代谢控制发酵(全套课件746P).ppt
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- 代谢 控制 发酵 全套 课件 746
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1、代谢控制发酵课程代谢控制发酵课程第一章第一章 微生物的代谢微生物的代谢第一节第一节 微生物的代谢体系微生物的代谢体系 代谢(代谢(MetabolismMetabolism)是细胞内发生的各种化学反应)是细胞内发生的各种化学反应的总称,也就是发生在微生物细胞内各种生物化学反应的总称,也就是发生在微生物细胞内各种生物化学反应的总称。的总称。(catabolism)(anabolism)分分解解代代谢谢合合成成代代谢谢 合成代谢与分解代谢在生物体中耦联进行,它们合成代谢与分解代谢在生物体中耦联进行,它们之间既有明显差别,但又紧密相关。分解代谢为之间既有明显差别,但又紧密相关。分解代谢为合成代谢提供所
2、需要的能量和原料,而合成代谢合成代谢提供所需要的能量和原料,而合成代谢则是分解代谢的基础。则是分解代谢的基础。在代谢过程中,微生物通过分解代谢产生化学能,在代谢过程中,微生物通过分解代谢产生化学能,光合微生物光合微生物还可将光能转换成化学能,这些能量还可将光能转换成化学能,这些能量除用于合成代谢外,还可用于微生物的运动和运除用于合成代谢外,还可用于微生物的运动和运输,另有部分能量以热或光的形式释放到环境中输,另有部分能量以热或光的形式释放到环境中去。去。 初级代谢和次级代谢初级代谢和次级代谢初级代谢:能使营养物转化为结构物质、具生初级代谢:能使营养物转化为结构物质、具生理活性物质或提供生长能量
3、的一类代谢。产物理活性物质或提供生长能量的一类代谢。产物有小分子前体物、单体、多聚体等生命必需物有小分子前体物、单体、多聚体等生命必需物质;质;次级代谢:某些微生物在一定生长时期出现的次级代谢:某些微生物在一定生长时期出现的一类代谢。产物有抗生素、酶抑制剂、毒素、一类代谢。产物有抗生素、酶抑制剂、毒素、甾体化合物等,与生命活动无关,不参与细胞甾体化合物等,与生命活动无关,不参与细胞结构,也不是酶活性必需,但对人类有用。结构,也不是酶活性必需,但对人类有用。二者关系:先初后次,初级形成期也是生长期,二者关系:先初后次,初级形成期也是生长期,只有大量生长,才能积累产物。只有大量生长,才能积累产物。
4、第二节第二节 微生物产能与耗能代谢微生物产能与耗能代谢 一、能量转换一、能量转换 ATPATP是能量转换的枢纽物质是能量转换的枢纽物质 1.1.底物水平磷酸化(底物水平磷酸化(Substrate Level PhosphorylationSubstrate Level Phosphorylation)不需氧不需氧 通过转移底物在生物氧化过程中形成的通过转移底物在生物氧化过程中形成的高能化合物的高能磷酸键,直接形成高能化合物的高能磷酸键,直接形成ATPATP的过程称的过程称为底物水平磷酸化。为底物水平磷酸化。 特点:底物在生物氧化中脱下的电子或氢不经过特点:底物在生物氧化中脱下的电子或氢不经过电
5、子传递链传递,而是通过酶促反应直接交给底物电子传递链传递,而是通过酶促反应直接交给底物自身的氧化产物,同时将释放出的能量自身的氧化产物,同时将释放出的能量( (一般通过一般通过高能磷酸键高能磷酸键) )交给交给ADPADP,形成,形成ATPATP。底物水平磷酸化。底物水平磷酸化是微生物在发酵中产生是微生物在发酵中产生ATPATP的唯一方式,在呼吸过的唯一方式,在呼吸过程虽也存在,但处于次要地位。程虽也存在,但处于次要地位。 底物在生物氧化过程中放出的电子通过电子传递底物在生物氧化过程中放出的电子通过电子传递链传到氧或其他氧化物链传到氧或其他氧化物(如如NO3-1),同时形成,同时形成ATP的过
6、的过程称为氧化磷酸化或电子传递磷酸化。程称为氧化磷酸化或电子传递磷酸化。 其核心为电子传递链(其核心为电子传递链(ETC, electron transport chain),或称为呼吸链(,或称为呼吸链(RC, respiratory chain)。)。ETC由若干个氢和电子传递体按氧化还原电位高低顺由若干个氢和电子传递体按氧化还原电位高低顺序排列而成,相当于一段由有机物分子连接而成的序排列而成,相当于一段由有机物分子连接而成的“生物导线生物导线”,电子在该导线上流动,产生,电子在该导线上流动,产生ATP。组。组成成ETC的成员主要有醌及醌衍生物、细胞色素、铁硫的成员主要有醌及醌衍生物、细胞
7、色素、铁硫蛋白及黄素蛋白蛋白及黄素蛋白4类化合物。类化合物。 二、微生物的产能代谢二、微生物的产能代谢 (一)化能异养微生物的生物氧化(一)化能异养微生物的生物氧化 1 1、发、发 酵酵发酵发酵(fermentation)是指微生物细胞将有机物氧是指微生物细胞将有机物氧化释放的电子直接交给底物本身未完全氧化的化释放的电子直接交给底物本身未完全氧化的某种中间产物,同时释放能量并产生各种不同某种中间产物,同时释放能量并产生各种不同的代谢产物。在发酵条件下有机化合物只是部的代谢产物。在发酵条件下有机化合物只是部分地被氧化,因此,只释放出一小部分的能量。分地被氧化,因此,只释放出一小部分的能量。发酵过
8、程的氧化是与有机物的还原耦联在一起发酵过程的氧化是与有机物的还原耦联在一起的。被还原的有机物来自于初始发酵的分解代的。被还原的有机物来自于初始发酵的分解代谢,即不需要外界提供电子受体。谢,即不需要外界提供电子受体。 发酵的种类有很多,其底物有碳水化合物、有发酵的种类有很多,其底物有碳水化合物、有机酸、氨基酸等,其中以微生物发酵葡萄糖最机酸、氨基酸等,其中以微生物发酵葡萄糖最为重要。为重要。 葡萄糖是异养微生物的主要碳源和能源,可葡萄糖是异养微生物的主要碳源和能源,可直接进入糖代谢途径被降解成小分子物质直接进入糖代谢途径被降解成小分子物质丙酮酸。丙酮酸。主要分为四种途径:主要分为四种途径:(1
9、1)EMPEMP途径途径:糖酵解途径:糖酵解途径(2 2)HMPHMP途径途径:戊糖磷酸途径:戊糖磷酸途径(3 3)EDED途径途径:2-2-酮酮-3-3-脱氧脱氧-6-6-磷酸葡糖酸(磷酸葡糖酸(KDPGKDPG)途径)途径(4 4)PKPK途径途径:磷酸解酮酶途径:磷酸解酮酶途径(1 1)EMPEMP途径途径主要生理功能是:主要生理功能是:1 1、提供、提供ATPATP和和NADHNADH2 2、中间产物又可提供微、中间产物又可提供微生物合成代谢的碳骨架生物合成代谢的碳骨架3 3、可逆转合成多糖、可逆转合成多糖 无氧条件下,该途径无氧条件下,该途径产能效率很低,但多种产能效率很低,但多种中
10、间代谢物不仅可为合中间代谢物不仅可为合成反应提供原材料,而成反应提供原材料,而且起链接许多有关代谢且起链接许多有关代谢途径的作用,可用于多途径的作用,可用于多种发酵产品的生产。种发酵产品的生产。(2 2)HMPHMP途径途径 从葡萄糖从葡萄糖-6-P-6-P开始,即单磷酸己糖基开始,即单磷酸己糖基础上开始降解,故亦称为单磷酸己糖途径,磷础上开始降解,故亦称为单磷酸己糖途径,磷酸戊糖支路(酸戊糖支路(HMPHMP途径中途径中3-P-3-P-甘油醛可以进入甘油醛可以进入EMPEMP途径)。途径)。HMPHMP途径的总反应可用下图表示:途径的总反应可用下图表示:戊糖磷酸途径的概况戊糖磷酸途径的概况
11、一般认为一般认为HMPHMP途径不是产能途径,而是为生物途径不是产能途径,而是为生物合成提供大量的还原力合成提供大量的还原力NADPHNADPH和中间代谢产物,如核酮糖和中间代谢产物,如核酮糖- -5-P5-P是合成核酸、某些辅酶及组氨酸的原料;是合成核酸、某些辅酶及组氨酸的原料;NADPHNADPH是合成是合成脂肪酸、类固醇和谷氨酸的供氢体。另外,核酮糖脂肪酸、类固醇和谷氨酸的供氢体。另外,核酮糖-5-P-5-P还还可以转化为核酮糖可以转化为核酮糖-1,5-1,5-二磷酸,在羧化酶作用下固定二磷酸,在羧化酶作用下固定COCO2 2,对于光能自养菌、化能自养菌具有重要意义。对于光能自养菌、化能
12、自养菌具有重要意义。HMPHMP途径是戊糖代谢的主要途径,其生理意义:途径是戊糖代谢的主要途径,其生理意义: 为核苷酸和核酸的生物合成提供戊糖为核苷酸和核酸的生物合成提供戊糖- -磷酸;磷酸; 产生大量的产生大量的NADPHNADPH,一方面参与脂肪酸、固醇,一方面参与脂肪酸、固醇等细胞物质的合成,另一方面可通过呼吸链产生大等细胞物质的合成,另一方面可通过呼吸链产生大量的能量;量的能量; 四碳糖(赤藓糖)可用于芳香族氨基酸的合成;四碳糖(赤藓糖)可用于芳香族氨基酸的合成; 在反应中存在在反应中存在3 73 7碳糖,使具有该途径的微碳糖,使具有该途径的微生物的碳源谱更广泛;生物的碳源谱更广泛;
13、通过该途径可产生许多发酵产物,如核苷酸、氨通过该途径可产生许多发酵产物,如核苷酸、氨基酸、辅酶、乳酸等。基酸、辅酶、乳酸等。 单独单独HMP途径途径较少,一般与较少,一般与EMP途径同存途径同存 (3 3)EDED途径途径 E D 途 径 是途 径 是 1 9 5 2 年 在 研 究 嗜 糖 假 单 胞 菌年 在 研 究 嗜 糖 假 单 胞 菌(Pseudomonas Saccharophila)时发现的。在)时发现的。在ED途途径中,葡萄糖径中,葡萄糖-6-P首先脱氢产生首先脱氢产生6-P-葡萄糖酸,接着葡萄糖酸,接着在脱水酶和醛缩酶的作用下,产生甘油醛在脱水酶和醛缩酶的作用下,产生甘油醛-
14、3-P和丙酮和丙酮酸,然后甘油醛酸,然后甘油醛-3-P进入进入EMP途径转变成丙酮酸。途径转变成丙酮酸。1分子葡萄糖经分子葡萄糖经ED途径最后生成途径最后生成2分子丙酮酸,分子丙酮酸,1分子分子ATP,1分子分子NADPH和和NADH。ED途径可不依赖于途径可不依赖于EMP、HMP途径而单独存在,但对于靠底物水平磷途径而单独存在,但对于靠底物水平磷酸化类的酸化类的ATP的厌养菌而言,的厌养菌而言,ED途径不如途径不如EMP途径途径经济。经济。 ED途径是少数途径是少数EMP途径不完整的细菌例如假单胞途径不完整的细菌例如假单胞菌和发酵单胞菌等所特有的利用葡萄糖的替代途菌和发酵单胞菌等所特有的利用
15、葡萄糖的替代途径,包括铜绿、荧光假单胞菌,根瘤菌,固氮菌,径,包括铜绿、荧光假单胞菌,根瘤菌,固氮菌,农杆菌,运动发酵假单胞菌等。农杆菌,运动发酵假单胞菌等。 其特点是利用葡萄糖的反应步骤简单,产能效率其特点是利用葡萄糖的反应步骤简单,产能效率低(低(1分子葡萄糖仅产分子葡萄糖仅产1分子分子ATP,仅为,仅为EMP途径途径之半),反应中有一个之半),反应中有一个6碳的关键中间代谢物碳的关键中间代谢物KDPG。由于由于ED途径可与途径可与EMP途径、途径、HMP途径和途径和TCA循循环等各种代谢途径相连接,因此可以相互协调,环等各种代谢途径相连接,因此可以相互协调,以满足微生物对能量、还原力和不
16、同中间代谢物以满足微生物对能量、还原力和不同中间代谢物的需要。的需要。在不同的微生物中,在不同的微生物中,EMP、HMP和和ED途途径在己糖分解代谢中径在己糖分解代谢中的重要性是有明显差的重要性是有明显差别的。别的。在微生物细胞中,有在微生物细胞中,有的同时存在多条途径的同时存在多条途径来降解葡萄糖,有的来降解葡萄糖,有的只有一种。在某一具只有一种。在某一具体条件下,拥有多条体条件下,拥有多条途径的某种微生物究途径的某种微生物究竟经何种途径代谢,竟经何种途径代谢,对发酵产物影响很大。对发酵产物影响很大。 (4 4)磷酸解酮酶途径)磷酸解酮酶途径 磷酸解酮酶途径是明串珠菌在进行异型乳酸发酵磷酸解
17、酮酶途径是明串珠菌在进行异型乳酸发酵过程中分解己糖和戊糖的途径。没有过程中分解己糖和戊糖的途径。没有EMP、HMP、ED途径的细菌通过途径的细菌通过PK途径分解葡萄糖,产物有乙酸、途径分解葡萄糖,产物有乙酸、乳酸等。该途径的特征性酶是磷酸解酮酶。乳酸等。该途径的特征性酶是磷酸解酮酶。 根据解酮酶不同:根据解酮酶不同: 具有磷酸戊糖解酮酶的称具有磷酸戊糖解酮酶的称PK途径,肠膜明串珠菌、途径,肠膜明串珠菌、番茄乳杆菌、甘露醇乳杆菌、短杆乳杆菌;番茄乳杆菌、甘露醇乳杆菌、短杆乳杆菌; 具有磷酸己糖解酮酶的叫具有磷酸己糖解酮酶的叫HK途径,双歧杆菌。途径,双歧杆菌。 在无氧条件下,以葡萄糖分解过程中
18、形成的各种在无氧条件下,以葡萄糖分解过程中形成的各种中间产物作为受体来接受中间产物作为受体来接受NADH + H+ 和和 NADPH + H+的氢,于是产生了各种各样的发酵产物。的氢,于是产生了各种各样的发酵产物。由由EMPEMP途径中丙酮酸出发的发酵途径中丙酮酸出发的发酵pH小于小于7.5(一般控制在(一般控制在3.54.5)乙醇发酵特点:乙醇发酵特点:发酵基质氧化不彻底,发酵结果仍有有机物;发酵基质氧化不彻底,发酵结果仍有有机物;酶体系不完全,只有脱氢酶,没有氧化酶;酶体系不完全,只有脱氢酶,没有氧化酶;产生能量少。产生能量少。通过通过EDED途径进行的乙醇发酵(细菌的乙醇发酵)途径进行的
19、乙醇发酵(细菌的乙醇发酵)参与微生物:运动发酵假单胞菌参与微生物:运动发酵假单胞菌同型乳酸发酵:发酵产物只有乳酸,产生同型乳酸发酵:发酵产物只有乳酸,产生2分子分子ATP;异型乳酸发酵(通过异型乳酸发酵(通过HMP途径或途径或PK途径):发酵产物途径):发酵产物除乳酸外还有乙醇与除乳酸外还有乙醇与CO2。表表 同型乳酸发酵与异型乳酸发酵的比较同型乳酸发酵与异型乳酸发酵的比较 肠杆菌属(产气杆菌)在发酵葡萄糖时,只有一小部肠杆菌属(产气杆菌)在发酵葡萄糖时,只有一小部分按混合酸发酵的类型进行外,大部分丙酮酸先通过两分按混合酸发酵的类型进行外,大部分丙酮酸先通过两个分子的缩合成为乙酰乳酸,再脱羧成
20、为个分子的缩合成为乙酰乳酸,再脱羧成为3-3-羟基丁酮,羟基丁酮,然后再还原为然后再还原为2 2,3-3-丁二醇。丁二醇。2 2、呼吸作用、呼吸作用 微生物在降解底物过程中,将释放出电子传给微生物在降解底物过程中,将释放出电子传给NADNAD(P P)+ +、FADFAD或或FMNFMN等电子载体,再经电子传递系统传给外源等电子载体,再经电子传递系统传给外源电子受体,从而生成水或其它还原型产物并释放出能电子受体,从而生成水或其它还原型产物并释放出能量的过程称为呼吸作用。量的过程称为呼吸作用。呼吸作用与发酵作用的根本区别在于呼吸作用与发酵作用的根本区别在于:电子载体不是:电子载体不是将电子直接传
21、递给底物降解的中间产物,而是交给电将电子直接传递给底物降解的中间产物,而是交给电子传递系统,逐步释放出能量后再交给最终电子受体。子传递系统,逐步释放出能量后再交给最终电子受体。其中,以分子氧作为最终电子受体的称为有氧呼吸其中,以分子氧作为最终电子受体的称为有氧呼吸(aerobic respirationaerobic respiration),以氧化型化合物作为最),以氧化型化合物作为最终 电 子 受 体 的 称 为 无 氧 呼 吸 (终 电 子 受 体 的 称 为 无 氧 呼 吸 ( a n a e r o b i c a n a e r o b i c respirationrespira
22、tion)。)。许多不能被发酵的有机化合物能够通过呼吸作用许多不能被发酵的有机化合物能够通过呼吸作用被分解,是因为在进行呼吸作用的生物电子传递被分解,是因为在进行呼吸作用的生物电子传递系统中发生了系统中发生了NADHNADH的再氧化和的再氧化和ATPATP的生成。因此,的生成。因此,只要生物体内有一种能将电子从该化合物转移给只要生物体内有一种能将电子从该化合物转移给NADNAD+ +的酶存在,而且该化合物的氧化水平低于的酶存在,而且该化合物的氧化水平低于COCO2 2即可。即可。能通过呼吸作用进行分解的有机物包括某些能通过呼吸作用进行分解的有机物包括某些碳水碳水化合物化合物、脂肪酸、许多醇类。
23、但对人造化合物,、脂肪酸、许多醇类。但对人造化合物,如如PVCPVC、PPPP等,微生物的呼吸作用具有显著抗性,等,微生物的呼吸作用具有显著抗性,可在环境中积累,造成有害的生态影响。可在环境中积累,造成有害的生态影响。 (1 1)有氧呼吸)有氧呼吸 根据原核生物与真核生物不同,葡萄糖完全氧化总共可获得根据原核生物与真核生物不同,葡萄糖完全氧化总共可获得30或或32个个ATP。(2 2)无氧呼吸)无氧呼吸 某些厌氧和兼性厌氧微生物在无氧条件下进行某些厌氧和兼性厌氧微生物在无氧条件下进行无氧呼吸,如铜绿假单胞、地衣芽孢杆菌等。无氧呼吸,如铜绿假单胞、地衣芽孢杆菌等。无氧呼吸的最终电子受体不是氧,而
24、是像无氧呼吸的最终电子受体不是氧,而是像NONO3 3- -、NONO2 2- -、SOSO4 42-2-、S S2 2O O3 32-2-、COCO2 2等这类外源受体。无等这类外源受体。无氧呼吸也需要细胞色素等电子传递体,并在能氧呼吸也需要细胞色素等电子传递体,并在能量分级释放过程中伴有磷酸化作用,也能产生量分级释放过程中伴有磷酸化作用,也能产生较多的能量用于生命活动。但由于部分能量随较多的能量用于生命活动。但由于部分能量随电子转移传给最终电子受体,所以生成的能量电子转移传给最终电子受体,所以生成的能量不如有氧呼吸产生的多。不如有氧呼吸产生的多。 (二)化能自养微生物(以无机物(二)化能自
25、养微生物(以无机物COCO2 2为为唯一或主要碳源)的生物氧化唯一或主要碳源)的生物氧化 化能自养菌是一类从无机物的氧化中得到能量化能自养菌是一类从无机物的氧化中得到能量(ATP)和还原力和还原力(NADH2或或NADPH2),再通过卡尔文循环,再通过卡尔文循环同化同化CO2的微生物。专性化能自养菌不吸收利用有的微生物。专性化能自养菌不吸收利用有机物,故不能像异养细菌通过糖酵解和机物,故不能像异养细菌通过糖酵解和TCA产能。产能。研究证明,某些专性自养菌缺乏一些关键酶,它们研究证明,某些专性自养菌缺乏一些关键酶,它们的的EMP、ED不完全,不完全,TCA也存在缺陷:缺乏由也存在缺陷:缺乏由TC
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