氨基酸PPT课件.ppt
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1、生 物 化 学赵艳玲2010第二章第二章 蛋白质化学蛋白质化学 主要内容主要内容: : n重点重点:组成蛋白质的20种常见氨基酸的分类、化学结构、酸碱、性质及物化性质。蛋白质的肽和肽键。n难点难点:蛋白质的肽键性质蛋白质高级结构,尤其是超二级结构,结构域和三级结构,四级结构。第一节第一节 氨基酸氨基酸是由许多不同的氨基酸按一定的序列是由许多不同的氨基酸按一定的序列通过酰胺键(肽键)缩合而成的,具有较稳通过酰胺键(肽键)缩合而成的,具有较稳定的构象并具有一定生物功能的大分子。定的构象并具有一定生物功能的大分子。n蛋白质的重要性蛋白质的重要性蛋白质是生命现象的蛋白质是生命现象的最基本物质基础最基本
2、物质基础蛋白质的生物机体的结构物质蛋白质的生物机体的结构物质蛋白质的生物的功能物质蛋白质的生物的功能物质蛋白质与生命起源的关系蛋白质与生命起源的关系1. 1. 生物体的组成成分生物体的组成成分2. 2. 酶酶3. 3. 运输:运输:4. 4. 运动:运动:5. 5. 抗体抗体6. 6. 干扰素干扰素7. 7. 遗传信息的控制遗传信息的控制8. 8. 细胞膜的通透性细胞膜的通透性9. 9. 高等动物的记忆、识别机构高等动物的记忆、识别机构Na-KNa-K泵、泵、驱动蛋白介导的转运活动驱动蛋白介导的转运活动离子转运离子转运蛋白质含量蛋白质含量 蛋白氮蛋白氮6.256.25N N的含量平均为的含量平
3、均为16%16%凯氏(凯氏(KjadehlKjadehl)定氮法)定氮法的理论基础的理论基础C C(5055%5055%)H H(68%68%)O O(2023%2023%)N N(1518%1518%)S S(04%04%)n 蛋白质在生物体内的分蛋白质在生物体内的分布布 含量含量( (干重干重) ) 微生物微生物 50-80% 50-80% 人人 体体 45% 45% 一般细胞一般细胞 50% 50% 种类种类 大肠杆菌大肠杆菌 3000 3000种种 人体人体 10 10万种万种 第一节第一节 氨氨 基基 酸酸组成蛋白质组成蛋白质一些一些aaaa及其衍生物充当化学信号分子及其衍生物充当化
4、学信号分子 Thyroxine(甲状腺素,酪氨酸衍生物)和吲哚乙酸(植物中的色氨酸衍生物)都是激素。氨基酸是许多含氨基酸是许多含N N分子的前体物分子的前体物 核苷酸和核酸的含氮碱基、血红素、叶绿素的合成都需要aa一些基本氨基酸和非基本一些基本氨基酸和非基本aaaa是代谢中间物是代谢中间物 精氨酸、瓜氨酸、鸟氨酸是尿素循环(Urea cycle)的中间物。 主要内容主要内容: : 1、氨基酸的结构通式及其构型 2、氨基酸的分类及其结构3、氨基酸的物理性质4、氨基酸的酸碱性质5、氨基酸的重要化学通性6、氨基酸的制备一、氨基酸一、氨基酸蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子(一)蛋白质的水解(一)蛋白质
5、的水解蛋白质的水解可分为完全水解和部分水解两种情况。蛋白质的水解可分为完全水解和部分水解两种情况。(1 1)酸水解)酸水解 常用常用H H2 2SOSO4 4 (4mol/L) (4mol/L)和和HCl (6mol/L)HCl (6mol/L)进行水进行水解。色氨酸破坏,天冬酰胺、谷胺酰胺脱酰胺基。解。色氨酸破坏,天冬酰胺、谷胺酰胺脱酰胺基。 (2 2)碱水解)碱水解 用用5mol/L5mol/L的的NaOHNaOH水解,氨基酸消旋,色氨酸水解,氨基酸消旋,色氨酸稳定。稳定。(3 3)酶水解)酶水解 水解位点特异,为部分水解。用于一级结构水解位点特异,为部分水解。用于一级结构分析。分析。(二
6、)氨基酸的结构通式及其构型(二)氨基酸的结构通式及其构型 a-a-氨基酸氨基酸是指羧基分子中是指羧基分子中a-a-碳原碳原子上的一个氢原子被氨基取代而成的子上的一个氢原子被氨基取代而成的化合物。常见的化合物。常见的2020种氨基酸中,除了种氨基酸中,除了脯氨酸脯氨酸外,都是外,都是a-a-氨基酸。氨基酸。不带电形式 H2NCHCOOHR +H3NCHCOO-R两性离子形式(1 1)具有酸性的)具有酸性的-COOH-COOH基及碱性的基及碱性的-NH-NH2 2基,为两性电解质。基,为两性电解质。(2 2)如果)如果RHRH,则具有不对称碳原子,因而是光活性物质。,则具有不对称碳原子,因而是光活
7、性物质。1、氨基酸的结构通式2、氨基酸的构型C C如是不对称如是不对称C C(除甘氨酸(除甘氨酸GlyGly),则:),则: 1 1、具有两种立体异构体、具有两种立体异构体 D- D-型和型和L-L-型型 2 2、具有旋光性(手性)、具有旋光性(手性) 左旋(左旋(- -)或右旋()或右旋(+ +) (一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸二、氨基酸的分类及其结构二、氨基酸的分类及其结构 组成蛋白质的组成蛋白质的2020种氨基酸称为基本氨基酸。种氨基酸称为基本氨基酸。它们中除脯氨酸外都是它们中除脯氨酸外都是-氨基酸,即在氨基酸,即在-碳原碳原子上有一个氨基。基本氨基酸都符合通式,都有子
8、上有一个氨基。基本氨基酸都符合通式,都有单字母和三字母缩写符号。单字母和三字母缩写符号。化学名称英文三字符号单字符中文代号甘氨酸GlycineGlyG甘丙氨酸alanineAlaA丙缬氨酸valineValV缬亮氨酸leucineLeuL亮异亮氨酸isoleucineIleI异亮丝氨酸serineSerS丝苏氨酸threonineThrT苏半胱氨酸cysteineCysC半胱甲硫氨酸methionineMetM甲硫天冬氨酸aspartic acidAspD天化学名称英文三字符号单字符中文代号谷氨酸glutamic acidGluE谷天冬酰胺asparagineAsnN 谷氨酰胺glutamin
9、eGlnQ赖氨酸lysineLysK赖精氨酸arginineArgR精苯丙氨酸phenylalaninePheF苯丙酪氨酸tyrosineTyrY酪组氨酸histidineHisH组色氨酸tryptophanTrpW色脯氨酸prolineProP脯甘、丙、缬、亮、异亮 是一氨基一羧基氨基酸丝、苏 是羟基氨基酸半胱、甲硫 是含硫氨基酸天、谷是一氨基二羧基氨基酸 天冬酰胺和谷氨酰胺是酰胺 赖和精 是二氨基一羧基氨基酸苯丙和酪 是芳香族氨基酸组、色、脯是杂环氨基酸1 1、根据侧链、根据侧链R R基团的结构分类基团的结构分类(1 1)脂肪族氨基酸()脂肪族氨基酸(1515个)个)一氨基一羧基氨基酸(中
10、性氨基酸)一氨基一羧基氨基酸(中性氨基酸) 甘、丙、缬、亮、异亮甘、丙、缬、亮、异亮 含羟基氨基酸:含羟基氨基酸:丝、苏丝、苏 含硫氨基酸:含硫氨基酸:半胱、甲硫半胱、甲硫 一氨基二羧基氨基酸(酸性氨基酸):一氨基二羧基氨基酸(酸性氨基酸):天、谷天、谷酰胺(酸性氨基酸)酰胺(酸性氨基酸) :天冬酰胺、谷氨酰胺天冬酰胺、谷氨酰胺二氨基一羧基氨基酸(碱性氨基酸)二氨基一羧基氨基酸(碱性氨基酸) :赖、精赖、精 (2 2)芳香族氨基酸)芳香族氨基酸 (2 2个)个) 苯丙、酪苯丙、酪(3 3)杂环族氨基酸)杂环族氨基酸 (3 3个)个) 组、色、脯组、色、脯六伴穷光蛋六伴穷光蛋半胱、蛋半胱、蛋半胱
11、、蛋(甲硫)氨酸半胱、蛋(甲硫)氨酸含硫氨基酸含硫氨基酸 酸谷天出门酸谷天出门谷、天谷、天谷氨酸、天冬氨酸谷氨酸、天冬氨酸酸性氨基酸酸性氨基酸 死猪肝色脸死猪肝色脸丝、组、甘、色丝、组、甘、色丝、组、甘、色氨酸丝、组、甘、色氨酸一碳单位来源的氨基酸一碳单位来源的氨基酸 只携一两钱只携一两钱缬、异亮、亮缬、异亮、亮缬、异亮、亮氨酸缬、异亮、亮氨酸支链氨基酸支链氨基酸 一本落色书一本落色书异、苯、酪、色、苏异、苯、酪、色、苏异亮、苯丙、酪、色、苏氨酸异亮、苯丙、酪、色、苏氨酸生糖兼生酮生糖兼生酮 拣来精读之拣来精读之赖、精、组赖、精、组赖氨酸、精氨酸、组氨酸赖氨酸、精氨酸、组氨酸碱性氨基酸碱性氨基
12、酸 芳香老本色芳香老本色酪、苯、色酪、苯、色酪、苯丙、色氨酸酪、苯丙、色氨酸芳香族氨基酸芳香族氨基酸 不抢甘肃来不抢甘肃来脯、羟、甘、苏、赖脯、羟、甘、苏、赖脯、羟脯、甘、苏、赖氨酸脯、羟脯、甘、苏、赖氨酸不参与转氨基不参与转氨基的氨基酸的氨基酸(二)不常见的蛋白质氨基酸(二)不常见的蛋白质氨基酸 有些不常见的氨基酸在某些蛋白质中存在,是由相应有些不常见的氨基酸在某些蛋白质中存在,是由相应的常见氨基酸经修饰而来。的常见氨基酸经修饰而来。 在结缔组织的胶原蛋白中有在结缔组织的胶原蛋白中有5-5-羟赖氨酸、羟赖氨酸、4-4-羟脯氨酸;羟脯氨酸;肌球蛋白含有甲基化的氨基酸(肌球蛋白含有甲基化的氨基酸
13、(6-N-6-N-甲基赖氨酸甲基赖氨酸 );凝);凝血酶原中发现了血酶原中发现了羧基谷氨酸;细菌紫膜质中存在焦谷羧基谷氨酸;细菌紫膜质中存在焦谷氨酸;甲状腺蛋白中氨酸;甲状腺蛋白中TyrTyr的衍生物:的衍生物: 3.53.5 - -二碘酪氨酸、甲二碘酪氨酸、甲状腺素等。状腺素等。(三)非蛋白质氨基酸(三)非蛋白质氨基酸 除参与蛋白质组成的除参与蛋白质组成的2020多种氨基酸外,生物体内存在大多种氨基酸外,生物体内存在大量的氨基酸中间代谢产物,它们不是蛋白质的结构单元,但量的氨基酸中间代谢产物,它们不是蛋白质的结构单元,但在生物体内具有很多生物学功能。在生物体内具有很多生物学功能。 (1 1)
14、L-L-型型氨基酸的衍生物:氨基酸的衍生物:L-L-瓜氨酸和瓜氨酸和L-L-鸟氨酸鸟氨酸 (2 2)D-D-型氨基酸:型氨基酸:D-D-谷、谷、D-D-丙(肽聚糖中)、丙(肽聚糖中)、D-D-苯丙(短苯丙(短杆菌肽杆菌肽S S) (3 3)-、-、-氨基酸氨基酸 :-丙(泛素的前体)、丙(泛素的前体)、-氨基丁酸(神经递质)。氨基丁酸(神经递质)。 三、氨基酸的物理性质(一) 旋光性旋光性 rotation,optical activity,chiralityn一个异构体的溶液可使偏振光逆时针旋转(记为(一个异构体的溶液可使偏振光逆时针旋转(记为(- -)) ),另一个异构体可使偏振光顺时针旋
15、转(计为(另一个异构体可使偏振光顺时针旋转(计为(+ +),称为),称为旋光性。旋光性。n光学异构体的其它理化性质完全相同。光学异构体的其它理化性质完全相同。注意:旋光度与溶剂、浓度、温度、注意:旋光度与溶剂、浓度、温度、pHpH值等条件有关值等条件有关甘氨酸是一种构型甘氨酸是一种构型, ,无旋光性无旋光性苏氨酸苏氨酸和和异亮氨酸异亮氨酸有四种光有四种光学异构体。学异构体。其余其余1717种氨基酸有两种光学种氨基酸有两种光学异构体:异构体:L L型、型、D D型。型。构成蛋白质的氨基酸均属构成蛋白质的氨基酸均属L-L-型(型(L-L-苏氨酸)。苏氨酸)。( (二二) )溶解性:溶解性: 溶解于
16、水,特别是稀酸稀碱溶液,不溶于乙醚、氯仿等有机溶剂。( (三三) )熔熔 点点: : 均大于200度l构成蛋白质的构成蛋白质的2020种氨基酸在种氨基酸在可见光区都没有光吸收,但可见光区都没有光吸收,但在远紫外区在远紫外区(220nm)(220nm)均有光均有光吸收。吸收。l酪氨酸的酪氨酸的 maxmax275nm275nm, 275275=1.4x10=1.4x103 3; ;l苯丙氨酸的苯丙氨酸的 maxmax257nm257nm, 257257=2.0 x10=2.0 x102 2; ;l色氨酸的色氨酸的 maxmax280nm280nm, 280280=5.6x10=5.6x103 3
17、; ;蛋白质最大紫外吸收峰在蛋白质最大紫外吸收峰在280nm280nm处。处。四、氨基酸的酸碱化学四、氨基酸的酸碱化学(一)氨基酸的两性离子形式(一)氨基酸的两性离子形式 三个现象:三个现象:晶体溶点高晶体溶点高离子晶格,不是分子晶格。离子晶格,不是分子晶格。不溶于非极性溶剂不溶于非极性溶剂极性分子极性分子 介电常数高(氨基酸使水的介电常数增高,而乙醇、丙介电常数高(氨基酸使水的介电常数增高,而乙醇、丙酮使水的介电常数降低。)酮使水的介电常数降低。)水溶液中的氨基酸是极性分水溶液中的氨基酸是极性分子。子。 ( (二二) )氨基酸的两性解离性质及等电点(氨基酸的两性解离性质及等电点(pIpI)p
18、H = pIpH = pI 净电荷净电荷=0=0 pH pI pH pIpH pI净电荷为负净电荷为负CHCHR RCOOHCOOHNHNH3 3+ +CHCHR RCOOCOONHNH2 2CHCHR RCOOCOONHNH3 3+ + + H+ OH- + H+ OH-(pK(pK 1 1) )(pK(pK 2 2) )A+A+A0A0A-A-( (三三) )氨基酸的酸碱滴定曲线氨基酸的酸碱滴定曲线在在pH2.34pH2.34和和pH9.60pH9.60处,处,GlyGly具有缓冲能力。具有缓冲能力。起点:起点: 100% Gly100% Gly+ + 净电荷:净电荷:+1+1第一拐点:第
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