物活性,因此必须溶解包含体并对表达蛋白进行复性。v包含体的制备可通过常规方法如超声波、匀浆等使菌体破碎后,离心就可得到。密度梯度离心后则可得到高纯度的包含体l包含体通常不溶于水,加入强蛋白质变性剂后方可溶解l根据包含体中蛋白质种类的不同,通常用68molL盐酸胍或910molL尿素溶解包含体。采用pH 2045的酸性溶液也可使包含体溶解。v形成包含体的表达蛋白恢复其活性的过程称为包含体蛋白质复性l其基本原理是随着变性剂浓度的降低,表达蛋白恢复其天然构型l常用的复性方法有逐步稀释法或透析法等。vSpizizen于19
12、58年发现枯草杆菌168菌株为可转化菌株以来,枯草杆菌的遗传学工作不断深入和发展 v枯草杆菌的研究之所以领先于其他芽孢杆菌的种,主要是由于他的转化、转导方法较完善,以及大量的衍生菌株lA.芽孢杆菌的分类除枯草杆菌外,已报导用作宿主表达克隆基因的有:嗜碱芽孢杆菌、淀粉芽孢杆菌、短芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、球形芽孢杆菌、嗜热脂肪芽孢杆菌、苏云金芽孢杆菌和耐碱的芽孢杆菌以及病原菌炭疽芽孢杆菌等12种l B.枯草芽孢杆菌168的基因组序列测定已完成 v芽孢杆菌表达系统的优点-相对于大肠杆菌1、非致病性:除个别种(炭疽芽孢杆菌和腊样芽孢杆菌)外对人畜无害2、转化外源DNA的感受
13、态系统也同样适用于转化重组DNA3、质粒和噬菌体都可以作为克隆的载体 4、细胞壁的组成简单,只含有肽聚糖和磷璧质,因此在分泌的蛋白质产品中不会混杂有胞被内毒素(热源性脂多糖),而这一点是大肠杆菌无法比拟的 5、能够大量分泌某些胞外蛋白,蛋白跨越细胞膜后,被加工和直接释放到培养基中而不发生聚集,回收和纯化蛋白较为简单。例如:淀粉酶、蛋白酶及杀虫晶体蛋白等l与革兰氏阴性(大肠杆菌)相比,阳性菌(芽孢杆菌)简单的细胞壁结构赋予了它高效地向胞外分泌目的蛋白的能力,这样从而使得目的蛋白的纯化相对比较简单l芽孢杆菌拥有一套高效的分泌信号肽及分子伴侣系统。可完成目的蛋白的高效分泌表达,从而避免包涵体形成 6
14、、良好的发酵基础和生产技术,在相对简单的培养基中能生长到很高的密度v芽孢杆菌的缺点如下: 1、能够产生大量的胞外蛋白酶,往往造成表达产物的大量降解。 2、能自发形成感受的的菌株极少,感受态持续时间短暂,分子克隆效率低 3、存在限制和修饰系统,重组质粒不稳定。 v芽孢杆菌常用的宿主l已报导用作宿主表达克隆基因的有Brevibacillus brevis(短短芽孢杆菌)、嗜碱芽孢杆菌、淀粉芽孢杆菌、短芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、球形芽孢杆菌、嗜热脂肪芽孢杆菌、苏云金芽孢杆菌和耐碱的芽孢杆菌以及病原菌炭疽芽孢杆菌等l短短芽孢杆菌作为表达菌株的几个优点:1、几乎不向胞外分泌蛋白
15、酶(枯草芽孢杆菌至少分泌8种不同的蛋白酶),利于目的蛋白的稳定性2、细胞壁相对于枯草杆菌来讲更薄,有利于外源蛋白的分泌3、据研究其发酵液中存在着可以促进蛋白中二硫键形成的因子,可以促进外源蛋白的折叠v载体:l目前,芽孢杆菌中常用的载体主要有自主复制质粒、整合质粒和噬菌体三种从芽孢杆菌中分离的自主复制质粒,除极少数以外(例如pBC16),均为无抗性标志的隐秘质粒带有抗性标志的自主复制质粒主要来自其它G+细菌,特别是来自金黄色葡萄球菌的质粒。其中广泛使用的有pUB110、pC194和pE194等。迄今已在上述质粒的基础上构建了双标记质粒、芽孢杆菌/大肠杆菌穿梭质粒、表达质粒、整合质粒和探针质粒等v
16、绝大多数的载体在阳性菌中的拷贝数都非常低。采用整合质粒将克隆基因整合到宿主染色体,是克服芽孢杆菌质粒不稳定性的一个有效的途径v整合的目的一般通过同源重组或者转座子插入来实现。这种质粒的基本结构是在大肠杆菌质粒的基础上增加一个芽孢杆菌的抗性标志,以及待整合的目的基因。l它在大肠杆菌中进行基因克隆或亚克隆操作。整合质粒导入芽孢杆菌后,由于它没有芽孢杆菌质粒的复制起点而不能自主复制,只有插入到宿主体后,随着细胞复制而复制。在含有整合质粒中芽孢杆菌抗性标志的抗生素的培养基上,就可以很容易挑出这种整合体v整合质粒另一个重要的用途是用于目的基因的敲除。不少噬菌体都可用作载体,如105噬菌体,SP噬菌体及其
17、它噬菌体。其中 105噬菌体应用较多,它是一个温和噬菌体,基因组约为39.2Kb,从中发展了不少载体。目的基因一般在体外“包装”之后,经噬菌体介导(转导)而进入宿主菌进行表达v乳酸菌乳酸菌 (Lactic acid bacteria)v沙门氏菌沙门氏菌 (Salmonella typhimurium)v苏云金杆菌苏云金杆菌 (Bacillus thuringiensis)优点:优点:1、基因背景了解清楚,上游操作简单,生长迅速,非常、基因背景了解清楚,上游操作简单,生长迅速,非常适于大规模发酵。适于大规模发酵。2、具有一定的加工及修饰能力:如二硫键的正确形成,、具有一定的加工及修饰能力:如二硫
18、键的正确形成,前体蛋白的水解加工。表达产物与天然蛋白相同或类前体蛋白的水解加工。表达产物与天然蛋白相同或类似。似。3、可将异源蛋白基因与、可将异源蛋白基因与N-末端前导肽等信号肽融合,指末端前导肽等信号肽融合,指导新生肽的分泌,在分泌中可对表达的蛋白进行糖基导新生肽的分泌,在分泌中可对表达的蛋白进行糖基化修饰,但其修饰糖链与高等真核细胞并不相同。化修饰,但其修饰糖链与高等真核细胞并不相同。 4、可移去起始甲硫氨酸,避免了作为药物使用可能引起、可移去起始甲硫氨酸,避免了作为药物使用可能引起的免疫反应问题。的免疫反应问题。 v缺点:缺点:l产糖量过多因而损坏蛋白质的生物活性、安产糖量过多因而损坏蛋
19、白质的生物活性、安全性等;全性等;l糖基化修饰与高等真核细胞并不相同。糖基化修饰与高等真核细胞并不相同。 载体:均为大肠杆菌和酵母菌的载体:均为大肠杆菌和酵母菌的“穿梭穿梭”质粒。质粒。有附加体型载体和整合体型载体两种。常用启有附加体型载体和整合体型载体两种。常用启动子:动子:GAL1、AOX1、AUG1、TEF1 等。等。酵母表达系统载体有:酵母表达系统载体有:1、整合型载体、整合型载体: 导入酵母宿主细胞后与酵母细胞导入酵母宿主细胞后与酵母细胞染色体基因组染色体基因组DNA整合,稳定性高,但基因拷整合,稳定性高,但基因拷贝数低。贝数低。 2、附加体型载体:在酵母宿主中拷贝数量大,、附加体型
20、载体:在酵母宿主中拷贝数量大,但在传代过程中易丢失,影响重组菌的稳定性但在传代过程中易丢失,影响重组菌的稳定性和表达量。和表达量。 v常见宿主有:酿酒酵母、裂殖酵母、克鲁维酵常见宿主有:酿酒酵母、裂殖酵母、克鲁维酵母、巴氏毕赤酵母等母、巴氏毕赤酵母等。l酿酒酵母表达系统多为附加型载体,巴氏毕赤酵母,酿酒酵母表达系统多为附加型载体,巴氏毕赤酵母,多形汉逊酵母表达系统为整合型载体。克鲁维酵母多形汉逊酵母表达系统为整合型载体。克鲁维酵母表达系统则兼而有之表达系统则兼而有之l酿酒酵母表达系统缺乏强有力的启动子,分泌效率酿酒酵母表达系统缺乏强有力的启动子,分泌效率差,表达质粒易于丢失差,表达质粒易于丢失
21、l目前,毕赤酵母表达系统是应用最广泛的酵母表达目前,毕赤酵母表达系统是应用最广泛的酵母表达系统系统它以甲醇作为唯一的碳源。产量较高。翻译后的它以甲醇作为唯一的碳源。产量较高。翻译后的加工更接近哺乳动物加工更接近哺乳动物 。如日本绿十字公司利用。如日本绿十字公司利用该系统可以达到公斤级水平的人血清白蛋白的生该系统可以达到公斤级水平的人血清白蛋白的生产。产。 商品化酵母表达系统有毕赤酵母(商品化酵母表达系统有毕赤酵母(Pichia)系统系统 (invitrogen)和)和Saccharomyces酿酒酵酿酒酵母表达系统(母表达系统(invitrogen)毕赤酵母系统重组蛋白表达量可高达毕赤酵母系统
22、重组蛋白表达量可高达12 g /L,表达量,表达量最高。最高。v昆虫细胞表达系统是以杆状病毒为载体,昆虫细胞表达系统是以杆状病毒为载体,昆虫细胞为宿主的表达系统。昆虫细胞为宿主的表达系统。 1、表达效率高。重组蛋白的表达水平最高可达、表达效率高。重组蛋白的表达水平最高可达到细胞总蛋白的到细胞总蛋白的50。2、属于真核表达系统。有糖基化作用、脂肪酸、属于真核表达系统。有糖基化作用、脂肪酸酰基化作用、氨基末端乙酰化作用以及磷酸化,酰基化作用、氨基末端乙酰化作用以及磷酸化,有利于表达产物形成天然的高级结构,保持原有利于表达产物形成天然的高级结构,保持原有的生物活性与功能。有的生物活性与功能。3、杆状
23、病毒能容纳较大的外源基因而不影响其、杆状病毒能容纳较大的外源基因而不影响其本身的增殖。本身的增殖。4、杆状病毒属于昆虫病毒。具有高度特异的宿、杆状病毒属于昆虫病毒。具有高度特异的宿主范围,对脊椎动物和植物均无致病性。病毒主范围,对脊椎动物和植物均无致病性。病毒重组因失去多角体保护,在自然界的生存能力重组因失去多角体保护,在自然界的生存能力很弱,因此比较安全。很弱,因此比较安全。5、应用晚期多角体蛋白基因启动子表达外源基、应用晚期多角体蛋白基因启动子表达外源基因可表达毒性蛋白。因可表达毒性蛋白。 6、杆状病毒表达载体通用性广。可表达来自病、杆状病毒表达载体通用性广。可表达来自病毒、细菌、真菌、植
24、物和动物几乎所有的蛋白,毒、细菌、真菌、植物和动物几乎所有的蛋白,并且能表达带有内含子的外源基因。并且能表达带有内含子的外源基因。 7、重组杆状病毒除在体外昆虫培养细胞表达外、重组杆状病毒除在体外昆虫培养细胞表达外源基因外,还能感染昆虫活体,在体内高效表源基因外,还能感染昆虫活体,在体内高效表达外源蛋白。达外源蛋白。缺点:缺点: l宿主细胞生长慢宿主细胞生长慢l培养基昂贵培养基昂贵l含有免疫宿主蛋白、含有免疫宿主蛋白、 杆状病毒感染会导致杆状病毒感染会导致宿主死亡、因此每一轮蛋白合成均需重新宿主死亡、因此每一轮蛋白合成均需重新感染感染昆虫细胞内的糖基化方式与脊椎动物细胞昆虫细胞内的糖基化方式与
25、脊椎动物细胞内的糖基化方式有一定的差异,其糖蛋白内的糖基化方式有一定的差异,其糖蛋白的糖链结构多为简单的不分支结构。的糖链结构多为简单的不分支结构。 v启动子采用多角体蛋白启动子。宿主细胞通常启动子采用多角体蛋白启动子。宿主细胞通常来源于双翅目昆虫,包括果蝇、蚊子。来源于来源于双翅目昆虫,包括果蝇、蚊子。来源于草地夜蛾草地夜蛾(Spodoptera frugiperda)的的Sf9细胞系细胞系是最常用的宿主细胞。是最常用的宿主细胞。v商品化系统:商品化系统:lB a c u l o D i r e c t 杆 状 病 毒 表 达 系 统杆 状 病 毒 表 达 系 统(invitrogen),典
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