(生物化学教学课件)第20章 重组dna技术(5-1, lmj2015) (1).ppt
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- 生物化学教学课件第20章 重组dna技术5-1 lmj2015 1 生物化学 教学 课件 20 重组 dna 技术 lmj2015
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1、第二十章第二十章重组重组DNADNA技术技术Recombinant DNA technique 第一节第一节 重组重组DNADNA技术的基本过程技术的基本过程Basic Process of Recombinant DNA Technology 2022年年5月月21日日6时时54分分2学习要求:学习要求: 掌握掌握重组重组DNA技术与基因工程的概念、基本原技术与基因工程的概念、基本原理和基本步骤。理和基本步骤。又称又称基因工程基因工程,是是在体外将不同来源的在体外将不同来源的或或 插入插入,构建成,构建成并将它导入到合适的并将它导入到合适的,使其在细胞中扩增和繁殖,使其在细胞中扩增和繁殖,;
2、再进行扩增、;再进行扩增、。2022年年5月月21日日6时时54分分3 亦称亦称,或或。 获取这类同一的获取这类同一的DNADNA分子群体、细胞群体或个体分子群体、细胞群体或个体群体的过程,即无性繁殖。群体的过程,即无性繁殖。 又称又称嵌合嵌合DNADNA(chimera DNAchimera DNA),),是采用克隆技术是采用克隆技术把来自不同生物的把来自不同生物的外源外源 DNADNA插入插入载体分子载体分子所形成的杂所形成的杂合合DNADNA分子。分子。2022年年5月月21日日6时时54分分4 指从同一始祖经无性繁殖传代而来的一群遗传指从同一始祖经无性繁殖传代而来的一群遗传上同一的上同
3、一的DNADNA分子、细胞或个体;分子、细胞或个体;2022年年5月月21日日6时时54分分52022年年5月月21日日6时时54分分62022年年5月月21日日6时时54分分72022年年5月月21日日6时时54分分8Common Enzymes Used in Recombinant DNA Technology学习要求:学习要求: 掌握掌握限制性内切酶的概念、性质和分类方法,限制性内切酶的概念、性质和分类方法,熟悉熟悉重组技术中的其他工具酶。重组技术中的其他工具酶。 是一类能识别双链是一类能识别双链DNADNA中的某些中的某些,并由此切割,并由此切割DNADNA双链的核酸内切酶,又称为双
4、链的核酸内切酶,又称为与与共同构成细菌的共同构成细菌的,限,限制外源制外源DNADNA,保护自身,保护自身DNADNA。2022年年5月月21日日6时时54分分9 主要是从原核生物中分离纯化而来。主要是从原核生物中分离纯化而来。第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写斜体;第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写斜体;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写斜体;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写斜体;第四个字母代表株;第四个字母代表株;用罗马数字表示发现的先后次序。用罗马数字表示发现的先后次序。H Hinind d 属属 种种 株株 序序Haemophilus Haemophilus in
5、influenzae fluenzae d d株株流感嗜血杆菌流感嗜血杆菌 d d株的第三种酶株的第三种酶2022年年5月月21日日6时时54分分10和和型限制酶通常是相对型限制酶通常是相对反应过程中反应过程中需有需有MgMg2+2+和和ATPATP参与参与。、和和型(基因工程技术中常用型(基因工程技术中常用型)。型)。型限制酶型限制酶通常以通常以同源二聚体同源二聚体形式存在,形式存在,只具只具有核酸内切酶活性有核酸内切酶活性而无甲基化酶活性,反应过程中而无甲基化酶活性,反应过程中只需有只需有MgMg2+2+参与参与而不需有而不需有ATPATP参与。参与。2022年年5月月21日日6时时54分
6、分11 类酶识别序具有类酶识别序具有回文结构回文结构(palindrome)(palindrome)特点,特点, 即具有即具有双重旋转对称结构双重旋转对称结构的的DNADNA反向重复双链序列反向重复双链序列。型型 大部分大部分型限制酶都能识别由型限制酶都能识别由4 48 8个核苷酸组个核苷酸组成的特定序列。成的特定序列。2022年年5月月21日日6时时54分分12Bam Bam HHGGATCCGGATCCCCTAGGCCTAGGGTCGTCCAGCAGGACGACCTGCTG平端切口平端切口G GCCTAGCCTAGGATCCGATCC G G粘端切口粘端切口HinHinddGTCGACGT
7、CGACCAGCTGCAGCTG平或钝末端(平或钝末端(blunt end)blunt end)粘性末端(粘性末端(sticky end)sticky end)2022年年5月月21日日6时时54分分13GGATCCCCTAGGGCCTAGGATCC GBam HGGATCCCCTAGGGCCTAGGATCC GBst 来源不同但能识别相同序列,切割来源不同但能识别相同序列,切割 DNADNA后产生后产生相同的黏性末端的限制酶,又称同相同的黏性末端的限制酶,又称同功异源酶功异源酶。2022年年5月月21日日6时时54分分14 GGATCC CCTAGG AGATCT TCTAGAGCCTAG
8、GATCC GATCTAG GATCT A 识别序列不完全相同,但切割识别序列不完全相同,但切割 DNADNA后,产生相同的黏后,产生相同的黏性末端的限制酶称为同尾酶。这两个相同的黏性末端称为性末端的限制酶称为同尾酶。这两个相同的黏性末端称为配伍未端配伍未端(compatible end)(compatible end)。2022年年5月月21日日6时时54分分15 识别识别DNADNA序列中的一个或几个碱基是可变的,并且序列中的一个或几个碱基是可变的,并且识别序列往往超过识别序列往往超过6 6个核苷酸。为个核苷酸。为型限制酶的特例。型限制酶的特例。 Bstp GGTNACC CCANTGG2
9、022年年5月月21日日6时时54分分16 Bbl CGGN(N)4CCG; GCC(N)4NGGC 重组重组DNADNA技术、基因组技术、基因组DNADNA物理图谱绘制、基因组物理图谱绘制、基因组DNADNA同源性研究、切割基因组同源性研究、切割基因组DNADNA或或cDNAcDNA构建基因组文构建基因组文库或库或cDNAcDNA文库等。文库等。 DNADNA纯度、结构及甲基度程度;酶切反应的温度、纯度、结构及甲基度程度;酶切反应的温度、时间及缓冲液体系等。时间及缓冲液体系等。2022年年5月月21日日6时时54分分17 只能封闭只能封闭DNADNA链上的链上的缺口(缺口(nicknick)
10、, ,而不能封闭而不能封闭裂口(裂口(gapgap)。)。 需要在一条需要在一条DNADNA链的链的3 3 末端具有游离的羟基末端具有游离的羟基、另、另一条一条DNADNA链的链的5 5 末端有磷酸基团末端有磷酸基团,而且反应过程需要,而且反应过程需要由由ATPATP提供能量。提供能量。2022年年5月月21日日6时时54分分18 只能连接具有互补只能连接具有互补黏性末端黏性末端的两个双链的两个双链DNADNA分分子底物。需要子底物。需要NADNAD+ +作为辅助因子。作为辅助因子。2022年年5月月21日日6时时54分分19*GAATTC*CTTAAG*5353EcoR IDNA连接酶连接酶
11、*G*C T T A A 5335OHPA A T T C* G*5335 P OH+*AGCT*TCGA*5353Alu IT4 DNA连接酶连接酶OHP5335 *TC *AG5335 OHPCT*GA*+2022年年5月月21日日6时时54分分20 连接的底物可以是两个双链连接的底物可以是两个双链DNADNA分子的互补分子的互补黏黏性末端性末端或或平末端平末端。最早是从。最早是从T4T4噬菌体感染的大肠埃噬菌体感染的大肠埃希菌分离,易制备,应用广。希菌分离,易制备,应用广。2022年年5月月21日日6时时54分分212022年年5月月21日日6时时54分分22 能够催化以能够催化以DNA
12、DNA或或RNARNA为模板合成为模板合成DNADNA的反应,的反应,把脱氧核糖核苷酸连续地添加到双链把脱氧核糖核苷酸连续地添加到双链DNADNA分子或引分子或引物链的物链的3 3 -OH-OH末端,催化核苷酸的聚合作用。末端,催化核苷酸的聚合作用。 具有具有 具有具有2022年年5月月21日日6时时54分分23依赖依赖RNARNA的的DNADNA聚合酶。聚合酶。是最常用的高保真是最常用的高保真DNA聚合酶聚合酶之一。之一。有有活性活性 是被发现的第一个耐热的、依是被发现的第一个耐热的、依赖赖DNADNA的的DNADNA聚合酶,聚合酶,有有活性活性活性活性对对MgMg2+2+浓度非常敏感。浓度
13、非常敏感。 普遍使用的是来源于普遍使用的是来源于AMV(鸟类成髓细胞白血鸟类成髓细胞白血病病毒病病毒)及及M-MLV(莫洛尼鼠白血病病毒莫洛尼鼠白血病病毒)的反转录的反转录酶,酶,具有具有2022年年5月月21日日6时时54分分24 (terminal deoxynucleotidyl transferaseterminal deoxynucleotidyl transferase) (1) (1) 底物是底物是或有或有。5533OHCo2+dNTPnppi5533( (A/G/C/T)n)n2022年年5月月21日日6时时54分分25(2) (2) 底物是底物是或或的双链的双链DNADNA。
14、Co2+dNTPnppi53OH53(A/G/C/T)nCo2+dNTPnppi53OH53(A/G/C/T)n (1 1)主要作用是在载体或目的)主要作用是在载体或目的基因基因 3 3 末端加上末端加上同源多聚尾巴同源多聚尾巴,形成人工黏性末端,便于,形成人工黏性末端,便于DNADNA重组。重组。 (2 2)DNA 3DNA 3 末端的同位素标记末端的同位素标记。2022年年5月月21日日6时时54分分26 (alkaline phosphatasealkaline phosphatase) 能特异地切除能特异地切除DNADNA和和RNARNA上上5 5 - -磷酸基团磷酸基团。 (poly
15、nuleotide kinasepolynuleotide kinase) 又称又称T4T4多核苷酸激酶,能催化多核苷酸激酶,能催化ATPATP的的- -磷酸基磷酸基团转移到团转移到DNADNA或或RNARNA片段的片段的5 5 -OH-OH末端末端。2022年年5月月21日日6时时54分分27重组重组DNADNA技术中常用的工具酶技术中常用的工具酶Common Vectors in Recombinant DNA Technology2022年年5月月21日日6时时54分分29学习要求:学习要求:掌握质粒载体的概念和特点,掌握质粒载体的概念和特点,了解了解各载体的应各载体的应用。用。 是在克
16、隆载体的基础上,增添了与宿主细胞相是在克隆载体的基础上,增添了与宿主细胞相适应的适应的强启动子强启动子,以及有利于表达产物分泌、分离,以及有利于表达产物分泌、分离或纯化的元件。或纯化的元件。复制起始点复制起始点oriCoriC,2022年年5月月21日日6时时54分分30复制起始点,复制起始点,2022年年5月月21日日6时时54分分31最常用的目的基因最常用的目的基因用于克隆大片段用于克隆大片段DNADNA( (自习自习) )用于用于SangerSanger双脱氧双脱氧DNADNA测序测序( (自习自习) )构建基因组构建基因组DNADNA或或cDNAcDNA文库文库( (自习自习) )包括
17、人或哺乳动物病毒、昆虫及植物病包括人或哺乳动物病毒、昆虫及植物病 毒用于在真核细胞中表达目的蛋白毒用于在真核细胞中表达目的蛋白( (自习自习) )用于更大用于更大DNADNA片段的克隆片段的克隆( (自习自习) )2022年年5月月21日日6时时54分分32细菌培养细菌培养染色质染色质质粒质粒 严紧型质粒(严紧型质粒(stringent plaxmidstringent plaxmid) 松弛型质粒(松弛型质粒(relaxed plaxmidrelaxed plaxmid)AmprORITetr两个抗性基因,用两个抗性基因,用于筛选阳性克隆。于筛选阳性克隆。两个酶切位点,用两个酶切位点,用于插
18、入目的基因于插入目的基因复制起始点,保证复制起始点,保证高拷贝自我复制高拷贝自我复制。2022年年5月月21日日6时时54分分34OripUC192686 bpAmprP(BLA)PlacAva I (413)BamHI (418)Eco RI (397)Hin dIII (448)Pst I (440)Sma I (415)Xma I (413)Apa LI (178)Apa LI (1121)Apa LI (2367)MCS提供多个单酶提供多个单酶切位点用于克切位点用于克隆操作隆操作Lac Z半乳糖苷酶半乳糖苷酶N N端端肽片段肽片段的编码基因的编码基因2022年年5月月21日日6时时54
19、分分351.1.能在体外转录克隆基因的质粒载体能在体外转录克隆基因的质粒载体 由由pUCpUC系列质粒载体派生而来,系列质粒载体派生而来,带有来自噬菌体带有来自噬菌体T7T7、SP6SP6的启动子的启动子,为,为RNARNA聚合酶的附着提供了特异聚合酶的附着提供了特异性识别位点。如性识别位点。如pGEM-3Z/4Z.pGEM-3Z/4Z.2.2.穿梭质粒载体穿梭质粒载体(shuttle plasmid vectorshuttle plasmid vector) 是一类人工构建的,是一类人工构建的,具有具有两种不同复制起始点两种不同复制起始点和选择标记和选择标记,可在两种不同的宿主细胞中存活和复
20、,可在两种不同的宿主细胞中存活和复制的质粒载体。制的质粒载体。2022年年5月月21日日6时时54分分36 许多耐热的许多耐热的DNADNA聚合酶聚合酶( (如如等等) )扩增时,扩增时,都在都在PCRPCR产物产物3 3 - -末端加上了末端加上了A A碱基。碱基。335PCR产物产物AA5Taq酶酶T载体载体TT55332022年年5月月21日日6时时54分分37在连接酶的作用下可直接将在连接酶的作用下可直接将PCRPCR产物克隆到产物克隆到TATA载体中。载体中。 可容纳可容纳7 kb7 kb以下以下的外源片段。有供外源基因片的外源片段。有供外源基因片段插入的单一内切酶位点。段插入的单一
21、内切酶位点。 可容纳可容纳9 923kb23kb的外源片段。有两个或两组内切的外源片段。有两个或两组内切酶位点,供外源基因片段插入替代。酶位点,供外源基因片段插入替代。2022年年5月月21日日6时时54分分38(自习)(自习)(自习)(自习) ,简称,简称YACYAC载体载体,由酵母染,由酵母染色体、酵母色体、酵母2 2mDNAmDNA质粒的复制起始序列等元件衍生质粒的复制起始序列等元件衍生而成;可插入而成;可插入100kb100kb2,000kb2,000kb外源外源DNADNA片段,是人类片段,是人类基因组计划中物理图谱绘制采用的主要载体。基因组计划中物理图谱绘制采用的主要载体。 ,简称
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