酶与维生素-ppt课件.ppt
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1、 酶的分子结构与功能酶的分子结构与功能 酶的命名与分类酶的命名与分类 酶促反应的特点与机制酶促反应的特点与机制 酶动力学酶动力学 酶活性调节酶活性调节 酶与生物医学的关系酶与生物医学的关系 维生素与辅酶维生素与辅酶 酶的发现酶的发现1857年法国巴斯德年法国巴斯德-发酵是酵母细胞生命活动的结果发酵是酵母细胞生命活动的结果;1878年年Buchner等用酵母提取液实现了无细胞发酵,证实有等用酵母提取液实现了无细胞发酵,证实有生物催化剂的存在。生物催化剂的存在。1926年,年,Sumner从刀豆得到脲酶(从刀豆得到脲酶(urease)结晶,并明确)结晶,并明确其化学本质为蛋白质。其化学本质为蛋白质
2、。此后发现近万种酶,证实其化学本质都是蛋白质,因此,人此后发现近万种酶,证实其化学本质都是蛋白质,因此,人们一直认为生物催化剂的化学本质就是蛋白质。们一直认为生物催化剂的化学本质就是蛋白质。1980s,Cech和和Altman等人在研究中发现,部分核酸也具等人在研究中发现,部分核酸也具有催化作用,提出了核酶的概念,进一步扩展了生物催化剂有催化作用,提出了核酶的概念,进一步扩展了生物催化剂的范围。的范围。 酶酶enzyme是生物催化剂(是生物催化剂(biocatalyst) 体内生化反应均是由酶催化体内生化反应均是由酶催化w 酶的偶联作用形成生物体内的代谢途径酶的偶联作用形成生物体内的代谢途径S
3、PE底物底物substrate产物产物 productSP1E1P2E2P3E3PxEx关键酶关键酶Key enzyme第一节第一节 酶的分子结构与功能酶的分子结构与功能一、一、酶的分子组成酶的分子组成非蛋白部分:非蛋白部分:辅助因子辅助因子 (cofactor) 单纯酶(单纯酶(single enzyme)纯蛋白)纯蛋白结合酶(结合酶(conjugated enzyme) w 酶酶有机辅助因子有机辅助因子又称为又称为 辅酶辅酶 (coenzymes),与维与维生素生素(Vitamins)密切相关。密切相关。w与酶蛋白结合紧密,甚至是共价结合的辅助因子又被与酶蛋白结合紧密,甚至是共价结合的辅助
4、因子又被称之为称之为辅基辅基(prosthetic groups) 辅酶辅酶 与与 辅基辅基辅酶:在单一酶组成的反应体系中会随着酶促反应的进辅酶:在单一酶组成的反应体系中会随着酶促反应的进行不断被消耗,直到反应达到平衡,如果补充辅酶则可行不断被消耗,直到反应达到平衡,如果补充辅酶则可以继续生成产物。以继续生成产物。辅基:在酶促反应过程中通常不离开酶蛋白,在酶完成辅基:在酶促反应过程中通常不离开酶蛋白,在酶完成对底物的转化作用前后不会被消耗,自身结构也要恢复对底物的转化作用前后不会被消耗,自身结构也要恢复原状。在独立化学反应达到平衡后,补充辅基通常既不原状。在独立化学反应达到平衡后,补充辅基通常
5、既不能提高酶反应速度,也不能增加产物的生成。能提高酶反应速度,也不能增加产物的生成。酶的必需基团酶的必需基团 (essential groups):):酶分子整体构酶分子整体构象中对于酶发挥活性所必需的基团象中对于酶发挥活性所必需的基团 ;酶活性中心或活性部位(酶活性中心或活性部位( active center,active site):酶的必需基团在在空间结构上彼此靠近,组成:酶的必需基团在在空间结构上彼此靠近,组成具有特定动态构象的局部空间结构,形状如口袋或裂穴,具有特定动态构象的局部空间结构,形状如口袋或裂穴,开口在酶分子表面,能与底物特异地结合并将之转化为开口在酶分子表面,能与底物特异
6、地结合并将之转化为产物;产物;二、二、酶的活性中心酶的活性中心 底物结合基团底物结合基团(substrate binding group):):直接参与直接参与酶对底物的结合,形成酶酶对底物的结合,形成酶-底物复合物(底物复合物(E-S complex););催化基团(催化基团(catalytic group):):影响底物中某些化学键影响底物中某些化学键的稳定性或直接与底物发生化学反应,促进底物转变成的稳定性或直接与底物发生化学反应,促进底物转变成中间产物或产物。中间产物或产物。必需基团必需基团essential groups1976国际生化学会(国际生化学会(IUB)酶学委员会规定:在特定
7、的反)酶学委员会规定:在特定的反应条件下,在应条件下,在25每分每分钟催化钟催化1mol底物转化为产物所需底物转化为产物所需的的酶量酶量为一个为一个国际单位国际单位 (international unit, IU)。1979催量单位催量单位(katal): 1催量(催量(1kat)是指在对应条件下,)是指在对应条件下,每秒钟使每秒钟使1mol底物转化为产物所需的酶量。底物转化为产物所需的酶量。 1kat=6.0107 IU。酶的比活性酶的比活性: 为单位质量蛋白中的酶活性为单位质量蛋白中的酶活性(应用于酶提取应用于酶提取) 三、三、酶活性单位酶活性单位 按照酶促反应的性质可分为六大类:按照酶促
8、反应的性质可分为六大类: 1.氧化还原酶类(氧化还原酶类(oxidoreductases) 2.转移酶类转移酶类 (transfersaes) 3.水解酶类水解酶类 (hydrolases) 4.裂解酶类或裂合酶类(裂解酶类或裂合酶类(lyases)5.异构酶类异构酶类 (isomerases)6.合成酶类或连接酶类(合成酶类或连接酶类(ligases) 第二节第二节 酶的命名与分类酶的命名与分类 1. 氧化还原酶类(氧化还原酶类(oxidoreductases)E.C. (enzyme commission) Number: 1.1 -OH 1.2 C=O 1.3 CH-CH一、一、酶的分类
9、酶的分类 2. 转移酶类转移酶类 (transfersaes) E.C. Number: 2.1 C1 groups 2.2 aldehydic or ketonic residues 2.3 Acyltransferases 2.6 Aminotransferases 2.7 P-containing groups3. 水解酶类水解酶类(hydrolases) E.C. Number 3.1 Cleaving ester linkage 3.1.1 Carboxylic ester hydrolases 3.1.3 Phosphoric monoester hyrolases 4. 裂解酶类
10、或裂合酶类(裂解酶类或裂合酶类(lyases) 5. 异构酶类异构酶类(isomerases) 合成酶类或连接酶类(合成酶类或连接酶类(ligases) E.C. Number 6.1 Forming C-O bonds 6.2 Forming C-S bonds 6.3 Forming C-N bonds 6.4 Forming C-C bonds EC编编 号号 推荐名称推荐名称 系统名称系统名称 催化反应催化反应1.1.1.1 醇脱氢酶醇脱氢酶 乙醇乙醇: NAD+ 氧化还原酶氧化还原酶 乙醇乙醇+ NAD+ 乙醛乙醛+NADH+H+ 2.6.1.2 丙氨酸氨基转移酶丙氨酸氨基转移酶 G
11、lu:丙酮酸转氨酶丙酮酸转氨酶 Glu +丙酮酸丙酮酸 Ala +-酮戊二酸酮戊二酸 3.1.1.7 乙酰胆碱酯酶乙酰胆碱酯酶 乙酰胆碱水解酶乙酰胆碱水解酶 乙酰胆碱乙酰胆碱 + H2O 胆碱胆碱 + 乙酸乙酸4.2.1.2 延胡索酸酶延胡索酸酶 延胡索酸水化酶延胡索酸水化酶 延胡索酸延胡索酸+ H2O 琥珀酸琥珀酸5.3.1.1 磷酸丙糖异构酶磷酸丙糖异构酶 磷酸丙糖异构酶磷酸丙糖异构酶 3-磷酸甘油醛磷酸甘油醛 磷酸二羟丙酮磷酸二羟丙酮6.3.1.1 天冬酰胺合成酶天冬酰胺合成酶 天冬氨酸天冬氨酸: NH3: ATP合成酶合成酶 Asp + ATP + NH3 Asn + ADP +Pi二
12、、二、酶的命名酶的命名 极高的催化效率极高的催化效率 高度专一性高度专一性对环境因素敏感对环境因素敏感活性可调节活性可调节 第三节第三节 酶促反应的特点与机制酶促反应的特点与机制 一、酶催化作用的特点一、酶催化作用的特点 酶的高催化效率:降低反应的活化能酶的高催化效率:降低反应的活化能脲酶催化尿素水脲酶催化尿素水解速度比解速度比H+催化催化作用高作用高7106倍。倍。酶底物结合以酶底物结合以更高效率形成过更高效率形成过渡态,从而实现渡态,从而实现高效的催化作用。高效的催化作用。 酶专一性或特异性(酶专一性或特异性(specificity) 酶对底物具有明确选择性,且只催化预定的化学反应,生酶对
13、底物具有明确选择性,且只催化预定的化学反应,生成具有确定结构的产物,这种对底物的选择性和生成确成具有确定结构的产物,这种对底物的选择性和生成确定产物的性质称为酶专一性或特异性定产物的性质称为酶专一性或特异性 。特异性可按高低分:特异性可按高低分:绝对专一绝对专一性和性和相对专一相对专一性,性,如脲酶(如脲酶(urease)仅能催化尿素水解生成)仅能催化尿素水解生成CO2和和NH3;消化蛋白的胰蛋白酶、糜蛋白酶和弹性蛋白酶,均可水消化蛋白的胰蛋白酶、糜蛋白酶和弹性蛋白酶,均可水解多种蛋白质,但通常只断裂肽链中特定氨基酸对应的解多种蛋白质,但通常只断裂肽链中特定氨基酸对应的肽键。肽键。 蛋白水解酶
14、中心局部空间结构与酶的专一性蛋白水解酶中心局部空间结构与酶的专一性 选择性水解多肽链中选择性水解多肽链中Arg/Lys的羧基肽键的羧基肽键 选择性水解肽链中选择性水解肽链中芳香族氨基酸芳香族氨基酸(Phe、Tyr和和Trp)残基的羧基肽键残基的羧基肽键内陷更浅,所以内陷更浅,所以只能作用于侧链只能作用于侧链较短的氨基酸残较短的氨基酸残基参与的肽键基参与的肽键 立体异构体专一性立体异构体专一性 只能作用于立体异构体中的某一种,或生成产物只只能作用于立体异构体中的某一种,或生成产物只具有相应的某种立体结构。具有相应的某种立体结构。如:延胡索酸酶仅催化反丁烯二酸(即延胡索酸)如:延胡索酸酶仅催化反丁
15、烯二酸(即延胡索酸)水化成苹果酸,对顺丁烯二酸则无作用。水化成苹果酸,对顺丁烯二酸则无作用。 光学异构体专一性光学异构体专一性 如:乳酸脱氢酶(如:乳酸脱氢酶(LDH)只能催化)只能催化L-乳酸脱氢生成乳酸脱氢生成丙酮酸,而不能作用于丙酮酸,而不能作用于D-乳酸,催化丙酮酸还原生乳酸,催化丙酮酸还原生成乳酸时,也只生成成乳酸时,也只生成L-乳酸而不生成乳酸而不生成D-乳酸。乳酸。酶的化学本质是蛋白质酶的化学本质是蛋白质,其发挥活性依赖于其特有的空,其发挥活性依赖于其特有的空间动态构象,因此酶只有在较温和条件下才能有效发间动态构象,因此酶只有在较温和条件下才能有效发挥其催化作用。挥其催化作用。所
16、有可所有可改变蛋白质构象的物质和环境改变蛋白质构象的物质和环境条件,如条件,如: 溶液中的溶液中的pH、反应体系的温度、有机溶剂、氧化剂等,都对酶、反应体系的温度、有机溶剂、氧化剂等,都对酶的活性有明显影响。的活性有明显影响。 w酶活性对环境因素的敏感性酶活性对环境因素的敏感性 生物细胞调控代谢生物细胞调控代谢-通过调节酶活性来实施,尤其是通过调节酶活性来实施,尤其是限速酶活性。限速酶活性。酶结构活性的调节酶结构活性的调节: 一是通过抑制剂和激动剂改变酶一是通过抑制剂和激动剂改变酶的活性,另一是通过化学共价修饰改变酶的结构以调的活性,另一是通过化学共价修饰改变酶的结构以调节酶的活性,如酶的磷酸
17、化或去磷酸化共价修饰而改节酶的活性,如酶的磷酸化或去磷酸化共价修饰而改变活性。变活性。酶总量活性的调节酶总量活性的调节:通过改变酶的表达量而影响酶通过改变酶的表达量而影响酶的总体活性,通过对酶生物合成的诱导与阻遏作用对的总体活性,通过对酶生物合成的诱导与阻遏作用对酶量进行调节。酶量进行调节。w酶活性的可调节性酶活性的可调节性 各种酶具体的作用机制不尽相同,且还有许多不确定之处,但存各种酶具体的作用机制不尽相同,且还有许多不确定之处,但存有共性,即酶在催化反应过程中,都需要先与底物结合,形成有共性,即酶在催化反应过程中,都需要先与底物结合,形成过渡态过渡态(transition state)复合
18、物后,再转变为酶与产物的复合复合物后,再转变为酶与产物的复合物,再释放产物并复原酶分子,使酶分子可以再进行另一次催物,再释放产物并复原酶分子,使酶分子可以再进行另一次催化反应酶催化循环。化反应酶催化循环。 酶降低反应的活化能是通过与底物结合成酶底物复合物酶降低反应的活化能是通过与底物结合成酶底物复合物(enzyme-substrate complex, ES复合物)实现的。复合物)实现的。 二、酶催化机制二、酶催化机制S EE - SPE酶与底物相互接近时,通过相互诱导、相互变形和相互酶与底物相互接近时,通过相互诱导、相互变形和相互适应,才使酶与底物相互结合形成适应,才使酶与底物相互结合形成E
19、S复合物,此即诱导复合物,此即诱导契合学说契合学说(induced-fit theory) w酶与底物诱导契合酶与底物诱导契合 己糖激酶与葡萄糖结合的诱导契合己糖激酶与葡萄糖结合的诱导契合 许多酶在催化过程中,先与底物分子共价结合,形成特殊的共价结许多酶在催化过程中,先与底物分子共价结合,形成特殊的共价结构的中间产物,再转变成终产物。构的中间产物,再转变成终产物。共价催化也常发生在双底物反应中,酶活性中心的结合基团可较某共价催化也常发生在双底物反应中,酶活性中心的结合基团可较某一底物更易攻击另一底物,首先形成以共价结合的酶底物中间产物,一底物更易攻击另一底物,首先形成以共价结合的酶底物中间产物
20、,再和第二种底物分子结合反应。再和第二种底物分子结合反应。共价催化主要有两类共价催化主要有两类: 亲核共价催化亲核共价催化(covalent nucleophilic catalysis)与亲电共价催化与亲电共价催化(covalent electrophilic catalysis)。 w共价催化共价催化 亲核共价催化酶底物共价复合物的形成亲核共价催化酶底物共价复合物的形成普通催化剂常仅有一种解离状态,只能进行酸催化,或碱催化;普通催化剂常仅有一种解离状态,只能进行酸催化,或碱催化; 酶是两性电解质,同一种酶常常兼有酸、碱双重催化作用。酶是两性电解质,同一种酶常常兼有酸、碱双重催化作用。酸碱催
21、化可分为两类:特异酸碱催化和一般酸碱催化。酸碱催化可分为两类:特异酸碱催化和一般酸碱催化。特异性催化由氢离子和氢氧根离子进行的催化,酶的催化速率特异性催化由氢离子和氢氧根离子进行的催化,酶的催化速率常数直接受缓冲溶液常数直接受缓冲溶液pH影响,但不受缓冲容量的影响。影响,但不受缓冲容量的影响。一般酸碱催化由酸碱分子参与的催化,在催化反应跃迁过程中,一般酸碱催化由酸碱分子参与的催化,在催化反应跃迁过程中,缓冲溶液可作为质子的受体或供体,因此酶的催化速率常数受缓冲缓冲溶液可作为质子的受体或供体,因此酶的催化速率常数受缓冲容量影响。容量影响。 w酸碱催化酸碱催化 酸碱催化酸碱催化 全酶中金属离子的作
22、用机制很复杂,目前主要有下列几个方面认识:全酶中金属离子的作用机制很复杂,目前主要有下列几个方面认识: (1)金属离子可作为金属离子可作为酶活性中心的催化基酶活性中心的催化基团直接参与传递电子等催化团直接参与传递电子等催化反应;反应;(2)金属离子与酶蛋白结合后,可金属离子与酶蛋白结合后,可稳定酶稳定酶发挥其催化作用所需要的活发挥其催化作用所需要的活性性构象构象;(3)金属离子结合在酶蛋白上,通过金属离子结合在酶蛋白上,通过中和中和酶与底物结合的局部环境的酶与底物结合的局部环境的负电荷负电荷,以降低静电排斥力而促进对底物的结合;,以降低静电排斥力而促进对底物的结合;(4)金属离子作为辅助底物通
23、过特定方式金属离子作为辅助底物通过特定方式连接酶与底物连接酶与底物,便于酶对底,便于酶对底物的识别。物的识别。 w金属离子催化金属离子催化 在多分子反应中,反应物(底物)之间必须以正确的方向发生碰撞,才有在多分子反应中,反应物(底物)之间必须以正确的方向发生碰撞,才有可能形成具有所需要分子取向的过度态。满足此要求的碰撞称为有效碰撞。可能形成具有所需要分子取向的过度态。满足此要求的碰撞称为有效碰撞。底物和辅助因子按特定顺序和特定空间定向结合到酶的活性中心,使它们底物和辅助因子按特定顺序和特定空间定向结合到酶的活性中心,使它们相互接近而获得有利于反应进行的正确定向,相互接近而获得有利于反应进行的正
24、确定向,提高底物分子发生有效碰撞提高底物分子发生有效碰撞的几率的几率,这种作用称为邻近效应(,这种作用称为邻近效应(proximity)。)。w邻近效应与表面效应邻近效应与表面效应 咪唑催化的乙酸对硝基苯酯的水解反应,咪唑催化的乙酸对硝基苯酯的水解反应,分子内反应速度为分子间反应速度的分子内反应速度为分子间反应速度的24倍倍 。化学反应速度和酶促反应速度化学反应速度和酶促反应速度底物浓度对酶促反应速度的影响底物浓度对酶促反应速度的影响 w酶反应速度方程酶反应速度方程 米氏方程米氏方程酶浓度对反应速度的影响酶浓度对反应速度的影响 温度对反应速度的影响温度对反应速度的影响pH对反应速度的影响对反应
25、速度的影响 抑制剂对酶促反应速度的影响抑制剂对酶促反应速度的影响 激活剂对酶活性的影响激活剂对酶活性的影响 第四节第四节 酶动力学酶动力学 initial rate 酶促反应进程曲线(酶促反应进程曲线(progress curve) 一、化学反应速度和酶促反应速度一、化学反应速度和酶促反应速度测定化学反应速度常测定初速度测定化学反应速度常测定初速度 二、底物浓度对酶促反应速度的影响二、底物浓度对酶促反应速度的影响 酶促反应速度的酶促反应速度的底物饱和现象底物饱和现象 ES 生成速度生成速度: vfVf = k1E S = k1 (ET-ES)SES 消耗速度消耗速度: vd稳态时稳态时: vf
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