生物大分子课件:bio-coures-9.ppt
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- 生物 大分子 课件 bio coures
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1、核酸核酸核酸是极为重要的生物大分子之一,约占细胞干重的核酸是极为重要的生物大分子之一,约占细胞干重的515。核酸。核酸分脱氧核糖核酸(分脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸()和核糖核酸(RNA)两大类。所有生物细胞都)两大类。所有生物细胞都含有这两类核酸。含有这两类核酸。DNA主要集中于细胞核内,也存在于线粒体、叶绿素主要集中于细胞核内,也存在于线粒体、叶绿素内。内。RNA主要分布在细胞质中。但是对于病毒来说,要么只含主要分布在细胞质中。但是对于病毒来说,要么只含DNA,要,要么只含么只含RNA。核酸是一种线型核酸是一种线型多聚核苷酸多聚核苷酸,它的基本单位是,它的基本单位是核苷酸核苷酸。两类核
2、酸的基本化学组成两类核酸的基本化学组成 DNA RNA 嘌呤碱 腺嘌呤(A) 鸟嘌呤(G) 腺嘌呤 鸟嘌呤 嘧啶碱 胞嘧啶(C) 胸腺嘧啶(T) 胞嘧啶 脲嘧啶(U) 戊糖 D-2-脱氧核糖 D-核糖 酸 磷酸 磷酸 核酸中的核酸中的碱基碱基分两类:嘧啶碱和嘌呤碱。分两类:嘧啶碱和嘌呤碱。核苷核苷(核糖苷)由戊(核糖苷)由戊糖和碱基缩合而成,并以糖和碱基缩合而成,并以糖苷键相连接。糖环上的糖苷键相连接。糖环上的C1与嘧啶碱的与嘧啶碱的N1或与嘌呤或与嘌呤碱的碱的N9相连接,形成相连接,形成N-糖糖苷键。苷键。X-射线衍射分析已射线衍射分析已证明,核苷中的碱基与糖证明,核苷中的碱基与糖环平面互相
3、垂直。环平面互相垂直。核苷中的戊糖羟基被磷酸核苷中的戊糖羟基被磷酸酯化,就形成酯化,就形成核苷酸核苷酸。脱氧核糖核酸(脱氧核糖核酸(DNA)DNA的碱基组成的碱基组成参与参与DNA组成的主要有四种碱基:腺嘌呤(组成的主要有四种碱基:腺嘌呤(A)、鸟嘌呤)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶()、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶()和胸腺嘧啶(T)。用纸层析及紫外分光光度)。用纸层析及紫外分光光度计对各种生物计对各种生物DNA的碱基组成进行定量测定可发现如下规律:的碱基组成进行定量测定可发现如下规律:所有所有DNA中中A与与T的摩尔含量相等;的摩尔含量相等;G与与C的摩尔含量相等。因的摩尔含量相等。因此嘌呤的总含量和嘧
4、啶的总含量相等,即此嘌呤的总含量和嘧啶的总含量相等,即AGCT。DNA的碱基组成具有种属的特异性,不同的生物种的的碱基组成具有种属的特异性,不同的生物种的DNA具有具有自己独特的碱基组成。但自己独特的碱基组成。但DNA碱基组成没有组织和器官的特异性。碱基组成没有组织和器官的特异性。生长发育阶段、营养状态和环境的改变都不影响生长发育阶段、营养状态和环境的改变都不影响DNA的碱基组成。的碱基组成。所有所有DNA中碱基组成必定是中碱基组成必定是AT,GC。这一规律的发现,。这一规律的发现,提示了提示了A与与T,G与与C之间碱基互补的可能性,为以后之间碱基互补的可能性,为以后DNA双螺旋结双螺旋结构的
5、建立提供了重要根据。构的建立提供了重要根据。DNA的一级结构的一级结构图的右侧是多核苷酸的几种缩写法。图的右侧是多核苷酸的几种缩写法。B为线条式缩写,竖线表示核糖的碳链,为线条式缩写,竖线表示核糖的碳链,A、C、T、G表示不同的碱基,表示不同的碱基,P代表磷代表磷酸基,由酸基,由P引出的斜线一端与引出的斜线一端与C3相连,另相连,另一端与一端与C5相连。相连。C为文字缩写,为文字缩写,P在碱基在碱基的左侧,表示的左侧,表示P在在C5位置上;位置上;P在碱基的在碱基的右侧,表示右侧,表示P与与C3相连。有时多核苷酸中相连。有时多核苷酸中磷酸二酯键上的磷酸二酯键上的P也可省略。这两种写法也可省略。
6、这两种写法对对DNA和和RNA分子都适用。分子都适用。DNA的一级结构是由数量庞大的四种的一级结构是由数量庞大的四种脱氧核糖核苷酸即:脱氧腺嘌呤核苷酸、脱氧核糖核苷酸即:脱氧腺嘌呤核苷酸、脱氧鸟嘌呤核苷酸、脱氧胞嘧啶核苷酸和脱氧鸟嘌呤核苷酸、脱氧胞嘧啶核苷酸和脱氧胸腺嘧啶核苷酸,通过脱氧胸腺嘧啶核苷酸,通过3,5磷酸二磷酸二酯键连接起来的直线形或环形多聚体。由酯键连接起来的直线形或环形多聚体。由于脱氧核糖中于脱氧核糖中C-2上不含羟基,上不含羟基,C-1又与又与碱基项连接,所以唯一可以形成的键是碱基项连接,所以唯一可以形成的键是3,5磷酸二酯键,磷酸二酯键,DNA不可能有侧链。不可能有侧链。D
7、NA的空间结构的空间结构目前公认的DNA双螺旋结构模型的建立,主要有两方面的根据:一是DNA碱基组成的定量分析;二是对DNA纤维和DNA晶体的X光衍射分析。Watson和Crick所用的资料来自在相对湿度为92时所得的DNA钠盐纤维,这种DNA称为B型DNA。生物体内天然状态的DNA几乎都以B-DNA存在。根据Watson和Crick所提出的模型,B-DNA具有以下特性:两条反向平行的多核苷酸链围绕同一中心轴相互缠绕;嘌呤与嘧啶碱位于双螺旋的内侧,磷酸与核糖在外侧,彼此通过3,5-磷酸二酯键相连接,形成DNA分子的骨架。碱基平面与纵轴垂直,糖环的平面则与纵轴平行。多核苷酸链的方向取决于核苷酸间
8、磷酸二酯键的走向。习惯上以C3C5为正向。两条链均为右手螺旋。双螺旋结构上有两条螺形凹沟:大沟的宽度为1.2nm,深度为0.85nm;小沟的宽度为0.6nm,深度为0.75nm;双螺旋的平均直径为2nm,两个相邻的碱基对之间相距的高度,即碱基堆积距离为0.34nm,两个核苷酸之间的夹角为36。因此,沿中心轴每旋转一周有10个核苷酸。每一转的高度(即螺距)为3.4nm。两条核苷酸链依靠彼此碱基之间形成的氢键相连系而结合在一起。根两条核苷酸链依靠彼此碱基之间形成的氢键相连系而结合在一起。根据分子模型的计算,一条链上的嘌呤碱必须与另一条链上的嘧啶碱相匹配,据分子模型的计算,一条链上的嘌呤碱必须与另一
9、条链上的嘧啶碱相匹配,其距离才正好与双螺旋的直径相吻合。碱基之间所形成的氢键,根据对碱其距离才正好与双螺旋的直径相吻合。碱基之间所形成的氢键,根据对碱基构象研究的结果,基构象研究的结果,A只能与只能与T相配对,形成两个氢键;相配对,形成两个氢键;G与与C相配对,形相配对,形成三个氢键,所以成三个氢键,所以GC之间的连接较为稳定。上述碱基之间配对的原则称之间的连接较为稳定。上述碱基之间配对的原则称为碱基互补。由此,当一条多核苷酸链的序列被确定以后,即可推知其互为碱基互补。由此,当一条多核苷酸链的序列被确定以后,即可推知其互补链的序列。碱基互补原则具有极重要的生物学意义:补链的序列。碱基互补原则具
10、有极重要的生物学意义:DNA复制、转录、复制、转录、反转录等的分子基础都是碱基互补。反转录等的分子基础都是碱基互补。Complementary base pairing between (a) guanine and cytosine and (b)adenine and thymine 对对DNA晶体所作的晶体所作的X射线衍射分析可提供更为精确的信息。射线衍射分析可提供更为精确的信息。K. Dickerson等用人工合成的多聚脱氧核糖核苷酸(十二聚体)晶体进行等用人工合成的多聚脱氧核糖核苷酸(十二聚体)晶体进行X射线衍射分析后,认为这种十二聚体的结构与射线衍射分析后,认为这种十二聚体的结构与
11、Watson和和Crick所提所提出的模型十分相似,但在结构上并不象出的模型十分相似,但在结构上并不象WatsonCrick模型所说的那样模型所说的那样均一。这是由于碱基序列的不同,以致在局部结构上有较大的差异,均一。这是由于碱基序列的不同,以致在局部结构上有较大的差异,这些差异是:这些差异是:Watson和和Crick的模型认为每一螺周含有的模型认为每一螺周含有10个碱基对,所以两个核个碱基对,所以两个核苷酸之间的夹角是苷酸之间的夹角是36 。但在。但在Dickerson的十二聚体中,两个碱基之间的的十二聚体中,两个碱基之间的夹角可自夹角可自28 至至42 不等。不等。Dickerson所研
12、究的十二聚体结构中,组成碱基对的两个碱基的分所研究的十二聚体结构中,组成碱基对的两个碱基的分布并非在同一平面上,而是碱基对沿长轴旋转一定角度,从而使碱基布并非在同一平面上,而是碱基对沿长轴旋转一定角度,从而使碱基对的形状象螺旋桨叶片的样子,故称之为螺旋桨状扭曲。这种结构可对的形状象螺旋桨叶片的样子,故称之为螺旋桨状扭曲。这种结构可提高碱基堆积力,使提高碱基堆积力,使DNA结构更稳定。结构更稳定。DNA作为一种在生命活动中非常重要的生物大分子,有必要对其某些特作为一种在生命活动中非常重要的生物大分子,有必要对其某些特性加以讨论。性加以讨论。DNA分子的长度。分子的长度。天然天然DNA分子的长度往
13、往是很长的。以大肠杆菌染色分子的长度往往是很长的。以大肠杆菌染色体体DNA为例,其分子量为为例,其分子量为2.6 109或由或由4 106碱基对组成,长度为碱基对组成,长度为1.4 106nm。就其长度与直径之比而言,这是一种极不对称的分子。如此细长的分子对任就其长度与直径之比而言,这是一种极不对称的分子。如此细长的分子对任何机械力的作用都十分敏感,所以用一般方法制备的何机械力的作用都十分敏感,所以用一般方法制备的DNA样品往往是降解了样品往往是降解了的的DNA片断。片断。DNA的长度可用电子显微镜直接测量。的长度可用电子显微镜直接测量。DNA分子结构中的碱基互变异构体。分子结构中的碱基互变异
14、构体。DNA分子的某些化学性质与其碱基分子的某些化学性质与其碱基上氢原子的位置有关。碱环上的氢原子有其较为固定的位置:腺嘌呤和胞嘧上氢原子的位置有关。碱环上的氢原子有其较为固定的位置:腺嘌呤和胞嘧啶环上的氢原子常处于氨基(啶环上的氢原子常处于氨基(NH2)状态,只有极少数处于亚胺基()状态,只有极少数处于亚胺基(NH)状)状态;同样,鸟嘌呤和胸腺嘧啶环上态;同样,鸟嘌呤和胸腺嘧啶环上C6上的氧原子常为酮式(上的氧原子常为酮式(CO),很少),很少有烯醇式(有烯醇式(COH)。氢原子在碱基上具有较固定位置有重要意义:如果)。氢原子在碱基上具有较固定位置有重要意义:如果DNA分子的碱基上的氢原子无
15、这一特性,分子的碱基上的氢原子无这一特性,A就容易与就容易与C配对,配对,G则容易与则容易与T配配对,这样对,这样DNA分子双螺旋结构中分子双螺旋结构中AT,GC碱基互补的原则不复存在,碱基互补的原则不复存在,DNA分子也就难以成为遗传物质了。另一方面,分子也就难以成为遗传物质了。另一方面,A与与C上的氢原子偶尔也可上的氢原子偶尔也可形成亚胺基,形成亚胺基,G与与T上的氧原子偶尔也可形成烯醇式。可能这就是上的氧原子偶尔也可形成烯醇式。可能这就是DNA复制复制时引起突变的原因之一,这种突变是生物进化的动力。时引起突变的原因之一,这种突变是生物进化的动力。DNA分子的稳定性。分子的稳定性。 DNA
16、分子双螺旋结构在生理状态下是很稳定的。分子双螺旋结构在生理状态下是很稳定的。维持稳定性的主要因素是碱基堆积力。嘌呤与嘧啶碱形状扁平,呈疏维持稳定性的主要因素是碱基堆积力。嘌呤与嘧啶碱形状扁平,呈疏水性,分布于双螺旋结构的内侧。大量碱基层层堆积,两相邻碱基的水性,分布于双螺旋结构的内侧。大量碱基层层堆积,两相邻碱基的平面十分贴近,于是使双螺旋结构内部形成一个强大的疏水区,与介平面十分贴近,于是使双螺旋结构内部形成一个强大的疏水区,与介质中的水分子隔开。其次,大量存在于质中的水分子隔开。其次,大量存在于DNA分子中的其它弱键在维分子中的其它弱键在维持双螺旋结构的稳定性上也起一定的作用。这些弱键包括
17、:互补碱基持双螺旋结构的稳定性上也起一定的作用。这些弱键包括:互补碱基对之间的氢键;磷酸基团上的负电荷和介质中的阳离子之间形成的离对之间的氢键;磷酸基团上的负电荷和介质中的阳离子之间形成的离子键;范德华力等等。子键;范德华力等等。DNA分子的可塑性。分子的可塑性。在溶液中在溶液中DNA分子具有较大的可塑性。由于分分子具有较大的可塑性。由于分子上局部区域受热力学的作用,往往使子上局部区域受热力学的作用,往往使DNA分子发生弯曲、缠绕或分子发生弯曲、缠绕或伸展。这种分子变形并不是由于互补碱基对之间的氢键瞬间断裂的结伸展。这种分子变形并不是由于互补碱基对之间的氢键瞬间断裂的结果,而是由于果,而是由于
18、DNA分子多核苷酸链的骨架上的共价键的转角改变所分子多核苷酸链的骨架上的共价键的转角改变所引起的。引起的。DNA的生物学功能的生物学功能间接证据早就提示间接证据早就提示DNA可能是遗传物质,这些证据包括:可能是遗传物质,这些证据包括: DNA分子分布在染色体内,是染色体的主要成分,而染色体是直接与遗分子分布在染色体内,是染色体的主要成分,而染色体是直接与遗传有关的。传有关的。 细胞核内细胞核内DNA含量十分稳定,而且与染色体数目的多少有平行关系:体含量十分稳定,而且与染色体数目的多少有平行关系:体细胞(双倍体)细胞(双倍体)DNA含量为生殖细胞(单倍体)含量为生殖细胞(单倍体)DNA含量的两倍
19、。含量的两倍。 DNA在代谢上较稳定,不受营养条件、年龄等因素影响。在代谢上较稳定,不受营养条件、年龄等因素影响。 可作用于可作用于DNA分子的一些物理和化学因素,如紫外线、分子的一些物理和化学因素,如紫外线、X射线、氮芥射线、氮芥等都可以引起生物遗传特性的改变。等都可以引起生物遗传特性的改变。基因的化学本质基因的化学本质首先用实验证明基因的化学本质就是首先用实验证明基因的化学本质就是DNA分子的是分子的是O.T.Avery等(等(1944年)。他年)。他们选用的实验材料肺炎链球菌有两种不同的品系:具荚膜的品系形成光滑型的菌落们选用的实验材料肺炎链球菌有两种不同的品系:具荚膜的品系形成光滑型的
20、菌落(S型),是有毒的;无荚膜的品系形成粗糙型的菌落(型),是有毒的;无荚膜的品系形成粗糙型的菌落(R型),是无毒的。他们发型),是无毒的。他们发现,将现,将S型肺炎链球菌的型肺炎链球菌的DNA加到加到R型的培养物中,能够使型的培养物中,能够使R型转变成型转变成S型,表现出具型,表现出具有毒性的荚膜的特性。有毒性的荚膜的特性。这种细菌转化实验证明,使细菌性状发生转变的因子是这种细菌转化实验证明,使细菌性状发生转变的因子是DNA而不是而不是RNA或蛋白质,或蛋白质,DNA是遗传信息的载体。是遗传信息的载体。无论是被热致死的光滑型肺炎链球菌,还是粗糙型的活的肺炎链球菌,单独注无论是被热致死的光滑型
21、肺炎链球菌,还是粗糙型的活的肺炎链球菌,单独注射都不能使小鼠致死,而两者混合物注射则会使小鼠致死。从混合物注射致死的小射都不能使小鼠致死,而两者混合物注射则会使小鼠致死。从混合物注射致死的小鼠体内分离出了活的光滑型的肺炎链球菌;在体外将光滑型菌株的鼠体内分离出了活的光滑型的肺炎链球菌;在体外将光滑型菌株的DNA提取物加提取物加到粗糙型菌株的培养物中,也可以使后者转化成为具联性的光滑型菌株。到粗糙型菌株的培养物中,也可以使后者转化成为具联性的光滑型菌株。A.D.Hershey等肯定了等肯定了Avery的结论(的结论(1952年)。他们用放射性同位素年)。他们用放射性同位素32P和和35S,分别标
22、记,分别标记T2噬菌体的内部噬菌体的内部DNA和外壳和外壳D蛋白质,然后再用这种蛋白质,然后再用这种双标记的噬菌体去感染大肠杆菌寄主细胞,结果发现只有双标记的噬菌体去感染大肠杆菌寄主细胞,结果发现只有32P标记的标记的DNA注注入到寄主细胞内部,并且重新繁殖出子代噬菌体。这个实验进一步表明:入到寄主细胞内部,并且重新繁殖出子代噬菌体。这个实验进一步表明:在噬菌体中的遗传物质也是在噬菌体中的遗传物质也是DNA分子,而不是蛋白质。分子,而不是蛋白质。(a)噬菌体的蛋白质外壳只含有噬菌体的蛋白质外壳只含有S,因,因此当其生长在含此当其生长在含35S的培养基中时,它的的培养基中时,它的蛋白质便被特异性
23、地标记上,而当噬茵体蛋白质便被特异性地标记上,而当噬茵体是在含是在含32P的培养基中增殖时,它的的培养基中增殖时,它的DNA也就会被特异性地标记上,因为在它的外也就会被特异性地标记上,因为在它的外壳蛋白质中没有壳蛋白质中没有P;(b)用这种带上双标记用这种带上双标记的噬菌体感染大肠杆菌寄主,噬茵体颗粒的噬菌体感染大肠杆菌寄主,噬茵体颗粒吸附在细胞上,并将其吸附在细胞上,并将其DNA注入细胞内;注入细胞内;(c)将感染的细茵培养物在混合搅拌器中将感染的细茵培养物在混合搅拌器中剧烈振荡,使吸附在细胞上的已经中空的剧烈振荡,使吸附在细胞上的已经中空的噬茵体外壳脱落下来;噬茵体外壳脱落下来;(d)在感
24、染的寄主在感染的寄主细胞内,噬茵体细胞内,噬茵体DNA大量复制大量复制(其中只有其中只有亲本亲本DNA链才带有链才带有32P同位素同位素)并装配成子并装配成子代噬菌体颗粒;代噬菌体颗粒;(e)寄主细胞破裂,释放寄主细胞破裂,释放出新的子代噬菌体颗粒,其中有少量的噬出新的子代噬菌体颗粒,其中有少量的噬菌体菌体DNA带有带有32P标记,但没有一个蛋白标记,但没有一个蛋白质外壳具有质外壳具有35S标记。标记。DNA的复制的复制证明了证明了DNA是遗传物质和基因的载体之后,进而研究的问题是维系生命现象的是遗传物质和基因的载体之后,进而研究的问题是维系生命现象的基础基础DNA分子的自我复制的过程,以揭示
25、遗传信息是怎样从亲代准确地传递到子分子的自我复制的过程,以揭示遗传信息是怎样从亲代准确地传递到子代的本质。代的本质。M.Meselson和和F.W.Stahl用实验证明(用实验证明(1958年)在年)在DNA复制的过程中,在适宜的条件下,松开配对碱基之间的氢键,复制的过程中,在适宜的条件下,松开配对碱基之间的氢键,便能使两条链解开形成单链。然后每以条单链为模板,在便能使两条链解开形成单链。然后每以条单链为模板,在DNA聚合酶及游离的核苷酸参与下,按照碱基配对原则,聚合酶及游离的核苷酸参与下,按照碱基配对原则,吸引带有互补碱基的核苷酸,并在相邻的核苷酸之间形成磷吸引带有互补碱基的核苷酸,并在相邻
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