高通量测序应用-PPT课件.ppt

1、1高通量测序的应用2高通量测序的用途高通量测序的用途3高通量测序的用途高通量测序的用途l基因组序列的物种进行重测序，鉴定SNP，indel及基因组结构变化；对含有全基因组序列且转录本注释较好的物种开展转录组学研究，解析细胞转录产物的数量变化及其结构信息。 4高通量测序现状高通量测序现状l 第二代测序技术，又称超高通量测序。目前，科学家正为1000美元完成一个基因组测序而努力。多家研究单位正在为此展开竞争，而且进展比预期的更快。 5高通量测序原理高通量测序原理l高通量测序方法原理示意图6高通量测序平台高通量测序平台l高通量测序的三大平台：l Illumina公司的Solexa测序仪 ，l 罗氏公

2、司(Roche)的454 测序仪 ，l ABI公司的SOLiD 测序仪7高通量测序特点高通量测序特点l速度快l通量高l结果一致性好l简便高效8高通量测序在基因组上应用高通量测序在基因组上应用l应用于人基因组重测序l动植物、细菌基因组测序9高通量测序在高通量测序在mRNA表达谱的应用表达谱的应用l将miRNA的标记与线性放大相结合，只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。 10高通量测序在高通量测序在microRNA中的应用中的应用l高通量、低成本l易于寻找新片段及作用位点11高通量测序在高通量测序在CHIP-CHIP的应用的应用l相对ref seq，染色质免疫沉淀以后的DNA直接进行测序, 可以直接获得蛋白与DNA结合的位点信息l相对ChIP-chip, ChIP-seq可以检测更小的结合区段、未知的结合位点、结合位点 。12高通量测序在甲基化的应用高通量测序在甲基化的应用l对于DNA甲基化的检测，目前采用：甲基化DNA富集并结合高通量测序 ，可以检测到全基因组范围内的甲基化现象。l特点：高效，准确13特异片段测序特异片段测序l血浆DNA测序l游离RNA测序14未来未来-高通量测序会成为临床辅助工具高通量测序会成为临床辅助工具l致病基因l碱基突变15Thank you ！