生物化学与分子生物学课件:酶.ppt
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- 生物化学 分子生物学 课件
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1、基因工程研究所基因工程研究所1Enzyme第第 3 章章 酶酶赵蕊赵蕊 副教授副教授基因工程研究所基因工程研究所2基因工程研究所基因工程研究所3教教 学学 要要 求求【教学课时教学课时】 6 学时学时【掌握内容掌握内容】酶的概念、化学本质、分子组成,单纯酶和全酶;活性中酶的概念、化学本质、分子组成,单纯酶和全酶;活性中心、必需基团的分类及其作用;酶促反应的特点;心、必需基团的分类及其作用;酶促反应的特点;Km与与Vmax值的概念和意值的概念和意义;抑制剂对酶促反应的影响:不可逆抑制的作用,可逆性抑制包括竞争义;抑制剂对酶促反应的影响:不可逆抑制的作用,可逆性抑制包括竞争性、非竞争性、反竞争性抑
2、制的动力学特征及其生理学意义;酶原与酶原性、非竞争性、反竞争性抑制的动力学特征及其生理学意义;酶原与酶原激活的过程与生理意义;变构酶和变构调节的概念、机理和动力学特征。激活的过程与生理意义;变构酶和变构调节的概念、机理和动力学特征。酶的共价修饰的概念和作用特点;同工酶的概念、生理意义。酶的共价修饰的概念和作用特点;同工酶的概念、生理意义。【熟悉内容熟悉内容】酶促反应的机理、中间产物学说;酶浓度、底物浓度、温酶促反应的机理、中间产物学说;酶浓度、底物浓度、温度、度、pH、激活剂对酶促反应的影响;酶活性的测定与酶活性单位概念;酶、激活剂对酶促反应的影响;酶活性的测定与酶活性单位概念;酶含量的调节特
3、点和调控。含量的调节特点和调控。基因工程研究所基因工程研究所4主主 要要 内内 容容1354酶的分类与命名酶的分类与命名酶的分子结构与功能酶的分子结构与功能酶促反应动力学酶促反应动力学酶的工作原理酶的工作原理酶的调节酶的调节26酶与医学的关系酶与医学的关系基因工程研究所基因工程研究所5酶学研究简史酶学研究简史公元前两千多年,我国已有酿酒记载。公元前两千多年,我国已有酿酒记载。1857年,年,Pasteur提出提出酒精发酵酒精发酵是酵母细胞生命活动的是酵母细胞生命活动的结果结果“活力论活力论”。1878年,年,Khne首次提出首次提出Enzyme一词。一词。1897年,年,Eduard Buch
4、ner用不含酵母细胞的酵母提取用不含酵母细胞的酵母提取液,实现了发酵,证明液,实现了发酵,证明发酵不需要活细胞的存在发酵不需要活细胞的存在。1926年,美国康乃尔大学年,美国康乃尔大学Sumner(萨姆纳)首次从刀(萨姆纳)首次从刀豆中提纯出脲酶结晶,并指出豆中提纯出脲酶结晶,并指出酶是蛋白质酶是蛋白质。 基因工程研究所基因工程研究所61930年,美国的生物化学家年,美国的生物化学家Northrop分离得到了胃蛋分离得到了胃蛋白酶(白酶(pepsin)、胰蛋白酶()、胰蛋白酶(trypsin)、胰凝乳蛋白)、胰凝乳蛋白酶(酶(chymotrypsin)结晶,)结晶,确立了酶的化学本质确立了酶的
5、化学本质。 1982年,年,Cech首次发现首次发现RNA也具有酶的催化活性,也具有酶的催化活性,提出提出核酶核酶(ribozyme)的概念。的概念。1995年,报道了具有年,报道了具有DNA连接酶活性连接酶活性DNA片段,称为片段,称为脱氧核酶脱氧核酶(deoxyribozyme)。基因工程研究所基因工程研究所7Eduard Buchner(1860-1917)Wilhelm Khne(1837-1900)He is best known today for coining the word enzymeThe Nobel Prize in Chemistry 1907 enzyme (“i
6、n yeast”)希腊文希腊文 en = in , zyme = yeast布希纳布希纳 威廉威廉库内库内 基因工程研究所基因工程研究所8J. B. Sumner1/2 of the prize (1887-1955) The Nobel Prize in Chemistry 1946 J. H. Northrop1/4 of the prize (1891-1987) W. M. Stanley1/4 of the prize (1904-1971) 萨姆纳萨姆纳 斯坦利斯坦利 诺斯罗普诺斯罗普 “for their preparation of enzymes andvirus prote
7、ins in a pure form”“for his discovery that enzymes can be crystallized”基因工程研究所基因工程研究所9 Urease crystals Sumner, J. B. (1926) “The isolation and crystallization of the enzyme urease” J. Biol. Chem. 69:435-441. Pepsin crystalsNorthrop, J. H. (1930) “Crystallin pepsin, 1: Isolation and tests of purity”
8、J. Gen . Physiol. 13:739-766.基因工程研究所基因工程研究所10核酶(核酶(ribozyme) 1982年美国年美国T. Cech等人发现四膜等人发现四膜虫的虫的rRNA前体能在完全没有蛋白质的前体能在完全没有蛋白质的情况下进行自我加工,发现情况下进行自我加工,发现RNA有催化有催化活性活性 。Thomas Cech University of Colorado at Boulder, USA 基因工程研究所基因工程研究所12 1983年美国年美国S.Altman等研究等研究RNaseP(由(由20%蛋白质和蛋白质和80%的的RNA组成),发现组成),发现RNaseP
9、中的中的RNA可催化可催化E. coli tRNA的前体的前体加工。加工。 Sidney Altman Yale University New Haven, CT, USA 基因工程研究所基因工程研究所15生物催化剂生物催化剂(biocatalyst):酶和核酶酶和核酶 核酶核酶(ribozyme):具有高效、特异催化作用:具有高效、特异催化作用的核酸,主要参与的核酸,主要参与RNA的剪接。的剪接。酶酶是一类由活细胞产生的,对其特异底物是一类由活细胞产生的,对其特异底物具有高效催化作用的蛋白质。具有高效催化作用的蛋白质。What is the difference between an enz
10、yme and a protein?ProteinRNAEnzymes All enzymes are proteins except some RNAs and not all proteins are enzymes基因工程研究所基因工程研究所17几个有关名词几个有关名词底物底物(substrate, S):酶作用的物质。:酶作用的物质。 产物产物(product, P):反应生成的物质。:反应生成的物质。酶促反应:酶催化的反应。酶促反应:酶催化的反应。酶活性:酶催化化学反应的能力。酶活性:酶催化化学反应的能力。 -酮戊二酸转氨酶丙酮酸Ala + Glu基因工程研究所基因工程研究所18第一
11、节第一节酶的分子结构与功能酶的分子结构与功能The Molecular Structure and Function of Enzyme 基因工程研究所基因工程研究所19酶的不同形式酶的不同形式单体酶单体酶(monomeric enzyme) 仅具有三级结构的酶。仅具有三级结构的酶。寡聚酶寡聚酶(oligomeric enzyme) 由多个相同或不同亚基以由多个相同或不同亚基以非共价键连接组成的酶。非共价键连接组成的酶。多酶体系多酶体系(multienzyme system) 由几种不同功能的酶由几种不同功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物。彼此聚合形成的多酶复合物。多功能酶多功能酶(multif
12、unctional enzyme)或串联酶或串联酶(tandem enzyme) 一些多酶体系在进化过程中由于基因一些多酶体系在进化过程中由于基因的融合,多种不同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶称的融合,多种不同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶。为多功能酶。基因工程研究所基因工程研究所20一、酶的分子组成中常含有辅助因子一、酶的分子组成中常含有辅助因子蛋白质部分:酶蛋白蛋白质部分:酶蛋白 (apoenzyme)辅助因子辅助因子(cofactor) 金属离子金属离子小分子有机化合物小分子有机化合物全酶全酶(holoenzyme)结合酶结合酶 (conjugated enzyme)
13、单纯酶单纯酶 (simple enzyme)基因工程研究所基因工程研究所21全酶分子中各部分在催化反应中的作用全酶分子中各部分在催化反应中的作用酶蛋白酶蛋白决定反应的特异性决定反应的特异性辅助因子辅助因子决定反应的种类与性质决定反应的种类与性质基因工程研究所基因工程研究所22金属酶金属酶(metalloenzyme)金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易丢失。丢失。金属激活酶金属激活酶(metal-activated enzyme) 金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合不甚紧密。合不甚紧密。 金属离子是最多见的辅助因子金属
14、离子是最多见的辅助因子基因工程研究所基因工程研究所23金属离子的作用:金属离子的作用:参与催化反应,传递电子;参与催化反应,传递电子;在酶与底物间起桥梁作用;在酶与底物间起桥梁作用;稳定酶的构象;稳定酶的构象;中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。基因工程研究所基因工程研究所24基因工程研究所基因工程研究所25辅助因子按其与酶蛋白结合的紧密程度分为辅助因子按其与酶蛋白结合的紧密程度分为 辅酶辅酶 (coenzyme):与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤的与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤的方法除去。方法除去。 辅基辅基 (prosthetic group):与酶蛋
15、白结合紧密,不能用透析或超与酶蛋白结合紧密,不能用透析或超滤的方法除去滤的方法除去。基因工程研究所基因工程研究所27二、酶的活性中心是酶分子中执行其催化二、酶的活性中心是酶分子中执行其催化功能的部位功能的部位酶分子中氨基酸残酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中基侧链的化学基团中,一些与酶活性密切相关一些与酶活性密切相关的化学基团的化学基团。必需基团必需基团(essential group)基因工程研究所基因工程研究所28指必需基团在空间结构上彼此靠近,组指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物。结合并将底
16、物转化为产物。酶的活性中心酶的活性中心 (active center)基因工程研究所基因工程研究所29p活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团结合基团结合基团binding group催化基团催化基团(catalytic group)催化底物转变成产物催化底物转变成产物 维持酶活性中心应有的空间构象和作为调节维持酶活性中心应有的空间构象和作为调节剂的结合部位所必需。剂的结合部位所必需。p活性中心外的必需基团活性中心外的必需基团p 构成酶活性中心的常见基团:构成酶活性中心的常见基团:His的咪唑基、的咪唑基、Ser的的-OH、Cys的的-SH、Glu的的-COOH。基因工程研究所基因工程研究所
17、30底底 物物 活性中心以外活性中心以外的必需基团的必需基团结合基团结合基团催化基团催化基团 活性中心活性中心 基因工程研究所基因工程研究所31溶菌酶的活性中心溶菌酶的活性中心溶菌酶的溶菌酶的活性中心活性中心是一裂隙,可以容是一裂隙,可以容纳纳肽多糖肽多糖的的6个单个单糖基(糖基(A,B,C,D,E,F),并与),并与之形成氢键和之形成氢键和van derwaals力。力。催化基团催化基团是是35位位Glu,52位位Asp;101位位Asp和和108位位Trp是是结合基团结合基团。63基因工程研究所基因工程研究所32三、同工酶是催化相同化学反应但一级结三、同工酶是催化相同化学反应但一级结构不同
18、的一组酶构不同的一组酶同工酶同工酶(isoenzyme)是指催化相同的化是指催化相同的化学反应,而酶蛋白的分子结构、理化性质乃学反应,而酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。至免疫学性质不同的一组酶。基因工程研究所基因工程研究所33 根据国际生化学会的建议,同工酶是由根据国际生化学会的建议,同工酶是由不同基不同基因编码因编码的多肽链,或由的多肽链,或由同一基因转录同一基因转录生成的不同生成的不同mRNA所翻译的不同多肽链组成的蛋白质。所翻译的不同多肽链组成的蛋白质。 同工酶存在于同一种属或同一个体的不同组织同工酶存在于同一种属或同一个体的不同组织或同一细胞的不同亚细胞结构中,它
19、使不同的组织或同一细胞的不同亚细胞结构中,它使不同的组织、器官和不同的亚细胞结构具有不同的代谢特征。、器官和不同的亚细胞结构具有不同的代谢特征。这是同工酶用于诊断不同器官疾病的理论依据。这是同工酶用于诊断不同器官疾病的理论依据。 基因工程研究所基因工程研究所34举例举例1:乳酸脱氢酶:乳酸脱氢酶(LDH1 LDH5)基因工程研究所基因工程研究所35LD5基因工程研究所基因工程研究所36基因工程研究所基因工程研究所37临床意义临床意义心肌梗死和肝病病人血清心肌梗死和肝病病人血清LDH同工酶谱的变化同工酶谱的变化1 1酶酶活活性性心肌梗死酶谱心肌梗死酶谱正常酶谱正常酶谱肝病酶谱肝病酶谱2 23 3
20、4 45 5基因工程研究所基因工程研究所3812345酶活性酶活性迁移位置迁移位置酶活性酶活性迁移位置迁移位置ab (a) LDH同工酶电泳图谱同工酶电泳图谱 (b)(a)正常人)正常人LDH同工酶电泳图谱同工酶电泳图谱,(b)心肌梗塞病人血清)心肌梗塞病人血清LDH同工酶电泳图谱同工酶电泳图谱 12345基因工程研究所基因工程研究所39举例举例 2:肌酸激酶:肌酸激酶(CK1CK3) CK1(BB) CK2(MB) CK3(MM)脑脑 心肌心肌 骨骼肌骨骼肌 心肌梗塞后心肌梗塞后618小时,小时,CK2释放入血,而释放入血,而LDH的释放比的释放比CK2迟迟12天,因此可用于心肌梗天,因此可
21、用于心肌梗死的早期诊断。死的早期诊断。基因工程研究所基因工程研究所40第二节第二节 酶促反应的特点与机理酶促反应的特点与机理The Characteristic and Mechanism of Enzyme-Catalyzed Reaction 基因工程研究所基因工程研究所41p酶与一般催化剂的共同点酶与一般催化剂的共同点在反应前后没有质和量的变化;在反应前后没有质和量的变化;只能催化热力学允许的化学反应;只能催化热力学允许的化学反应;只能加速可逆反应的进程,而不改变反只能加速可逆反应的进程,而不改变反应的平衡点。应的平衡点。基因工程研究所基因工程研究所42(一)酶促反应具有极高的效率(一)
22、酶促反应具有极高的效率 一、一、 酶促反应的特点酶促反应的特点酶的催化效率通常比非催化反应高酶的催化效率通常比非催化反应高1081020倍,倍,比一般催化剂高比一般催化剂高1071013倍。倍。酶的催化不需要较高的反应温度。酶的催化不需要较高的反应温度。酶 加 速 反 应 的 机 理 是 降 低 反 应 的 活 化 能酶 加 速 反 应 的 机 理 是 降 低 反 应 的 活 化 能(activation energy)。酶比一般催化剂更有效。酶比一般催化剂更有效地降低反应的活化能。地降低反应的活化能。基因工程研究所基因工程研究所43 酶的特异性酶的特异性(specificity):一种酶仅作
23、用于一种一种酶仅作用于一种或一类化合物,或一定的化学键,催化一定的化或一类化合物,或一定的化学键,催化一定的化学反应并生成一定的产物。酶的这种选择性称为学反应并生成一定的产物。酶的这种选择性称为酶的特异性或专一性。酶的特异性或专一性。(二)酶促反应具有高度的特异性(二)酶促反应具有高度的特异性 绝对特异性绝对特异性(absolute specificity) 相对特异性相对特异性(relative specificity) 立体结构特异性立体结构特异性(stereo specificity)基因工程研究所基因工程研究所44绝对特异性绝对特异性酶只作用于特定结构的底物,进行一种专一酶只作用于特定
24、结构的底物,进行一种专一的反应,生成一种特定结构的产物的反应,生成一种特定结构的产物 。如:如: OCNH2NH2+ H2O2NH3 + CO2尿素脲酶OCNHNH2+ H2O甲基尿素CH3脲酶基因工程研究所基因工程研究所45相对特异性相对特异性酶作用于一类化合物或一种化学键。酶作用于一类化合物或一种化学键。如:如:OHOHHHOHHOHCH2OHHCH2OHHCH2OHOHHHOHOO11OHOHHHOHHOHCH2HCH2OHHCH2OHOHHHOHOO11OOOHHHHOHHOHCH2OHH1蔗糖棉子糖蔗糖酶基因工程研究所基因工程研究所46立体结构特异性立体结构特异性酶仅作用于立体异构体
25、中的一种。酶仅作用于立体异构体中的一种。HCH3CCOOHOHHCH3COHCOOHABCABC基因工程研究所基因工程研究所47(三)酶促反应的可调节性(三)酶促反应的可调节性 酶促反应受多种因素的调控,以适应机体酶促反应受多种因素的调控,以适应机体对不断变化的内外环境和生命活动的需要。对不断变化的内外环境和生命活动的需要。对酶生成与降解量的调节对酶生成与降解量的调节酶催化效力的调节酶催化效力的调节通过改变底物浓度对酶进行调节等通过改变底物浓度对酶进行调节等基因工程研究所基因工程研究所48二、酶通过促进底物形成过渡态而提高反二、酶通过促进底物形成过渡态而提高反应速率应速率(一)更有效地降低反应
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