生物学分子生物学DNA复制课件.pptx
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- 生物学 分子 DNA 复制 课件
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1、教学要求教学要求1. 理解理解DNA复制的半保留机制和半不连续复制的半保留机制和半不连续复制复制2. 掌握细菌掌握细菌DNA复制过程及有重要作用的复制过程及有重要作用的酶和蛋白质酶和蛋白质3. 掌握真核生物掌握真核生物DNA复制的特点复制的特点4. 掌握掌握DNA复制的类型复制的类型主要内容主要内容第第1节节 DNA复制概述复制概述第第2节节 细菌细菌DNA的复制的复制第第3节节 真核生物真核生物DNA的复制的复制问 题l复制开始时亲本链是完全解开的吗?复制开始时亲本链是完全解开的吗?l复制可以随机起始吗?复制可以随机起始吗?l复制是沿一个方向还是双向进行?复制是沿一个方向还是双向进行?l复制
2、是从复制是从5 3 还是还是3 5,或是双向,或是双向进行的?进行的?l复制过程中有哪些酶参与?复制过程中有哪些酶参与? DNA replication第第1节节 DNA复制概述复制概述一、半保留机制一、半保留机制 二、复制子二、复制子(Replicons)和复制方向和复制方向三、半不连续复制三、半不连续复制 (semi-discontinous replication )四、四、RNA引导引导 (RNA priming )一、一、半保留机制半保留机制亲代双链亲代双链DNA分子在分子在DNA聚聚合酶的作用下,分别以各单链合酶的作用下,分别以各单链 DNA分子分子为模板,聚合与自身碱基可以互补配
3、对为模板,聚合与自身碱基可以互补配对的游离的的游离的dNTP,合成出两条与亲代,合成出两条与亲代DNA分子完全相同的子代分子完全相同的子代DNA分子的过程。分子的过程。 一、一、半保留机制半保留机制 2.半保留复制:半保留复制:复制过程中各以双螺旋复制过程中各以双螺旋DNA的其中一条链为模板合成其互补链,的其中一条链为模板合成其互补链,新生的互补链与母链构成子代新生的互补链与母链构成子代DNA分子分子 。半保留复制半保留复制新合成新合成 的链的链2、实验证据(1958 Meselson 和Stahl) Matthew Messelson Franklin Stahl单林娜 制作10 DNA r
4、eplication E. ColiE. Coli DNA DNA在在1515N-N-标记标记的营养液中生的营养液中生长多代,使长多代,使DNADNA双链充分标记双链充分标记万有引力万有引力将将1515N-N-标记标记的的E.ColiE.Coli 加入加入1414N N 培培养液中养液中细胞在细胞在1414N N中中复制复制1 1次次细胞在细胞在1414N N中复中复制第制第2 2次次细胞在细胞在1414N N中复中复制第制第3 3次次DNADNA半保留复制的生物学意义:半保留复制的生物学意义: DNADNA的半保留复制表明的半保留复制表明DNADNA在代谢上的稳定性,在代谢上的稳定性,保证亲
5、代的遗传信息稳定地传递给后代。保证亲代的遗传信息稳定地传递给后代。复制子复制子(复制单位或复制元复制单位或复制元 ) :能独立进行复制的:能独立进行复制的DNA 单位,从起始位点到终止位点的全部单位,从起始位点到终止位点的全部DNA。Origin(复制起始位点复制起始位点):复制开始处复制开始处DNA分子的特分子的特定位置定位置。(富含富含AT)Terminus(复制终止点复制终止点) 复制终止处复制终止处DNA分子的特定分子的特定位置。位置。DNA replication二、复制子二、复制子(Replicons)和复制方向和复制方向1.复制子复制子l原核生物(Prokaryote):单复制起
6、点,即整个染色体只有一个复制单位 单林娜 制作14 All prokaryotic chromosomes and many bacteriophage and viral DNA molecules are circles and comprise single replications. (单复制子)(单复制子)真核生物(真核生物(EukaryoteEukaryote) : : 多复制起点多复制起点,即一个即一个genomegenome中有中有多个复制单位多个复制单位2 2、复制方向(复制过程的顺序性)、复制方向(复制过程的顺序性)l复制叉(复制叉(Replication fork):复制
7、时DNA分子中的叉形结构,是由解开的两条链和尚未松解开的双螺旋形成的,是复制有关的酶和蛋白质组装成复合物和新链合成的部位。 lreplication bubbles(复制泡复制泡):两个靠得很近的复制叉之间形成的空间。Replication forkorigins of DNA replication (every 150 kb)replication bubbledaughter chromosomesfusion of bubblesbidirectional replicationOrigins of DNA replication on mammalian chromosomes5 3
8、 3 5 5 3 3 5 3 5 5 3 Electron Microscopy of replicating DNA reveals replicating bubbles. 单向复制单向复制 双向复制双向复制 (1 1)单双向复制取决于起点处有一个)单双向复制取决于起点处有一个还是两个复制叉还是两个复制叉单单起点、起点、单单方向(原核)方向(原核)多多起点、起点、单单方方向(真核)向(真核)单单起点、起点、双双方向方向(原核原核)多多起点、起点、双双方向方向(真核)(真核)(2 2) 复制的多模式复制的多模式 Bidirectional (双向复制双向复制) replication of
9、a circular bacterial repliconorignterminidaughter DNAA single termination site is roughly 180o opposite the unique origin3 5 OK !How ?5 3 5 3 三、半不连续复制三、半不连续复制 (semi-discontinous replication ) DNA聚合酶只能以53方向合成DNA, 事实上没有发现DNA能按35合成的证据E.coli t- 2, 7, 15, 30 脉冲标记脉冲标记 dT-H3 0 0 KCN 杀死杀死D.S. DNA S.S. DNA 密
10、度梯度离心密度梯度离心 测定测定 H3-T 放射强度放射强度脉冲追踪脉冲追踪 20 in dT-H3 30 正常培养基中数分钟正常培养基中数分钟 冈崎片段(冈崎片段(Okazaki fragmentOkazaki fragment)19681968 D.S. DNA 5Okazaki fragmentlagging strandlagging strand(后随链(后随链):):单林娜 制作30 DNA replication四四 、RNA引导引导The first few nucleotides(核苷酸核苷酸) at the 5-end of Okazaki fragments are ri
11、bonucleotides(核糖核苷酸核糖核苷酸). Hence, DNA synthesis is primed by RNA that is then removed before fragments are joined. Crucial for high fidelity(忠实性忠实性) of replicationDNA复制反应的共同特点复制反应的共同特点l半保留复制半保留复制l半不连续复制半不连续复制l有特定的复制起点有特定的复制起点l需要引物需要引物l复制真实性复制真实性l复制叉双向移动,复制叉双向移动,DNA合成的单向延伸,合成的单向延伸, l复制受控制复制受控制DNA rep
12、lication第第2节节 细菌细菌DNA的复制的复制一、一、 DNA复制所需的蛋白质和酶复制所需的蛋白质和酶二、二、 DNA复制的过程复制的过程三、三、 DNA复制的方式复制的方式一、一、 DNA复制所需的蛋白质和酶复制所需的蛋白质和酶dATP, dGTP, dCTP, dTTP primer templatelProteins and enzymes2. DNA复制所需的蛋白质和酶复制所需的蛋白质和酶DNA helicase (DNA解旋酶解旋酶)single-stranded binding protein (SSB, 单链结合单链结合蛋白蛋白)DNA primase (DNA 引发酶引
13、发酶) DNA topoisomerase (拓扑异构酶拓扑异构酶) Primosome (引发体引发体)DNA polymerase (DNA聚合酶聚合酶)DNA ligase (DNA 连接酶连接酶)DNA helicase (DNA解旋酶解旋酶) 利用利用ATP供能,解开供能,解开DNA双链双链, 可随复制叉可随复制叉的伸展向前移动的伸展向前移动大肠杆菌中解旋酶的种类大肠杆菌中解旋酶的种类种种 类类功功 能能DnaA辨认起始点,并结合到复制起始部位辨认起始点,并结合到复制起始部位DnaB解开解开DNA双链双链DnaC运送和协同运送和协同DnaBsingle-stranded bindin
14、g protein (SSB, 单链结合蛋白单链结合蛋白) 稳定已被解开的稳定已被解开的DNA单链,阻止复性和保单链,阻止复性和保护单链不被核酸酶降解。护单链不被核酸酶降解。 使单链使单链DNA 呈伸展状态,无弯曲和结节,呈伸展状态,无弯曲和结节,有利于作为模板有利于作为模板DNA primase (DNA 引发酶引发酶) 在模板复制的起始部位,以在模板复制的起始部位,以DNA为模板催为模板催化互补碱基聚合生成一小段化互补碱基聚合生成一小段RNA e.g. DNa G (E. coli)DNA topoisomerase (拓扑异构酶拓扑异构酶) 是一类调节是一类调节DNA分子的超螺旋水平,可
15、改变分子的超螺旋水平,可改变DNA拓扑性拓扑性质的酶。对质的酶。对DNA分子的作用是既能水解、又能连接磷酸分子的作用是既能水解、又能连接磷酸二酯键。二酯键。 拓扑异构酶拓扑异构酶 I: 切开切开DNA双链中的一股,使双链中的一股,使DNA在解链旋在解链旋转中不打结,转中不打结,DNA变为松弛状态再封闭切口。变为松弛状态再封闭切口。 同转录有同转录有关关 拓扑异构酶拓扑异构酶 II: 能切断能切断DNA双链,使螺旋松弛。在双链,使螺旋松弛。在ATP参参与下,松弛的与下,松弛的DNA进入负超螺旋,再连接断端。进入负超螺旋,再连接断端。同复制同复制有关有关 Primosome (引发体引发体) A
16、mobile complex includes helicase (DNaA, DNaB, DNaC) and DNA primase. 由多种蛋白质及酶组成由多种蛋白质及酶组成,是是DNA复制开始复制开始所必需的所必需的. 性质 聚合酶聚合酶 聚合酶3 5 外切活性+ + + +5 3 外切活性+-5 3 聚合活性+ 中+ 很低+ 很高新生链合成-+主要是对主要是对DNADNA损伤的修损伤的修复;以及在复;以及在DNADNA复制时复制时切除切除RNARNA引物并填补其引物并填补其留下的空隙。留下的空隙。修复紫外修复紫外光引起的光引起的DNADNA损伤损伤DNA DNA 复制的主要复制的主要聚
17、合酶,还具有聚合酶,还具有3 3-5-5 外切酶的外切酶的校对功能,提高校对功能,提高DNADNA复制的保真性复制的保真性DNA polymerase (DNA聚合酶聚合酶)DNA polymerase IIIDNA polymerase III 二聚体复合物二聚体复合物 由由10种亚基种亚基( ) 组成不对称异组成不对称异源二聚体。源二聚体。 核心酶(核心酶()DNA polymerase III holoenzyme 单林娜 制作51 2.2.核酸外切酶活性核酸外切酶活性3 3 55 外切酶活性:外切酶活性:切除错配的核苷酸切除错配的核苷酸5 5 33 外切酶活性:外切酶活性: 切除引物切
18、除引物 切除突变的片段切除突变的片段C T T C A G G AG A A G T C C G G C G5335 DNA ligase 连接连接DNA链链3 -OH末端和相邻末端和相邻DNA链链5 -P末端,形成磷末端,形成磷酸二酯键,从而把两段相邻的酸二酯键,从而把两段相邻的DNA链连接成完整的链。链连接成完整的链。反应需要反应需要ATP。二、二、 DNA复制的过程复制的过程(1) Initiation (起始起始)(2) Elongation (延伸延伸)(3) Termination and segregation (终止与分终止与分离离)(1) Initiation (起始起始)识
19、别原点识别原点分开双链,稳定单链分开双链,稳定单链通过引发体起动子代链的合成反应通过引发体起动子代链的合成反应单林娜 制作58 单林娜 制作HU ATPDnaA 13bp segments OriC Supercolled template 1 单林娜 制作59 1. 起始复合体:随同HU蛋白一起,2040个dnaA protein-ATP 复合体结合到DNA上,包围4个9-mers区HU ATPDnaA 13bp segments OriC Supercolled template 1 单林娜 制作2. 开放性复合体:开放性复合体:DnaA 蛋白使蛋白使13bp重重复单位熔解而形成开放复单位
20、熔解而形成开放性复合体,这一过程需性复合体,这一过程需要要ATP 。3. 前引发复合体:前引发复合体:这时这时DnaB 和和DnaC蛋蛋白进入白进入DNA的熔解区的熔解区与与OriC结合形成前引结合形成前引发复合体。发复合体。 4. 单链结合蛋白结合,单链结合蛋白结合,稳定稳定OriC的单链结构的单链结构引发和复制引发和复制2 DnaB DnaC ATP DnaC DnaB 3 4 38 解旋酶解旋酶 (DnaB) 解开解开DNA链。链。 SSB结合稳定其单链结构结合稳定其单链结构 旋转酶解除链的张力旋转酶解除链的张力 . Primase 合成一段合成一段RNA引物引物 Dna A Dna B
21、、 Dna CDNA topoisomerase引物引物酶酶SSB3 5 3 5 Prismosome and primer3 5 3 5 引物是由引物酶催化合成的短链引物是由引物酶催化合成的短链RNA分子。分子。 引物引物3 HO5引物引物酶酶Re-initiation of bacterial replication at new origins before completion of the first round of replication (3) Elongation (延伸延伸) DNA聚合酶聚合酶III合成前导链和滞后链合成前导链和滞后链 DNA polymerase I切除
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