环境微生物学全册完整教学课件.ppt
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1、环境微生物学全册完环境微生物学全册完 整教学课件整教学课件 环境微生物学环境微生物学 Presentation/期中考试期中考试 l主题:微生物技术在环境保护主题:微生物技术在环境保护/污染控制中的应用污染控制中的应用 l10min oral presentation / 期中考试期中考试, l要求:条理清楚、思路清晰;注明参考文献要求:条理清楚、思路清晰;注明参考文献 l分值比例:分值比例:30% l时间:第时间:第8周、周、9周周 绪论绪论 l环境与环境工程面临的问题环境与环境工程面临的问题 l可持续发展与微生物可持续发展与微生物 l环境微生物学的定义环境微生物学的定义 l环境微生物学研究
2、的内容环境微生物学研究的内容 l环境微生物学的任务环境微生物学的任务 Duisburg Munich Aachen Switzerland 环境微生物学的定义环境微生物学的定义 l微生物微生物 人类人类环境环境污染物污染物 人类生存环境人类生存环境 环境微生物学研究的内容环境微生物学研究的内容 l自然环境中的微生物及生态学研究自然环境中的微生物及生态学研究 l污染环境中的微生物及生态学研究污染环境中的微生物及生态学研究 l三废的生物处理中微生物学原理和方法三废的生物处理中微生物学原理和方法 的研究的研究 l环境监测与评价的微生物学方法和原理环境监测与评价的微生物学方法和原理 的研究的研究 l自
3、然环境中的微生物生态学研究自然环境中的微生物生态学研究 “广义广义”环境微生物学环境微生物学 自然环境自然环境 微生物种群微生物种群 微生物微生物 生物地球化学循环生物地球化学循环 l污染环境中的微生物生态学研究污染环境中的微生物生态学研究 “污染微生物学污染微生物学” 污染环境污染环境 微生物种群微生物种群 l三废处理中微生物学原理方法研究三废处理中微生物学原理方法研究 污水处理微生物工程研究和应用污水处理微生物工程研究和应用 污染环境中微生物生态学的研究污染环境中微生物生态学的研究 三废处理高效菌种的分离筛选三废处理高效菌种的分离筛选 遗传工程方法培育遗传工程方法培育“超级细菌超级细菌”
4、高效省能新处理技术的研究开发高效省能新处理技术的研究开发 环境微生物学的任务环境微生物学的任务 l了解并揭示微生物在生态系统中的地位了解并揭示微生物在生态系统中的地位 与作用与作用 l避免或防止微生物对人类的麻烦及危害避免或防止微生物对人类的麻烦及危害 l开发、利用微生物以保护环境造福人类开发、利用微生物以保护环境造福人类 教材及参考书教材及参考书 l环境工程微生物学环境工程微生物学 周群英周群英 高廷耀高廷耀 高等教育出版社高等教育出版社 l环境微生物学环境微生物学 史家樑史家樑 徐亚同徐亚同 张圣章张圣章 华东师范大学出版社华东师范大学出版社 l环境微生物工程环境微生物工程 马文漪马文漪
5、杨柳燕杨柳燕 南京大学出版社南京大学出版社 教材及参考书教材及参考书 l环境生物技术环境生物技术 马放马放 冯玉杰冯玉杰 任南琪任南琪化学工业出版社化学工业出版社 lBiology of Microorganisms (7th Ed). T. D. Brock, M. T. Madigan, J. Martinko, J. Parker Prentice Hall lBiochemistry of Microbial Degradation C. Ratledge Kluwer Acdemic Publisher PART I AN INTRODUCTION OF MICROBIOLOGY C
6、hapter 1 An Overview of Microorganisms 1 Definition and characteristics 2 Classification and nomenclature What is microorganism? 103 100 10-3 10-6 10-9(m) Animals and Microbe Plants 1 Definition and characteristics 微生物的特征微生物的特征 体积小、比表面积大、形态简单体积小、比表面积大、形态简单 吸收多、转化快吸收多、转化快 生长旺、繁殖快、数量多生长旺、繁殖快、数量多 适应强、易
7、变异适应强、易变异 分布广、种类多分布广、种类多 体积小体积小 杆菌:杆菌: 长:长:2微米微米 (芝麻长度的(芝麻长度的1500分之一)分之一) 宽:宽:0.5微米微米 (头发丝直径的(头发丝直径的70分之一)分之一) 重:重:10-1310-12克克 (每毫克有几十亿个细菌)(每毫克有几十亿个细菌) RobertHooke,1664 Moldandsporesonleather Moldonroseleaf AntonivanLeeuwenhoek,1684 Morphologicaltypesof bacteria Amodernlightmicroscope Purplephototr
8、ophic bacteria Greenalgae Ascanningelectronmicroscope Electronmicrographofcellsof thephototrophicbacterium Rhodospirillumsodomense 用电子/原子级的方式来观察物体表面并生 成高解析度的三维图像,然后再放大无数倍。 它可以展示1-5纳米尺度上的所有细节 透射电镜看到的是通过电子衍射后的频谱图 然后用光学方法将频谱图还原成结构图 看到的是分子结构而不是其表面形貌 Atransmissionelectronmicroscope ElectronmicrographofaB
9、acillussubtiliscellindivision NucleoidfromacellofE.coli 带有冠细胞的人类卵子:这张彩 色图片上的紫色人类卵子坐落在 一个柱状物上。两个红色冠细胞 粘贴在透明带状物上 卵子表面的精子:生命循环从此开始:这张 图片上显示的是大量精子正在争先恐后地给 卵子受精。 人类胚胎和精子:这张色彩艳丽的美丽图 片,是利用共聚焦显微镜拍摄的。胚胎和 精细胞核呈紫色,而精子的尾巴是绿色。 蓝色区域是缝隙连接(gap junction),它 们把细胞彼此联系在一起 培育6天后的人类胚胎被植入子宫:生命循环从此开 始:6天的人类胚胎开始被植入子宫内膜子宫的 内表
10、面 大量精子涌入输卵管 精子钻入卵子 22天后胚胎尚未发育成熟,但我们可以看到 大脑内部了那个蓝色的居然是大脑啊大脑 24天后第一批发育的器官之一心脏开始跳动 那个咖啡豆居然是心脏啊心脏 4周 8周 3个月 红血球:从这张图片上看,它们很像肉桂色糖果,但事实上它 们是人体里最普通的血细胞红血球。这些中间向内部凹陷 的细胞的主要任务,是将氧气输送到我们的整个身体 头发分叉:经常修剪和良好的护理, 可避免像这张图片上出现发梢分叉的 现象 肺气泡:这张彩色图片显示的是人类肺部内表面。 图中的洞穴是肺气泡,这里是血液交换气体的地方 肺癌细胞:这张异常的肺癌细胞图与上面的健康 肺部图片形成鲜明对比 巨噬
11、细胞吞噬细菌 形态结构简单形态结构简单 单细胞单细胞 简单多细胞简单多细胞 非细胞生命物质非细胞生命物质 比表面积大比表面积大 比表面积:比表面积: 大肠杆菌约为人体的大肠杆菌约为人体的30万倍万倍 物质、能量和信息的交换物质、能量和信息的交换 生物生物 体重体重 (g) 日食量日食量 (g/d) 日食量日食量/体体 重重 人人60 1031 1030.017 地鼠地鼠3g31 闪绿蜂鸟闪绿蜂鸟22 大肠杆菌大肠杆菌1 10-12g5 10-850000 吸收多吸收多 生物生物日产蛋白质日产蛋白质/ /体重体重 公牛公牛1/1000 酵母菌酵母菌100/1 转化快转化快 生物生物代时代时日分裂
12、日分裂 次数次数 日增殖率日增殖率 大肠杆菌大肠杆菌20min.724.7 1021 酿酒酵母酿酒酵母2hr.124.1 103 念珠蓝细菌念珠蓝细菌1d.12 生长旺、繁殖快生长旺、繁殖快 数量多数量多 1克土壤:克土壤: 酵母菌酵母菌1 105个个 霉菌孢子霉菌孢子1 106个个 放线菌孢子放线菌孢子1 107个个 细菌细菌1 108个个 人体肠道:人体肠道:正常菌群正常菌群100400种种 总数总数1 1014个个 占粪便干重的占粪便干重的1/3 数量多数量多 纸币表面:细菌纸币表面:细菌9 106个(个(85%以上含大肠杆菌)以上含大肠杆菌) 喷嚏:细菌喷嚏:细菌5 1031.5 10
13、5个(感冒者个(感冒者8.5 107个)个) 林区、草地空气林区、草地空气 55个个/m3 公园空气公园空气 1000个个/m3 商业街空气商业街空气 5.8 105个个/m3 商店空气商店空气 4 106个个/m3 适应强、易变异适应强、易变异 抗热性、抗寒性抗热性、抗寒性 抗酸性、抗碱性、抗盐性、抗毒物性、抗酸性、抗碱性、抗盐性、抗毒物性、 抗干燥性、抗缺氧性、抗干燥性、抗缺氧性、 抗压力性、抗辐射性抗压力性、抗辐射性 分布广、种类多分布广、种类多 大气圈大气圈:85km高空高空 土壤圈:土壤圈:表面:数量少表面:数量少 520cm深处:最多深处:最多108个个/克克 20cm1m深处:渐
14、减深处:渐减 2m深处:几个深处:几个/克克 岩石圈:岩石圈:南极地层南极地层100m400m深处的岩心深处的岩心 水圈:水圈:10000m深处深处 硫细菌(嗜热、厌氧、耐压)硫细菌(嗜热、厌氧、耐压) 分布广、种类多分布广、种类多 水体水体细菌数量(细菌数量(ml 1) ) 澄清的山泉水50300 混浊富营养的湖水200012000 河流沉积物107108 湖底沉积物810951010 类型类型种数种数 细菌/放线菌0.2104 蓝细菌0.2104 真菌4.7104 原生动物2.4104 藻类2.3104 病毒/立克次氏体0.1104 总计总计9.9 104 Adensecommunityo
15、f algaeandcyanobacteria insurfacewatersofa nutrient-richlake Bacterialcommunityinthe depthsofalake 微生物独特的代谢类型:微生物独特的代谢类型: l多种产能方式多种产能方式 l分解能力强分解能力强 l合成能力合成能力 l独特的繁殖方式独特的繁殖方式 l非凡的抵御极端环境能力等非凡的抵御极端环境能力等 一个宿主细胞内的SARS病毒粒子 (红),放大倍率5.6万倍。这种 冠形病毒的表层蛋白形成冠部,用 于吸住和刺透宿主细胞。非典型肺 炎是一种致命肺病,2002年首次在 中国出现。这幅照片是使用高科技
16、含量的透射式电子显微镜拍摄的, 利用电子穿过样本的方式进行成像。 借助于能够放大数万倍的强大显微镜,德国 科学摄影师组织“科学之眼”让一系列人类 肉眼无法看到的致命病菌暴露出庐山真面目。 乍一看,这幅照片好似悬挂在画廊的一幅绘 画作品,实际上展示了致命的埃博拉病毒。 这幅照片借助透射式电子显微镜拍摄,放大 倍率1.25万倍。 天花病毒,好似一幅油画作品,放大倍率2.85万倍。照片中, 黄色为蛋白质,红色为DNA。使用显微镜拍完照片后,数字艺术家 为照片添加颜色,以呈现令人吃惊的视觉效果。在最后完成的照 片中,病菌的最微小细节也暴露无疑。 好似寿司的天花病毒。这种病毒由遗传物质(红)好似寿司的天
17、花病毒。这种病毒由遗传物质(红) 和和DNADNA构成,外面包裹着蛋白外壳(黄)。科学图片库的构成,外面包裹着蛋白外壳(黄)。科学图片库的 马克马克- -阿伯特表示:阿伯特表示:“一些照片呈现的景象犹如绘画作品,一些照片呈现的景象犹如绘画作品, 已收录在美术书中。公众对这些照片反响强烈,有助于已收录在美术书中。公众对这些照片反响强烈,有助于 我们为普通公众展现科学研究的魅力,尤其是孩子。我们为普通公众展现科学研究的魅力,尤其是孩子。” 第一个被发现的病毒:烟草花叶病毒 1886年,德国人阿道夫麦尔把患有花叶 病的烟草叶片加水研磨,再把汁液注射 到健康烟草的叶脉中,结果健康的烟草 也生病了。于是
18、,阿道夫麦尔首次证明 了这种病是可以传染的。那时,著名的 微生物学家巴斯德已经提出了“细菌致 病”学说。所以,麦尔认为烟草花叶病 是由细菌引起的。最终,他错过了人类 首次发现病毒的机会。1898年,荷兰细 菌学家贝杰林克做了同样的试验,根据 多次实验,他得出结论:让烟草生病的 不是细菌,而是一种全新的东西,并取 名为病毒,这就是烟草花叶病毒。 已知的最大病毒:阔口罐病毒 2014年,法国的两位科学家尚塔尔阿伯杰 尔和米歇尔克拉弗里,他俩在西伯利亚永 久冻土中发现了一个3万年前的阔口罐病毒 样本。阔口罐病毒呈椭圆形,其中的一端有 一个开口,病毒内部结构和蜂巢相近。阔口 罐病毒是目前已知最大的病毒
19、,在被发现的 阔口罐病毒当中,长度最长的有1.5微米, 直径则有0.5微米,它比以前认为最大的病 毒潘多拉病毒还要大50%。 杀死人类最多的病毒:流感病毒 根据流感病毒感染的对象不同,可以将病毒 分为人类流感病毒、猪流感病毒、马流感病 毒以及禽流感病毒等类群。 流感病毒之所以那么厉害,主要是它会造成 急性上呼吸道感染,并由空气迅速传播,从 而带来周期性的世界大流行。 就算是现在,我们依然受到流感病毒的危害 ,今年刚研制出一种对付某种流感的疫苗, 过几年,可能又会出现新的流感病毒。流感 病毒强大的、变化莫测的变异能力,是我们 很难对付它的原因 致死率最高的病毒:狂犬病病毒 埃博拉病毒会带来百分之
20、九十的死亡率。然 而,在病毒界,埃博拉病毒致死率还不是最 高的,稳坐第一把交椅的是狂犬病病毒。人 、猫、狗、马、蝙蝠等都可能感染这种病, 而只要感染,发病后,病毒便会侵入宿主的 大脑,引起急性脑炎后,几乎必死无疑,无 药可治。 已被人类控制的病毒:天花病毒 仅仅在1967年,根据国际卫生组织公布的数据可知,就有1500万人曾感染天花,其中,200万人死 亡。那些感染后最终能幸存下来的人,也大多会在皮肤上留下永久的瘢痕,还有的因为角膜溃疡而 导致眼盲。 运的是,世界卫生组织在1958年接受苏联的建议,展开全球消灭天花的行动。一时间 ,世界各地的医护人员在出现天花的地区进行围堵式的接种,效果非常显
21、著。 1978年,一名英国 医学摄影师在实验室内染上天花,她是全球最后一名天花患者。1980年5月8日,世界卫生组织正式 宣布,天花已从地球上灭绝 数量最多的病毒:噬菌体 噬菌体,顾名思义,它的特点就是以细菌为宿主 。比如咱们大肠内的大肠杆菌,就是“T2噬菌体 ”的攻击目标。你可能想不到的是,噬菌体曾经 在原苏联、法国等地,作为抗生素的替代品,在 长达90年的时间里充当着医疗用品跟大多数病毒 一样,噬菌体只是一团由蛋白质外壳包裹的遗传 物质。不同的是,噬菌体一般都长有“尾巴”, 它的作用是用来将遗传物质注入细菌体内 借助扫描电子显微镜拍摄的脑膜炎奈瑟氏菌,可引发流 行性脑脊髓膜炎,放大倍率3.
22、3万倍。 肺炎链球菌,很多人携带这种病菌,但并没有发病。在 免疫系统脆弱的人体内,这种病菌能够感染上呼吸道, 引起肺炎 鼠疫病菌(鼠疫耶尔森菌),可引起致命的黑死病。欧 洲14世纪中期爆发的黑死病以及1664年至1665年的伦敦 大瘟疫便由它们导致。 大肠杆菌,放大倍率1.7万倍。这种细菌可引起肠胃炎、 尿道感染和食物中毒 杆状炭疽热病菌,可引起炭疽热。“9-11”恐 怖袭击后,炭疽热孢子以信件为载体在美国出现 和传播,引发大规模恐慌。在显微镜下,炭疽热 孢子被放大了1.8万倍,用惊人的清晰度呈现每一 个菌株。 肺结核病菌,放大倍率1万倍。这种病菌通过咳嗽 或者打喷嚏进入肺部 借助扫描电子显微
23、镜拍摄的包柔氏螺旋体菌,放大倍率 3650倍。这种螺旋形病菌可引起莱姆关节炎,通过扁虱 叮咬在人类中间传播 乳头状瘤病毒,放大倍率6万倍。这种病毒含有72个衣壳 蛋白,导致感染者长瘤 流感病毒粒子,放大倍率23万倍。这种病毒由RNA构成, 四周环绕一个核壳体(红)和一个含脂包膜(绿)脊髓灰质炎病毒,放大倍率9万倍。RNA处在 中央,外面包裹着蛋白外壳(绿)。脊髓灰 质炎病毒共有3种,1型可引发脊髓灰质炎疫 情。 电镜下的黑曲霉孢子囊 电镜下的黄曲霉 2 Classification and nomenclature 1. 分类单位分类单位 Kingdom (界)(界) Phyllum(门)(门
24、) Class(纲)(纲) Order(目)(目) Family(科)(科) Genus(属)(属) Species(种)(种) 三总界五界三总界五界: 非细胞总界:病毒等非细胞总界:病毒等 原核总界:原核总界:1. 细菌界;细菌界;2. 蓝细菌界蓝细菌界 真核总界:真核总界:3. 植物界;植物界;4. 真菌界;真菌界;5. 动物界动物界 五界五界:原核生物界原核生物界 原生生物界原生生物界 真菌界真菌界 动物界动物界 植物界植物界 六界六界:病毒界病毒界 原核生物界原核生物界 真核原生生物界真核原生生物界 真菌界真菌界 动物界动物界 植物界植物界 三原界系统:三原界系统: 古细菌原界:古细菌
25、原界: 产甲烷菌、极端嗜盐菌、嗜热嗜酸菌产甲烷菌、极端嗜盐菌、嗜热嗜酸菌 真核生物原界:真核生物原界: 原生动物、植物、真菌、动物原生动物、植物、真菌、动物 真细菌原界:真细菌原界: 蓝细菌、除古细菌以外的其它原核生物蓝细菌、除古细菌以外的其它原核生物 微生物常用分类系统微生物常用分类系统 原核细胞型:原核细胞型: 细菌细菌 放线菌放线菌 蓝细菌蓝细菌 真核细胞型:真核细胞型: 真菌(酵母菌、霉菌)真菌(酵母菌、霉菌) 原生动物原生动物 微型藻类微型藻类 非细胞型:非细胞型:病毒病毒 亚病毒亚病毒 细胞生物分类细胞生物分类 微生物微生物 Micro- organisms 大大(高等高等)生物生
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